Bättre avgränsning av CDK13-relaterad fenotyp och epigenetisk signatur. (CDK13)

Utredarna strävar efter att bättre förstå och avgränsa det genetiska syndromet CDK13. Denna genetiska störning beskrevs i september 2016 i Nature Genetics (PMID 27479907).

Sedan denna första publicering av 6 individer som bär på den patogena mutationen CDK13, har 37 andra individer som bär på en patogen mutation av CDK13 rapporterats i litteraturen. Utredarna försöker bättre definiera fenotypen av individer med patogena varianter av CDK13, för att bättre förstå intellektuell funktion såväl som styrkorna och svagheterna med intellektuell funktion genom att samla in standardiserade neuropsykologiska bedömningar som redan utförts såsom WPPSI/WISC och WAIS. För detta ändamål kommer utredarna att samla in kliniska och neuropsykologiska data som redan utförts i vårdsammanhang.

Utredarna syftar också till att samla de cerebrala MRI-skanningar som redan utförts för att bättre avgränsa de cerebrala anomalierna som observerats hos individer och om sekvensen anpassas kommer utredarna att utföra VBM-studier.

Slutligen kommer utredarna att försöka identifiera en epigenetisk signatur i denna genetiska sjukdom. För detta ändamål kommer utredarna att samla in genomiskt DNA från perifert blod som redan har samlats in för genetisk analys och skicka en anonymiserad sats av prover till vår samarbetspartner, Dr. Bekim Sadicovik. Dr. Bekim Sadicovik och hans team kommer att jämföra de epigenetiska markörerna av DNA-metyleringstyp med motsvarande köns- och ålderskontroller. Om specifika prober är onormalt metylerade i CDK13-individer kommer detta att bestämma en sjukdomsspecifik epigenetisk signatur. Utredarna kommer sedan att kunna föreslå en epigenetisk signatur för individer med okarakteriserade CDK13-variationer (klass 3, VUS). Denna metod kommer att göra det möjligt att definiera om variationen är ansvarig för sjukdomen eller inte utan att gå igenom funktionsanalyssteg som är svåra att implementera rutinmässigt.

De förväntade fördelarna är en bättre förståelse av CDK13-sjukdomen, nycklar till neuropsykologisk rehabilitering, en bättre förståelse av mänskliga hjärnfunktioner, möjligheten att föreslå en epigenetisk signatur för personer hos vilka det inte är möjligt att avgöra om en variation i CDK13-genen är patologisk. eller inte