Molekylär vs konventionell mikrobiologisk diagnostik för infektioner vid lungtransplantation (PNEUMOARRAY)

Molekylära analyser som detekterar bakteriella organismer genom nukleinsyrasekvenser snarare än odling har potential att förbättra tiden till diagnos för nedre luftvägsinfektioner. Deras prestationsegenskaper är dock okända hos lungtransplanterade.

PNEUMOARRAY är en prospektiv studie som inkluderar alla patienter >18 år som genomgår lungtransplantation från september 2022, vid IRCCS Fondazione Cà Granda Policlinico i Milano. Patienter som inte uppfyller inklusionskriterierna exkluderas från denna studie.

En fibro-bronkoskopi (FBS) med bronchoalveolar lavage (BAL) utförs, enligt klinisk praxis, både på lungdonator och mottagare. Donators BAL samlas in före transplantattransplantation, medan BAL på lungtransplantationsmottagare utförs 72 timmar efter transplantationen. På varje BAL-prov utförs både lungdonator och mottagare, molekylär diagnostik och odlingsundersökning.

Målet med denna prospektiva studie är att jämföra den snabba molekylära tekniken BioFire Pneumonia Panel Filamarray och konventionella kulturbaserade metoder i den mikrobiologiska diagnosen av bronkoalveolär sköljning av lungtransplanterade patienter.

Det primära resultatet är:

- bestämma den mikrobiologiska överensstämmelsen mellan molekylär diagnostisk och konventionell odlingsteknik vid donatorns bronkoalveolära sköljning före lungtransplantation

Sekundära resultat är:

• bestämma den mikrobiologiska överensstämmelsen mellan molekylär diagnostisk och konventionell odlingsteknik vid mottagarens bronkoalveolära sköljning, utförd 72 timmar efter lungtransplantation
• bestämma den mikrobiologiska överensstämmelsen mellan molekylär diagnostisk och konventionell odlingsteknik för att detektera molekylär resistensmönster
• bestämma skillnaden i tid till mikrobiologiska resultat mellan molekylär diagnostisk och konventionell odlingsteknik
• fastställa tid till kliniska beslut baserat på molekylär diagnostiska tekniker jämfört med konventionella odlingstekniker

Provstorleken för statistisk signifikans inkluderar 53 patienter.

För majoriteten av bakterier och svampar är mikrobiologisk odling från BAL fortfarande guldstandarden för diagnos, men odlingar begränsas av lång omloppstid och minskad känslighet hos patienter som har fått empirisk anti-infektionsbehandling. I denna miljö kan snabb mikrobiologisk diagnos vara avgörande för att påbörja riktad antimikrobiell terapi/profylax och identifiera gener som kodar för resistens, för att administrera riktad terapi och för att minska antimikrobiell resistens.