Rollen til donorutvelgelse på utfallet av fekal mikrobiotatransplantasjon hos pasienter med irritabel tarmsyndrom

Studiebeskrivelse Kort sammendrag: To hundre pasienter randomiseres 1:1:1:1 til placebo (egen avføring), og får 90 g fekal transplantasjon fra donor A, donor B eller donor C. Fekaltransplantasjonen administreres til distal duodenum via arbeidskanalen til et gastroskop. Pasientene skal fylle ut 5 spørreskjemaer som måler symptomer, tretthet, livskvalitet og diettinntak ved baseline og ved sluttpunktet av studien og gi en avføringsprøve ved baseline, og 3, 6 og 12 måneder etter FMT. Dysbiose og fekale bakterier bestemmes ved å bruke 16S rRNA-genet PCR DNA-amplifikasjon/probehybridisering som dekker regioner V3-V9.

Detaljert beskrivelse: Pasienter: To hundre pasienter som oppfyller Roma IV-kriteriene for irritabel tarmsyndrom (IBS) skal inkluderes i studien. Alle IBS-undertyper skal inkluderes med unntak av IBS-U. Donorer: Undersøkerne har valgt ut 3 givere (A, B og C) i henhold til kriteriene brukt i deres tidligere randomiserte dobbeltblinde, placebokontrollerte studie. Disse kriteriene inkluderte: å være en sunn mann eller kvinne uten sykdomshistorie og ingen bruk av medisiner, i alderen 20-50 år, være ikke-røyker og trene regelmessig. De ble båret av vaginal fødsel og ammet. De ble kun behandlet noen få ganger med antibiotika i løpet av livet. De er screenet i henhold til de europeiske retningslinjene for givere for FMT. Før de ble akseptert som donorer, ble bakterieprofilen og dysbiosen analysert i en avføringsprøve ved bruk av GA-map dysbiosetesten, med en dysbioseindeks (DI)=1, som indikerer normobiose. Avføringen deres skal testes hver tredje måned under forsøket for å utelukke smittsom sykdom. Donor A er en mann på 41 år, donor B er en kvinne på 31 år og donor C er en mann på 35 år.

Protokoll: Pasientene randomiseres 1:1:1:1 til placebo (for å motta sin egen avføring), for å motta 90 g fekal transplantasjon fra donor A, fra donor B eller donor C. Fekal transplantasjon administreres til den distale duodenum via arbeidskanal til et gastroskop. Pasientene skal fylle ut 5 spørreskjemaer og levere fekale prøver ved baseline, og 3, 6 og 12 måneder etter FMT. Innsamling, klargjøring og administrering av avføring: Avføring fra både givere og pasienter skal samles og oppbevares ved -80ºC. Frossen donoravføring skal tines i kjøleskapet ved 4ºC, og hver porsjon på 30 g løses opp i 30 ml 4ºC kaldt 0,9 % sterilt saltvann. Den oppløste avføringen administreres til pasientene, etter faste over natten, gjennom arbeidskanalen til et gastroduodenoskop i pars descendens av tolvfingertarmen, alltid distalt for Vaters papilla. Spørreskjemaer

1. IBS Symptom Severity Scale (IBS-SSS).
2. Birmingham Symptom Scale.
3. Fatigue Assessment Scale (FAS).
4. Spørreskjema for IBS-livskvalitet (IBSQoL).
5. Semikvantitivt spørreskjema for matfrekvens (FFQ)
6. Bristol Stool Form Scale

Bakterieanalyse: Fekal bakteriell analyse utføres ved bruk av en 16S rRNA-gen PCR DNA-amplifikasjon/probehybridiseringsteknikk som dekker regioner V3-V9. DNA-ekstraksjon gjøres ved å bruke magnetiske perler. DI er basert på 54 DNA-prober rettet mot mer enn 300 bakteriestammer basert på deres 16S rRNA-sekvens i syv variable regioner (V3-V9). 49 bakterieprober er artsspesifikke, 19 oppdager bakterier på slektsnivå, og 9 prober oppdager bakterier på høyere taksonomiske nivåer. Probemerking er ved enkeltnukleotidforlengelse og hybridisering til komplementære prober koblet til magnetiske kuler, og signaldeteksjon ved bruk av BioCode 1000A 128-Plex Analyzer (Applied BioCode, Santa Fe Springs, CA, USA). En DI over 2 viser en mikrobiotaprofil som er forskjellig fra den for den normobiotiske referansesamlingen (DI 1-2: ikke-dysbiose, DI: moderat, DI 4-5: alvorlig dysbiose).