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Approche d'apprentissage automatique pour étudier les interactions entre l'environnement et l'homéostasie des tissus intestinaux dans les MII

2 novembre 2023 mis à jour par: Silvio Danese, IRCCS San Raffaele

Approche d'apprentissage automatique et technologies IoT pour démêler l'interaction complexe entre les facteurs environnementaux et l'homéostasie des tissus intestinaux dans les troubles inflammatoires chroniques : colmater les fuites intestinales

La barrière épithéliale intestinale est l’un des points de contrôle de sécurité les plus importants de notre corps. Elle empêche les facteurs nocifs d’envahir les surfaces muqueuses et facilite l’absorption des nutriments et de l’eau. Son bon fonctionnement est essentiel au maintien de l’homéostasie du tissu intestinal et d’une bonne immunité. Cependant, un tel équilibre peut être interrompu, entraînant une entrée incontrôlée de stimuli pathogènes qui, à leur tour, activent une réponse immunitaire intestinale persistante, avec des conséquences néfastes sur l’immunité locale et systémique. Les modifications de la composition et de la fonctionnalité du microbiome intestinal semblent être un facteur central affectant l’intégrité de la barrière intestinale, influençant ainsi la perméabilité intestinale. La composition du microbiome est influencée par les habitudes alimentaires, la pollution et les conditions environnementales, l’hygiène, le patrimoine génétique et l’activité physique, qui pourraient interagir de concert conduisant à une dysbiose, influençant ainsi la réponse immunitaire par la production de plusieurs métabolites. Les maladies inflammatoires chroniques, notamment la colite ulcéreuse (CU) et le diabète de type 1 (DT1), partagent la dysbiose du microbiote, parmi les caractéristiques pathologiques, qui peuvent survenir, être provoquées ou exacerbées en raison d'une fuite de barrière. Par conséquent, ces deux maladies chroniques peuvent être considérées comme des pathologies prototypes où le lien intrinsèque entre la dysbiose intestinale et la fuite de la barrière s’influencent mutuellement au cours de la pathogenèse.

Aperçu de l'étude

Description détaillée

Il s'agit d'une étude observationnelle multicentrique réalisée sur des patients avec un diagnostic établi de CU (selon la classification standard) et des patients atteints d'un diabète de type 1 (DT1) d'apparition récente qui vise à identifier les facteurs environnementaux et génétiques contribuant à l'inflammation chronique au sein de l'intestin et dans les organes périphériques en tirant parti des technologies Internet-Of Things (IoT) (web app) et des approches d'apprentissage automatique. Lors de la procédure de coloscopie prévue pour les patients atteints de CU suite à la surveillance de routine selon la pratique clinique normale (0 et 12 mois), le gastro-entérologue prélèvera 8 biopsies supplémentaires ; de plus, des échantillons de sang et des selles pour les patients atteints de CU et des échantillons de sang, des selles et des urines pour les patients atteints de DT1 seront collectés au départ et pendant la surveillance de routine selon la pratique clinique normale (0, 6 et 12 mois) et conservés pour les périodes suivantes analyse. Pour les patients atteints de DT1, le prélèvement d'échantillons de sang, d'urine et de selles n'est pas prévu pour la pratique clinique normale, mais sera effectué spécifiquement pour cette proposition de recherche à différents moments de la visite clinique normale de pratique clinique : référence, après 6 mois et après 12 mois.

Pour les patients atteints de CU, du sang et des biopsies sont prélevés au cours des procédures déjà prévues pour la pratique clinique normale lors de la surveillance clinique. Les enquêteurs profiteront de ces procédures de soins standard pour collecter un volume de sang supplémentaire (au départ, après 6 mois et après 12 mois). Par conséquent, les patients exprimant leur participation volontaire à l'étude seront invités à donner des échantillons fécaux lors de la visite de surveillance de routine (conformément à la pratique clinique normale) à différents moments : au départ, après 6 mois et après 12 mois.

Ospedale San Raffaele (OSR - Operative Unit (UO)1 (UO1)) est le promoteur de cette étude. Les autres centres participant à l'étude sont :

  • Hôpital Casa Sollievo della Sofferenza (CSS) - Foggia (UO2)
  • Azienda Ospedaliera San Camillo Forlanini - Roma (UO3) 150 sujets au total (100 patients atteints de CU et 50 patients atteints de DT1) seront inscrits au Centre IBD (Département de gastroentérologie et d'endoscopie digestive) et à l'unité pédiatrique de l'Ospedale San Raffaele.

Type d'étude

Observationnel

Inscription (Estimé)

300

Contacts et emplacements

Cette section fournit les coordonnées de ceux qui mènent l'étude et des informations sur le lieu où cette étude est menée.

Lieux d'étude

      • Milan, Italie
        • IRCCS Ospedale San Raffaele

Critères de participation

Les chercheurs recherchent des personnes qui correspondent à une certaine description, appelée critères d'éligibilité. Certains exemples de ces critères sont l'état de santé général d'une personne ou des traitements antérieurs.

Critère d'éligibilité

Âges éligibles pour étudier

  • Enfant
  • Adulte
  • Adulte plus âgé

Accepte les volontaires sains

N/A

Méthode d'échantillonnage

Échantillon de probabilité

Population étudiée

La population qui sera recrutée pour la finalisation de cette étude sera composée de 300 patients (250 patients atteints de CU et 50 patients atteints de DT1) sous surveillance de routine selon la pratique clinique normale.

Veuillez noter les limites d'âge (ci-dessus) : il existe différentes limites d'âge selon le groupe :

RCH : > 18 ans DT1 : entre 7 et 17 ans

La description

Critère d'intégration:

UC :

  • patients adultes (> 18 ans)
  • diagnostic établi de CU (quelle qu'en soit l'étendue)
  • la maladie en rémission telle que définie par des selles normales/jour
  • pas de saignement rectal
  • calprotectine fécale <250 ug/g)

DT1 :

  • âge entre 7 et 17 ans
  • diagnostic clinique du diabète de type 1 insulino-dépendant
  • positivité pour au moins un autoanticorps d'îlot (ICA, GADA, IA-2, IAA, ZnT8)
  • pas plus de 3 mois après la première injection d’insuline

Critère d'exclusion:

  • consentement éclairé non signé
  • maladie cœliaque
  • autres pathologies inflammatoires intestinales
  • maladie cardiaque importante
  • affections associées à un dysfonctionnement immunitaire ou à une dyscrasie hématologique (y compris tumeur maligne, lymphopénie, thrombocytopénie ou anémie)
  • dysfonctionnement hépatique ou rénal,
  • tuberculose,
  • Infections actives par le VHB, le VHC, le VIH ou l'EBV ou le CMV

Plan d'étude

Cette section fournit des détails sur le plan d'étude, y compris la façon dont l'étude est conçue et ce que l'étude mesure.

Comment l'étude est-elle conçue ?

Détails de conception

Cohortes et interventions

Groupe / Cohorte
Intervention / Traitement
Colite ulcéreuse (CU)
Les patients seront inscrits dans tous les centres participant à cette étude : Ospedale San Raffaele - Milano, Ospedale Casa Sollievo della Sofferenza - Foggia et Azienda Ospedaliera San Camillo Forlanini - Roma comme suit : 100 patients UC à l'OSR, 75 à l'hôpital San Camillo et 75 au CSS
Au cours de la surveillance de routine selon la pratique clinique normale, des échantillons de sang, des selles et des urines seront prélevés sur des patients atteints de CU et de DT1 (0, 6 et 12 mois). De plus, pour les patients atteints de CU lors de la sigmoïdoscopie de surveillance selon la pratique clinique normale (ou coloscopie si le patient a plus de 8 ans ; lors de l'inscription et après 12 mois), des biopsies coliques seront prélevées.
Diabète de type 1 (DT1)
50 nouveaux patients atteints de DT1 recrutés et inscrits à l’OSR
Au cours de la surveillance de routine selon la pratique clinique normale, des échantillons de sang, des selles et des urines seront prélevés sur des patients atteints de CU et de DT1 (0, 6 et 12 mois). De plus, pour les patients atteints de CU lors de la sigmoïdoscopie de surveillance selon la pratique clinique normale (ou coloscopie si le patient a plus de 8 ans ; lors de l'inscription et après 12 mois), des biopsies coliques seront prélevées.

Que mesure l'étude ?

Principaux critères de jugement

Mesure des résultats
Description de la mesure
Délai
Identifier les facteurs contribuant à l'inflammation chronique au sein de l'intestin et des organes périphériques, en s'intéressant en particulier aux marqueurs sanguins
Délai: 1-18 mois
Évaluation du profil de réponse immunitaire : mesure du pourcentage de différentes populations de cellules immunitaires
1-18 mois
Identifier les facteurs contribuant à l'inflammation chronique au sein de l'intestin et des organes périphériques, en se concentrant en particulier sur les marqueurs fécaux
Délai: 1-18 mois
Évaluation de la composition microbienne de l'intestin : identification et quantification des différentes espèces microbiennes colonisant l'intestin
1-18 mois
Identifier les facteurs contribuant à l'inflammation chronique au sein de l'intestin et des organes périphériques, en s'appuyant notamment sur les marqueurs des biopsies
Délai: 1-18 mois
Extraction d'ARN et transcriptomique pour identifier la variation moléculaire
1-18 mois

Mesures de résultats secondaires

Mesure des résultats
Description de la mesure
Délai
Profitant des mesures collectées dans le résultat 1, les enquêteurs utiliseront une approche multiomique basée sur l'apprentissage automatique pour reconnaître facilement les différences, la stratification et la caractérisation des patients.
Délai: 19-24 mois
À l'aide de MOFA, un outil bioinformatique basé sur l'apprentissage automatique qui analyse de manière complète et simultanée plusieurs données omiques et spécifiques au patient enregistrées au cours du suivi, les enquêteurs ont pu identifier l'origine de différents résultats cliniques au cours de l'évolution de la maladie, les stratifiant finalement en fonction de facteurs environnementaux pour auxquels ils ont été exposés ainsi que leurs caractéristiques moléculaires et génétiques.
19-24 mois

Collaborateurs et enquêteurs

C'est ici que vous trouverez les personnes et les organisations impliquées dans cette étude.

Parrainer

Dates d'enregistrement des études

Ces dates suivent la progression des dossiers d'étude et des soumissions de résultats sommaires à ClinicalTrials.gov. Les dossiers d'étude et les résultats rapportés sont examinés par la Bibliothèque nationale de médecine (NLM) pour s'assurer qu'ils répondent à des normes de contrôle de qualité spécifiques avant d'être publiés sur le site Web public.

Dates principales de l'étude

Début de l'étude (Estimé)

1 novembre 2023

Achèvement primaire (Estimé)

1 mai 2025

Achèvement de l'étude (Estimé)

1 novembre 2025

Dates d'inscription aux études

Première soumission

29 septembre 2023

Première soumission répondant aux critères de contrôle qualité

2 novembre 2023

Première publication (Réel)

7 novembre 2023

Mises à jour des dossiers d'étude

Dernière mise à jour publiée (Réel)

7 novembre 2023

Dernière mise à jour soumise répondant aux critères de contrôle qualité

2 novembre 2023

Dernière vérification

1 novembre 2023

Plus d'information

Termes liés à cette étude

Plan pour les données individuelles des participants (IPD)

Prévoyez-vous de partager les données individuelles des participants (DPI) ?

INDÉCIS

Informations sur les médicaments et les dispositifs, documents d'étude

Étudie un produit pharmaceutique réglementé par la FDA américaine

Non

Étudie un produit d'appareil réglementé par la FDA américaine

Non

Ces informations ont été extraites directement du site Web clinicaltrials.gov sans aucune modification. Si vous avez des demandes de modification, de suppression ou de mise à jour des détails de votre étude, veuillez contacter register@clinicaltrials.gov. Dès qu'un changement est mis en œuvre sur clinicaltrials.gov, il sera également mis à jour automatiquement sur notre site Web .

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