Impatto del background genetico come fattore di rischio per la malattia cardiovascolare aterosclerotica nella popolazione brasiliana (CV-GENES)
L'obiettivo principale di questo progetto è valutare l'informazione genomica precedentemente associata a malattie cardiovascolari (CVD) e la sua importanza come predittore di rischio indipendente (espresso in Odds Ratio) quando aggiustato per fattori di rischio tradizionali (fumo, diabete, ipertensione arteriosa, obesità, ansia e depressione, dieta inadeguata, inattività fisica, consumo di alcol e rapporto apolipoproteina B/A1 (ApoB/ApoA1).
Verrà condotto uno studio caso-controllo su individui di età superiore ai 18 anni. I casi (N = 1867) verranno arruolati subito dopo l'insorgenza del primo evento cardiovascolare aterosclerotico (Infarto Miocardico Acuto, Ictus ed Eventi Trombotico-Ischemici delle Arterie Periferiche). Il rapporto tra casi e controlli sarà 1:1. I controlli (N = 1867) saranno individui adulti di età superiore ai 18 anni che hanno cercato assistenza medica presso le stesse sedi per altri motivi clinici (senza CVD) o individui senza alcuna malattia conclamata. La valutazione genetica sarà effettuata mediante l'associazione di Low-covering Whole Genome Sequencing (copertura 0.5-5x) e Whole Exome Sequencing (copertura media 30x).
Panoramica dello studio
Stato
Condizioni
Intervento / Trattamento
Descrizione dettagliata
Lo studio sarà condotto in circa 50 centri, comprendenti le cinque regioni brasiliane. Lo studio sarà condotto da luglio 2022 a dicembre 2023. La raccolta dei dati sarà effettuata in ogni centro consecutivamente, per casi e controlli, attraverso Case Report Form (CRF) elettronico.
I casi (N = 1867) saranno selezionati in base all'insorgenza del primo evento cardiovascolare aterosclerotico (Infarto Miocardico Acuto, Ictus ed Eventi Trombotico-Ischemici Arteriosi Periferici) durante la fase di ricovero per la gestione dell'evento aterotrombotico acuto. Il rapporto tra casi e controlli sarà 1:1. I controlli (N = 1867) saranno individui adulti di età superiore ai 18 anni che hanno cercato assistenza medica nelle stesse sedi per altri motivi clinici (senza CVD) o individui senza alcuna malattia conclamata. Le definizioni di eventi aterotrombotici acuti seguono i classici criteri di esame clinico e complementare e si basano su linee guida nazionali e internazionali. Il progetto completo è stato presentato al sistema locale Institutional Review Board (IRB)/National Research Ethics Commission (CONEP) e ha ottenuto l'approvazione etica (CAAE: 56482922.2.1001.0070). Tutti i casi ei controlli saranno invitati a partecipare e, se sono d'accordo, sarà ottenuto un modulo di consenso informato.
Gli investigatori valuteranno le esposizioni ai fattori di rischio tradizionali in combinazione con i dati genomici (punteggio di rischio poligenico) sia nei casi che nei controlli e queste esposizioni saranno espresse come odds ratio. Saranno costruiti modelli di regressione logistica multipla per regolare e determinare i punti di forza dell'associazione tra variabili demografiche, fattori di rischio tradizionali e dati genetici: sesso, età, etnia, peso, indice di massa corporea, fumo, diabete, ipertensione, obesità, ansia e depressione, dieta inadeguata, inattività fisica, consumo di alcol e rapporto apolipoproteina B/A1 (ApoB/ApoA1). Per ogni variabile di associazione con una maggiore probabilità di malattia cardiovascolare (OR significativo), verrà calcolato un rischio attribuibile per stimare la frazione di rischio attribuibile alla componente genetica (Polygenic Risk Score) e ad altre variabili cliniche e demografiche.
Il punteggio di rischio poligenico sarà calcolato attraverso un approccio ibrido tenendo conto delle seguenti caratteristiche: dimensione dell'effetto di ciascun polimorfismo a singolo nucleotide (SNP), numero di alleli effetto osservati, ploidia del campione, numero totale di SNP inclusi nel punteggio di rischio poligenico, e il numero di SNP non mancanti nel campione. A ciascun allele di rischio verranno assegnati punti nel punteggio di rischio e il punteggio totale sarà compreso tra 0 (assenza di alleli di rischio) e il valore massimo (ancora da definire), in base alla distribuzione degli alleli di rischio che verranno identificati nel popolazione inclusa nello studio. La scala sarà interpretata in un'associazione diretta (positiva), cioè, maggiore è il punteggio, maggiore è il numero di alleli e le rispettive dimensioni dell'effetto ponderato. Infine, il punteggio di rischio poligenico sarà aggiustato ai fattori di rischio tradizionali precedentemente riportati per la malattia cardiovascolare aterosclerotica per determinare la frazione di rischio attribuibile associata al profilo genomico.
Tipo di studio
Iscrizione (Effettivo)
Contatti e Sedi
Luoghi di studio
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São Paulo, Brasile
- Hospital Santa Paula
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AC
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Rio Branco, AC, Brasile
- Acurácia Serviços Médicos
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Alagoas
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Maceió, Alagoas, Brasile
- Centro de Pesquisas Clínicas Dr. Marco Mota HCOR
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Bahia
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Ipiaú, Bahia, Brasile
- Hospital e Clínica São Roque
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Salvador, Bahia, Brasile
- Instituto Cárdio Pulmonar da Bahia
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CE
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Aracaju, CE, Brasile
- Centro de Pesquisa Clinica do Coracao
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Ceará
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Barbalha, Ceará, Brasile
- Hospital Maternidade Sao Vicente De Paulo
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ES
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Vila Velha, ES, Brasile
- Hospital Evangélico de Vila Velha
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Vitória, ES, Brasile
- Hospital Universitario Cassiano Antonio de Moraes
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GO
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Goiânia, GO, Brasile
- Universidade Federal de Goiás - UFG
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MA
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São Luís, MA, Brasile
- Hospital Universitário da Universidade Federal do Maranhão/HU/UFMA
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MG
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Belo Horizonte, MG, Brasile
- Santa Casa de Misericordia de Belo Horizonte
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Uberaba, MG, Brasile
- Hospital de Clínicas da Universidade Federal do Triângulo Mineiro
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MS
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Campo Grande, MS, Brasile
- Hospital Universitário Maria Aparecida Pedrossian
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Mount
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Cuiabá, Mount, Brasile
- Hospital Geral Filantrópico Universitário - Assoc. de Proteção à Maternidade e Infância de Cuiabá
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PE
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Recife, PE, Brasile
- Real Hospital Português de Beneficência em Pernambuco
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PI
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Teresina, PI, Brasile
- Hospital Universitário da Universidade Federal do Piauí
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PR
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Campina Grande Do Sul, PR, Brasile
- Hospital e Maternidade Angelina Caron
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Curitiba, PR, Brasile
- Núcleo de Pesquisa Clínica S/S
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RN
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Natal, RN, Brasile
- Instituto Atena de Pesquisa Clinica
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RS
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Passo Fundo, RS, Brasile
- Associação Hospitalar Beneficente São Vicente de Paulo
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Pelotas, RS, Brasile
- Santa Casa de Misericordia de Pelotas
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Porto Alegre, RS, Brasile
- Hospital De Clinicas De Porto Alegre
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Porto Alegre, RS, Brasile
- Instituto de Cardiologia do Rio Grande do Sul
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Porto Alegre, RS, Brasile
- Hospital Nossa Senhora Da Conceicao Sa
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Santa Maria, RS, Brasile
- Hospital Universitario de Santa Maria
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Rio Grande Do Sul
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Bento Gonçalves, Rio Grande Do Sul, Brasile
- Associacao Dr. Bartholomeu Tacchini
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SE
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Aracaju, SE, Brasile
- Hospital Cirurgia
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SP
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Barueri, SP, Brasile
- Hospital Municipal de Barueri
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Campinas, SP, Brasile
- Instituto de Pesquisa Clinica de Campinas
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Campinas, SP, Brasile
- Scentryfar Pesquisa Clínica
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São José Do Rio Preto, SP, Brasile
- Fundação Faculdade de Medicina de São José do Rio Preto
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São Paulo, SP, Brasile
- Instituto Dante Pazzanese de Cardiologia
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São Paulo, SP, Brasile
- Instituto de Cardiologia HCFMUSP
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São Paulo, SP, Brasile
- Instituto de Pesquisa GNDI
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Santa Catarina
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Blumenau, Santa Catarina, Brasile
- Maestri e Kormann Consultoria Medico Cientifica
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Joinville, Santa Catarina, Brasile, 89204-250
- H&W Cardiologia LTDA
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Sao Paulo
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São Paulo, Sao Paulo, Brasile
- Hospital Alemao Oswaldo Cruz
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São Paulo
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Matão, São Paulo, Brasile
- Hospital Carlos Fenando Malzoni
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São José Do Rio Preto, São Paulo, Brasile
- Braile Hospital Dia Ltda
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Criteri di partecipazione
Criteri di ammissibilità
Età idonea allo studio
Accetta volontari sani
Metodo di campionamento
Popolazione di studio
Saranno arruolati pazienti ricoverati con il primo evento aterosclerotico (Casi). I pazienti ricoverati negli stessi ospedali senza eventi cardiovascolari o senza alcuna malattia conclamata saranno i controlli. Il calcolo della dimensione del campione presupponeva un modello di ereditarietà dominante, all'interno di un disegno di studio caso-controllo non corrispondente 1:1. Un campione di 1867 casi e 1867 controlli avrebbe un potere statistico del 90% per rilevare un OR genetico di 1,3, assumendo una frequenza allelica del 10%, considerando un controllo spaiato 1:1 del fattore genetico.
È stata considerata una prevalenza del 10% della malattia nella popolazione target, un livello di significatività alfa del 5%, test di ipotesi bilaterale.
Descrizione
Criterio di inclusione:
- Casi: adulti di età superiore ai 18 anni con primo evento cardiovascolare aterosclerotico (infarto miocardico acuto, ictus ed eventi trombotico-ischemici delle arterie periferiche)
- Controlli: individui adulti di età superiore ai 18 anni che hanno cercato assistenza medica presso le stesse sedi per altri motivi clinici (senza CVD) o individui senza alcuna malattia conclamata
Criteri di esclusione:
- Precedente occorrenza di eventi cardiovascolari (infarto del miocardio, ictus o eventi trombotici dell'arteria periferica)
- Pazienti già reclutati in un altro studio collegato al Programma GENOMA Brasile.
Piano di studio
Come è strutturato lo studio?
Dettagli di progettazione
- Modelli osservazionali: Caso di controllo
- Prospettive temporali: Prospettiva
Coorti e interventi
Gruppo / Coorte |
Intervento / Trattamento |
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Caso - malattia cardiovascolare aterosclerotica
Pazienti con il primo evento cardiovascolare aterosclerotico (Infarto Miocardico Acuto, Ictus ed Eventi Trombotico-Ischemici delle Arterie Periferiche)
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Il punteggio di rischio poligenico (PRS) aggrega gli effetti delle varianti genetiche in un unico numero che predice la predisposizione genetica a un fenotipo.
I PRS sono tipicamente composti da centinaia a milioni di varianti genetiche, solitamente polimorfismi a singolo nucleotide (SNP).
Per ogni individuo, il numero di alleli di rischio calcolati in ciascuna variante viene sommato e ponderato per il valore stimato degli effetti ottenuti (log odds ratio per tratti con valori binari o coefficienti Beta per tratti con valore continuo) ottenuti da studi genomici su larga scala (GWAS)
Altri nomi:
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Controllo - senza malattia cardiovascolare aterosclerotica o sano
Pazienti che hanno richiesto assistenza medica presso lo stesso centro dei casi senza evento cardiovascolare aterosclerotico (infarto miocardico acuto, ictus ed eventi trombotico-ischemici delle arterie periferiche) o individui sani
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Il punteggio di rischio poligenico (PRS) aggrega gli effetti delle varianti genetiche in un unico numero che predice la predisposizione genetica a un fenotipo.
I PRS sono tipicamente composti da centinaia a milioni di varianti genetiche, solitamente polimorfismi a singolo nucleotide (SNP).
Per ogni individuo, il numero di alleli di rischio calcolati in ciascuna variante viene sommato e ponderato per il valore stimato degli effetti ottenuti (log odds ratio per tratti con valori binari o coefficienti Beta per tratti con valore continuo) ottenuti da studi genomici su larga scala (GWAS)
Altri nomi:
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Cosa sta misurando lo studio?
Misure di risultato primarie
Misura del risultato |
Misura Descrizione |
Lasso di tempo |
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Frazione di rischio attribuibile alla popolazione misurata per il punteggio di rischio poligenico. La scala va da 0 al numero massimo di alleli di rischio. Più alto è il punteggio, maggiore è il numero di alleli di rischio (peggio).
Lasso di tempo: attraverso il completamento degli studi, una media di 1 anno
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Frazione di rischio attribuibile alla popolazione di malattie cardiovascolari aterosclerotiche aggiustata per altri fattori di rischio correlati a: dieta, esercizio fisico, fumo, alcolismo, anamnesi di malattie croniche (diabete, ipertensione, dislipidemia, ecc.) e parametri biochimici.
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attraverso il completamento degli studi, una media di 1 anno
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I geni dei polimorfismi come fattore di rischio indipendente per l'insorgenza di infarto miocardico acuto (IMA), ictus ed eventi trombotico-ischemici arteriosi periferici
Lasso di tempo: attraverso il completamento degli studi, una media di 1 anno
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Poiché si tratta di uno studio caso-controllo, non ci sarà alcun follow-up per il verificarsi di eventi clinici.
Pertanto, valuteremo le esposizioni ai fattori di rischio tradizionali per eventi cardiovascolari (IM, ictus ed evento aterotrombotico periferico acuto) in combinazione con i dati genomici (punteggio di rischio poligenico) sia nei casi che nei controlli, e queste esposizioni saranno espresse come odds ratio.
Saranno costruiti modelli di regressione logistica multipla per regolare e determinare i punti di forza dell'associazione tra variabili demografiche, fattori di rischio tradizionali e dati genetici
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attraverso il completamento degli studi, una media di 1 anno
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Collaboratori e investigatori
Sponsor
Investigatori
- Cattedra di studio: Álvaro Avezum, MD, PhD, Hospital Alemao Oswaldo Cruz
Pubblicazioni e link utili
Pubblicazioni generali
- Yusuf S, Joseph P, Rangarajan S, Islam S, Mente A, Hystad P, Brauer M, Kutty VR, Gupta R, Wielgosz A, AlHabib KF, Dans A, Lopez-Jaramillo P, Avezum A, Lanas F, Oguz A, Kruger IM, Diaz R, Yusoff K, Mony P, Chifamba J, Yeates K, Kelishadi R, Yusufali A, Khatib R, Rahman O, Zatonska K, Iqbal R, Wei L, Bo H, Rosengren A, Kaur M, Mohan V, Lear SA, Teo KK, Leong D, O'Donnell M, McKee M, Dagenais G. Modifiable risk factors, cardiovascular disease, and mortality in 155 722 individuals from 21 high-income, middle-income, and low-income countries (PURE): a prospective cohort study. Lancet. 2020 Mar 7;395(10226):795-808. doi: 10.1016/S0140-6736(19)32008-2. Epub 2019 Sep 3. Erratum In: Lancet. 2020 Mar 7;395(10226):784.
- Yusuf S, Hawken S, Ounpuu S, Dans T, Avezum A, Lanas F, McQueen M, Budaj A, Pais P, Varigos J, Lisheng L; INTERHEART Study Investigators. Effect of potentially modifiable risk factors associated with myocardial infarction in 52 countries (the INTERHEART study): case-control study. Lancet. 2004 Sep 11-17;364(9438):937-52. doi: 10.1016/S0140-6736(04)17018-9.
- Piegas LS, Avezum A, Pereira JC, Neto JM, Hoepfner C, Farran JA, Ramos RF, Timerman A, Esteves JP; AFIRMAR Study Investigators. Risk factors for myocardial infarction in Brazil. Am Heart J. 2003 Aug;146(2):331-8. doi: 10.1016/S0002-8703(03)00181-9.
- Rosengren A, Hawken S, Ounpuu S, Sliwa K, Zubaid M, Almahmeed WA, Blackett KN, Sitthi-amorn C, Sato H, Yusuf S; INTERHEART investigators. Association of psychosocial risk factors with risk of acute myocardial infarction in 11119 cases and 13648 controls from 52 countries (the INTERHEART study): case-control study. Lancet. 2004 Sep 11-17;364(9438):953-62. doi: 10.1016/S0140-6736(04)17019-0.
- O'Donnell MJ, Chin SL, Rangarajan S, Xavier D, Liu L, Zhang H, Rao-Melacini P, Zhang X, Pais P, Agapay S, Lopez-Jaramillo P, Damasceno A, Langhorne P, McQueen MJ, Rosengren A, Dehghan M, Hankey GJ, Dans AL, Elsayed A, Avezum A, Mondo C, Diener HC, Ryglewicz D, Czlonkowska A, Pogosova N, Weimar C, Iqbal R, Diaz R, Yusoff K, Yusufali A, Oguz A, Wang X, Penaherrera E, Lanas F, Ogah OS, Ogunniyi A, Iversen HK, Malaga G, Rumboldt Z, Oveisgharan S, Al Hussain F, Magazi D, Nilanont Y, Ferguson J, Pare G, Yusuf S; INTERSTROKE investigators. Global and regional effects of potentially modifiable risk factors associated with acute stroke in 32 countries (INTERSTROKE): a case-control study. Lancet. 2016 Aug 20;388(10046):761-75. doi: 10.1016/S0140-6736(16)30506-2. Epub 2016 Jul 16.
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- Colares VS, Titan SM, Pereira Ada C, Malafronte P, Cardena MM, Santos S, Santos PC, Fridman C, Barros RT, Woronik V. MYH9 and APOL1 gene polymorphisms and the risk of CKD in patients with lupus nephritis from an admixture population. PLoS One. 2014 Mar 21;9(3):e87716. doi: 10.1371/journal.pone.0087716. eCollection 2014.
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Studia le date principali
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Completamento dello studio (Stimato)
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Primo inviato che soddisfa i criteri di controllo qualità
Primo Inserito (Effettivo)
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Ultimo aggiornamento pubblicato (Effettivo)
Ultimo aggiornamento inviato che soddisfa i criteri QC
Ultimo verificato
Maggiori informazioni
Termini relativi a questo studio
Parole chiave
Termini MeSH pertinenti aggiuntivi
Altri numeri di identificazione dello studio
- HAlemaoOswaldoCruz
- CAAE: 56482922.2.1001.0070 (Altro identificatore: Brazilian National Ethics Committee)
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