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Déchiffrer l'impact des expositions au complexe moléculaire dérivé du microbiome intestinal sur la santé et les maladies humaines (ExpoBiome)

26 janvier 2024 mis à jour par: Andreas Michalsen

Le projet ExpoBiome analysera l'impact du jeûne sur les patients atteints de la maladie de Parkinson (MP) ou de polyarthrite rhumatoïde (PR) au niveau clinique ainsi que l'effet du jeûne sur leur système immunitaire et leur microbiote intestinal. ExpoBiome combinera la métagénomique et d'autres "omiques" [méta-transcriptomique, méta-protéomique et (méta-)métabolomique], les analyses bioinformatiques et la biostatistique dans un cadre de biologie des systèmes pour acquérir de nouvelles connaissances mécanistes sur les interactions microbiome-système immunitaire dans le contexte de maladies chroniques. maladies à signature inflammatoire.

En plus d'une étude transversale unique sur des participants en bonne santé, des patients atteints de PR et de MP, une étude longitudinale à jeun avec deux bras (PR et MP) est prévue.

Aperçu de l'étude

Statut

Complété

Les conditions

Intervention / Traitement

Description détaillée

Le microbiome intestinal humain est un écosystème complexe, qui contribue à des fonctions essentielles à la physiologie humaine. Les modifications du microbiome sont associées à plusieurs maladies chroniques caractérisées par une inflammation, notamment des maladies neurodégénératives et auto-immunes. Les molécules effectrices dérivées du microbiome comprenant des acides nucléiques, des (poly)peptides et des métabolites sont présentes à des niveaux élevés dans l'intestin, mais ont jusqu'à présent échappé à une étude systématique. Ce manque de connaissances limite la compréhension mécaniste de l'impact fonctionnel du microbiome sur les maladies chroniques telles que la maladie de Parkinson (MP) et la polyarthrite rhumatoïde (PR). Ici, pour la première fois, une combinaison de méthodologies avancées à haute résolution sera intégrée pour identifier de manière exhaustive les constituants de ce complexe moléculaire et leur impact sur le système immunitaire humain. Tout d'abord, une analyse multi-omique quantitative et intégrée sur des échantillons de microbiome collectés auprès d'individus en bonne santé et de patients atteints de MP ou de PR nouvellement diagnostiqués sera effectuée.

En utilisant des connaissances préalables contextualisées (ExpoBiome Map) et des méthodes d'apprentissage automatique, nous identifierons des molécules microbiennes associées à des immunophénotypes spécifiques à une condition. Deuxièmement, la signature du biomarqueur lors d'une intervention clinique modèle (jeûne thérapeutique) sera validée et suivie pour prédire les résultats du traitement. Troisièmement, des microbes et des molécules seront criblés dans des modèles HuMiX gut-on-chip personnalisés pour identifier de nouveaux composés anti-inflammatoires. En fournissant des informations mécanistes sur la base moléculaire des interactions homme-microbiome, le projet générera de nouvelles connaissances essentielles sur les relations causales entre le microbiome intestinal et le système immunitaire dans la santé et la maladie. En facilitant l'élucidation de molécules dérivées du microbiome actuellement inconnues, il identifiera de nouveaux gènes, protéines, métabolites et voies hôtes pour le développement de futures applications diagnostiques et thérapeutiques.

Type d'étude

Interventionnel

Inscription (Réel)

183

Phase

  • N'est pas applicable

Contacts et emplacements

Cette section fournit les coordonnées de ceux qui mènent l'étude et des informations sur le lieu où cette étude est menée.

Lieux d'étude

  • Allemagne
      • Berlin, Allemagne, 14109
        • Charité Hochschulambulanz für Naturheilkunde am Immanuel Krankenhaus
    • Hessen
      • Kassel, Hessen, Allemagne, 34128
        • Paracelsus-Elena-Klinik Kassel

Critères de participation

Les chercheurs recherchent des personnes qui correspondent à une certaine description, appelée critères d'éligibilité. Certains exemples de ces critères sont l'état de santé général d'une personne ou des traitements antérieurs.

Critère d'éligibilité

Âges éligibles pour étudier

14 ans à 75 ans (Adulte, Adulte plus âgé)

Accepte les volontaires sains

Oui

La description

Critère d'intégration:

  • Un des diagnostics suivants : polyarthrite rhumatoïde (premier diagnostic il y a > 6 semaines et
  • Les individus témoins ("en bonne santé") doivent être sans aucun signe de PR active, connue ou traitée, sans aucun signe de maladie du système nerveux central active, connue ou traitée, et sans antécédents familiaux connus de MP idiopathique
  • Arthrite dans au moins une articulation
  • Les individus témoins doivent correspondre le plus possible aux individus PR ou PD, en particulier leur âge, leur sexe et leur éducation
  • Présenter la déclaration écrite de consentement
  • Consentement au prélèvement et à l'utilisation des échantillons
  • Capacité à comprendre les informations du patient et volonté de signer le formulaire de consentement

Critère d'exclusion:

  • goutte ou arthrite bactérienne avérée
  • Maladie psychiatrique qui limite la compréhension du protocole d'examen (incapable de consentir)
  • IMC < 18,5
  • Troubles alimentaires préexistants / actuels (boulimie mentale, anorexie mentale) au cours des 5 dernières années.
  • Maladies internes graves (par ex. insuffisance rénale avec créatinine > 2mg/dl)
  • Participation à une autre étude
  • Régime végétalien existant ou jeûne au cours des 6 derniers mois
  • Grossesse ou allaitement
  • Maladie intestinale inflammatoire chronique
  • Utilisation d'antibiotiques au cours des 12 derniers mois
  • Présence d'anémie

Plan d'étude

Cette section fournit des détails sur le plan d'étude, y compris la façon dont l'étude est conçue et ce que l'étude mesure.

Comment l'étude est-elle conçue ?

Détails de conception

  • Objectif principal: Recherche sur les services de santé
  • Répartition: Non randomisé
  • Modèle interventionnel: Affectation à un seul groupe
  • Masquage: Aucun (étiquette ouverte)

Armes et Interventions

Groupe de participants / Bras
Intervention / Traitement
Expérimental: RA - bras longitudinal
Autre: Jeûne
Les patients subissent une période de jeûne de 5 à 10 jours avec un apport énergétique alimentaire de 350 à 400 kcal par jour avec des jus de fruits et de légumes ou, si cela n'est pas possible, un régime établi imitant le jeûne de 600 à 800 kcal selon Longo et al.
Expérimental: PD - bras longitudinal
Autre: Jeûne
Les patients subissent une période de jeûne de 5 à 10 jours avec un apport énergétique alimentaire de 350 à 400 kcal par jour avec des jus de fruits et de légumes ou, si cela n'est pas possible, un régime établi imitant le jeûne de 600 à 800 kcal selon Longo et al.
Aucune intervention: RA - bras transversal
Aucune intervention: PD - bras transversal
Aucune intervention: Témoins sains - bras transversal

Que mesure l'étude ?

Principaux critères de jugement

Mesure des résultats
Description de la mesure
Délai
Caractérisation du microbiote intestinal
Délai: Passage par rapport à la ligne de base à 12 mois
Typage moléculaire du microbiote intestinal par séquençage et analyse à haut débit d'échantillons de selles (métagénomique, métatranscriptomique, métaprotéomique, métabolomique)
Passage par rapport à la ligne de base à 12 mois

Mesures de résultats secondaires

Mesure des résultats
Description de la mesure
Délai
Tension artérielle au repos
Délai: Passage par rapport à la ligne de base à 12 mois
Passage par rapport à la ligne de base à 12 mois
Rythme cardiaque
Délai: Passage par rapport à la ligne de base à 12 mois
Passage par rapport à la ligne de base à 12 mois
Circonférence abdominale
Délai: Passage par rapport à la ligne de base à 12 mois
Passage par rapport à la ligne de base à 12 mois
Rapport taille/hanche
Délai: Passage par rapport à la ligne de base à 12 mois
Passage par rapport à la ligne de base à 12 mois
Indice de masse corporelle (kg/m2)
Délai: Passage par rapport à la ligne de base à 12 mois
Passage par rapport à la ligne de base à 12 mois
Score d'activité de la maladie 28 (DAS-28-CRP)
Délai: Passage par rapport à la ligne de base à 12 mois
Changement par rapport à la ligne de base dans le DAS-28-CRP, allant de 2,0 à 10,0 tandis que des valeurs plus élevées signifient une activité plus élevée de la maladie et en dessous de 2,6, une rémission
Passage par rapport à la ligne de base à 12 mois
Questionnaire d'évaluation de la santé (HAQ)
Délai: Passage par rapport à la ligne de base à 12 mois
Changement par rapport à la ligne de base dans le HAQ, allant de 0 à 3 tandis que des valeurs plus élevées signifient un degré d'invalidité plus élevé
Passage par rapport à la ligne de base à 12 mois
Score simplifié de l'indice d'activité de la maladie (SDAI)
Délai: Passage par rapport à la ligne de base à 12 mois
Changement par rapport à la ligne de base dans le SDAI, plage de 0 à 86 avec une plage supposée de 0,1 à 10 mg/dL pour la CRP. Des valeurs plus élevées signifient une activité plus élevée de la maladie et une valeur inférieure à 34 signifie une rémission.
Passage par rapport à la ligne de base à 12 mois
Questionnaire sur les capacités fonctionnelles de Hanovre (Funktionsfragebogen Hannover, FFbH-R)
Délai: Passage par rapport à la ligne de base à 12 mois
Changement par rapport à la ligne de base dans le FFbH-R, allant de 0 à 100 % tandis que des valeurs plus élevées signifient un niveau supérieur de capacité fonctionnelle
Passage par rapport à la ligne de base à 12 mois
MDS-UPDRS
Délai: Passage par rapport à la ligne de base à 12 mois
Révision parrainée par la Movement Disorders Society de l'échelle d'évaluation unifiée de la maladie de Parkinson, parties I, II, IV (MDS-UPDRS parties I, II, IV). Plage de score total : 0-260 (y compris le MDS-UPDRS partie III), comprenant 4 sous-catégories. Les sous-catégories sont additionnées pour calculer le score total. Un score inférieur signifie un meilleur résultat.
Passage par rapport à la ligne de base à 12 mois
Échelle de sommeil de la maladie de Parkinson-2 (PDSS-2)
Délai: Passage par rapport à la ligne de base à 12 mois
L'échelle 2 du sommeil de la maladie de Parkinson (PDSS-2) est conçue pour évaluer l'incapacité nocturne dans la maladie de Parkinson. Le PDSS-2 est une échelle analogique de 15 questions qui classe les réponses de 0 à 4, 4 étant le pire. (La question 1 est une exception, où 4 est meilleur et 0 est pire). En plus d'une évaluation globale de l'incapacité de sommeil, trois aspects des problèmes de sommeil peuvent être obtenus ; troubles du sommeil (total des questions 1-3, 8 et 14), symptômes moteurs nocturnes spécifiques à la MP (total des questions 4-6, 12 et 13) et symptômes nocturnes spécifiques à la MP (total des questions 7, 9-11 et 15).
Passage par rapport à la ligne de base à 12 mois
Questionnaire sur la maladie de Parkinson-39 (PDQ-39)
Délai: Passage par rapport à la ligne de base à 12 mois
Le questionnaire de 39 questions sur la maladie de Parkinson (PDQ-39) est une échelle d'évaluation de la qualité de vie rapportée par les patients dans la maladie de Parkinson. Les répondants affirment s'ils ont rencontré des problèmes dus à leur maladie en utilisant une échelle de cinq points allant de jamais (0 point) à toujours (4 points, ou pire) dans la réalisation d'activités courantes. Le PDQ-39 comprend 8 domaines : mobilité, émotion, activités de la vie quotidienne, cognition, stigmatisation, soutien social, communication, inconfort corporel. Gamme totale de scores possibles = 0 - 156, les scores les plus élevés représentant une gravité plus faible.
Passage par rapport à la ligne de base à 12 mois
Questionnaire sur les symptômes non moteurs (NMSQ)
Délai: Passage par rapport à la ligne de base à 12 mois
Le questionnaire sur les symptômes non moteurs (SMN) peut être remis aux personnes atteintes de la maladie de Parkinson afin d'aider les professionnels de la santé et des services sociaux à évaluer leurs symptômes non moteurs. Le questionnaire sur les symptômes non moteurs est un questionnaire en 30 points basé sur le patient. utilisé pour déterminer les symptômes non moteurs ressentis par le patient au cours du mois écoulé. Les points doivent être totalisés pour donner une note sur 30. Un score inférieur à 10 est léger, 10-20 modéré et supérieur à 20, sévère.
Passage par rapport à la ligne de base à 12 mois
Échelle des symptômes non moteurs (NMSS)
Délai: Passage par rapport à la ligne de base à 12 mois
L'échelle des symptômes non moteurs (NMSS) mesure la fréquence et la sévérité d'une gamme de symptômes non moteurs dans la maladie de Parkinson, à travers 30 questions regroupées en 9 domaines : cardiovasculaire, sommeil/fatigue, humeur/cognition, problèmes de perception/hallucinations, attention /mémoire, tractus gastro-intestinal, urinaire, fonction sexuelle et divers (douleur, goût/odorat, changement de poids, transpiration excessive). La gravité est évaluée sur une échelle de 0 (aucune) à 3 (sévère). La fréquence est notée sur une échelle de 1 (rarement) à 4 (très fréquent). Les scores des items sont calculés comme le produit de la gravité et de la fréquence ; le score total est obtenu en additionnant les scores des items. Le score total NMSS varie de 0 à 360, un score inférieur indiquant moins de symptômes. Un changement négatif par rapport au départ indique une amélioration des symptômes (score réduit).
Passage par rapport à la ligne de base à 12 mois
Questionnaire sur le stress (Cohen Perceived Stress Scale, CPSS)
Délai: Passage par rapport à la ligne de base à 12 mois
Changement par rapport à la ligne de base dans le SCSP, plage de 0 à 4 dans chaque élément. Les scores sont obtenus en inversant les réponses (par exemple, 0 = 4, 1 = 3, 2 = 2, 3 = 1 et 4 = 0) aux éléments énoncés positivement, puis en additionnant tous les éléments de l'échelle, les valeurs plus élevées signifiant un degré plus élevé de perception. stresser.
Passage par rapport à la ligne de base à 12 mois
Questionnaire de qualité de vie (OMS-5)
Délai: Passage par rapport à la ligne de base à 12 mois
Changement par rapport à la ligne de base dans l'OMS-5, plage de 0 à 100 %, des valeurs plus élevées signifiant un niveau de bien-être plus élevé
Passage par rapport à la ligne de base à 12 mois
Échelle hospitalière d'anxiété et de dépression (HADS)
Délai: Passage par rapport à la ligne de base à 12 mois
Évaluation à pleine échelle, plage de 0 à 42, score inférieur signifiant un meilleur résultat
Passage par rapport à la ligne de base à 12 mois
Questionnaire d'humeur (Profile of Mood States, POMS)
Délai: Passage par rapport à la ligne de base à 12 mois
Le changement par rapport à la ligne de base de la détresse émotionnelle sera mesuré à l'aide de la version courte de la version allemande du profil des états d'humeur (ASTS) (19 éléments, échelle de Likert à 7 points ; 0 = pas du tout, 6 = extrêmement). Des scores plus faibles indiquent des profils d'humeur plus stables.
Passage par rapport à la ligne de base à 12 mois
Mesures sociodémographiques
Délai: Ligne de base
Âge, sexe, niveau d'éducation, revenu du ménage, statut d'emploi, état matrimonial, langue parlée, antécédents familiaux complets, maladies et comorbidités actuelles et antérieures, et médicaments actuels
Ligne de base
Facteurs comportementaux
Délai: Passage par rapport à la ligne de base à 12 mois
L'inactivité physique, le café, les activités de promotion de la santé via les échelles de Likert, vont de 0 à 5 tandis que des valeurs plus élevées signifient un degré d'accord plus élevé
Passage par rapport à la ligne de base à 12 mois
Comportement alimentaire
Délai: Passage par rapport à la ligne de base à 12 mois
FFQ modifié enregistrant le comportement alimentaire tel que les heures de repas, la fréquence de l'apport alimentaire, les préférences alimentaires, les expériences de jeûne
Passage par rapport à la ligne de base à 12 mois
Facteurs comportementaux : consommation d'alcool
Délai: Passage par rapport à la ligne de base à 12 mois
Nombre de boissons alcoolisées en moyenne par semaine au cours du dernier mois
Passage par rapport à la ligne de base à 12 mois
Facteurs comportementaux : fumer
Délai: Ligne de base
Statut tabagique en paquets-années
Ligne de base
Questions sur les attentes
Délai: Ligne de base
Pour le jeûne sur une échelle de Likert en 5 points de 1 (rien du tout) à 5 (très fort)
Ligne de base
Numération sanguine différentielle
Délai: Passage par rapport à la ligne de base à 12 mois
Passage par rapport à la ligne de base à 12 mois
Transaminases hépatiques (GPT, GOT) et Gamma glutamyl transpeptidase (y-GT)
Délai: Passage par rapport à la ligne de base à 12 mois
GPT en unités par litre (U/L) GOT (U/L) y-GT (U/L)
Passage par rapport à la ligne de base à 12 mois
Bilirubine (totale, directe, indirecte en mg/dL)
Délai: Passage par rapport à la ligne de base à 12 mois
Passage par rapport à la ligne de base à 12 mois
Protéines totales en grammes par litre (g/L)
Délai: Passage par rapport à la ligne de base à 12 mois
Passage par rapport à la ligne de base à 12 mois
Albumine en grammes par litre (g/L)
Délai: Passage par rapport à la ligne de base à 12 mois
Passage par rapport à la ligne de base à 12 mois
Créatinine en µmol par litre (µmol/L)
Délai: Passage par rapport à la ligne de base à 12 mois
Passage par rapport à la ligne de base à 12 mois
Débit de filtration glomérulaire estimé (DFGe) en millilitres par minute (mL/min)
Délai: Passage par rapport à la ligne de base à 12 mois
Passage par rapport à la ligne de base à 12 mois
Phosphatase alcalique en unités par litre (U/L)
Délai: Passage par rapport à la ligne de base à 12 mois
Passage par rapport à la ligne de base à 12 mois
Urée en milligrammes par décilitre (mg/dL)
Délai: Passage par rapport à la ligne de base à 12 mois
Passage par rapport à la ligne de base à 12 mois
Lipides sanguins et glycémie à jeun
Délai: Passage par rapport à la ligne de base à 12 mois
  • triglycérides (mmol/L)
  • cholestérol total (mmol/L)
  • LDL (mmol/L)
  • HDL (mmol/L)
  • glycémie à jeun (mmol/L)
Passage par rapport à la ligne de base à 12 mois
HbA1C (mmol/mol Hb, %)
Délai: Passage par rapport à la ligne de base à 12 mois
Passage par rapport à la ligne de base à 12 mois
TSH (mU/L)
Délai: Passage par rapport à la ligne de base à 12 mois
Passage par rapport à la ligne de base à 12 mois
IGF-1 (ng/ml)
Délai: Passage par rapport à la ligne de base à 12 mois
Passage par rapport à la ligne de base à 12 mois
Insuline (mU/L)
Délai: Passage par rapport à la ligne de base à 12 mois
Passage par rapport à la ligne de base à 12 mois
CrP très sensible (mg/L)
Délai: Passage par rapport à la ligne de base à 12 mois
Évaluer les changements dans les niveaux de hs-CrP chez les participants atteints de PR
Passage par rapport à la ligne de base à 12 mois
Facteur rhumatoïde (FR, IgM) (U/mL)
Délai: Ligne de base
Évaluer le statut RF chez les participants atteints de PR
Ligne de base
Peptide citrulliné anti-cyclique (ACPA) (U/mL)
Délai: Passage par rapport à la ligne de base à 12 mois
Évaluer le changement des niveaux d'ACPA chez les participants atteints de PR
Passage par rapport à la ligne de base à 12 mois
Zonuline (ng/mL)
Délai: Passage par rapport à la ligne de base à 12 mois
Passage par rapport à la ligne de base à 12 mois
Protéine de liaison aux acides gras 2 (FABP2) (pg/mL)
Délai: Passage par rapport à la ligne de base à 12 mois
Passage par rapport à la ligne de base à 12 mois
Calprotectine plasmatique (µg/g)
Délai: Passage par rapport à la ligne de base à 12 mois
Passage par rapport à la ligne de base à 12 mois
Calprotectine fécale (µg/g)
Délai: Passage par rapport à la ligne de base à 12 mois
Passage par rapport à la ligne de base à 12 mois
Phénotypage des cellules immunitaires
Délai: Passage par rapport à la ligne de base à 12 mois
Détermination des paramètres cytométriques qui indiquent des changements dans l'activation cellulaire ou des changements quantitatifs dans la taille absolue et/ou relative des sous-populations (par ex. monocytes classiques/intermédiaires/non classiques, lymphocytes T naïfs et mémoire, différenciation des lymphocytes B en plasmablastes/cellules) Analyse de l'expression génique des cellules immunitaires avec les puces à génome entier Affymetrix et RNAseq pour rechercher des modèles de transcription et des marqueurs qui aident à identifier les (sous-)populations de cellules immunitaires pertinentes, qui ne sont pas encore incluses dans le dépistage phénotypique cytométrique
Passage par rapport à la ligne de base à 12 mois
Métabolomique urinaire (10 ml d'urine médiane)
Délai: Passage par rapport à la ligne de base à 12 mois
Passage par rapport à la ligne de base à 12 mois
Analyse du microbiote oral dans la salive
Délai: Passage par rapport à la ligne de base à 12 mois
Passage par rapport à la ligne de base à 12 mois

Collaborateurs et enquêteurs

C'est ici que vous trouverez les personnes et les organisations impliquées dans cette étude.

Parrainer

Andreas Michalsen

Collaborateurs

Luxembourg Centre for Systems Biomedicine
Paracelsus-Elena-Klinik Kassel

Les enquêteurs

  • Chercheur principal: Andreas Michalsen, Prof. Dr. med., Charité - Universitätsmedizin Berlin

Dates d'enregistrement des études

Ces dates suivent la progression des dossiers d'étude et des soumissions de résultats sommaires à ClinicalTrials.gov. Les dossiers d'étude et les résultats rapportés sont examinés par la Bibliothèque nationale de médecine (NLM) pour s'assurer qu'ils répondent à des normes de contrôle de qualité spécifiques avant d'être publiés sur le site Web public.

Dates principales de l'étude

Début de l'étude (Réel)

21 avril 2021

Achèvement primaire (Réel)

26 septembre 2023

Achèvement de l'étude (Réel)

26 septembre 2023

Dates d'inscription aux études

Première soumission

14 avril 2021

Première soumission répondant aux critères de contrôle qualité

14 avril 2021

Première publication (Réel)

15 avril 2021

Mises à jour des dossiers d'étude

Dernière mise à jour publiée (Réel)

29 janvier 2024

Dernière mise à jour soumise répondant aux critères de contrôle qualité

26 janvier 2024

Dernière vérification

1 janvier 2024

Plus d'information

Termes liés à cette étude

Termes MeSH pertinents supplémentaires

Autres numéros d'identification d'étude

  • ExpoBiome

Plan pour les données individuelles des participants (IPD)

Prévoyez-vous de partager les données individuelles des participants (DPI) ?

INDÉCIS

Description du régime IPD

On ne sait pas encore s'il y aura un plan pour rendre l'IPD disponible.

Informations sur les médicaments et les dispositifs, documents d'étude

Étudie un produit pharmaceutique réglementé par la FDA américaine

Non

Étudie un produit d'appareil réglementé par la FDA américaine

Non

Ces informations ont été extraites directement du site Web clinicaltrials.gov sans aucune modification. Si vous avez des demandes de modification, de suppression ou de mise à jour des détails de votre étude, veuillez contacter register@clinicaltrials.gov. Dès qu'un changement est mis en œuvre sur clinicaltrials.gov, il sera également mis à jour automatiquement sur notre site Web .

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