Diagnostic microbiologique moléculaire vs conventionnel pour les infections dans la transplantation pulmonaire (PNEUMOARRAY)

Les tests moléculaires qui détectent les organismes bactériens par des séquences d'acides nucléiques plutôt que par la culture ont le potentiel d'améliorer le délai de diagnostic des infections des voies respiratoires inférieures. Cependant, leurs caractéristiques de performance sont inconnues chez les receveurs de greffe pulmonaire.

PNEUMOARRAY est une étude prospective, incluant tous les patients âgés de plus de 18 ans qui subissent une transplantation pulmonaire à partir de septembre 2022, à l'IRCCS Fondazione Cà Granda Policlinico à Milan. Les patients ne répondant pas aux critères d'inclusion sont exclus de cette étude.

Une fibro-bronchoscopie (FBS) avec lavage broncho-alvéolaire (LBA) est réalisée, selon la pratique clinique, à la fois sur les poumons donneur et receveur. Le BAL du donneur est collecté avant la transplantation du greffon, tandis que le BAL du receveur de la greffe pulmonaire est effectué 72 heures après la transplantation. Sur chaque échantillon de BAL, à la fois du donneur et du receveur de poumon, un diagnostic moléculaire et un examen de culture sont effectués.

Le but de cette étude prospective est de comparer la technique moléculaire rapide BioFire Pneumonia Panel Filamarray et les méthodes conventionnelles basées sur la culture dans le diagnostic microbiologique sur le lavage bronchoalvéolaire des patients transplantés pulmonaires.

Le résultat principal est :

-déterminer la concordance microbiologique entre le diagnostic moléculaire et les techniques de culture conventionnelles sur lavage bronchoalvéolaire du donneur avant transplantation pulmonaire

Les résultats secondaires sont :

• déterminer la concordance microbiologique entre le diagnostic moléculaire et les techniques de culture conventionnelles sur le lavage bronchoalvéolaire du receveur, réalisé 72 heures après la transplantation pulmonaire
• déterminer la concordance microbiologique entre le diagnostic moléculaire et les techniques de culture conventionnelles dans la détection des modèles de résistance moléculaire
• déterminer la différence de temps d'obtention des résultats microbiologiques entre le diagnostic moléculaire et les techniques de culture conventionnelles
• déterminer le délai avant la décision clinique en se basant sur les techniques de diagnostic moléculaire par rapport aux techniques de culture conventionnelles

La taille de l'échantillon pour la signification statistique comprend 53 patients.

Pour la majorité des bactéries et des champignons, la culture microbiologique du BAL reste l'étalon-or pour le diagnostic, mais les cultures sont limitées par un long délai d'exécution et une sensibilité réduite chez les patients qui ont reçu un traitement anti-infectieux empirique. Dans ce contexte, un diagnostic microbiologique rapide peut être crucial pour commencer une thérapie/prophylaxie antimicrobienne ciblée et identifier les gènes codant pour la résistance, afin d'administrer une thérapie ciblée et de réduire la résistance antimicrobienne.