Identification des auto-antigènes dans l'EGPA et l'asthme éosinophile sévère (IDEA)

Les chercheurs aborderont la question de recherche avec des approches parallèles agnostiques et ciblées.

Dans l'approche agnostique, la présence d'auto-anticorps dans le sérum et les expectorations des patients contre les éosinophiles inactifs et activés, avec et sans modification post-traductionnelle, sera examinée par immunofluorescence indirecte.

Dans l'approche ciblée, les chercheurs examineront par dosage immunoenzymatique (ELISA) la présence/l'absence d'anticorps dirigés contre des éosinophiles candidats présélectionnés et des protéines membranaires de base, à la fois sous forme native et modifiées après la traduction. Les protéines à examiner seront choisies en fonction de l'examen de la littérature (par ex. peroxydase des éosinophiles et collagène V) et des protéines spécifiques aux éosinophiles identifiées par l'analyse de l'ensemble de gènes FANTOM5 (Functional Annotation of the Mouse/Mammalian Genome) (FANTOM Consortium et al. 2014).

Des échantillons de sang et d'expectorations de patients hautement caractérisés souffrant d'asthme éosinophile sévère et/ou d'EGPA seront examinés compte tenu de la possibilité de réponses immunitaires spécifiques au compartiment.

Une fois que les auto-antigènes candidats ont été identifiés dans le groupe sélectionné de patients atteints d'asthme éosinophile sévère et d'EGPA, les chercheurs examineront ensuite leur prévalence dans des échantillons de sérum provenant d'une sélection plus large de patients atteints de maladies des voies respiratoires éosinophiles, y compris l'asthme léger à modéré, sévère l'asthme à éosinophiles, l'EGPA, la polypose nasale et la maladie pulmonaire obstructive chronique à éosinophiles (MPOC) ainsi que des témoins sains. La durée de la maladie, l'atopie, la présence/l'absence de polypes nasaux, le sexe, l'âge seront examinés comme co-variables. Corrélations avec les taux d'éosinophiles sanguins les plus élevés, le besoin de corticostéroïdes oraux et la présence d'autres auto-anticorps, par ex. anti-MPO (myéloperoxydase) ANCA (anticorps cytoplasmique anti-neutrophiles), seront examinés. En particulier, les chercheurs rechercheront la présence de nouveaux auto-anticorps dans des sous-groupes spécifiques de patients : i) ANCA négatifs, ii) ANCA positifs par immunofluorescence mais négatifs pour les anticorps anti-MPO et anti-PR3 (protéinase-3), iii) ANA (anti -anticorps nucléaire) positifs mais ANCA et antigène nucléaire extractible (ENA) négatifs ; car les patients des trois groupes peuvent avoir de nouveaux auto-anticorps encore indéterminés. Des analyses ROC (courbe caractéristique de l'opérateur récepteur) AUC (aire sous la courbe) seront effectuées pour déterminer la valeur prédictive des auto-anticorps sanguins pour le diagnostic de la maladie des voies respiratoires à éosinophiles.