Denna sida har översatts automatiskt och översättningens korrekthet kan inte garanteras. Vänligen se engelsk version för en källtext.

Maskininlärningsmetod för att studera interaktionerna mellan miljö och tarmvävnadshomeostas vid IBD

2 november 2023 uppdaterad av: Silvio Danese, IRCCS San Raffaele

Maskininlärningsmetod och IoT-tekniker för att reda ut den komplexa interaktionen mellan miljöfaktorer och tarmvävnadshomeostas vid kroniska inflammatoriska sjukdomar: Tätning av den läckande tarmen

Den intestinala epitelbarriären är en av de viktigaste säkerhetskontrollpunkterna i vår kropp som hindrar skadliga faktorer från att invadera slemhinneytor och underlättar upptaget av näringsämnen och vatten. Dess korrekta funktion är avgörande för att upprätthålla tarmvävnadshomeostas och korrekt immunitet. En sådan jämvikt kan emellertid avbrytas, vilket resulterar i en okontrollerad ingång av patogena stimuli som i sin tur aktiverar ett ihållande tarmimmunsvar, med skadliga konsekvenser för både lokal och systemisk immunitet. Förändringar i sammansättningen och funktionaliteten hos tarmmikrobiomet verkar vara en central faktor för att påverka tarmbarriärens integritet och därmed påverka tarmens permeabilitet. Mikrobiomsammansättningen påverkas av kostvanor och miljöföroreningar och förhållanden, hygien, genetiska tillgångar och fysisk aktivitet, vilket kan samverka i samverkan och leda till dysbios och därigenom påverka immunsvaret genom produktion av flera metaboliter. Kroniska inflammatoriska sjukdomar, inklusive ulcerös kolit (UC) och typ 1-diabetes (T1D), delar mikrobiota dysbios, bland patologiska egenskaper, som kan uppstå, provoceras eller förvärras på grund av barriärläckage. Därför kan dessa två kroniska sjukdomar betraktas som prototyppatologier där det inneboende sambandet mellan intestinal dysbios och barriärläckaget påverkar varandra under patogenesen.

Studieöversikt

Detaljerad beskrivning

Detta är en observations multicenterstudie utförd på patienter med en fastställd diagnos av UC (enligt standardklassificeringen) och patienter med nyuppkomna typ 1-diabetes (T1D) som syftar till att identifiera miljömässiga och genetiska faktorer som bidrar till kronisk inflammation i tarmen och tarmarna. i perifera organ genom att dra nytta av Internet-of things (IoT)-teknologier (webbapp) och metoder för maskininlärning. Under den koloskopi som planeras för patienter med UC efter rutinövervakning enligt normal klinisk praxis (0 och 12 månader), kommer gastroenterologen att samla in ytterligare 8 biopsier; dessutom kommer blodprover och avföring för UC-patienter och blodprover, avföring och urin för T1D-patienter att samlas in vid baslinjen och under rutinövervakningen enligt normal klinisk praxis (0, 6 och 12 månader) och lagras i följande analys. För T1D-patienter är blod-, urin- och avföringsprovtagning inte planerad för normal klinisk praxis, utan kommer att utföras specifikt för detta forskningsförslag vid olika tillfällen under det normala kliniska besöket: baseline, efter 6 månader och efter 12 månader.

För UC-patienter samlas blod och biopsier in under de procedurer som redan är planerade för normal klinisk praxis under klinisk övervakning. Utredarna kommer att dra nytta av dessa standardprocedurer för att samla in ytterligare en volym blod (vid baslinjen, efter 6 månader och efter 12 månader). Därför kommer patienter som uttrycker sitt frivilliga deltagande i studien att bli ombedda att ge fekala prover under rutinövervakningsbesöket (enligt normal klinisk praxis) vid olika: vid baslinjen, efter 6 månader och efter 12 månader.

Ospedale San Raffaele (OSR - Operativ enhet (UO)1 (UO1)) är promotor för denna studie. De andra centra som deltar i studien är:

  • Ospedale Casa Sollievo della Sofferenza (CSS) - Foggia (UO2)
  • Azienda Ospedaliera San Camillo Forlanini - Roma (UO3) Totalt 150 försökspersoner (100 patienter med UC och 50 patienter med T1D) kommer att skrivas in vid IBD-centret (avdelningen för gastroenterologi och matsmältningsendoskopi) och vid den pediatriska enheten i Ospedale San Raffaele.

Studietyp

Observationell

Inskrivning (Beräknad)

300

Kontakter och platser

Det här avsnittet innehåller kontaktuppgifter för dem som genomför studien och information om var denna studie genomförs.

Studieorter

      • Milan, Italien
        • IRCCS Ospedale San Raffaele

Deltagandekriterier

Forskare letar efter personer som passar en viss beskrivning, så kallade behörighetskriterier. Några exempel på dessa kriterier är en persons allmänna hälsotillstånd eller tidigare behandlingar.

Urvalskriterier

Åldrar som är berättigade till studier

  • Barn
  • Vuxen
  • Äldre vuxen

Tar emot friska volontärer

N/A

Testmetod

Sannolikhetsprov

Studera befolkning

Populationen som kommer att rekryteras för slutförandet av denna studie kommer att bestå av 300 patienter (250 patienter med UC och 50 patienter med T1D) under rutinövervakning enligt normal klinisk praxis.

Vänligen notera för åldersgränserna (ovan): det finns olika åldersgränser beroende på grupp:

UC: > 18 år T1D: mellan 7 och 17 år

Beskrivning

Inklusionskriterier:

UC:

  • vuxna patienter (>18 år)
  • fastställd diagnos av UC (i vilken utsträckning som helst)
  • sjukdomen i remission enligt definition av normal tarmrörelser/dag
  • ingen rektal blödning
  • fekalt kalprotektin <250 ug/g)

T1D:

  • ålder mellan 7 och 17 år
  • klinisk diagnos av insulinberoende typ 1-diabetes
  • positivitet för minst en ö-autoantikropp (ICA, GADA, IA-2, IAA, ZnT8)
  • inte mer än 3 månader från första insulininjektion

Exklusions kriterier:

  • osignerat informerat samtycke
  • celiaki
  • andra tarminflammatoriska patologier
  • betydande hjärtsjukdom
  • tillstånd associerade med immundysfunktion eller hematologisk dyskrasi (inklusive malignitet, lymfopeni, trombocytopeni eller anemi)
  • lever- eller njursvikt,
  • tuberkulos,
  • HBV, HCV, HIV eller aktiva EBV- eller CMV-infektioner

Studieplan

Det här avsnittet ger detaljer om studieplanen, inklusive hur studien är utformad och vad studien mäter.

Hur är studien utformad?

Designdetaljer

Kohorter och interventioner

Grupp / Kohort
Intervention / Behandling
Ulcerös kolit (UC)
Patienter kommer att registreras i alla centra som deltar i denna studie: Ospedale San Raffaele - Milano, Ospedale Casa Sollievo della Sofferenza - Foggia och Azienda Ospedaliera San Camillo Forlanini - Roma enligt följande: 100 UC-patienter vid OSR, 75 på San Camillo Hospital och 75 på CSS
Under den rutinmässiga övervakningen enligt normal klinisk praxis kommer blodprover, avföring och urin att samlas in från UC-patienter och T1D-patienter (0, 6 och 12 månader). Dessutom, för UC-patienter under övervakningssigmoidoskopi enligt normal klinisk praxis (eller koloskopi om patienten har mer än 8 år; vid inskrivningen och efter 12 månader), kommer kolonbiopsier att samlas in
Diabetes typ 1 (T1D)
50 nya T1D-patienter rekryterade och inskrivna på OSR
Under den rutinmässiga övervakningen enligt normal klinisk praxis kommer blodprover, avföring och urin att samlas in från UC-patienter och T1D-patienter (0, 6 och 12 månader). Dessutom, för UC-patienter under övervakningssigmoidoskopi enligt normal klinisk praxis (eller koloskopi om patienten har mer än 8 år; vid inskrivningen och efter 12 månader), kommer kolonbiopsier att samlas in

Vad mäter studien?

Primära resultatmått

Resultatmått
Åtgärdsbeskrivning
Tidsram
Att identifiera de faktorer som bidrar till kronisk inflammation i tarmen och i perifera organ, särskilt med fokus på blodmarkörer
Tidsram: 1-18 månader
Utvärdering av immunsvarsprofilen: mätning av procentandelen av olika immuncellspopulationer
1-18 månader
Att identifiera de faktorer som bidrar till kronisk inflammation i tarmen och i perifera organ, särskilt med fokus på avföringsmarkörer
Tidsram: 1-18 månader
Utvärdering av mikrobiell sammansättning i tarmen: identifiering och kvantifiering av olika mikrobiella arter som koloniserar tarmen
1-18 månader
Att identifiera faktorer som bidrar till kronisk inflammation i tarmen och i perifera organ, särskilt med fokus på biopsimarkörer
Tidsram: 1-18 månader
RNA-extraktion och transkriptomik för att identifiera molekylär variation
1-18 månader

Sekundära resultatmått

Resultatmått
Åtgärdsbeskrivning
Tidsram
Genom att dra nytta av mätningarna som samlats in i resultat 1 kommer utredarna att använda en maskininlärningsbaserad multiomics-metod för att enkelt känna igen patientskillnader, stratifiering och karakterisering
Tidsram: 19-24 månader
Genom att använda MOFA, ett maskininlärningsbaserat bioinformatikverktyg som heltäckande och samtidigt analyserar flera omics och patientspecifika data som registrerats under uppföljningen, kunde utredarna identifiera ursprunget till olika kliniska resultat under sjukdomsförloppet, och slutligen stratifiera dem baserat på miljöfaktorer för att vilka de exponerades och deras molekylära och genetiska egenskaper.
19-24 månader

Samarbetspartners och utredare

Det är här du hittar personer och organisationer som är involverade i denna studie.

Studieavstämningsdatum

Dessa datum spårar framstegen för inlämningar av studieposter och sammanfattande resultat till ClinicalTrials.gov. Studieposter och rapporterade resultat granskas av National Library of Medicine (NLM) för att säkerställa att de uppfyller specifika kvalitetskontrollstandarder innan de publiceras på den offentliga webbplatsen.

Studera stora datum

Studiestart (Beräknad)

1 november 2023

Primärt slutförande (Beräknad)

1 maj 2025

Avslutad studie (Beräknad)

1 november 2025

Studieregistreringsdatum

Först inskickad

29 september 2023

Först inskickad som uppfyllde QC-kriterierna

2 november 2023

Första postat (Faktisk)

7 november 2023

Uppdateringar av studier

Senaste uppdatering publicerad (Faktisk)

7 november 2023

Senaste inskickade uppdateringen som uppfyllde QC-kriterierna

2 november 2023

Senast verifierad

1 november 2023

Mer information

Termer relaterade till denna studie

Plan för individuella deltagardata (IPD)

Planerar du att dela individuella deltagardata (IPD)?

OBESLUTSAM

Läkemedels- och apparatinformation, studiedokument

Studerar en amerikansk FDA-reglerad läkemedelsprodukt

Nej

Studerar en amerikansk FDA-reglerad produktprodukt

Nej

Denna information hämtades direkt från webbplatsen clinicaltrials.gov utan några ändringar. Om du har några önskemål om att ändra, ta bort eller uppdatera dina studieuppgifter, vänligen kontakta register@clinicaltrials.gov. Så snart en ändring har implementerats på clinicaltrials.gov, kommer denna att uppdateras automatiskt även på vår webbplats .

Prenumerera