Microbiote intestinal TNBC pendant le traitement néoadjuvant

Il s'agit d'une étude prospective randomisée avec un petit groupe de 30 patients (étude pilote). Une fois les participants inscrits, ils seront randomisés dans un rapport de 2 : 1 entre l'intervention nutritionnelle (conseils personnalisés sur l'augmentation de l'apport en fibres et le maintien d'un apport calorique adéquat pendant le traitement du cancer du sein) ou un document éducatif sur l'augmentation de l'apport en fibres. La randomisation sera masquée à l'aide d'un générateur de nombres aléatoires. Les enquêteurs et les prestataires de soins de santé ne seront pas aveuglés en raison de la nature de l'intervention elle-même, mais tous les documents liés à l'intervention nutritionnelle personnalisée ne feront pas partie du dossier médical électronique du participant. Les co-enquêteurs effectuant l'analyse des données ne connaîtront pas les tâches de groupe des participants.

Le consentement sera obtenu lors de l'inscription. Les variables à collecter dans le cadre du questionnaire démographique de base comprennent : l'âge, le sexe, l'état civil, le niveau d'éducation, la situation professionnelle, le revenu annuel, la résidence (code postal), l'IMC, les médicaments et la dose, le stade TNBC au moment du diagnostic et le type de traitement ( s).

Les participants effectueront : des mises à jour provisoires sur les médicaments, y compris l'utilisation d'antibiotiques (enquête intermédiaire), les symptômes gastro-intestinaux à l'aide de l'évaluation des symptômes gastro-intestinaux PROMIS, l'apport alimentaire (NCI-DSQ) avec deux journaux alimentaires de 24 heures, l'état de performance (échelle FACT-G), l'anxiété ( GAD-7), dépression (PHQ-9) et activité physique (RAPA). Si les participants signalent une anxiété et/ou une dépression modérée à sévère via les enquêtes GAD-7 et/ou PHQ-9, respectivement, ils seront informés par téléphone ou par e-mail pour contacter leur fournisseur de soins primaires ou leur oncologue pour obtenir une évaluation rapide. Des échantillons de selles seront collectés au départ (prétraitement), à des moments de 6 semaines, 12 semaines, 18 semaines et 24 semaines. La période d'intervalle de 6 semaines a été sélectionnée en fonction des cycles de traitement attendus avec de la doxorubicine/cyclophosphamide et du Taxol +/- pembrolizumab à dose dense. Cet intervalle a également été sélectionné en fonction du temps minimum attendu pour des changements potentiels dans l'apport alimentaire et les symptômes pendant le traitement. Des rappels d'enquête seront envoyés via l'application toutes les 6 semaines et les données seront exportées vers RedCap.

L'intervention nutritionnelle pour le groupe de traitement - conseils personnalisés sur l'augmentation de l'apport en fibres et le maintien d'un apport calorique adéquat pendant le traitement - sera administrée sous la forme (1) d'une consultation initiale de télésanté de 60 minutes au cours de la première semaine d'inscription à l'étude, et (2) jusqu'à deux suivis de 30 minutes tout au long de l'étude, idéalement le premier suivi dans les 6 semaines suivant l'inscription à l'étude. Ces séances seront dirigées par une diététiste professionnelle utilisant la sensibilisation culturelle et l'évaluation des symptômes. Les notes de séance seront incluses dans les dossiers médicaux des participants. L'intervention des participants témoins sera un document éducatif sur l'augmentation de l'apport en fibres. Les étudiants en maîtrise en exercice et en sciences nutritionnelles de l'Université d'État de San Diego (SDSU) aideront tous les participants à remplir deux journaux alimentaires ASA24 de 24 heures à chaque instant, ainsi que d'autres enquêtes. La composition nutritionnelle rapportée dans les journaux de 24 heures sera analysée au SDSU à l'aide de l'ASA24.

Les participants recueilleront des échantillons de selles à l'aide du kit Zymo Research, qui s'est déjà révélé tout aussi efficace qu'un échantillon de selles plus grand (scoop)10 envoyé par la poste à leur domicile. Ce kit comprend un tube de collecte fécale, un récupérateur de matières fécales, un sac pour risques biologiques, des gants et des instructions multilingues. Pour encourager la participation et la rétention, les participants recevront un chèque-cadeau de 40 $ par échantillon de selles avec une compensation totale pouvant aller jusqu'à 200 $. Les participants enverront des échantillons de selles au Scripps Biorepository et traités pour être stockés à -80 degrés C. Une fois tous les échantillons collectés, ils seront envoyés au Scripps Genomics Core pour l'extraction de l'ADN et le séquençage 16S. L'analyse des données de séquençage par le CCBB comprendra la classification taxonomique, les tableaux d'abondance, l'analyse de la diversité (indices alpha et bêta) et les tracés d'analyse en composantes principales (ACP). Les analyses de sous-ensembles compareront les participants ayant une consommation élevée/faible de fibres, un apport calorique élevé/faible, un surpoids/pas de surpoids selon l'IMC et un traitement dirigé contre le cancer (chimiothérapie seule ou avec immunothérapie).

Les données d'enquête seront importées dans GraphPad Prism pour la visualisation et les analyses. Pour chaque élément de l'enquête collecté aux 5 points temporels, un modèle à effets mixtes sera utilisé dans lequel le résultat de l'élément de l'enquête est la variable dépendante, le groupe (contrôle ou intervention nutritionnelle) et le point temporel sont des effets fixes, et le participant est traité comme un effet aléatoire. . Le modèle à effets mixtes utilise une estimation du maximum de vraisemblance restreinte pour tenir compte des valeurs manquantes. Les résidus seront examinés pour garantir que l'approximation de la normalité est atteinte. Les valeurs P seront rapportées pour chaque effet fixe (groupe et temps) et l'interaction entre ces effets, rapportée sous forme de temps x groupe.

Pour l'analyse TME, jusqu'à 3 participants ayant un apport alimentaire riche en fibres et 3 participants présentant une maladie résiduelle (c'est-à-dire jusqu'à 6 au total) seront sélectionnés sur la base d'un examen rétrospectif des dossiers, et des échantillons de biopsie avant et après le traitement seront identifié par le département de pathologie. Les échantillons seront ensuite traités et montés sur des lames, chacune avec 1 participant avec des échantillons de traitement pré- et post-néoadjuvant appariés par lame pour le profilage transcriptionnel spatial GeoMx de 96 régions d'intérêt (ROI) via le Scripps Genomics Core. Le CCBB effectuera une analyse statistique pour identifier les voies de signalisation et la composition des cellules immunitaires dans le TNBC.

À la fin de l'étude, les participants se verront proposer de participer à une séance individuelle via une plateforme de vidéoconférence (telle que Zoom) pour donner l'occasion aux participants de partager dans leurs propres mots leurs expériences dans l'étude et dans l'utilisation du application d'enquête. Plus précisément, les participants seront invités à discuter de l'utilité du matériel pédagogique fourni, de la facilité de navigation dans l'application d'étude et de participation à l'étude, ainsi que d'autres commentaires qui aideront les oncologues médicaux et les diététistes à améliorer continuellement l'expérience des patients pendant le traitement néoadjuvant. Les participants qui désinstallent l'application CareEvolution ou qui n'ont pas interagi avec l'application depuis plus de 60 jours seront exclus de l'étude.