Identification de nouveaux spliceosomes génétiques dans le neuroblastome
12 juillet 2024 mis à jour par: Affiliated Hospital of Nantong University
Identification de nouveaux spliceosomes génétiques dans le neuroblastome et leur application translationnelle dans le diagnostic et le traitement cliniques précis
Le neuroblastome est une tumeur maligne embryonnaire de la petite enfance qui provient des cellules de la crête neurale. Le neuroblastome présente une grande hétérogénéité dans ses caractéristiques biologiques, morphologiques, génétiques et cliniques. À l'heure actuelle, les principales méthodes de traitement du neuroblastome sont le traitement chirurgical associé à la chimiothérapie après l'opération et à la thérapie immunologique. Cependant, des études cliniques ont montré que 40 à 50 % des patients n'obtiennent pas de bons résultats après une chimiothérapie postopératoire.
L'étude d'essai clinique vise à dépister le génotype des enfants atteints de neuroblastome et à mener une analyse approfondie des données de séquençage et des transcriptions spécifiques à la tumeur en utilisant des technologies : technologie de séquençage en profondeur et technologie de séquençage de troisième génération.
Les principales questions auxquelles cette étude vise à répondre sont : [Question 1] Cette étude utilisera la technologie de séquençage de troisième génération pour trouver des variantes de transcription spécifiques associées à la différenciation du cancer ; [Question 2] Cette étude identifiera une possible expression différentielle tissulaire en utilisant la technologie de séquençage profond.
Les participants subiront une intervention chirurgicale au cours de laquelle les médecins retireront le tissu tumoral et les tissus normaux adjacents. Dans cette expérience, le tissu tumoral d'enfants atteints de neuroblastome sera utilisé comme groupe expérimental et le tissu normal adjacent sera utilisé comme groupe témoin. Dans cette étude, les différents génotypes d'enfants atteints de neuroblastome sont examinés par la technologie de séquençage profond et la technologie de séquençage de troisième génération. Et selon la différence entre les génotypes, les médecins traiteront personnellement les enfants atteints de neuroblastome. Cette étude espère trouver de nouveaux polymorphismes mononucléotidiques et de nouvelles cibles thérapeutiques.
Aperçu de l'étude
Statut
Recrutement
Les conditions
Intervention / Traitement
Description détaillée
L'étude d'essai clinique vise à dépister le génotype des enfants atteints de neuroblastome et à mener une analyse approfondie des données de séquençage et des transcriptions spécifiques à la tumeur à l'aide de technologies : technologie de séquençage en profondeur et technologie de séquençage de troisième génération. Cette étude espère trouver de nouveaux polymorphismes mononucléotidiques et de nouvelles cibles thérapeutiques.
Premièrement, les chercheurs collectent des tissus tumoraux et des tissus normaux adjacents de 20 enfants atteints de neuroblastome répondant aux critères d'inclusion et collectent leurs données cliniques. Dans cette expérience, le tissu tumoral d'enfants atteints de neuroblastome sera utilisé comme groupe expérimental et le tissu normal adjacent sera utilisé comme groupe témoin.
Deuxièmement, les chercheurs découvriront des gènes différentiellement exprimés en utilisant la technologie de séquençage profond et la technologie de séquençage de troisième génération pour séquencer 7 lignées cellulaires de neuroblastome. L'expression des isoformes de transcription a été divisée en un groupe d'amplification du gène N-myc et un autre groupe de non-amplification du gène N-myc en utilisant la technologie de séquençage de troisième génération. Après avoir extrait l’ARN total des tissus, les chercheurs vérifient la pureté, la concentration et l’intégrité de l’ARN. Si l’ARN est testé conformément aux normes, les chercheurs construiront une bibliothèque de gènes. Une fois la construction de la bibliothèque génétique terminée, les chercheurs utiliseront la machine pour séquencer les tissus.
Enfin, une analyse de survie et des mesures répétées seront utilisées pour analyser les données du groupe expérimental et du groupe témoin dans cette expérience. Le test T sera utilisé pour les données de mesure. Le test χ2 sera utilisé pour compter les données. La méthode Kaplan-Meier et l'analyse de régression de Cox seront utilisées pour l'analyse de survie. Toutes les analyses statistiques seront effectuées à l'aide du logiciel d'analyse statistique (Stata 26.0). P <0,05 est considéré comme significatif.
Type d'étude
Observationnel
Inscription (Estimé)
20
Contacts et emplacements
Cette section fournit les coordonnées de ceux qui mènent l'étude et des informations sur le lieu où cette étude est menée.
Coordonnées de l'étude
- Nom: Wenliang Ge, archiater
- Numéro de téléphone: 0086-13962854122
- E-mail: gewl@ntu.edu.cn
Lieux d'étude
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Jiangsu
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Nantong, Jiangsu, Chine
- Recrutement
- Affiliated Hospital of Nantong University
-
Contact:
- Wenliang Ge, archiater
- Numéro de téléphone: 0086-13962854122
- E-mail: gewl@ntu.edu.cn
-
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Critères de participation
Les chercheurs recherchent des personnes qui correspondent à une certaine description, appelée critères d'éligibilité. Certains exemples de ces critères sont l'état de santé général d'une personne ou des traitements antérieurs.
Critère d'éligibilité
Âges éligibles pour étudier
- Enfant
Accepte les volontaires sains
Non
Méthode d'échantillonnage
Échantillon de probabilité
Population étudiée
L'échantillon provient de patients atteints de neuroblastome qui ont subi une chirurgie laparoscopique/ouverte du neuroblastome à l'hôpital affilié à l'université de Nantong de 2024 à 2026.
Les enfants atteints de neuroblastome sont âgés de 0 à 14 ans, quel que soit leur sexe.
Les examens d'imagerie préopératoires indiquent un patient atteint de neuroblastome.
Avant la chimiothérapie postopératoire, la force physique du patient est bonne.
Un examen pathologique préopératoire du patient révèle un neuroblastome.
Les patients n’ont aucun autre antécédent de tumeur maligne.
Les patients participent volontairement et signent un consentement éclairé et peuvent se conformer au plan de visite d'étude et aux autres exigences du protocole.
La description
Critère d'intégration:
- Les enfants atteints de neuroblastome sont âgés de 0 à 14 ans, quel que soit leur sexe ;
- Les examens d'imagerie préopératoires indiquent un patient atteint de neuroblastome ;
- Avant la chimiothérapie postopératoire, la force physique du patient est bonne. Dans le même temps, les résultats des globules blancs, des neutrophiles, de l'hémoglobine, des plaquettes et d'autres indicateurs de test se situent tous dans la plage normale, ce qui est conforme aux conditions de traitement de la chimiothérapie et de l'immunothérapie concernées ;
- L'examen pathologique préopératoire du patient révèle un neuroblastome ;
- Les patients n'ont aucun autre antécédent de tumeur maligne ;
- Les patients participent volontairement et signent un consentement éclairé et peuvent se conformer au plan de visite d'étude et aux autres exigences du protocole.
Critère d'exclusion:
- Les patients présentant des métastases à distance ou une ascite lors de l'examen préopératoire sont exclus ;
- Les patients présentant un dysfonctionnement hépatique et rénal grave, ainsi que ceux atteints de maladies auto-immunes sont exclus ;
- Les patients atteints d'une maladie cardiovasculaire grave qui ne tolèrent pas l'anesthésie générale sont exclus ;
- Les patients présentant d'autres tumeurs malignes ou troubles sanguins sont exclus.
Plan d'étude
Cette section fournit des détails sur le plan d'étude, y compris la façon dont l'étude est conçue et ce que l'étude mesure.
Comment l'étude est-elle conçue ?
Détails de conception
Cohortes et interventions
Groupe / Cohorte |
Intervention / Traitement |
|---|---|
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groupe neuroblastome
Le tissu tumoral réséqué de patients atteints de neuroblastome a été prélevé par opération chirurgicale en tant que groupe expérimental.
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Si la taille du tissu tumoral est trop grande, le médecin administre une chimiothérapie au patient, puis effectue une intervention chirurgicale pour retirer la tumeur.
Dans cette étude, les génotypes d'enfants atteints de neuroblastome sont dépistés à l'aide de la technologie de séquençage profond et de la technologie de séquençage de troisième génération, et le traitement sera effectué selon différentes modalités thérapeutiques.
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Tissu normal adjacent au groupe tumoral
Le tissu normal adjacent à la tumeur des patients atteints de neuroblastome a été prélevé chirurgicalement comme groupe témoin.
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Que mesure l'étude ?
Principaux critères de jugement
Mesure des résultats |
Description de la mesure |
Délai |
|---|---|---|
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L'expression différentielle des tissus
Délai: 1 an
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La mesure des résultats est le changement dans l'expression différentielle tissulaire obtenue en comparant les résultats de séquençage profond d'échantillons de tissus de neuroblastome et d'échantillons de tissus normaux.
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1 an
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Variante de transcription spécifique
Délai: 1 an
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Les changements dans les transcriptions spécifiques liées à la différenciation tumorale ont été découverts en comparant le séquençage de troisième génération de lignées cellulaires d'échantillons de tissus de neuroblastome.
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1 an
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Collaborateurs et enquêteurs
C'est ici que vous trouverez les personnes et les organisations impliquées dans cette étude.
Les enquêteurs
- Chaise d'étude: Wenliang Ge, archiater, Nantong University Affiliated Hospital
Publications et liens utiles
La personne responsable de la saisie des informations sur l'étude fournit volontairement ces publications. Il peut s'agir de tout ce qui concerne l'étude.
Publications générales
- Janoueix-Lerosey I, Schleiermacher G, Michels E, Mosseri V, Ribeiro A, Lequin D, Vermeulen J, Couturier J, Peuchmaur M, Valent A, Plantaz D, Rubie H, Valteau-Couanet D, Thomas C, Combaret V, Rousseau R, Eggert A, Michon J, Speleman F, Delattre O. Overall genomic pattern is a predictor of outcome in neuroblastoma. J Clin Oncol. 2009 Mar 1;27(7):1026-33. doi: 10.1200/JCO.2008.16.0630. Epub 2009 Jan 26.
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- Ackermann S, Cartolano M, Hero B, Welte A, Kahlert Y, Roderwieser A, Bartenhagen C, Walter E, Gecht J, Kerschke L, Volland R, Menon R, Heuckmann JM, Gartlgruber M, Hartlieb S, Henrich KO, Okonechnikov K, Altmuller J, Nurnberg P, Lefever S, de Wilde B, Sand F, Ikram F, Rosswog C, Fischer J, Theissen J, Hertwig F, Singhi AD, Simon T, Vogel W, Perner S, Krug B, Schmidt M, Rahmann S, Achter V, Lang U, Vokuhl C, Ortmann M, Buttner R, Eggert A, Speleman F, O'Sullivan RJ, Thomas RK, Berthold F, Vandesompele J, Schramm A, Westermann F, Schulte JH, Peifer M, Fischer M. A mechanistic classification of clinical phenotypes in neuroblastoma. Science. 2018 Dec 7;362(6419):1165-1170. doi: 10.1126/science.aat6768.
- Peifer M, Hertwig F, Roels F, Dreidax D, Gartlgruber M, Menon R, Kramer A, Roncaioli JL, Sand F, Heuckmann JM, Ikram F, Schmidt R, Ackermann S, Engesser A, Kahlert Y, Vogel W, Altmuller J, Nurnberg P, Thierry-Mieg J, Thierry-Mieg D, Mariappan A, Heynck S, Mariotti E, Henrich KO, Gloeckner C, Bosco G, Leuschner I, Schweiger MR, Savelyeva L, Watkins SC, Shao C, Bell E, Hofer T, Achter V, Lang U, Theissen J, Volland R, Saadati M, Eggert A, de Wilde B, Berthold F, Peng Z, Zhao C, Shi L, Ortmann M, Buttner R, Perner S, Hero B, Schramm A, Schulte JH, Herrmann C, O'Sullivan RJ, Westermann F, Thomas RK, Fischer M. Telomerase activation by genomic rearrangements in high-risk neuroblastoma. Nature. 2015 Oct 29;526(7575):700-4. doi: 10.1038/nature14980. Epub 2015 Oct 14.
- Roderwieser A, Sand F, Walter E, Fischer J, Gecht J, Bartenhagen C, Ackermann S, Otte F, Welte A, Kahlert Y, Lieberz D, Hertwig F, Reinhardt HC, Simon T, Peifer M, Ortmann M, Buttner R, Hero B, O'Sullivan RJ, Berthold F, Fischer M. Telomerase Is a Prognostic Marker of Poor Outcome and a Therapeutic Target in Neuroblastoma. JCO Precis Oncol. 2019 Dec;3:1-20. doi: 10.1200/PO.19.00072.
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- Hartlieb SA, Sieverling L, Nadler-Holly M, Ziehm M, Toprak UH, Herrmann C, Ishaque N, Okonechnikov K, Gartlgruber M, Park YG, Wecht EM, Savelyeva L, Henrich KO, Rosswog C, Fischer M, Hero B, Jones DTW, Pfaff E, Witt O, Pfister SM, Volckmann R, Koster J, Kiesel K, Rippe K, Taschner-Mandl S, Ambros P, Brors B, Selbach M, Feuerbach L, Westermann F. Alternative lengthening of telomeres in childhood neuroblastoma from genome to proteome. Nat Commun. 2021 Feb 24;12(1):1269. doi: 10.1038/s41467-021-21247-8.
- Cheung NK, Zhang J, Lu C, Parker M, Bahrami A, Tickoo SK, Heguy A, Pappo AS, Federico S, Dalton J, Cheung IY, Ding L, Fulton R, Wang J, Chen X, Becksfort J, Wu J, Billups CA, Ellison D, Mardis ER, Wilson RK, Downing JR, Dyer MA; St Jude Children's Research Hospital-Washington University Pediatric Cancer Genome Project. Association of age at diagnosis and genetic mutations in patients with neuroblastoma. JAMA. 2012 Mar 14;307(10):1062-71. doi: 10.1001/jama.2012.228.
- Qadeer ZA, Valle-Garcia D, Hasson D, Sun Z, Cook A, Nguyen C, Soriano A, Ma A, Griffiths LM, Zeineldin M, Filipescu D, Jubierre L, Chowdhury A, Deevy O, Chen X, Finkelstein DB, Bahrami A, Stewart E, Federico S, Gallego S, Dekio F, Fowkes M, Meni D, Maris JM, Weiss WA, Roberts SS, Cheung NV, Jin J, Segura MF, Dyer MA, Bernstein E. ATRX In-Frame Fusion Neuroblastoma Is Sensitive to EZH2 Inhibition via Modulation of Neuronal Gene Signatures. Cancer Cell. 2019 Nov 11;36(5):512-527.e9. doi: 10.1016/j.ccell.2019.09.002. Epub 2019 Oct 17.
- George SL, Parmar V, Lorenzi F, Marshall LV, Jamin Y, Poon E, Angelini P, Chesler L. Novel therapeutic strategies targeting telomere maintenance mechanisms in high-risk neuroblastoma. J Exp Clin Cancer Res. 2020 May 6;39(1):78. doi: 10.1186/s13046-020-01582-2.
Dates d'enregistrement des études
Ces dates suivent la progression des dossiers d'étude et des soumissions de résultats sommaires à ClinicalTrials.gov. Les dossiers d'étude et les résultats rapportés sont examinés par la Bibliothèque nationale de médecine (NLM) pour s'assurer qu'ils répondent à des normes de contrôle de qualité spécifiques avant d'être publiés sur le site Web public.
Dates principales de l'étude
Début de l'étude (Réel)
1 avril 2024
Achèvement primaire (Estimé)
31 août 2024
Achèvement de l'étude (Estimé)
31 août 2024
Dates d'inscription aux études
Première soumission
30 juin 2024
Première soumission répondant aux critères de contrôle qualité
12 juillet 2024
Première publication (Réel)
16 juillet 2024
Mises à jour des dossiers d'étude
Dernière mise à jour publiée (Réel)
16 juillet 2024
Dernière mise à jour soumise répondant aux critères de contrôle qualité
12 juillet 2024
Dernière vérification
1 avril 2024
Plus d'information
Termes liés à cette étude
Mots clés
Termes MeSH pertinents supplémentaires
- Tumeurs par type histologique
- Tumeurs
- Tumeurs, glandulaires et épithéliales
- Tumeurs, neuroépithéliales
- Tumeurs neuroectodermiques
- Tumeurs, cellules germinales et embryonnaires
- Tumeurs, tissu nerveux
- Tumeurs neuroectodermiques primitives
- Tumeurs neuroectodermiques, primitives, périphériques
- Neuroblastome
Autres numéros d'identification d'étude
- LCYJ20242005
Plan pour les données individuelles des participants (IPD)
Prévoyez-vous de partager les données individuelles des participants (DPI) ?
NON
Informations sur les médicaments et les dispositifs, documents d'étude
Étudie un produit pharmaceutique réglementé par la FDA américaine
Non
Étudie un produit d'appareil réglementé par la FDA américaine
Non
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