Identifiering av autoantigener i EGPA och svår eosinofil astma (IDEA)

Utredarna kommer att närma sig forskningsfrågan med parallella agnostiska och riktade ansatser.

I det agnostiska tillvägagångssättet kommer närvaron av autoantikroppar i patientserum och sputum mot inaktiva och aktiverade eosinofiler, med och utan posttranslationell modifiering, att undersökas genom indirekt immunofluorescens.

I det riktade tillvägagångssättet kommer utredarna att undersöka med enzymkopplad immunanalys (ELISA) närvaron/frånvaron av antikroppar mot förutvalda eosinofil- och basmembranproteiner både i naturlig form och posttranslationellt modifierade. Proteiner att undersöka kommer att väljas baserat på litteraturgenomgång (t.ex. eosinofil peroxidas och kollagen V) och eosinofilspecifika proteiner identifierade av FANTOM5 (Functional Annotation of the Mouse/Mammalian Genome) genesetanalys (FANTOM Consortium et al. 2014).

Både blod- och sputumprover från högt karaktäriserade patienter med svår eosinofil astma och/eller EGPA kommer att undersökas med tanke på möjligheten till kompartmentspecifika immunsvar.

När kandidatautoantigener har identifierats i den utvalda gruppen av patienter med svår eosinofil astma och EGPA kommer utredarna att undersöka deras prevalens i serumprover från ett bredare urval av patienter med eosinofila luftvägssjukdomar inklusive mild till måttlig astma, svår eosinofil astma, EGPA, nasal polypos och eosinofil kronisk obstruktiv lungsjukdom (KOL) samt friska kontroller. Sjukdomslängd, atopi, närvaro/frånvaro näspolyper, kön, ålder kommer att undersökas som kovariater. Korrelationer med högsta antal eosinofiler i blodet, krav på orala kortikosteroider och närvaro av andra autoantikroppar, t.ex. anti-MPO (myeloperoxidas) ANCA (anti-neutrofil cytoplasmatisk antikropp), kommer att undersökas. I synnerhet kommer utredarna att leta efter förekomsten av nya autoantikroppar i specifika patientundergrupper: i) ANCA-negativ, ii) ANCA-positiv genom immunfluorescens men negativ för anti-MPO- och anti-PR3 (proteinas-3)-antikroppar, iii) ANA (antikroppar). -nukleär antikropp) positiv men ANCA och extraherbar nukleär antigen (ENA) negativ; eftersom patienter i alla tre grupperna kan ha nya, ännu obestämda autoantikroppar. ROC (receiver operator characteristic curve) AUC-analyser (area under curve) kommer att utföras för att fastställa det prediktiva värdet av blodautoantikroppar för diagnos av eosinofil luftvägssjukdom.