Denne siden ble automatisk oversatt og nøyaktigheten av oversettelsen er ikke garantert. Vennligst referer til engelsk versjon for en kildetekst.

Maskinlæringsmetode for å studere interaksjonene mellom miljø og tarmvevshomeostase i IBD

2. november 2023 oppdatert av: Silvio Danese, IRCCS San Raffaele

Maskinlæringsmetode og IoT-teknologier for å avdekke det komplekse samspillet mellom miljøfaktorer og tarmvevshomeostase ved kroniske inflammatoriske lidelser: tetting av den lekkende tarmen

Den intestinale epitelbarrieren er en av de viktigste sikkerhetskontrollene i kroppen vår som hindrer skadelige faktorer fra å invadere slimhinneoverflater og letter absorpsjonen av næringsstoffer og vann. Dens korrekte funksjon er avgjørende for å opprettholde tarmvevshomeostase og riktig immunitet. Imidlertid kan en slik likevekt bli avbrutt, noe som resulterer i en ukontrollert inngang av patogene stimuli som igjen aktiverer en vedvarende tarmimmunrespons, med skadelige konsekvenser for både lokal og systemisk immunitet. Endringer i sammensetningen og funksjonaliteten til tarmmikrobiomet ser ut til å være en sentral faktor for å påvirke tarmbarriereintegriteten og dermed påvirke tarmens permeabilitet. Mikrobiomsammensetningen påvirkes av kostholdsvaner og miljøforurensning og forhold, hygiene, genetiske eiendeler og fysisk aktivitet, som kan samhandle i samspill og føre til dysbiose, og dermed påvirke immunresponsen gjennom produksjon av flere metabolitter. Kroniske inflammatoriske sykdommer, inkludert ulcerøs kolitt (UC) og type 1 diabetes (T1D), deler mikrobiota dysbiose, blant patologiske egenskaper, som kan oppstå, bli provosert eller forverret på grunn av barrierelekkasje. Derfor kan disse to kroniske sykdommene betraktes som prototypepatologier der den iboende forbindelsen mellom intestinal dysbiose og barrierelekkasjen påvirker hverandre under patogenesen.

Studieoversikt

Detaljert beskrivelse

Dette er en observasjons multisenterstudie utført på pasienter med etablert diagnose UC (i henhold til standard klassifisering) og pasienter med nyoppstått type 1 diabetes (T1D) som tar sikte på å identifisere miljømessige og genetiske faktorer som bidrar til kronisk betennelse i tarm og tarm. i perifere organer ved å dra nytte av Internet-Of things (IoT) teknologier (webapp) og maskinlæringsmetoder. Under koloskopi-prosedyren som er planlagt for pasienter med UC etter rutineovervåking i henhold til normal klinisk praksis (0 og 12 måneder), vil gastroenterologen samle 8 ekstra biopsier; videre vil blodprøver og avføring for UC-pasienter og blodprøver, avføring og urin for T1D-pasienter tas ved baseline og under rutineovervåkingen i henhold til normal klinisk praksis (0, 6 og 12 måneder) og lagres i følgende analyse. For T1D-pasienter er det ikke planlagt blod-, urin- og avføringsprøvetaking for normal klinisk praksis, men vil bli utført spesifikt for dette forskningsforslaget på forskjellige tidspunkt under det kliniske besøket i normal klinisk praksis: baseline, etter 6 måneder og etter 12 måneder.

For UC-pasienter samles blod og biopsier inn under prosedyrene som allerede er planlagt for normal klinisk praksis under klinisk overvåking. Etterforskerne vil dra nytte av disse standardprosedyrene for å samle inn et ekstra volum blod (ved baseline, etter 6 måneder og etter 12 måneder). Derfor vil pasienter som uttrykker sin frivillige deltakelse i studien bli bedt om å gi avføringsprøver under det rutinemessige overvåkingsbesøket (i henhold til vanlig klinisk praksis) ved forskjellige: ved baseline, etter 6 måneder og etter 12 måneder.

Ospedale San Raffaele (OSR - Operative Unit (UO)1 (UO1)) er pådriver for denne studien. De andre sentrene som deltar i studien er:

  • Ospedale Casa Sollievo della Sofferenza (CSS) - Foggia (UO2)
  • Azienda Ospedaliera San Camillo Forlanini - Roma (UO3) Totalt 150 forsøkspersoner (100 pasienter med UC og 50 pasienter med T1D) vil bli registrert ved IBD-senteret (Department of Gastroenterology and Digestive Endoscopy) og ved Pediatric Unit i Ospedale San Raffaele.

Studietype

Observasjonsmessig

Registrering (Antatt)

300

Kontakter og plasseringer

Denne delen inneholder kontaktinformasjon for de som utfører studien, og informasjon om hvor denne studien blir utført.

Studiesteder

      • Milan, Italia
        • IRCCS Ospedale San Raffaele

Deltakelseskriterier

Forskere ser etter personer som passer til en bestemt beskrivelse, kalt kvalifikasjonskriterier. Noen eksempler på disse kriteriene er en persons generelle helsetilstand eller tidligere behandlinger.

Kvalifikasjonskriterier

Alder som er kvalifisert for studier

  • Barn
  • Voksen
  • Eldre voksen

Tar imot friske frivillige

N/A

Prøvetakingsmetode

Sannsynlighetsprøve

Studiepopulasjon

Befolkningen som vil bli rekruttert for sluttføringen av denne studien vil bestå av 300 pasienter (250 pasienter med UC og 50 pasienter med T1D) under rutineovervåking i henhold til vanlig klinisk praksis.

Vennligst en merknad for aldersgrensene (over): det er forskjellige aldersgrenser avhengig av gruppen:

UC: > 18 år T1D: mellom 7 og 17 år

Beskrivelse

Inklusjonskriterier:

UC:

  • voksne pasienter (>18 år)
  • etablert diagnose av UC (uansett grad)
  • sykdommen i remisjon som definert av normal avføring/dag
  • ingen rektal blødning
  • fekalt kalprotektin <250 ug/g)

T1D:

  • alder mellom 7 og 17 år
  • klinisk diagnose av insulinavhengig type 1 diabetes
  • positivitet for minst ett øy-autoantistoff (ICA, GADA, IA-2, IAA, ZnT8)
  • ikke mer enn 3 måneder fra første insulininjeksjon

Ekskluderingskriterier:

  • usignert informert samtykke
  • cøliaki
  • andre intestinale inflammatoriske patologier
  • betydelig hjertesykdom
  • tilstander assosiert med immundysfunksjon eller hematologisk dyskrasi (inkludert malignitet, lymfopeni, trombocytopeni eller anemi)
  • lever- eller nyresvikt,
  • tuberkulose,
  • HBV, HCV, HIV eller aktive EBV- eller CMV-infeksjoner

Studieplan

Denne delen gir detaljer om studieplanen, inkludert hvordan studien er utformet og hva studien måler.

Hvordan er studiet utformet?

Designdetaljer

Kohorter og intervensjoner

Gruppe / Kohort
Intervensjon / Behandling
Ulcerøs kolitt (UC)
Pasienter vil bli registrert i alle sentrene som deltar i denne studien: Ospedale San Raffaele - Milano, Ospedale Casa Sollievo della Sofferenza - Foggia og Azienda Ospedaliera San Camillo Forlanini - Roma som følger: 100 UC-pasienter ved OSR, 75 ved San Camillo Hospital og 75 på CSS
Under den rutinemessige overvåkingen i henhold til vanlig klinisk praksis, vil det bli tatt blodprøver, avføring og urin fra UC-pasienter og T1D-pasienter (0, 6 og 12 måneder). Dessuten, for UC-pasienter under overvåkingen sigmoidoskopi i henhold til vanlig klinisk praksis (eller koloskopi hvis pasienten har mer enn 8 år; ved innskrivning og etter 12 måneder), vil kolonbiopsier bli samlet inn
Diabetes type 1 (T1D)
50 nye T1D-pasienter rekruttert og registrert ved OSR
Under den rutinemessige overvåkingen i henhold til vanlig klinisk praksis, vil det bli tatt blodprøver, avføring og urin fra UC-pasienter og T1D-pasienter (0, 6 og 12 måneder). Dessuten, for UC-pasienter under overvåkingen sigmoidoskopi i henhold til vanlig klinisk praksis (eller koloskopi hvis pasienten har mer enn 8 år; ved innskrivning og etter 12 måneder), vil kolonbiopsier bli samlet inn

Hva måler studien?

Primære resultatmål

Resultatmål
Tiltaksbeskrivelse
Tidsramme
For å identifisere faktorene som bidrar til kronisk betennelse i tarmen og i perifere organer, spesielt med fokus på blodmarkører
Tidsramme: 1-18 måneder
Evaluering av immunresponsprofilen: måling av prosentandelen av forskjellige immuncellepopulasjoner
1-18 måneder
For å identifisere faktorene som bidrar til kronisk betennelse i tarmen og i perifere organer, spesielt med fokus på avføringsmarkører
Tidsramme: 1-18 måneder
Evaluering av mikrobiell sammensetning av tarmen: identifikasjon og kvantifisering av forskjellige mikrobielle arter som koloniserer tarmen
1-18 måneder
For å identifisere faktorene som bidrar til kronisk betennelse i tarmen og i perifere organer, spesielt med fokus på biopsimarkører
Tidsramme: 1-18 måneder
RNA-ekstraksjon og transkriptomikk for å identifisere molekylær variasjon
1-18 måneder

Sekundære resultatmål

Resultatmål
Tiltaksbeskrivelse
Tidsramme
Ved å dra nytte av målingene samlet i utfall 1, vil etterforskerne bruke en maskinlæringsbasert multi-omics-tilnærming for enkelt å gjenkjenne pasientforskjeller, stratifisering og karakterisering
Tidsramme: 19-24 måneder
Ved å bruke MOFA, et maskinlæringsbasert bioinformatikkverktøy som omfattende og samtidig analyserer flere omics og pasientspesifikke data registrert under oppfølgingen, kunne etterforskerne identifisere opprinnelsen til ulike kliniske utfall i løpet av sykdomsforløpet, og til slutt stratifisere dem basert på miljøfaktorer. som de ble utsatt for og deres molekylære og genetiske egenskaper.
19-24 måneder

Samarbeidspartnere og etterforskere

Det er her du vil finne personer og organisasjoner som er involvert i denne studien.

Studierekorddatoer

Disse datoene sporer fremdriften for innsending av studieposter og sammendragsresultater til ClinicalTrials.gov. Studieposter og rapporterte resultater gjennomgås av National Library of Medicine (NLM) for å sikre at de oppfyller spesifikke kvalitetskontrollstandarder før de legges ut på det offentlige nettstedet.

Studer hoveddatoer

Studiestart (Antatt)

1. november 2023

Primær fullføring (Antatt)

1. mai 2025

Studiet fullført (Antatt)

1. november 2025

Datoer for studieregistrering

Først innsendt

29. september 2023

Først innsendt som oppfylte QC-kriteriene

2. november 2023

Først lagt ut (Faktiske)

7. november 2023

Oppdateringer av studieposter

Sist oppdatering lagt ut (Faktiske)

7. november 2023

Siste oppdatering sendt inn som oppfylte QC-kriteriene

2. november 2023

Sist bekreftet

1. november 2023

Mer informasjon

Begreper knyttet til denne studien

Plan for individuelle deltakerdata (IPD)

Planlegger du å dele individuelle deltakerdata (IPD)?

UBESLUTTE

Legemiddel- og utstyrsinformasjon, studiedokumenter

Studerer et amerikansk FDA-regulert medikamentprodukt

Nei

Studerer et amerikansk FDA-regulert enhetsprodukt

Nei

Denne informasjonen ble hentet direkte fra nettstedet clinicaltrials.gov uten noen endringer. Hvis du har noen forespørsler om å endre, fjerne eller oppdatere studiedetaljene dine, vennligst kontakt register@clinicaltrials.gov. Så snart en endring er implementert på clinicaltrials.gov, vil denne også bli oppdatert automatisk på nettstedet vårt. .

Kliniske studier på Diabetes mellitus, type 1

3
Abonnere