Le système immunitaire inné intestinal chez les nouveau-nés. Développement et inflammation dans la santé et la maladie (INTINE)

1. Étude NEC 1.1. Critères d'intégration Nourrissons prématurés nés < semaine 32 de l'AG. Le nombre total à inclure sera de 200. 1.2. Critères d'exclusion Les prématurés nés avec des maladies congénitales ou d'autres affections graves peuvent différer leur participation.

Situations où le prélèvement de tissus lors d'une intervention chirurgicale est impossible ou problématique, par ex. en raison de la longueur restante de l'intestin vital, sont jugés trop courts selon la discrétion du chirurgien opératoire.

1.3. Conception de l'étude Les nourrissons seront inclus juste après la naissance après avoir obtenu leur consentement sur la base d'informations écrites et verbales. Des échantillons fécaux seront collectés dès le premier jour de la vie et chaque semaine pendant les semaines suivantes jusqu'à la sortie pour étudier la composition du microbiome fécal en relation avec le développement de NEC et l'effet du traitement médical.

En cas de développement d'une NEC nécessitant une intervention chirurgicale, l'intestin affecté sera réséqué et des stomies seront établies. Des échantillons de contenu fécal et de tissus sont prélevés dans l'intestin proximal et distal par rapport à l'intestin divisé. Au moment de l'inversion des stomies, le tissu sera collecté à la fois proximal et distal de la division pour étudier le développement de l'intestin au début de la vie ainsi que les effets nutritionnels potentiels sur la maturité intestinale. Les nourrissons qui ne subissent pas de chirurgie servent de témoins, ceux qui sont traités pour NEC avec des antibiotiques uniquement, seront inclus dans une sous-analyse comparant le microbiome des nourrissons nécessitant une intervention chirurgicale.

1.4. Échantillonnage 1.4.1. Échantillons fécaux Les échantillons fécaux sont collectés dès que possible après la naissance et une fois par semaine jusqu'à la sortie. Les matières fécales sont grattées de la couche dès leur apparition. Le montant doit correspondre à un ongle. Deux échantillons sont collectés à chaque instant. Les visages seront stockés dans un tube approprié, après prélèvement, le contenu est mélangé avec un tampon (solution saline) 1:2 avant congélation à -600 degrés C. Contenu fécal collecté lors de la chirurgie primaire et lors de l'inversion de la stomie, les échantillons sont préparés de la même manière.

1.4.2. Échantillons intestinaux Lors d'une intervention chirurgicale, un échantillon de tissu de l'extrémité proximale et distale de l'intestin réséqué et de l'intestin restant est prélevé et congelé immédiatement après le prélèvement et conservé à -800 °C. Pour pouvoir collecter autant d'échantillons de tissus que possible, notre stratégie sera de congeler au moins 4 échantillons (environ 1 cm2) du tissu réséqué ; 2 du site sain et 2 du site malade de l'intestin. Un ou plusieurs échantillons seront préparés pour une nouvelle analyse au DTU (uniquement chez les nourrissons du Rigshospitalet). Lors de l'inversion de la stomie, le tissu sera prélevé du site de la stomie et de l'extrémité proximale de l'intestin détourné. Tous les tissus seront transférés vers une biobanque hébergée par OPEN à l'hôpital universitaire d'Odense.

1.5. Résultats 1.5.1. Primaire Étudier le rôle du microbiote dans le développement de la NEC et les changements associés dans le système immunitaire intestinal chez ceux qui seront opérés 1.5.2. Secondaire : données démographiques telles que l'AG, le poids corporel, le type de naissance et le score d'Apgar. Clinique : croissance, type de nutrition, nombre de jours sous TPN, nombre de jours avec cathéter veineux central et traitement médical. 1.6. Informations et consentement Les nourrissons prématurés admis soit au Département de soins intensifs des nourrissons et des tout-petits, Rigshospitalet ou au Département de néonatalogie, OUH seront examinés pour déterminer leur éligibilité. Les informations nécessaires seront transmises aux chercheurs. Pour les enfants qui remplissent les critères d'inclusion, les parents seront approchés et informés du projet et invités à participer à l'étude et à obtenir leur consentement écrit éclairé. Le consentement des parents à participer à l'étude doit être documenté dans le dossier médical électronique du patient. Un consentement éclairé doit être obtenu avant le prélèvement de tout échantillon pour le projet. Si les parents le souhaitent, ils pourront avoir accès à un observateur parmi le personnel sans lien direct avec le projet de recherche et ils auront également la possibilité d'être accompagnés d'un évaluateur. Outre les informations écrites et orales sur l'étude, la brochure "Før du beslutter dig: Om at være forsøgsperson i sundhedsvidenskabelige forsøg" de VEK, ainsi que la brochure "Forsøgspersonens rettigheder i et sundhedsvidenskabeligt forskningsprojekt" seront remises aux parents. Si les parents consentent, ils recevront une copie du formulaire de consentement éclairé.

Si possible, un délai de réflexion de 24 heures sera proposé avant de signer le consentement éclairé, auquel cas une nouvelle rencontre (la projection) sera programmée. Si les participants n'ont pas besoin de temps pour réfléchir, la déclaration de consentement éclairé peut être signée immédiatement après la réunion d'information par la mère du participant ou les parents du participant et l'investigateur (ou l'équipe de recherche à qui cette responsabilité a été confiée par l'investigateur). . Une fois le consentement éclairé signé, le participant se verra offrir une copie. Le consentement éclairé signé est une condition préalable au démarrage du dépistage ou de toute procédure liée à l'étude.

1. Étude sur l'atrésie 1.1. Inclusion Tous les nouveau-nés et les enfants jusqu'à 1 an doivent subir une chirurgie intestinale en raison d'une atrésie à n'importe quel site de l'intestin. Une inclusion d'un total de 75 patients est prévue.

1.2. Exclusion Pour les nourrissons et les enfants, un prélèvement de tissus intestinaux compromettrait la chirurgie et la santé du patient.

1.3. Conception de l'étude Les nourrissons atteints de malformations congénitales devront subir une intervention chirurgicale programmée pour réséquer et/ou anastomoser la zone affectée de l'intestin, et certains recevront une stomie qui nécessitera une inversion ultérieure. Lors de la chirurgie primaire, des échantillons de matières fécales et de tissus intestinaux seront prélevés à proximité et à distance de la pathologie. En cas de stomie et lorsque l'enfant subira ultérieurement une intervention chirurgicale d'inversion, des échantillons de tissus des extrémités proximale et distale de l'intestin seront collectés avec des échantillons fécaux.

1.4. Échantillonnage 1.4.1. Échantillons fécaux Les échantillons fécaux sont collectés dès que possible après l'opération primaire et une fois par semaine jusqu'à la sortie. Les matières fécales sont grattées de la couche dès leur apparition. Le montant doit correspondre à un ongle. Deux échantillons sont collectés à chaque instant. Les matières fécales seront conservées dans un tube approprié, après collecte, le contenu est mélangé avec un tampon (solution saline) 1:2 avant congélation à -600 degrés C. Contenu fécal collecté lors de la chirurgie primaire et lors de l'inversion de la stomie, les échantillons sont préparés de la même manière.

1.4.2. Échantillons intestinaux Lors de la chirurgie, 2 échantillons de tissus ou plus des intestins proximaux et distaux seront prélevés. Pour pouvoir collecter autant d'échantillons de tissus que possible, notre stratégie consistera à congeler au moins 4 échantillons (environ 1 cm2) du tissu réséqué ; 2 de la partie proximale et distale, respectivement. Un ou plusieurs échantillons seront préparés pour une nouvelle analyse au DTU (uniquement chez les nourrissons du Rigshospitalet). La même procédure sera effectuée lors de l'inversion de la stomie. Tous les tissus seront, après la fin de l'étude, transférés vers une biobanque hébergée par OPEN à l'hôpital universitaire d'Odense.

1.5. Résultats : 1.5.1. Constitution primaire et développement du système immunitaire intestinal et colonisation bactérienne intestinale dans le temps 1.5.2. Données démographiques secondaires telles que l'AG, le poids corporel, le type de naissance et le score d'Apgar. Clinique : croissance, type de nutrition, traitement médical et évolution de la maladie. 1.6. Information et consentement Les nourrissons nés avec une malformation congénitale du tractus gastro-intestinal nécessitant une intervention chirurgicale seront examinés pour déterminer leur éligibilité. Les informations nécessaires seront transmises aux chercheurs. Pour les enfants qui remplissent les critères d'inclusion, les parents seront approchés et informés du projet et invités à participer à l'étude et à obtenir leur consentement écrit éclairé. Le consentement des parents à participer à l'étude doit être documenté dans le dossier médical électronique du patient. Un consentement éclairé doit être obtenu avant le prélèvement de tout échantillon pour le projet. Les informations écrites et orales seront effectuées par le personnel du Département de soins intensifs des nourrissons et des tout-petits, Rigshospitalet, Département de chirurgie pédiatrique, Rigshospitalet, Département de chirurgie pédiatrique, OUH ou le Département de Néonatalogie, OUH. Si la famille le souhaite, elle pourra avoir accès à un observateur parmi le personnel sans lien direct avec le projet de recherche et elle aura également la possibilité d'être accompagnée d'un évaluateur. Outre les informations écrites et orales sur l'étude, la brochure "Før du beslutter dig: Om at være forsøgsperson i sundhedsvidenskabelige forsøg" de VEK, ainsi que la brochure "Forsøgspersonens rettigheder i et sundhedsvidenskabeligt forskningsprojekt" seront remises aux parents. Si les parents consentent, ils recevront une copie du formulaire de consentement éclairé.

Si possible, une période de réflexion de quelques heures pendant la période d'attente pour la chirurgie sera proposée avant de signer le consentement éclairé. Si les participants n'ont pas besoin de temps pour réfléchir, la déclaration de consentement éclairé peut être signée immédiatement après la réunion d'information par la mère du participant ou les parents du participant et l'investigateur (ou l'équipe de recherche à qui cette responsabilité a été confiée par l'investigateur). . Une fois le consentement éclairé signé, le participant se verra offrir une copie. Le consentement éclairé signé est une condition préalable au démarrage de toute procédure liée à l’étude.