Caractéristiques épidémiologiques, cliniques et moléculaires des patients atteints d'insuffisance respiratoire aiguë touchés par 2019-NCOV.

L'étude est une étude de cohorte avec collecte de données rétrospective-prospective. Toutes les données cliniques recueillies dans l'étude sont généralement surveillées dans la pratique clinique et aucun examen clinique supplémentaire ne sera requis dans le seul but de l'étude.

Les patients seront invités à consentir à l'utilisation à des fins de recherche d'échantillons de sang et de lavage bronchique/résidus provenant d'écouvillons nasopharyngés pour effectuer des analyses cellulaires et moléculaires visant à mieux comprendre la pathogenèse de la maladie et les différences individuelles de susceptibilité à la maladie. Ces expérimentations n'auront pas d'impact direct sur la prise en charge clinique des patients. Il est impossible de détailler maintenant toutes les expériences qui seront réalisées sur des échantillons stockés. Il est possible d'anticiper que des échantillons pourraient être utilisés pour analyser la réponse immunitaire en étudiant les cellules immunitaires et les médiateurs solubles de la réponse immunitaire. De plus, des échantillons seront utilisés pour extraire des acides nucléiques afin d'analyser les profils d'expression génique et les variations d'ADN éventuellement liées à la sensibilité aux maladies. Une partie des études génétiques pourrait être menée dans d'autres laboratoires à l'étranger (c'est-à-dire l'Institut de biologie moléculaire clinique de l'Université Christian-Albrechts de Kiel et l'Institut de médecine clinique de l'Université d'Oslo) dans le cadre de collaborations scientifiques. En particulier, les chercheurs prévoient d'étudier les niveaux d'expression de molécules connues pour l'infection virale médiée, comme l'enzyme de conversion de l'angiotensine 2 (ACE2) et la protéase transmembranaire, enzyme sérine 2 (TMPRSS2). Des variants génétiques dans ces gènes, et plus généralement dans d'autres gènes du génome, pourraient être liés à la susceptibilité à l'infection virale et/ou à la sévérité de l'évolution clinique de la maladie. Par conséquent, les chercheurs prévoient de comparer la fréquence des variants génétiques potentiellement liés à la sensibilité/sévérité du COVID-19 dans différents sous-groupes de patients, allant des individus positifs pour le virus mais asymptomatiques aux individus touchés par le COVID-19 avec un SDRA nécessitant une admission aux soins intensifs. L'extension des analyses qui seront réalisées ne peut être anticipée car elle dépend aussi du montant des financements qui seront disponibles pour l'étude ; potentiellement le génome entier pourrait être analysé.

Biomarqueurs originaux du sepsis et du SDRA développés à l'ICH (par ex. PTX3, sIL-1R2, MSF) seront utilisés pour évaluer leur potentiel pronostique chez les patients COVID-19. Les PBMC seront analysés par FACS pour étudier l'immunophénotype et le corréler au résultat clinique. Les marqueurs originaux de l'activation fonctionnelle des leucocytes développés à l'ICH seront inclus dans l'analyse (par ex. IL-1R8, IL-1R2). Le BAL résiduel et l'écouvillon rhinopharyngé seront utilisés pour l'analyse du microbiote, la métabolomique et la mesure des cytokines. Le plasma et la salive/les crachats seront également utilisés pour tester les anticorps anti-SRAS-Cov-2 (IgM, IgG et IgA) et pour l'analyse du microbiote.

Afin de mieux décrire les populations de patients COVID-19 traités dans notre hôpital, il est nécessaire de collecter des données sur les résultats de la maladie sur un processus de suivi à court, moyen et long terme. Les chercheurs visent à comprendre comment la maladie et les traitements intensifs affectent la vie des patients en convalescence. Les enquêteurs souhaitent notamment explorer la qualité de vie liée à la santé, l'impact de la maladie sur le plan psychologique, la capacité fonctionnelle cardio-respiratoire résiduelle et la force musculaire. Tous les tests choisis sont des tests d'usage courant dans le suivi des patients gravement malades notamment atteints du syndrome de détresse respiratoire aiguë.

La qualité de vie liée à la santé sera mesurée avec le questionnaire international validé EQ-5D-5L, dans sa forme italienne validée. Le questionnaire est joint et a été autorisé pour une utilisation gratuite et non commerciale par le consortium EuroQuol.

En tant qu'outil de dépistage pour évaluer la présence de symptômes psychologiques, tels que l'anxiété et la dépression, le questionnaire Hospital Anxiety and Depression Scale (HADS) sera administré dans sa version italienne.

La capacité fonctionnelle cardio-respiratoire sera mesurée avec le test de marche de six minutes, conformément aux directives internationales publiées par l'American Thoracic Society.

Les tests de comptage de respiration unique seront également effectués. Il consiste en la capacité de compter de zéro à vingt après une seule inspiration maximale.

Enfin, des tests dynamiques tels que le test Timed Up-and-Go (TUG) et le test Short physical performance battery (SPPB) seront réalisés pour évaluer la force musculaire, notamment des membres inférieurs, la capacité à s'équilibrer en marchant et le mobilité générale des patients. Les deux tests susmentionnés sont internationalement validés et sont couramment utilisés dans l'évaluation de la réserve fonctionnelle des patients en gériatrie et en réadaptation. Tous ces tests peuvent être administrés aux patients pendant leur séjour à l'hôpital ou après leur sortie lors de rendez-vous programmés.