Bedre avgrensning av CDK13-relatert fenotype og epigenetisk signatur. (CDK13)

Etterforskerne tar sikte på å bedre forstå og avgrense det genetiske syndromet CDK13 Denne genetiske lidelsen ble beskrevet i september 2016 i Nature Genetics (PMID 27479907).

Siden denne første publikasjonen av 6 individer som bærer den patogene mutasjonen CDK13, har 37 andre individer som bærer en patogen mutasjon av CDK13 blitt rapportert i litteraturen. Etterforskerne søker å bedre definere fenotypen til individer med patogene varianter av CDK13, for bedre å forstå intellektuell funksjon. så vel som styrker og svakheter ved intellektuell funksjon ved å samle standardiserte nevropsykologiske vurderinger som allerede er utført som WPPSI/WISC og WAIS. For dette formålet vil etterforskerne samle kliniske og nevropsykologiske data som allerede er utført i forbindelse med omsorg.

Etterforskerne tar også sikte på å samle de cerebrale MR-skanningene som allerede er utført for å bedre avgrense de cerebrale anomaliene observert hos individer, og hvis sekvensen er tilpasset, vil etterforskerne utføre VBM-studier.

Til slutt vil etterforskerne forsøke å identifisere en epigenetisk signatur i denne genetiske sykdommen. For dette formål vil etterforskerne samle genomisk DNA fra perifert blod som allerede er samlet inn for genetisk analyse og sende et anonymisert parti med prøver til vår samarbeidspartner, Dr. Bekim Sadicovik. Dr. Bekim Sadicovik og teamet hans vil sammenligne de epigenetiske DNA-metyleringsmarkørene med de tilsvarende kjønns- og alderskontrollene. Hvis spesifikke prober er unormalt metylert i CDK13-individer, vil dette bestemme en sykdomsspesifikk epigenetisk signatur. Etterforskerne vil da kunne foreslå en epigenetisk signatur for individer med ukarakteriserte CDK13-variasjoner (klasse 3, VUS). Denne metoden vil gjøre det mulig å definere om variasjonen er ansvarlig for sykdommen eller ikke uten å gå gjennom funksjonsanalysetrinn som er vanskelig å implementere rutinemessig.

De forventede fordelene er en bedre forståelse av CDK13-sykdommen, nøkler til nevropsykologisk rehabilitering, en bedre forståelse av menneskelige hjernefunksjoner, muligheten for å foreslå en epigenetisk signatur for personer der det ikke er mulig å avgjøre om en variasjon i CDK13-genet er patologisk. eller ikke