Bedre afgrænsning af CDK13-relateret fænotype og epigenetisk signatur. (CDK13)

Efterforskerne sigter mod bedre at forstå og afgrænse det genetiske syndrom CDK13. Denne genetiske lidelse blev beskrevet i september 2016 i Nature Genetics (PMID 27479907).

Siden denne første publikation af 6 individer, der bærer den patogene mutation CDK13, er 37 andre individer, der bærer en patogen mutation af CDK13, blevet rapporteret i litteraturen. Efterforskerne søger at bedre definere fænotypen af ​​individer med patogene varianter af CDK13 for bedre at forstå intellektuel funktion samt styrker og svagheder ved intellektuel funktion ved at indsamle standardiserede neuropsykologiske vurderinger, der allerede er udført, såsom WPPSI/WISC og WAIS. Til dette formål vil efterforskerne indsamle kliniske og neuropsykologiske data, der allerede er udført i forbindelse med pleje.

Efterforskerne sigter også mod at indsamle de cerebrale MR-scanninger, der allerede er udført, for bedre at afgrænse de cerebrale anomalier observeret hos individer, og hvis sekvensen tilpasses, vil efterforskerne udføre VBM-undersøgelser.

Endelig vil efterforskerne forsøge at identificere en epigenetisk signatur i denne genetiske sygdom. Til dette formål vil efterforskerne indsamle genomisk DNA fra perifert blod, der allerede er indsamlet til genetisk analyse og sende en anonymiseret batch af prøver til vores samarbejdspartner, Dr. Bekim Sadicovik. Dr. Bekim Sadicovik og hans team vil sammenligne de epigenetiske DNA-methyleringsmarkører med de tilsvarende køns- og alderskontroller. Hvis specifikke prober er unormalt methylerede i CDK13-individer, vil dette bestemme en sygdomsspecifik epigenetisk signatur. Efterforskerne vil derefter være i stand til at foreslå en epigenetisk signatur for individer med ukarakteriserede CDK13-variationer (klasse 3, VUS). Denne metode vil gøre det muligt at definere, om variationen er ansvarlig for sygdommen eller ej, uden at gennemgå funktionelle analysetrin, som er vanskelige at implementere rutinemæssigt.

De forventede fordele er en bedre forståelse af CDK13 sygdom, nøgler til neuropsykologisk rehabilitering, en bedre forståelse af menneskelige hjernefunktioner, muligheden for at foreslå en epigenetisk signatur for mennesker, hos hvem det ikke er muligt at afgøre, om en variation i CDK13 genet er patologisk. eller ikke