Impact du contexte génétique en tant que facteur de risque de maladie cardiovasculaire athéroscléreuse dans la population brésilienne (CV-GENES)
L'objectif principal de ce projet est d'évaluer l'information génomique précédemment associée aux maladies cardiovasculaires (MCV) et son importance en tant que prédicteur de risque indépendant (exprimé en Odds Ratio) lorsqu'elle est ajustée aux facteurs de risque traditionnels (tabagisme, diabète, hypertension artérielle, obésité, anxiété et dépression, alimentation inadéquate, sédentarité, consommation d'alcool et rapport apolipoprotéine B/A1 (ApoB/ApoA1).
Une étude cas-témoin non appariée portant sur des individus de plus de 18 ans sera réalisée. Les cas (N = 1867) seront inscrits juste après la survenue du premier événement cardiovasculaire athéroscléreux (infarctus aigu du myocarde, accident vasculaire cérébral et événements thrombotiques-ischémiques de l'artère périphérique). Le rapport entre les cas et les témoins sera de 1:1. Les témoins (N = 1867) seront des individus adultes de plus de 18 ans qui ont cherché des soins médicaux aux mêmes endroits pour d'autres raisons cliniques (pas de CVD) ou des individus sans aucune maladie manifeste. L'évaluation génétique sera réalisée par l'association du séquençage du génome entier à faible couverture (couverture 0,5-5x) et du séquençage de l'exome entier (couverture moyenne 30x).
Aperçu de l'étude
Statut
Les conditions
Intervention / Traitement
Description détaillée
L'étude sera menée dans environ 50 centres, comprenant les cinq régions brésiliennes. L'étude sera menée de juillet 2022 à décembre 2023. La collecte de données sera effectuée dans chaque centre consécutivement, pour les cas et les témoins, par le biais du formulaire de rapport de cas électronique (CRF).
Les cas (N = 1 867) seront sélectionnés en fonction de la survenue du premier événement cardiovasculaire athéroscléreux (infarctus aigu du myocarde, accident vasculaire cérébral et événements thrombotiques-ischémiques artériels périphériques) au cours de la phase d'hospitalisation pour la prise en charge de l'événement athérothrombotique aigu. Le rapport entre les cas et les témoins sera de 1:1. Les témoins (N = 1867) seront des individus adultes de plus de 18 ans qui ont cherché des soins médicaux aux mêmes endroits pour d'autres raisons cliniques (pas de CVD) ou des individus sans aucune maladie manifeste. Les définitions des événements athérothrombotiques aigus suivent les critères classiques d'examen clinique et complémentaire et sont basées sur les recommandations nationales et internationales. Le projet complet a été soumis au système local de l'Institutional Review Board (IRB)/National Research Ethics Commission (CONEP) et a reçu l'approbation éthique (CAAE : 56482922.2.1001.0070). Tous les cas et témoins seront invités à participer et, s'ils sont d'accord, un formulaire de consentement éclairé sera obtenu.
Les enquêteurs évalueront les expositions aux facteurs de risque traditionnels en combinaison avec des données génomiques (score de risque polygénique) dans les cas et les témoins, et ces expositions seront exprimées sous forme de rapports de cotes. Des modèles de régression logistique multiple seront construits pour ajuster et déterminer les forces d'association entre les variables démographiques, les facteurs de risque traditionnels et les données génétiques : sexe, âge, origine ethnique, poids, indice de masse corporelle, tabagisme, diabète, hypertension, obésité, anxiété et dépression, alimentation inadéquate, sédentarité, consommation d'alcool et rapport apolipoprotéine B/A1 (ApoB/ApoA1). Pour chaque variable d'association avec un plus grand risque de maladie cardiovasculaire (OR significatif), un risque attribuable sera calculé pour estimer la fraction de risque attribuable à la composante génétique (score de risque polygénique) et à d'autres variables cliniques et démographiques.
Le score de risque polygénique sera calculé selon une approche hybride en prenant en compte les caractéristiques suivantes : taille d'effet de chaque polymorphisme nucléotidique unique (SNP), nombre d'allèles d'effet observés, ploïdie de l'échantillon, nombre total de SNP inclus dans le score de risque polygénique, et le nombre de SNP non manquants dans l'échantillon. Chaque allèle à risque se verra attribuer des points dans le score de risque, et le score total sera compris entre 0 (absence d'allèles à risque) et la valeur maximale (à définir), en fonction de la distribution des allèles à risque qui seront identifiés dans le population incluse dans l'étude. L'échelle sera interprétée dans une association directe (positive), c'est-à-dire que plus le score est élevé, plus le nombre d'allèles et les tailles d'effet pondérées respectives sont élevés. Enfin, le score de risque polygénique sera ajusté aux facteurs de risque traditionnels précédemment rapportés pour la maladie cardiovasculaire athéroscléreuse afin de déterminer la fraction de risque attribuable associée au profil génomique.
Type d'étude
Inscription (Réel)
Contacts et emplacements
Lieux d'étude
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São Paulo, Brésil
- Hospital Santa Paula
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AC
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Rio Branco, AC, Brésil
- Acurácia Serviços Médicos
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Alagoas
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Maceió, Alagoas, Brésil
- Centro de Pesquisas Clínicas Dr. Marco Mota HCOR
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Bahia
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Ipiaú, Bahia, Brésil
- Hospital e Clínica São Roque
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Salvador, Bahia, Brésil
- Instituto Cárdio Pulmonar da Bahia
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CE
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Aracaju, CE, Brésil
- Centro de Pesquisa Clínica do Coração
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Ceará
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Barbalha, Ceará, Brésil
- Hospital Maternidade Sao Vicente De Paulo
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ES
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Vila Velha, ES, Brésil
- Hospital Evangélico de Vila Velha
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Vitória, ES, Brésil
- Hospital Universitário Cassiano Antônio de Moraes
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GO
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Goiânia, GO, Brésil
- Universidade Federal de Goiás - UFG
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MA
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São Luís, MA, Brésil
- Hospital Universitário da Universidade Federal do Maranhão/HU/UFMA
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MG
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Belo Horizonte, MG, Brésil
- Santa Casa de Misericordia de Belo Horizonte
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Uberaba, MG, Brésil
- Hospital de Clínicas da Universidade Federal do Triângulo Mineiro
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MS
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Campo Grande, MS, Brésil
- Hospital Universitário Maria Aparecida Pedrossian
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Mount
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Cuiabá, Mount, Brésil
- Hospital Geral Filantrópico Universitário - Assoc. de Proteção à Maternidade e Infância de Cuiabá
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PE
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Recife, PE, Brésil
- Real Hospital Português de Beneficência em Pernambuco
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PI
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Teresina, PI, Brésil
- Hospital Universitário da Universidade Federal do Piauí
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PR
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Campina Grande Do Sul, PR, Brésil
- Hospital e Maternidade Angelina Caron
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Curitiba, PR, Brésil
- Núcleo de Pesquisa Clínica S/S
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RN
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Natal, RN, Brésil
- Instituto Atena de Pesquisa Clinica
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RS
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Passo Fundo, RS, Brésil
- Associação Hospitalar Beneficente São Vicente de Paulo
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Pelotas, RS, Brésil
- Santa Casa de Misericordia de Pelotas
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Porto Alegre, RS, Brésil
- Hospital de Clinicas de Porto Alegre
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Porto Alegre, RS, Brésil
- Instituto de Cardiologia do Rio Grande do Sul
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Porto Alegre, RS, Brésil
- Hospital Nossa Senhora Da Conceicao Sa
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Santa Maria, RS, Brésil
- Hospital Universitario de Santa Maria
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Rio Grande Do Sul
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Bento Gonçalves, Rio Grande Do Sul, Brésil
- Associacao Dr. Bartholomeu Tacchini
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SE
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Aracaju, SE, Brésil
- Hospital Cirurgia
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SP
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Barueri, SP, Brésil
- Hospital Municipal de Barueri
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Campinas, SP, Brésil
- Instituto de Pesquisa Clínica de Campinas
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Campinas, SP, Brésil
- Scentryfar Pesquisa Clínica
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São José Do Rio Preto, SP, Brésil
- Fundação Faculdade de Medicina de São José do Rio Preto
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São Paulo, SP, Brésil
- Instituto Dante Pazzanese de Cardiologia
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São Paulo, SP, Brésil
- Instituto de Cardiologia HCFMUSP
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São Paulo, SP, Brésil
- Instituto de Pesquisa GNDI
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Santa Catarina
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Blumenau, Santa Catarina, Brésil
- Maestri e Kormann Consultoria Medico Cientifica
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Joinville, Santa Catarina, Brésil, 89204-250
- H&W Cardiologia LTDA
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Sao Paulo
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São Paulo, Sao Paulo, Brésil
- Hospital Alemao Oswaldo Cruz
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São Paulo
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Matão, São Paulo, Brésil
- Hospital Carlos Fenando Malzoni
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São José Do Rio Preto, São Paulo, Brésil
- Braile Hospital Dia Ltda
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Critères de participation
Critère d'éligibilité
Âges éligibles pour étudier
Accepte les volontaires sains
Méthode d'échantillonnage
Population étudiée
Les patients hospitalisés avec le premier événement athéroscléreux seront inscrits (Cas). Les patients soignés dans les mêmes hôpitaux sans événements cardiovasculaires ou sans aucune maladie manifeste seront les témoins. Le calcul de la taille de l'échantillon supposait un modèle d'hérédité dominant, dans le cadre d'une étude cas-témoin non appariée 1:1. Un échantillon de 1867 cas et 1867 contrôles aurait une puissance statistique de 90% pour détecter un OR génétique de 1,3, en supposant une fréquence allélique de 10%, en considérant un contrôle non apparié 1:1 du facteur génétique.
Une prévalence de 10% de la maladie dans la population cible a été considérée, un seuil de signification alpha de 5%, test d'hypothèse bilatéral.
La description
Critère d'intégration:
- Cas : adultes de plus de 18 ans présentant un premier événement cardiovasculaire athéroscléreux (infarctus aigu du myocarde, accident vasculaire cérébral et événements thrombotiques-ischémiques de l'artère périphérique)
- Témoins : individus adultes de plus de 18 ans qui ont recherché des soins médicaux aux mêmes endroits pour d'autres raisons cliniques (pas de maladie cardiovasculaire) ou individus sans aucune maladie manifeste
Critère d'exclusion:
- Présence antérieure d'un événement cardiovasculaire (infarctus du myocarde, accident vasculaire cérébral ou événements thrombotiques de l'artère périphérique)
- Patients déjà recrutés dans une autre étude liée au programme GENOMA Brésil.
Plan d'étude
Comment l'étude est-elle conçue ?
Détails de conception
- Modèles d'observation: Cas-témoins
- Perspectives temporelles: Éventuel
Cohortes et interventions
Groupe / Cohorte |
Intervention / Traitement |
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Cas - maladie cardiovasculaire athéroscléreuse
Patients présentant le premier événement cardiovasculaire athéroscléreux (infarctus aigu du myocarde, accident vasculaire cérébral et événements thrombotiques-ischémiques de l'artère périphérique)
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Le score de risque polygénique (PRS) regroupe les effets des variants génétiques en un seul chiffre qui prédit la prédisposition génétique à un phénotype.
Les PRS sont généralement composés de centaines à des millions de variantes génétiques, généralement des polymorphismes mononucléotidiques (SNP).
Pour chaque individu, le nombre d'allèles à risque calculé dans chaque variante est additionné et pondéré par la valeur estimée des effets obtenus (log odds ratio pour les traits à valeurs binaires ou coefficients Beta pour les traits à valeur continue) obtenus à partir d'études génomiques à grande échelle (GWAS)
Autres noms:
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Contrôle - sans maladie cardiovasculaire athéroscléreuse ou en bonne santé
Patients ayant recherché des soins médicaux au même site que les cas sans événement cardiovasculaire athéroscléreux (infarctus aigu du myocarde, accident vasculaire cérébral et événements thrombotiques-ischémiques artériels périphériques) ou les individus en bonne santé
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Le score de risque polygénique (PRS) regroupe les effets des variants génétiques en un seul chiffre qui prédit la prédisposition génétique à un phénotype.
Les PRS sont généralement composés de centaines à des millions de variantes génétiques, généralement des polymorphismes mononucléotidiques (SNP).
Pour chaque individu, le nombre d'allèles à risque calculé dans chaque variante est additionné et pondéré par la valeur estimée des effets obtenus (log odds ratio pour les traits à valeurs binaires ou coefficients Beta pour les traits à valeur continue) obtenus à partir d'études génomiques à grande échelle (GWAS)
Autres noms:
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Que mesure l'étude ?
Principaux critères de jugement
Mesure des résultats |
Description de la mesure |
Délai |
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Fraction de risque attribuable à la population mesurée pour le score de risque polygénique. L'échelle ira de 0 au nombre maximal d'allèles à risque. Plus le score est élevé, plus le nombre d'allèles à risque est élevé (pire).
Délai: jusqu'à la fin des études, en moyenne 1 an
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Fraction de risque attribuable à la population des maladies cardiovasculaires athérosclérotiques ajustée pour d'autres facteurs de risque liés à : l'alimentation, l'exercice physique, le tabagisme, l'alcoolisme, les antécédents de maladies chroniques (diabète, hypertension, dyslipidémie, etc.) et les paramètres biochimiques.
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jusqu'à la fin des études, en moyenne 1 an
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Gènes de polymorphismes comme facteur de risque indépendant de survenue d'infarctus aigu du myocarde (IAM), d'accident vasculaire cérébral et d'événements thrombotiques ischémiques artériels périphériques
Délai: jusqu'à la fin des études, en moyenne 1 an
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Comme il s'agit d'une étude cas-témoin, il n'y aura pas de suivi de la survenue d'événements cliniques.
Par conséquent, nous évaluerons les expositions aux facteurs de risque traditionnels d'événements cardiovasculaires (IM, AVC et événement athérothrombotique périphérique aigu) en combinaison avec des données génomiques (score de risque polygénique) dans les cas et les témoins, et ces expositions seront exprimées sous forme de rapports de cotes.
Des modèles de régression logistique multiple seront construits pour ajuster et déterminer les forces d'association entre les variables démographiques, les facteurs de risque traditionnels et les données génétiques
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jusqu'à la fin des études, en moyenne 1 an
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Collaborateurs et enquêteurs
Parrainer
Les enquêteurs
- Chaise d'étude: Álvaro Avezum, MD, PhD, Hospital Alemao Oswaldo Cruz
Publications et liens utiles
Publications générales
- Yusuf S, Joseph P, Rangarajan S, Islam S, Mente A, Hystad P, Brauer M, Kutty VR, Gupta R, Wielgosz A, AlHabib KF, Dans A, Lopez-Jaramillo P, Avezum A, Lanas F, Oguz A, Kruger IM, Diaz R, Yusoff K, Mony P, Chifamba J, Yeates K, Kelishadi R, Yusufali A, Khatib R, Rahman O, Zatonska K, Iqbal R, Wei L, Bo H, Rosengren A, Kaur M, Mohan V, Lear SA, Teo KK, Leong D, O'Donnell M, McKee M, Dagenais G. Modifiable risk factors, cardiovascular disease, and mortality in 155 722 individuals from 21 high-income, middle-income, and low-income countries (PURE): a prospective cohort study. Lancet. 2020 Mar 7;395(10226):795-808. doi: 10.1016/S0140-6736(19)32008-2. Epub 2019 Sep 3. Erratum In: Lancet. 2020 Mar 7;395(10226):784.
- Yusuf S, Hawken S, Ounpuu S, Dans T, Avezum A, Lanas F, McQueen M, Budaj A, Pais P, Varigos J, Lisheng L; INTERHEART Study Investigators. Effect of potentially modifiable risk factors associated with myocardial infarction in 52 countries (the INTERHEART study): case-control study. Lancet. 2004 Sep 11-17;364(9438):937-52. doi: 10.1016/S0140-6736(04)17018-9.
- Piegas LS, Avezum A, Pereira JC, Neto JM, Hoepfner C, Farran JA, Ramos RF, Timerman A, Esteves JP; AFIRMAR Study Investigators. Risk factors for myocardial infarction in Brazil. Am Heart J. 2003 Aug;146(2):331-8. doi: 10.1016/S0002-8703(03)00181-9.
- Rosengren A, Hawken S, Ounpuu S, Sliwa K, Zubaid M, Almahmeed WA, Blackett KN, Sitthi-amorn C, Sato H, Yusuf S; INTERHEART investigators. Association of psychosocial risk factors with risk of acute myocardial infarction in 11119 cases and 13648 controls from 52 countries (the INTERHEART study): case-control study. Lancet. 2004 Sep 11-17;364(9438):953-62. doi: 10.1016/S0140-6736(04)17019-0.
- O'Donnell MJ, Chin SL, Rangarajan S, Xavier D, Liu L, Zhang H, Rao-Melacini P, Zhang X, Pais P, Agapay S, Lopez-Jaramillo P, Damasceno A, Langhorne P, McQueen MJ, Rosengren A, Dehghan M, Hankey GJ, Dans AL, Elsayed A, Avezum A, Mondo C, Diener HC, Ryglewicz D, Czlonkowska A, Pogosova N, Weimar C, Iqbal R, Diaz R, Yusoff K, Yusufali A, Oguz A, Wang X, Penaherrera E, Lanas F, Ogah OS, Ogunniyi A, Iversen HK, Malaga G, Rumboldt Z, Oveisgharan S, Al Hussain F, Magazi D, Nilanont Y, Ferguson J, Pare G, Yusuf S; INTERSTROKE investigators. Global and regional effects of potentially modifiable risk factors associated with acute stroke in 32 countries (INTERSTROKE): a case-control study. Lancet. 2016 Aug 20;388(10046):761-75. doi: 10.1016/S0140-6736(16)30506-2. Epub 2016 Jul 16.
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Dates d'enregistrement des études
Dates principales de l'étude
Début de l'étude (Réel)
Achèvement primaire (Réel)
Achèvement de l'étude (Estimé)
Dates d'inscription aux études
Première soumission
Première soumission répondant aux critères de contrôle qualité
Première publication (Réel)
Mises à jour des dossiers d'étude
Dernière mise à jour publiée (Réel)
Dernière mise à jour soumise répondant aux critères de contrôle qualité
Dernière vérification
Plus d'information
Termes liés à cette étude
Mots clés
Termes MeSH pertinents supplémentaires
Autres numéros d'identification d'étude
- HAlemaoOswaldoCruz
- CAAE: 56482922.2.1001.0070 (Autre identifiant: Brazilian National Ethics Committee)
Plan pour les données individuelles des participants (IPD)
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