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Abordagem de aprendizado de máquina para estudar as interações entre o ambiente e a homeostase do tecido intestinal na DII

2 de novembro de 2023 atualizado por: Silvio Danese, IRCCS San Raffaele

Abordagem de aprendizado de máquina e tecnologias de IoT para desvendar a complexa interação entre fatores ambientais e a homeostase do tecido intestinal em doenças inflamatórias crônicas: selando o intestino permeável

A barreira epitelial intestinal é um dos pontos de verificação de segurança mais importantes do nosso corpo, que impede que fatores prejudiciais invadam as superfícies mucosas e facilita a absorção de nutrientes e água. Seu correto funcionamento é essencial para manter a homeostase do tecido intestinal e a imunidade adequada. No entanto, tal equilíbrio pode ser interrompido, resultando numa entrada descontrolada de estímulos patogénicos que, por sua vez, activam uma resposta imunitária intestinal persistente, com consequências prejudiciais tanto para a imunidade local como sistémica. Alterações na composição e funcionalidade do microbioma intestinal parecem ser um fator central que afeta a integridade da barreira intestinal, influenciando assim a permeabilidade intestinal. A composição do microbioma é afetada pelos hábitos alimentares e pela poluição e condições ambientais, pela higiene, pelos ativos genéticos e pela atividade física, que podem interagir em conjunto, levando à disbiose, influenciando assim a resposta imunitária através da produção de vários metabolitos. Doenças inflamatórias crônicas, incluindo colite ulcerativa (UC) e diabetes tipo 1 (DT1), compartilham a disbiose da microbiota, entre características patológicas, que podem surgir, ser provocadas ou exacerbadas devido ao vazamento da barreira. Portanto, estas duas doenças crónicas podem ser consideradas patologias protótipo onde a ligação intrínseca entre a disbiose intestinal e a fuga da barreira se impactam durante a patogénese.

Visão geral do estudo

Descrição detalhada

Este é um estudo observacional multicêntrico realizado em pacientes com diagnóstico estabelecido de UC (de acordo com a classificação padrão) e pacientes com diabetes tipo 1 de início recente (DT1) que visa identificar fatores ambientais e genéticos que contribuem para a inflamação crônica no intestino e em órgãos periféricos, aproveitando as tecnologias da Internet das coisas (IoT) (aplicativo da web) e abordagens de aprendizado de máquina. Durante o procedimento de colonoscopia planejado para pacientes com UC seguindo a vigilância de rotina de acordo com a prática clínica normal (0 e 12 meses), o gastroenterologista irá coletar 8 biópsias adicionais; além disso, amostras de sangue e fezes para pacientes com UC e amostras de sangue, fezes e urina para pacientes com DM1 serão coletadas no início do estudo e durante a vigilância de rotina de acordo com a prática clínica normal (0, 6 e 12 meses) e armazenadas pelos seguintes análise. Para pacientes com DM1, a coleta de amostras de sangue, urina e fezes não está planejada para a prática clínica normal, mas será realizada especificamente para esta proposta de pesquisa em diferentes pontos durante a consulta clínica de prática clínica normal: linha de base, após 6 meses e após 12 meses.

Para pacientes com UC, o sangue e as biópsias são coletados durante os procedimentos já planejados para a prática clínica normal durante a vigilância clínica. Os investigadores aproveitarão estes procedimentos padrão de atendimento para coletar um volume adicional de sangue (no início do estudo, após 6 meses e após 12 meses). Portanto, os pacientes que expressarem sua participação voluntária no estudo serão solicitados a fornecer amostras fecais durante a visita de vigilância de rotina (de acordo com a prática clínica normal) em diferentes momentos: no início do estudo, após 6 meses e após 12 meses.

Ospedale San Raffaele (OSR - Unidade Operativa (UO)1 (UO1)) é o promotor deste estudo. Os outros centros participantes do estudo são:

  • Ospedale Casa Sollievo della Sofferenza (CSS) - Foggia (UO2)
  • Azienda Ospedaliera San Camillo Forlanini - Roma (UO3) 150 indivíduos no total (100 pacientes com UC e 50 pacientes com DM1) serão inscritos no Centro IBD (Departamento de Gastroenterologia e Endoscopia Digestiva) e na Unidade Pediátrica do Ospedale San Raffaele.

Tipo de estudo

Observacional

Inscrição (Estimado)

300

Contactos e Locais

Esta seção fornece os detalhes de contato para aqueles que conduzem o estudo e informações sobre onde este estudo está sendo realizado.

Locais de estudo

      • Milan, Itália
        • IRCCS Ospedale San Raffaele

Critérios de participação

Os pesquisadores procuram pessoas que se encaixem em uma determinada descrição, chamada de critérios de elegibilidade. Alguns exemplos desses critérios são a condição geral de saúde de uma pessoa ou tratamentos anteriores.

Critérios de elegibilidade

Idades elegíveis para estudo

  • Filho
  • Adulto
  • Adulto mais velho

Aceita Voluntários Saudáveis

N/D

Método de amostragem

Amostra de Probabilidade

População do estudo

A população que será recrutada para a finalização deste estudo será composta por 300 pacientes (250 pacientes com CU e 50 pacientes com DM1) sob vigilância de rotina de acordo com a prática clínica normal.

Tenha em atenção os limites de idade (acima): existem diferentes limites de idade dependendo do grupo:

UC: > 18 anos T1D: entre 7 e 17 anos

Descrição

Critério de inclusão:

UC:

  • pacientes adultos (>18 anos)
  • diagnóstico estabelecido de UC (qualquer extensão)
  • a doença em remissão, conforme definida por evacuações normais/dia
  • sem sangramento retal
  • calprotectina fecal <250 ug/g)

DM1:

  • idade entre 7 e 17 anos
  • diagnóstico clínico de diabetes tipo 1 dependente de insulina
  • positividade para pelo menos um autoanticorpo de ilhotas (ICA, GADA, IA-2, IAA, ZnT8)
  • não mais que 3 meses após a primeira injeção de insulina

Critério de exclusão:

  • consentimento informado não assinado
  • doença celíaca
  • outras patologias inflamatórias intestinais
  • doença cardíaca significativa
  • condições associadas à disfunção imunológica ou discrasia hematológica (incluindo malignidade, linfopenia, trombocitopenia ou anemia)
  • disfunção hepática ou renal,
  • tuberculose,
  • HBV, HCV, HIV ou infecções ativas por EBV ou CMV

Plano de estudo

Esta seção fornece detalhes do plano de estudo, incluindo como o estudo é projetado e o que o estudo está medindo.

Como o estudo é projetado?

Detalhes do projeto

Coortes e Intervenções

Grupo / Coorte
Intervenção / Tratamento
Colite Ulcerosa (UC)
Os pacientes serão inscritos em todos os centros participantes deste estudo: Ospedale San Raffaele - Milão, Ospedale Casa Sollievo della Sofferenza - Foggia e Azienda Ospedaliera San Camillo Forlanini - Roma da seguinte forma: 100 pacientes UC no OSR, 75 no Hospital San Camillo e 75 em CSS
Durante a vigilância de rotina de acordo com a prática clínica normal, amostras de sangue, fezes e urina serão coletadas de pacientes com UC e pacientes com DM1 (0, 6 e 12 meses). Além disso, para pacientes com UC durante a sigmoidoscopia de vigilância de acordo com a prática clínica normal (ou colonoscopia se o paciente tiver mais de 8 anos; no momento da inscrição e após 12 meses), serão coletadas biópsias de cólon
Diabetes tipo 1 (T1D)
50 novos pacientes com DM1 recrutados e inscritos no OSR
Durante a vigilância de rotina de acordo com a prática clínica normal, amostras de sangue, fezes e urina serão coletadas de pacientes com UC e pacientes com DM1 (0, 6 e 12 meses). Além disso, para pacientes com UC durante a sigmoidoscopia de vigilância de acordo com a prática clínica normal (ou colonoscopia se o paciente tiver mais de 8 anos; no momento da inscrição e após 12 meses), serão coletadas biópsias de cólon

O que o estudo está medindo?

Medidas de resultados primários

Medida de resultado
Descrição da medida
Prazo
Identificar os factores que contribuem para a inflamação crónica no intestino e nos órgãos periféricos, com particular enfoque nos marcadores sanguíneos
Prazo: 1-18 meses
Avaliação do perfil de resposta imunológica: medição da porcentagem de diferentes populações de células imunes
1-18 meses
Identificar os factores que contribuem para a inflamação crónica no intestino e nos órgãos periféricos, com especial enfoque nos marcadores fecais
Prazo: 1-18 meses
Avaliação da composição microbiana do intestino: identificação e quantificação de diferentes espécies microbianas que colonizam o intestino
1-18 meses
Identificar os factores que contribuem para a inflamação crónica no intestino e nos órgãos periféricos, em particular com foco em marcadores de biópsias
Prazo: 1-18 meses
Extração de RNA e transcriptômica para identificar variação molecular
1-18 meses

Medidas de resultados secundários

Medida de resultado
Descrição da medida
Prazo
Aproveitando as medições coletadas no Resultado 1, os investigadores usarão uma abordagem multiômica baseada em aprendizado de máquina para reconhecer facilmente as diferenças, estratificação e caracterização dos pacientes
Prazo: 19-24 meses
Usando MOFA, uma ferramenta de bioinformática baseada em aprendizado de máquina que analisa de forma abrangente e simultânea vários dados ômicos e específicos do paciente registrados durante o acompanhamento, os investigadores poderiam identificar a origem de diferentes resultados clínicos durante o curso da doença, em última análise, estratificando-os com base em fatores ambientais para quais foram expostos e suas características moleculares e genéticas.
19-24 meses

Colaboradores e Investigadores

É aqui que você encontrará pessoas e organizações envolvidas com este estudo.

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Datas de registro do estudo

Essas datas acompanham o progresso do registro do estudo e os envios de resumo dos resultados para ClinicalTrials.gov. Os registros do estudo e os resultados relatados são revisados ​​pela National Library of Medicine (NLM) para garantir que atendam aos padrões específicos de controle de qualidade antes de serem publicados no site público.

Datas Principais do Estudo

Início do estudo (Estimado)

1 de novembro de 2023

Conclusão Primária (Estimado)

1 de maio de 2025

Conclusão do estudo (Estimado)

1 de novembro de 2025

Datas de inscrição no estudo

Enviado pela primeira vez

29 de setembro de 2023

Enviado pela primeira vez que atendeu aos critérios de CQ

2 de novembro de 2023

Primeira postagem (Real)

7 de novembro de 2023

Atualizações de registro de estudo

Última Atualização Postada (Real)

7 de novembro de 2023

Última atualização enviada que atendeu aos critérios de controle de qualidade

2 de novembro de 2023

Última verificação

1 de novembro de 2023

Mais Informações

Termos relacionados a este estudo

Plano para dados de participantes individuais (IPD)

Planeja compartilhar dados de participantes individuais (IPD)?

INDECISO

Informações sobre medicamentos e dispositivos, documentos de estudo

Estuda um medicamento regulamentado pela FDA dos EUA

Não

Estuda um produto de dispositivo regulamentado pela FDA dos EUA

Não

Essas informações foram obtidas diretamente do site clinicaltrials.gov sem nenhuma alteração. Se você tiver alguma solicitação para alterar, remover ou atualizar os detalhes do seu estudo, entre em contato com register@clinicaltrials.gov. Assim que uma alteração for implementada em clinicaltrials.gov, ela também será atualizada automaticamente em nosso site .

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