Le rôle de la sélection des donneurs sur les résultats de la transplantation de microbiote fécal chez les patients atteints du syndrome du côlon irritable

Description de l'étude Bref résumé : Deux cents patients sont randomisés 1:1:1:1 dans un groupe placebo (propres selles), recevant 90 g de greffe fécale d'un donneur A, d'un donneur B ou d'un donneur C. La greffe fécale est administrée au duodénum distal via le canal opérateur de un gastroscope. Les patients doivent remplir 5 questionnaires mesurant les symptômes, la fatigue, la qualité de vie et l'apport alimentaire au départ et à la fin de l'essai et fournir un échantillon de matières fécales au départ et à 3, 6 et 12 mois après la FMT. La dysbiose et les bactéries fécales sont déterminées à l'aide d'une amplification d'ADN par PCR du gène d'ARNr 16S/hybridation de sonde couvrant les régions V3-V9.

Description détaillée : Patients : Deux cents patients qui remplissent les critères de Rome IV pour le syndrome du côlon irritable (SCI) seront inclus dans l'étude. Tous les sous-types IBS doivent être inclus, à l'exception d'IBS-U. Donateurs : Les enquêteurs ont sélectionné 3 donneurs (A, B et C) selon les critères utilisés dans leur précédente étude randomisée en double aveugle, contrôlée par placebo. Ces critères étaient les suivants : être un homme ou une femme en bonne santé, sans antécédents de maladie et sans prise de médicaments, âgé de 20 à 50 ans, non-fumeur et faire régulièrement de l'exercice. Ils ont été portés par voie vaginale et allaités. Ils n’ont été traités que quelques fois aux antibiotiques au cours de leur vie. Ils sont sélectionnés selon les directives européennes pour les donneurs de FMT. Avant leur acceptation comme donneurs, le profil bactérien et la dysbiose ont été analysés dans un échantillon fécal à l'aide du test de dysbiose GA-map, avec un indice de dysbiose (DI) = 1, indiquant une normobiose. Leurs selles doivent être testées tous les trois mois pendant l'essai pour exclure toute maladie transmissible. Le donneur A est un homme âgé de 41 ans, le donneur B est une femme âgée de 31 ans et le donneur C est un homme âgé de 35 ans.

Protocole : Les patients sont randomisés 1:1:1:1 dans un placebo (pour recevoir leurs propres selles), pour recevoir 90 g de greffe fécale du donneur A, du donneur B ou du donneur C. La greffe fécale est administrée au duodénum distal via le canal opérateur d'un gastroscope. Les patients doivent remplir 5 questionnaires et livrer des échantillons fécaux au départ et à 3, 6 et 12 mois après la FMT. Collecte, préparation et administration des selles : Les selles des donneurs et des patients doivent être collectées et conservées à - 80 ºC. Les selles congelées du donneur doivent être décongelées au réfrigérateur à 4 ºC et chaque portion de 30 g est dissoute dans 30 mL de solution saline stérile à 0,9 % froide à 4 ºC. Les selles dissoutes sont administrées aux patients, après une nuit de jeûne, par le canal opérateur d'un gastroduodénoscope dans la partie descendante du duodénum, ​​toujours distale par rapport à la papille de Vater. Questionnaires

1. Échelle de gravité des symptômes du SCI (IBS-SSS).
2. Échelle des symptômes de Birmingham.
3. Échelle d'évaluation de la fatigue (FAS).
4. Questionnaire IBS-qualité de vie (IBSQoL).
5. Questionnaire de fréquence alimentaire semi-quantitatif (FFQ)
6. Échelle de forme de tabouret Bristol

Analyse bactérienne : L'analyse bactérienne fécale est réalisée à l'aide d'une technique d'amplification d'ADN/hybridation par sonde du gène de l'ARNr 16S couvrant les régions V3-V9. L'extraction de l'ADN se fait à l'aide de billes magnétiques. DI s'appuie sur 54 sondes ADN ciblant plus de 300 souches bactériennes en fonction de leur séquence d'ARNr 16S dans sept régions variables (V3-V9). Quarante-neuf sondes bactériennes sont spécifiques à une espèce, 19 détectent des bactéries au niveau du genre et 9 sondes détectent des bactéries à des niveaux taxonomiques plus élevés. Le marquage des sondes se fait par extension d'un nucléotide unique et hybridation à des sondes complémentaires couplées à des billes magnétiques, et détection du signal à l'aide de l'analyseur BioCode 1000A 128-Plex (Applied BioCode, Santa Fe Springs, CA, USA). Un DI supérieur à 2 montre un profil microbiote différent de celui de la collection normobiotique de référence (DI 1-2 : non dysbiose, DI : modéré, DI 4-5 : dysbiose sévère).