Identifiering av nya genspliceosomer i neuroblastom

Den kliniska prövningsstudien syftar till att screena genotypen av barn med neuroblastom och genomföra en djupgående analys av sekvenseringsdata och tumörspecifika transkript med hjälp av teknologier - Deep Sequencing Technology och Third Generation Sequencing Technology. Denna studie hoppas kunna hitta nya enkelnukleotidpolymorfism och terapeutiska mål.

För det första samlar forskare in tumörvävnader och angränsande normala vävnader från 20 barn med neuroblastom som uppfyller inklusionskriterierna och samlar in deras kliniska data. I detta experiment kommer tumörvävnaden hos barn med neuroblastom att användas som experimentgrupp, och den intilliggande normala vävnaden kommer att användas som kontrollgrupp.

För det andra kommer forskare att hitta differentiellt uttryckta gener som använder Deep Sequencing-teknologi och Third Generation Sequencing Technology för att sekvensera 7 neuroblastomcellinjer. Expressionen av transkriptionsisoformerna delades upp i en grupp av N-myc-genamplifiering och en annan grupp av N-myc-gen-icke-amplifiering genom att använda tredje generationens sekvenseringsteknologi. Efter att ha extraherat det totala RNA från vävnader kontrollerar forskarna RNA:s renhet, koncentration och integritet. Om RNA testas upp till standard kommer forskarna att bygga ett genbibliotek. Efter att konstruktionen av genbiblioteket är klar kommer forskarna att använda maskinen för att sekvensera vävnader.

Slutligen kommer överlevnadsanalys och upprepade mätningar att användas för att analysera data från experimentgruppen och kontrollgruppen i detta experiment. T-test kommer att användas för mätdata. χ2-test kommer att användas för att räkna data. Kaplan-Meier metod och Cox regressionsanalys kommer att användas för överlevnadsanalys. Alla statistiska analyser kommer att utföras med programvara för statistisk analys (Stata 26.0). P < 0,05 anses signifikant.