Prévalence et mortalité associée des infections par des organismes multirésistants dans les unités de soins intensifs pour adultes (PREV-AR)

Méthodes Conception de l'étude PREVAR (PREValence of infection by MDR-microorganisms in ARgentina) était une étude nationale, transversale et multicentrique de 24 heures conçue et menée par SADI et SATI dans les USI argentines.

Les sites participants ont été recrutés pour participer via des annonces lors de réunions nationales, les sites Web des sociétés officielles, les réseaux sociaux, trois réunions en ligne expliquant le projet et des e-mails à tous les membres de la société. Les hôpitaux ont été enregistrés sur un site Web sécurisé, sur lequel les enquêteurs locaux ont enregistré les principales caractéristiques du site sous forme électronique.

Les données des patients ont été saisies dans un formulaire de rapport de cas électronique (CRF) à l'aide de la base de données Research Electronic Data Capture (REDCap) (annexe 2). Des chercheurs locaux ont été formés lors de réunions en ligne sur la façon de remplir le CRF. Un centre de données centralisé était chargé de gérer la base de données et de surveiller la qualité des données en contact étroit avec les chercheurs locaux afin de minimiser l'apparition de données manquantes. Une adresse e-mail dédiée a été créée pour rationaliser la communication.

Les données individuelles des patients ont été anonymisées en attribuant un code numérique à chaque cas et enregistrées par ordre d'admission.

Chaque comité d'examen institutionnel local a approuvé l'étude et établi l'exigence d'un consentement éclairé.

Le protocole de l’étude PREVAR est disponible en annexe 3. Tous les patients adultes, âgés de 18 ans et plus, présents dans une unité de soins intensifs participante le jour de l'étude pendant la période de 24 heures (à partir de 8h00) ont été inclus. La date exacte pourrait être choisie entre le 24 et le 28 novembre 2023, afin de faciliter la logistique des sites individuels. Les patients présents le premier jour à l’USI étaient disponibles pour être inclus dans la cohorte, qui a ensuite été suivie pour la mortalité. Il n'y avait aucun critère d'exclusion.

Procédures Le CRF comprenait les caractéristiques de base et démographiques des participants à l'étude : date d'admission à l'hôpital et aux soins intensifs, âge, sexe, comorbidités, scores APACHE II et SOFA enregistrés à l'admission ; facteurs de risque d'infection par MDRO au cours des six mois précédents, tels qu'une admission antérieure à l'hôpital, une colonisation par Enterobacterales spp (seule la colonisation par CPE a été mesurée, car il s'agit du seul type de colonisation habituellement surveillé dans les unités de soins intensifs argentines) et l'utilisation d'antibiotiques ; Le type d’admission (chirurgie médicale, élective ou d’urgence) a également été collecté. Les données concernant la colonisation par des entérobactéries productrices de carbapénémases au cours de la période comprise entre l'admission à l'hôpital et l'inscription ont été documentées, que la colonisation ait été détectée à l'hôpital ou en soins intensifs. Le score SOFA a également été calculé le jour de l'inscription.

L’état clinique du patient concernant l’infection a été enregistré par le médecin traitant selon les définitions SEPSIS-3 comme : sans infection, avec infection mais pas de sepsis, sepsis et choc septique.10 De plus, les infections ont été considérées comme certaines (confirmées microbiologiquement) et probables ou possibles, selon les définitions de l'International Sepsis Forum (ISF) pour la pneumonie, les infections du sang (y compris l'endocardite infectieuse), la septicémie liée au cathéter intravasculaire, les infections intra-abdominales, urosepsis et infections des plaies chirurgicales. 11 Dans les cas où les résultats des cultures étaient en attente, la catégorisation a été revue avec les enquêteurs principaux lorsque les résultats ont été rendus disponibles. Les définitions des sites d’infection étaient celles fournies par l’ISF. 11 Les infections ont été enregistrées comme étant contractées dans la communauté, en soins intensifs, à l'hôpital hors soins intensifs ou comme provenant d'établissements de soins de longue durée.

Selon les résultats microbiologiques, les infections ont été enregistrées comme MDRO ou non-MDRO. Les MDRO d'intérêt étaient A.baumannii, P. aeruginosa difficile à traiter, les entérobactéries productrices de carbapénémases, les micro-organismes producteurs de β-lactamases à spectre étendu (BLSE), les entérocoques résistants à la vancomycine et S. aureus résistant à la méthicilline (SARM). Si disponible, d'autres méthodes de diagnostic ont été utilisées pour les classer davantage comme : entérobactéries productrices de carbapénémases KPC (KPC), métallo-bêta-lactamases (MBL), oxacillinases (OXA), organismes producteurs de β-lactamases à spectre étendu (BLSE) et bêta-lactamases AMPC. Le groupe d'infections produites par des non-MDRO pour cette étude comprenait des infections par S.pneumoniae, S.pyogenes, S.aureus, E.Coli, Staphylococcus à coagulase négative, Proteus sp., KES (Klebsiella-Enterobacter-Serratia-Citrobacter (KESC), C. difficile et autres.

Le traitement antimicrobien prescrit était classé empirique ou ciblé, selon la présence ou non de cultures positives ; pour un traitement ciblé comme étant adéquat ou inadéquat, selon les tests de sensibilité aux antimicrobiens ; comme utilisant des antibiotiques nouveaux ou « anciens » selon les lignes directrices européennes pour le traitement des infections causées par des bacilles Gram négatif multirésistants 12 ; et comme recevant des groupes d'antibiotiques Access, Watch et Reserve selon la classification AWaRe de l'OMS.) 13 patients ont été suivis jusqu'à leur sortie de l'USI ou leur décès en USI.

Les hôpitaux étaient classés comme généraux ou spécialisés, et comme publics ou privés. Le nombre total de lits d'hôpital a été enregistré ainsi que les lits de soins intensifs et la disponibilité de certaines ressources pertinentes, telles que le comité de contrôle des infections et le programme de gestion des antimicrobiens. De plus, la surveillance MDRO des infections et de la colonisation et la fréquence à laquelle elle était effectuée (hebdomadairement, à l'admission en soins intensifs et/ou avant la chirurgie) ont été détaillées. Les méthodes utilisées pour détecter les mécanismes de résistance bactérienne ont été enregistrées comme étant phénotypiques, moléculaires ou immunochromatographiques.

Le protocole de l'étude, le CRF et l'ensemble des définitions figurent dans le manuel d'exploitation (annexe 4).

Résultats Le principal critère de jugement était la prévalence de l'infection par MDRO. Les critères de jugement secondaires étaient la mortalité globale en soins intensifs et ses déterminants indépendants, la mortalité en soins intensifs à 28 jours, les déterminants des infections par MDRO, la prévalence de la colonisation par CPE et de l'infection en général, et la durée du séjour en soins intensifs. Les données ont été censurées pendant 60 jours.

Analyse statistique La prévalence a été calculée comme le nombre d'infections causées par les MDRO divisé par le nombre de patients en soins intensifs le jour de l'étude.

Les variables sont présentées sous forme de nombres absolus et de pourcentages, ou sous forme de médianes et d'intervalles interquartiles (IQR). Les différences dans les variables enregistrées entre les patients atteints d'infections MDRO et non-MDRO, entre survivants et non-survivants et entre les patients avec et sans infection ont été analysées à l'aide du test χ² ou du test exact de Fisher pour les variables catégorielles, et du test t ou du classement de Wilcoxon. test de somme pour les variables continues, le cas échéant.

Pour estimer les associations entre les caractéristiques des patients, les facteurs organisationnels des soins intensifs et les caractéristiques des hôpitaux avec l'infection par MDRO et la mortalité en soins intensifs, un modèle à effets mixtes a été réalisé. Ces modèles ont une structure hiérarchique avec des patients (niveau 1) imbriqués au sein des hôpitaux (niveau 2). Cette imbrication tient compte de la corrélation potentielle des résultats au sein du même hôpital. Effets aléatoires : les hôpitaux ont été traités comme des effets aléatoires pour tenir compte de la corrélation potentielle des résultats au sein du même hôpital et pour capturer la variabilité entre les hôpitaux grâce à des interceptions aléatoires. Effets fixes : les caractéristiques des patients et les facteurs organisationnels des soins intensifs ont été inclus comme effets fixes, car ce sont les principaux effets. prédicteurs d’intérêt.

Seules les variables avec une valeur P <0,20 dans l'analyse bivariée ont été introduites dans le modèle final. Les résultats pour les effets fixes sont présentés sous forme d'odds ratios (OR) avec des intervalles de confiance (IC) à 95 %. Les effets aléatoires, ou mesures de variation, sont rapportés sous la forme de la variance, de son erreur type (SE) et du OU médian. La signification statistique des covariables a été déterminée à l'aide du test du rapport de vraisemblance.

Toutes les valeurs p rapportées sont bilatérales, une valeur p <0,05 étant considérée comme statistiquement significative.

Le bailleur de fonds de l’étude n’a joué aucun rôle dans la conception de l’étude, la collecte de données, l’analyse des données, l’interprétation des données ou la rédaction du rapport.