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Enfoque de aprendizaje automático para estudiar las interacciones entre el entorno y la homeostasis del tejido intestinal en la EII

2 de noviembre de 2023 actualizado por: Silvio Danese, IRCCS San Raffaele

Enfoque de aprendizaje automático y tecnologías de IoT para desentrañar la compleja interacción entre los factores ambientales y la homeostasis del tejido intestinal en los trastornos inflamatorios crónicos: sellar el intestino permeable

La barrera epitelial intestinal es uno de los puntos de control de seguridad más importantes de nuestro cuerpo que impide que los factores nocivos invadan las superficies mucosas y facilita la absorción de nutrientes y agua. Su correcto funcionamiento es esencial para mantener la homeostasis del tejido intestinal y una inmunidad adecuada. Sin embargo, dicho equilibrio puede interrumpirse, lo que resulta en una entrada incontrolada de estímulos patógenos que a su vez activan una respuesta inmune intestinal persistente, con consecuencias perjudiciales para la inmunidad tanto local como sistémica. Las alteraciones en la composición y funcionalidad del microbioma intestinal parecen ser un factor central que afecta la integridad de la barrera intestinal y, por lo tanto, influye en la permeabilidad intestinal. La composición del microbioma se ve afectada por los hábitos alimentarios y la contaminación y las condiciones ambientales, la higiene, los activos genéticos y la actividad física, que podrían interactuar en conjunto y provocar disbiosis, influyendo así en la respuesta inmune a través de la producción de varios metabolitos. Las enfermedades inflamatorias crónicas, incluida la colitis ulcerosa (CU) y la diabetes tipo 1 (DT1), comparten la disbiosis de la microbiota, entre las características patológicas, que pueden surgir, provocarse o exacerbarse debido a la fuga de la barrera. Por lo tanto, estas dos enfermedades crónicas pueden considerarse patologías prototipo en las que la conexión intrínseca entre la disbiosis intestinal y la fuga de la barrera se impactan entre sí durante la patogénesis.

Descripción general del estudio

Descripción detallada

Se trata de un estudio observacional multicéntrico realizado en pacientes con un diagnóstico establecido de CU (según la clasificación estándar) y pacientes con diabetes tipo 1 (DT1) de nueva aparición que tiene como objetivo identificar factores ambientales y genéticos que contribuyen a la inflamación crónica dentro del intestino y en órganos periféricos aprovechando las tecnologías de Internet de las cosas (IoT) (aplicación web) y los enfoques de aprendizaje automático. Durante el procedimiento de colonoscopia planificado para pacientes con CU siguiendo la vigilancia de rutina según la práctica clínica habitual (0 y 12 meses), el gastroenterólogo recolectará 8 biopsias adicionales; Además, se recolectarán muestras de sangre y heces para pacientes con CU y muestras de sangre, heces y orina para pacientes con diabetes Tipo 1 al inicio del estudio y durante la vigilancia de rutina de acuerdo con la práctica clínica habitual (0, 6 y 12 meses) y se almacenarán durante los siguientes análisis. Para los pacientes con diabetes tipo 1, la recolección de muestras de sangre, orina y heces no está planificada para la práctica clínica habitual, pero se realizará específicamente para esta propuesta de investigación en diferentes puntos durante la visita clínica de práctica clínica habitual: línea de base, después de 6 meses y después de 12 meses.

Para los pacientes con CU, la sangre y las biopsias se recolectan durante los procedimientos ya planificados para la práctica clínica habitual durante la vigilancia clínica. Los investigadores aprovecharán estos procedimientos de atención estándar para recolectar un volumen adicional de sangre (al inicio, después de 6 meses y después de 12 meses). Por tanto, a los pacientes que expresen su participación voluntaria en el estudio se les pedirá que proporcionen muestras fecales durante la visita de vigilancia de rutina (según la práctica clínica habitual) en diferentes: al inicio, a los 6 meses y a los 12 meses.

Ospedale San Raffaele (OSR - Unidad Operativa (UO)1 (UO1)) es el promotor de este estudio. Los otros centros que participan en el estudio son:

  • Ospedale Casa Sollievo della Sofferenza (CSS) - Foggia (UO2)
  • Azienda Ospedaliera San Camillo Forlanini - Roma (UO3) Se inscribirán 150 sujetos en total (100 pacientes con CU y 50 pacientes con diabetes Tipo 1) en el Centro de EII (Departamento de Gastroenterología y Endoscopia Digestiva) y en la Unidad de Pediatría del Ospedale San Raffaele.

Tipo de estudio

De observación

Inscripción (Estimado)

300

Contactos y Ubicaciones

Esta sección proporciona los datos de contacto de quienes realizan el estudio e información sobre dónde se lleva a cabo este estudio.

Ubicaciones de estudio

      • Milan, Italia
        • IRCCS Ospedale San Raffaele

Criterios de participación

Los investigadores buscan personas que se ajusten a una determinada descripción, denominada criterio de elegibilidad. Algunos ejemplos de estos criterios son el estado de salud general de una persona o tratamientos previos.

Criterio de elegibilidad

Edades elegibles para estudiar

  • Niño
  • Adulto
  • Adulto Mayor

Acepta Voluntarios Saludables

N/A

Método de muestreo

Muestra de probabilidad

Población de estudio

La población que será reclutada para la finalización de este estudio estará compuesta por 300 pacientes (250 pacientes con CU y 50 pacientes con DM1) bajo vigilancia rutinaria según la práctica clínica habitual.

Tenga en cuenta los límites de edad (arriba): existen diferentes límites de edad según el grupo:

CU: > 18 años DM1: entre 7 y 17 años

Descripción

Criterios de inclusión:

CU:

  • pacientes adultos (>18 años)
  • diagnóstico establecido de CU (cualquier extensión)
  • la enfermedad en remisión definida por deposiciones normales/día
  • sin sangrado rectal
  • calprotectina fecal <250 ug/g)

diabetes tipo 1:

  • edad entre 7 y 17 años
  • diagnóstico clínico de diabetes tipo 1 insulinodependiente
  • positividad para al menos un autoanticuerpo de islotes (ICA, GADA, IA-2, IAA, ZnT8)
  • no más de 3 meses desde la primera inyección de insulina

Criterio de exclusión:

  • consentimiento informado no firmado
  • enfermedad celíaca
  • otras patologías inflamatorias intestinales
  • enfermedad cardíaca significativa
  • afecciones asociadas con disfunción inmune o discrasia hematológica (incluidas neoplasias malignas, linfopenia, trombocitopenia o anemia)
  • disfunción hepática o renal,
  • tuberculosis,
  • Infecciones activas por VHB, VHC, VIH o EBV o CMV

Plan de estudios

Esta sección proporciona detalles del plan de estudio, incluido cómo está diseñado el estudio y qué mide el estudio.

¿Cómo está diseñado el estudio?

Detalles de diseño

Cohortes e Intervenciones

Grupo / Cohorte
Intervención / Tratamiento
Colitis ulcerosa (CU)
Los pacientes se inscribirán en todos los centros que participan en este estudio: Ospedale San Raffaele - Milano, Ospedale Casa Sollievo della Sofferenza - Foggia y Azienda Ospedaliera San Camillo Forlanini - Roma de la siguiente manera: 100 pacientes con UC en OSR, 75 en el Hospital San Camillo y 75 en CSS
Durante la vigilancia de rutina según la práctica clínica habitual, se recolectarán muestras de sangre, heces y orina de pacientes con CU y pacientes con diabetes tipo 1 (0, 6 y 12 meses). Además, para los pacientes con CU durante la sigmoidoscopia de vigilancia según la práctica clínica habitual (o colonoscopia si el paciente tiene más de 8 años; en el momento de la inscripción y después de 12 meses), se recogerán biopsias de colon.
Diabetes tipo 1 (DT1)
50 pacientes con diabetes tipo 1 de nueva aparición reclutados e inscritos en OSR
Durante la vigilancia de rutina según la práctica clínica habitual, se recolectarán muestras de sangre, heces y orina de pacientes con CU y pacientes con diabetes tipo 1 (0, 6 y 12 meses). Además, para los pacientes con CU durante la sigmoidoscopia de vigilancia según la práctica clínica habitual (o colonoscopia si el paciente tiene más de 8 años; en el momento de la inscripción y después de 12 meses), se recogerán biopsias de colon.

¿Qué mide el estudio?

Medidas de resultado primarias

Medida de resultado
Medida Descripción
Periodo de tiempo
Identificar los factores que contribuyen a la inflamación crónica dentro del intestino y en los órganos periféricos, centrándose en particular en los marcadores sanguíneos.
Periodo de tiempo: 1-18 meses
Evaluación del perfil de respuesta inmune: medición del porcentaje de diferentes poblaciones de células inmunes
1-18 meses
Identificar los factores que contribuyen a la inflamación crónica dentro del intestino y en los órganos periféricos, centrándose en particular en los marcadores de las heces.
Periodo de tiempo: 1-18 meses
Evaluación de la composición microbiana del intestino: identificación y cuantificación de diferentes especies microbianas que colonizan el intestino.
1-18 meses
Identificar los factores que contribuyen a la inflamación crónica dentro del intestino y en los órganos periféricos, centrándose en particular en los marcadores de biopsias.
Periodo de tiempo: 1-18 meses
Extracción de ARN y transcriptómica para identificar variaciones moleculares.
1-18 meses

Medidas de resultado secundarias

Medida de resultado
Medida Descripción
Periodo de tiempo
Aprovechando las mediciones recopiladas en el Resultado 1, los investigadores utilizarán un enfoque multiómico basado en aprendizaje automático para reconocer fácilmente las diferencias, estratificación y caracterización de los pacientes.
Periodo de tiempo: 19-24 meses
Utilizando MOFA, una herramienta bioinformática basada en aprendizaje automático que analiza de manera integral y simultánea múltiples ómicas y datos específicos del paciente registrados durante el seguimiento, los investigadores podrían identificar el origen de diferentes resultados clínicos durante el curso de la enfermedad y, en última instancia, estratificarlos en función de factores ambientales para a los que estuvieron expuestos y sus características moleculares y genéticas.
19-24 meses

Colaboradores e Investigadores

Aquí es donde encontrará personas y organizaciones involucradas en este estudio.

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Fechas de registro del estudio

Estas fechas rastrean el progreso del registro del estudio y los envíos de resultados resumidos a ClinicalTrials.gov. Los registros del estudio y los resultados informados son revisados ​​por la Biblioteca Nacional de Medicina (NLM) para asegurarse de que cumplan con los estándares de control de calidad específicos antes de publicarlos en el sitio web público.

Fechas importantes del estudio

Inicio del estudio (Estimado)

1 de noviembre de 2023

Finalización primaria (Estimado)

1 de mayo de 2025

Finalización del estudio (Estimado)

1 de noviembre de 2025

Fechas de registro del estudio

Enviado por primera vez

29 de septiembre de 2023

Primero enviado que cumplió con los criterios de control de calidad

2 de noviembre de 2023

Publicado por primera vez (Actual)

7 de noviembre de 2023

Actualizaciones de registros de estudio

Última actualización publicada (Actual)

7 de noviembre de 2023

Última actualización enviada que cumplió con los criterios de control de calidad

2 de noviembre de 2023

Última verificación

1 de noviembre de 2023

Más información

Términos relacionados con este estudio

Plan de datos de participantes individuales (IPD)

¿Planea compartir datos de participantes individuales (IPD)?

INDECISO

Información sobre medicamentos y dispositivos, documentos del estudio

Estudia un producto farmacéutico regulado por la FDA de EE. UU.

No

Estudia un producto de dispositivo regulado por la FDA de EE. UU.

No

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