Dechiffrere virkningen av eksponeringer fra tarmmikrobiom-avledet molekylkompleks i menneskers helse og sykdommer (ExpoBiome)
26. januar 2024 oppdatert av: Andreas Michalsen
ExpoBiome-prosjektet vil analysere virkningen av faste på pasienter med Parkinsons sykdom (PD) eller revmatoid artritt (RA) på et klinisk nivå, samt effekten av faste på deres immunsystem og tarmmikrobiota. ExpoBiome vil kombinere metagenomikk og andre "omics" [meta-transkriptomikk, meta-proteomikk og (meta-)metabolomikk], bioinformatiske analyser og biostatistikk under et systembiologisk rammeverk for å få ny mekanistisk innsikt i interaksjoner mellom mikrobiom og immunsystem i sammenheng med kroniske sykdommer med inflammatoriske signaturer.
I tillegg til en engangs tverrsnittsstudie av friske deltakere, planlegges pasienter med RA og PD en longitudinell fastestudie med to armer (RA og PD).
Studieoversikt
Detaljert beskrivelse
Det menneskelige tarmmikrobiomet er et komplekst økosystem som bidrar med viktige funksjoner til menneskets fysiologi. Endringer i mikrobiomet er assosiert med flere kroniske sykdommer preget av betennelse, inkludert nevrodegenerative og autoimmune sykdommer. Mikrobiom-avledede effektormolekyler som omfatter nukleinsyrer, (poly)peptider og metabolitter er tilstede i høye nivåer i tarmen, men har så langt unngått systematiske studier. Dette gapet i kunnskap begrenser den mekanistiske forståelsen av mikrobiomets funksjonelle innvirkning på kroniske sykdommer som Parkinsons sykdom (PD) og revmatoid artritt (RA). Her vil for første gang en kombinasjon av avanserte høyoppløselige metoder bli integrert for å identifisere komponentene i dette molekylære komplekset og deres innvirkning på det menneskelige immunsystemet. Først vil det utføres en kvantitativ, integrert multiomisk analyse på mikrobiomprøver samlet inn fra friske individer og pasienter med nylig diagnostisert PD eller RA.
Ved å bruke kontekstualiserte forkunnskaper (ExpoBiome Map) og maskinlæringsmetoder vil vi identifisere mikrobielle molekyler assosiert med tilstandsspesifikke immunfenotyper. For det andre vil biomarkørsignaturen under en modell klinisk intervensjon (terapeutisk faste) bli validert og sporet for å forutsi behandlingsresultater. For det tredje vil mikrober og molekyler bli screenet i personlige HuMiX gut-on-chip-modeller for å identifisere nye antiinflammatoriske forbindelser. Ved å gi mekanistisk innsikt i det molekylære grunnlaget for interaksjoner mellom mennesker og mikrobiom, vil prosjektet generere viktig ny kunnskap om årsakssammenhenger mellom tarmmikrobiomet og immunsystemet i helse og sykdom. Ved å lette belysningen av foreløpig ukjente mikrobiom-avledede molekyler, vil den identifisere nye gener, proteiner, metabolitter og vertsveier for utvikling av fremtidige diagnostiske og terapeutiske applikasjoner.
Studietype
Intervensjonell
Registrering (Faktiske)
183
Fase
- Ikke aktuelt
Kontakter og plasseringer
Denne delen inneholder kontaktinformasjon for de som utfører studien, og informasjon om hvor denne studien blir utført.
Studiesteder
-
-
-
Berlin, Tyskland, 14109
- Charité Hochschulambulanz für Naturheilkunde am Immanuel Krankenhaus
-
-
Hessen
-
Kassel, Hessen, Tyskland, 34128
- Paracelsus-Elena-Klinik Kassel
-
-
Deltakelseskriterier
Forskere ser etter personer som passer til en bestemt beskrivelse, kalt kvalifikasjonskriterier. Noen eksempler på disse kriteriene er en persons generelle helsetilstand eller tidligere behandlinger.
Kvalifikasjonskriterier
Alder som er kvalifisert for studier
14 år til 75 år (Voksen, Eldre voksen)
Tar imot friske frivillige
Ja
Beskrivelse
Inklusjonskriterier:
- En av følgende diagnoser: revmatoid artritt (første diagnose for >6 uker siden og
- Kontroll ("friske") individer må være uten tegn på aktiv, kjent eller behandlet RA, uten bevis for aktiv, kjent eller behandlet sentralnervesystemsykdom, og uten en kjent familiehistorie med idiopatisk PD
- Leddgikt i minst ett ledd
- Kontrollindivider bør matche RA- eller PD-individene så tett som mulig, spesielt deres alder, kjønn og utdanning
- Presentere skriftlig samtykkeerklæring
- Samtykke til prøvetaking og prøvebruk
- Evne til å forstå pasientinformasjonen og vilje til å signere samtykkeskjemaet
Ekskluderingskriterier:
- gikt eller påvist bakteriell leddgikt
- Psykiatrisk sykdom som begrenser forståelsen av undersøkelsesprotokollen (ikke i stand til å samtykke)
- BMI < 18,5
- Eksisterende/nåværende spiseforstyrrelser (bulimia nervosa, anorexia nervosa) i løpet av de siste 5 årene.
- Alvorlige indre sykdommer (f. nyresvikt med kreatinin > 2mg/dl)
- Deltakelse i en annen studie
- Eksisterende vegansk diett eller faste de siste 6 månedene
- Graviditet eller amming
- Kronisk inflammatorisk tarmsykdom
- Bruk av antibiotika de siste 12 månedene
- Tilstedeværelse av anemi
Studieplan
Denne delen gir detaljer om studieplanen, inkludert hvordan studien er utformet og hva studien måler.
Hvordan er studiet utformet?
Designdetaljer
- Primært formål: Helsetjenesteforskning
- Tildeling: Ikke-randomisert
- Intervensjonsmodell: Enkeltgruppeoppdrag
- Masking: Ingen (Open Label)
Våpen og intervensjoner
Deltakergruppe / Arm |
Intervensjon / Behandling |
|---|---|
|
Eksperimentell: RA - langsgående arm
|
Pasienter gjennomgår en 5-10 dagers fasteperiode med en kosttilførsel av energi på 350-400 kcal per dag med frukt- og grønnsaksjuice eller, hvis det ikke er mulig, en etablert faste-liknende diett på 600-800 kcal ifølge Longo et al.
|
|
Eksperimentell: PD - langsgående arm
|
Pasienter gjennomgår en 5-10 dagers fasteperiode med en kosttilførsel av energi på 350-400 kcal per dag med frukt- og grønnsaksjuice eller, hvis det ikke er mulig, en etablert faste-liknende diett på 600-800 kcal ifølge Longo et al.
|
|
Ingen inngripen: RA - tverrsnittsarm
|
|
|
Ingen inngripen: PD - tverrsnittsarm
|
|
|
Ingen inngripen: Sunne kontroller - tverrsnittsarm
|
Hva måler studien?
Primære resultatmål
Resultatmål |
Tiltaksbeskrivelse |
Tidsramme |
|---|---|---|
|
Karakterisering av tarmmikrobiota
Tidsramme: Endre over baseline til 12 måneder
|
Molekylær typing av tarmmikrobiotaen ved bruk av sekvensering og high-throughput analyse fra avføringsprøver (metagenomics, metatranscriptomics, metaproteomics, metabolomics)
|
Endre over baseline til 12 måneder
|
Sekundære resultatmål
Resultatmål |
Tiltaksbeskrivelse |
Tidsramme |
|---|---|---|
|
Hvilende blodtrykk
Tidsramme: Endre over baseline til 12 måneder
|
Endre over baseline til 12 måneder
|
|
|
Puls
Tidsramme: Endre over baseline til 12 måneder
|
Endre over baseline til 12 måneder
|
|
|
Abdominal omkrets
Tidsramme: Endre over baseline til 12 måneder
|
Endre over baseline til 12 måneder
|
|
|
Midje til hofte-forhold
Tidsramme: Endre over baseline til 12 måneder
|
Endre over baseline til 12 måneder
|
|
|
Kroppsmasseindeks (kg/m2)
Tidsramme: Endre over baseline til 12 måneder
|
Endre over baseline til 12 måneder
|
|
|
Sykdomsaktivitetspoeng 28 (DAS-28-CRP)
Tidsramme: Endre over baseline til 12 måneder
|
Endring fra baseline i DAS-28-CRP varierer fra 2,0 til 10,0 mens høyere verdier betyr høyere sykdomsaktivitet og under 2,6 betyr remisjon
|
Endre over baseline til 12 måneder
|
|
Health Assessment Questionnaire (HAQ)
Tidsramme: Endre over baseline til 12 måneder
|
Endring fra baseline i HAQ, varierer fra 0 til 3 mens høyere verdier betyr en høyere grad av funksjonshemming
|
Endre over baseline til 12 måneder
|
|
Simplified Disease Activity Index Score (SDAI)
Tidsramme: Endre over baseline til 12 måneder
|
Endring fra baseline i SDAI, område fra 0 til 86 med antatt område fra 0,1 til 10 mg/dL for CRP.
Høyere verdier betyr høyere sykdomsaktivitet og under 34 betyr remisjon.
|
Endre over baseline til 12 måneder
|
|
Hannover Spørreskjema for funksjonelle evner (Funktionsfragebogen Hannover, FFbH-R)
Tidsramme: Endre over baseline til 12 måneder
|
Endring fra baseline i FFbH-R, varierer fra 0 til 100 % mens høyere verdier betyr en høyere grad av funksjonell kapasitet
|
Endre over baseline til 12 måneder
|
|
MDS-UPDRS
Tidsramme: Endre over baseline til 12 måneder
|
Bevegelsesforstyrrelser Samfunnssponset revisjon av Unified Parkinsons Disease Rating Scale del I, II, IV (MDS-UPDRS del I, II, IV).
Totalt poengområde: 0-260 (inkludert MDS-UPDRS del III), inkludert 4 underkategorier.
Underkategorier summeres for å beregne den totale poengsummen.
En lavere poengsum betyr et bedre resultat.
|
Endre over baseline til 12 måneder
|
|
Parkinsons sykdom søvnskala-2 (PDSS-2)
Tidsramme: Endre over baseline til 12 måneder
|
Parkinson's Disease Sleep Scale 2 (PDSS-2) er utviklet for å vurdere nattlig funksjonshemming ved Parkinsons sykdom.
PDSS-2 er en analog skala med 15 spørsmål som rangerer svar fra 0 - 4, hvor 4 er dårligere.
(Spørsmål 1 er et unntak, der 4 er bedre og 0 er dårligere).
I tillegg til en samlet vurdering av søvnvansker kan tre aspekter ved søvnproblemer oppnås; forstyrret søvn (totalt spørsmål 1-3, 8 og 14), PD-spesifikke nattlige motoriske symptomer (totalt spørsmål 4-6, 12 og 13), og PD-spesifikke nattlige symptomer (Totalt spørsmål 7, 9-11 og 15).
|
Endre over baseline til 12 måneder
|
|
Parkinsons sykdom Spørreskjema-39 (PDQ-39)
Tidsramme: Endre over baseline til 12 måneder
|
The 39 question Parkinsons Disease Questionnaire (PDQ-39) er en pasientrapportert vurderingsskala for livskvalitet ved Parkinsons sykdom.
Respondentene bekrefter at de har opplevd problemer på grunn av sykdommen ved å bruke en fempunktsskala fra aldri (0 poeng) til alltid (4 poeng eller verre) ved å gjøre vanlige aktiviteter.
PDQ-39 består av 8 domener: mobilitet, følelser, daglige aktiviteter, kognisjon, stigma, sosial støtte, kommunikasjon, kroppslig ubehag.
Total mulig rekkevidde av skårer = 0 - 156, med høyere skårer som representerer dårligere alvorlighetsgrad.
|
Endre over baseline til 12 måneder
|
|
Ikke-motoriske symptomer spørreskjema (NMSQ)
Tidsramme: Endre over baseline til 12 måneder
|
Spørreskjemaet for ikke-motoriske symptomer (NMS) kan gis til personer rammet av Parkinson for å hjelpe helse- og sosialpersonell med å vurdere deres ikke-motoriske symptomer. Spørreskjemaet for ikke-motoriske symptomer er et 30-punkts, pasientbasert spørreskjema brukes til å bestemme de ikke-motoriske symptomene pasienten har opplevd i løpet av den siste måneden.
Poengene bør summeres for å gi en poengsum på 30.
En skår på under 10 er mild, 10-20 moderat og over 20, alvorlig.
|
Endre over baseline til 12 måneder
|
|
Skala for ikke-motoriske symptomer (NMSS)
Tidsramme: Endre over baseline til 12 måneder
|
Non-Motor Symptoms Scale (NMSS) måler frekvensen og alvorlighetsgraden av en rekke ikke-motoriske symptomer ved Parkinsons sykdom, gjennom 30 spørsmål gruppert i 9 domener: kardiovaskulær, søvn/tretthet, humør/kognisjon, perseptuelle problemer/hallusinasjoner, oppmerksomhet /minne, mage-tarmkanalen, urinveier, seksuell funksjon og diverse (smerte, smak/lukt, vektendring, overdreven svette).
Alvorlighet er vurdert på en skala fra 0 (ingen) til 3 (alvorlig).
Frekvens er vurdert på en skala fra 1 (sjelden) til 4 (svært hyppig).
Varepoeng beregnes som produktet av alvorlighetsgrad og frekvens; totalpoengsummen oppnås ved å summere varepoengsummene.
Den totale NMSS-skåren varierer fra 0 til 360 med en lavere skåre som indikerer færre symptomer.
En negativ endring fra baseline indikerer bedring i symptomer (redusert skåre).
|
Endre over baseline til 12 måneder
|
|
Stress spørreskjema (Cohen Perceived Stress Scale, CPSS)
Tidsramme: Endre over baseline til 12 måneder
|
Endre fra Baseline i CPSS, varierer fra 0 til 4 i hvert element.
Poeng oppnås ved å reversere responser (f.eks. 0 = 4, 1 = 3, 2 = 2, 3 = 1 & 4 = 0) på de positivt angitte elementene og deretter summere over alle skalaelementer, høyere verdier betyr en høyere karakter av oppfattet understreke.
|
Endre over baseline til 12 måneder
|
|
Spørreskjema for livskvalitet (WHO-5)
Tidsramme: Endre over baseline til 12 måneder
|
Endring fra baseline i WHO-5, varierer fra 0 til 100 %, høyere verdier betyr en høyere grad av velvære
|
Endre over baseline til 12 måneder
|
|
Sykehusangst- og depresjonsskala (HADS)
Tidsramme: Endre over baseline til 12 måneder
|
Vurderer full skala, område 0-42, lavere poengsum betyr et bedre resultat
|
Endre over baseline til 12 måneder
|
|
Stemningsskjema (Profile of Mood States, POMS)
Tidsramme: Endre over baseline til 12 måneder
|
Endring fra baseline i emosjonell nød vil bli målt ved å bruke den tyske versjonen av profilen for humørtilstander (ASTS) kortversjon (19 elementer, 7-punkts Likert-skala; 0=ikke i det hele tatt, 6=ekstremt).
Lavere skår indikerer mer stabile humørprofiler.
|
Endre over baseline til 12 måneder
|
|
Sosiodemografiske målinger
Tidsramme: Grunnlinje
|
Alder, kjønn, utdanningsnivå, husholdningsinntekt, arbeidsstatus, sivilstand, språk som snakkes, fullstendig familiehistorie, nåværende og tidligere sykdom og komorbiditeter, og nåværende medisiner
|
Grunnlinje
|
|
Atferdsfaktorer
Tidsramme: Endre over baseline til 12 måneder
|
Fysisk inaktivitet, kaffe, helsefremmende aktiviteter via Likert-skalaer, varierer fra 0 til 5 mens høyere verdier betyr en høyere grad av enighet
|
Endre over baseline til 12 måneder
|
|
Kostholdsatferd
Tidsramme: Endre over baseline til 12 måneder
|
Modifisert FFQ registrerer kostholdsatferd som måltider, frekvens av matinntak, matpreferanser, fasteopplevelser
|
Endre over baseline til 12 måneder
|
|
Atferdsfaktorer: alkoholforbruk
Tidsramme: Endre over baseline til 12 måneder
|
Antall alkoholholdige drikkevarer i gjennomsnitt per uke siste måned
|
Endre over baseline til 12 måneder
|
|
Atferdsfaktorer: røyking
Tidsramme: Grunnlinje
|
Røykestatus i pakkeår
|
Grunnlinje
|
|
Forventningsspørsmål
Tidsramme: Grunnlinje
|
For fasting på en 5-punkts likert-skala fra 1 (ingenting i det hele tatt) til 5 (veldig sterk)
|
Grunnlinje
|
|
Differensiell blodtelling
Tidsramme: Endre over baseline til 12 måneder
|
Endre over baseline til 12 måneder
|
|
|
Levertransaminaser (GPT, GOT) og gamma glutamyl transpeptidase (y-GT)
Tidsramme: Endre over baseline til 12 måneder
|
GPT i enheter per liter (U/L) GOT (U/L) y-GT (U/L)
|
Endre over baseline til 12 måneder
|
|
Bilirubin (totalt, direkte, indirekte i mg/dL)
Tidsramme: Endre over baseline til 12 måneder
|
Endre over baseline til 12 måneder
|
|
|
Totalt protein i gram per liter (g/L)
Tidsramme: Endre over baseline til 12 måneder
|
Endre over baseline til 12 måneder
|
|
|
Albumin i gram per liter (g/L)
Tidsramme: Endre over baseline til 12 måneder
|
Endre over baseline til 12 måneder
|
|
|
Kreatinin i µmol per liter (µmol/L)
Tidsramme: Endre over baseline til 12 måneder
|
Endre over baseline til 12 måneder
|
|
|
Estimert glomerulær filtrasjonshastighet (eGFR) i milliliter per minutt (ml/min)
Tidsramme: Endre over baseline til 12 måneder
|
Endre over baseline til 12 måneder
|
|
|
Alkalisk fosfatase i enheter per liter (U/L)
Tidsramme: Endre over baseline til 12 måneder
|
Endre over baseline til 12 måneder
|
|
|
Urea i milligram per desiliter (mg/dL)
Tidsramme: Endre over baseline til 12 måneder
|
Endre over baseline til 12 måneder
|
|
|
Blodlipider og fastende glukose
Tidsramme: Endre over baseline til 12 måneder
|
|
Endre over baseline til 12 måneder
|
|
HbA1C (mmol/mol Hb, %)
Tidsramme: Endre over baseline til 12 måneder
|
Endre over baseline til 12 måneder
|
|
|
TSH (mU/L)
Tidsramme: Endre over baseline til 12 måneder
|
Endre over baseline til 12 måneder
|
|
|
IGF-1 (ng/ml)
Tidsramme: Endre over baseline til 12 måneder
|
Endre over baseline til 12 måneder
|
|
|
Insulin (mU/L)
Tidsramme: Endre over baseline til 12 måneder
|
Endre over baseline til 12 måneder
|
|
|
Høysensitiv CrP (mg/L)
Tidsramme: Endre over baseline til 12 måneder
|
Evaluer endring i hs-CrP-nivåer hos deltakere med RA
|
Endre over baseline til 12 måneder
|
|
Revmatoid faktor (RF, IgM) (U/mL)
Tidsramme: Grunnlinje
|
Evaluer RF-status hos deltakere med RA
|
Grunnlinje
|
|
Antisyklisk sitrullinert peptid (ACPA) (U/mL)
Tidsramme: Endre over baseline til 12 måneder
|
Evaluer endring i ACPA-nivåer hos deltakere med RA
|
Endre over baseline til 12 måneder
|
|
Zonulin (ng/ml)
Tidsramme: Endre over baseline til 12 måneder
|
Endre over baseline til 12 måneder
|
|
|
Fettsyrebindende protein 2 (FABP2) (pg/mL)
Tidsramme: Endre over baseline til 12 måneder
|
Endre over baseline til 12 måneder
|
|
|
Plasma Calprotectin (µg/g)
Tidsramme: Endre over baseline til 12 måneder
|
Endre over baseline til 12 måneder
|
|
|
Fekalt kalprotektin (µg/g)
Tidsramme: Endre over baseline til 12 måneder
|
Endre over baseline til 12 måneder
|
|
|
Fenotyping av immunceller
Tidsramme: Endre over baseline til 12 måneder
|
Bestemmelse av cytometriske parametere som indikerer endringer i celleaktivering eller kvantitative endringer i den absolutte og/eller relative størrelsen til subpopulasjoner (f.
klassiske/mellomliggende/ikke-klassiske monocytter, naive og minne T-celler, B-celledifferensiering til plasmablaster/-celler) Genekspresjonsanalyse av immunceller med Affymetrix helgenommikroarrayer og RNAseq for å søke etter transkripsjonelle mønstre og markører som hjelper til med å identifisere relevante immuncelle(sub-)populasjoner, som ennå ikke er inkludert i den cytometriske fenotypingsskjermen
|
Endre over baseline til 12 måneder
|
|
Urin metabolomikk (10 ml midstream urin)
Tidsramme: Endre over baseline til 12 måneder
|
Endre over baseline til 12 måneder
|
|
|
Oral mikrobiotaanalyse i spytt
Tidsramme: Endre over baseline til 12 måneder
|
Endre over baseline til 12 måneder
|
Samarbeidspartnere og etterforskere
Det er her du vil finne personer og organisasjoner som er involvert i denne studien.
Sponsor
Etterforskere
- Hovedetterforsker: Andreas Michalsen, Prof. Dr. med., Charité - Universitätsmedizin Berlin
Studierekorddatoer
Disse datoene sporer fremdriften for innsending av studieposter og sammendragsresultater til ClinicalTrials.gov. Studieposter og rapporterte resultater gjennomgås av National Library of Medicine (NLM) for å sikre at de oppfyller spesifikke kvalitetskontrollstandarder før de legges ut på det offentlige nettstedet.
Studer hoveddatoer
Studiestart (Faktiske)
21. april 2021
Primær fullføring (Faktiske)
26. september 2023
Studiet fullført (Faktiske)
26. september 2023
Datoer for studieregistrering
Først innsendt
14. april 2021
Først innsendt som oppfylte QC-kriteriene
14. april 2021
Først lagt ut (Faktiske)
15. april 2021
Oppdateringer av studieposter
Sist oppdatering lagt ut (Faktiske)
29. januar 2024
Siste oppdatering sendt inn som oppfylte QC-kriteriene
26. januar 2024
Sist bekreftet
1. januar 2024
Mer informasjon
Begreper knyttet til denne studien
Ytterligere relevante MeSH-vilkår
Andre studie-ID-numre
- ExpoBiome
Plan for individuelle deltakerdata (IPD)
Planlegger du å dele individuelle deltakerdata (IPD)?
UBESLUTTE
IPD-planbeskrivelse
Det er foreløpig ikke kjent om det vil være en plan for å gjøre IPD tilgjengelig.
Legemiddel- og utstyrsinformasjon, studiedokumenter
Studerer et amerikansk FDA-regulert medikamentprodukt
Nei
Studerer et amerikansk FDA-regulert enhetsprodukt
Nei
Denne informasjonen ble hentet direkte fra nettstedet clinicaltrials.gov uten noen endringer. Hvis du har noen forespørsler om å endre, fjerne eller oppdatere studiedetaljene dine, vennligst kontakt register@clinicaltrials.gov. Så snart en endring er implementert på clinicaltrials.gov, vil denne også bli oppdatert automatisk på nettstedet vårt. .