Microbiota intestinale TNBC durante il trattamento neoadiuvante

Questo è uno studio prospettico randomizzato con un piccolo gruppo di 30 pazienti (studio pilota). Una volta arruolati, i partecipanti verranno randomizzati in un rapporto 2:1 tra l'intervento nutrizionale (consulenza personalizzata sull'aumento dell'assunzione di fibre e il mantenimento di un adeguato apporto calorico durante il trattamento del cancro al seno) o un volantino educativo sull'aumento dell'assunzione di fibre. La randomizzazione verrà nascosta utilizzando un generatore di numeri casuali. I ricercatori e gli operatori sanitari non saranno accecati dalla natura dell'intervento stesso, ma tutta la documentazione relativa all'intervento nutrizionale personalizzato non farà parte della cartella clinica elettronica del partecipante. I co-investigatori che completano l'analisi dei dati saranno ciechi rispetto alle assegnazioni di gruppo dei partecipanti.

Il consenso verrà ottenuto al momento dell'iscrizione. Le variabili da raccogliere come parte del questionario demografico di base includono: età, sesso, stato civile, livello di istruzione, stato occupazionale, reddito annuo, residenza (codice postale), BMI, farmaci e dose, stadio TNBC alla diagnosi e tipo di trattamento ( S).

I partecipanti completeranno: aggiornamenti temporanei sui farmaci incluso l'uso di antibiotici (indagine interinale), sintomi gastrointestinali utilizzando la valutazione dei sintomi gastrointestinali PROMIS, assunzione dietetica (NCI-DSQ) con due registri alimentari di 24 ore, stato delle prestazioni (scala FACT-G), ansia ( GAD-7), depressione (PHQ-9) e attività fisica (RAPA). Se i partecipanti segnalano ansia e/o depressione da moderata a grave rispettivamente attraverso i sondaggi GAD-7 e/o PHQ-9, verranno avvisati telefonicamente o via e-mail per contattare il proprio medico di base o l'oncologo per richiedere una valutazione tempestiva. I campioni di feci verranno raccolti al basale (pre-trattamento), a 6 settimane, 12 settimane, 18 settimane e 24 settimane. Il periodo di intervallo di 6 settimane è stato selezionato in base ai cicli di trattamento attesi con doxorubicina/ciclofosfamide a dose densa e Taxol +/- pembrolizumab. Questo intervallo è stato selezionato anche in base al tempo minimo previsto per potenziali cambiamenti nell'assunzione dietetica e nei sintomi durante il trattamento. I promemoria del sondaggio verranno inviati tramite l'app ogni 6 settimane e i dati verranno esportati in RedCap.

L'intervento nutrizionale per il gruppo di trattamento - consulenza personalizzata sull'aumento dell'assunzione di fibre e sul mantenimento di un adeguato apporto calorico durante il trattamento - verrà somministrato come (1) una consultazione di telemedicina iniziale di 60 minuti entro la prima settimana di iscrizione allo studio e (2) fino a due follow-up di 30 minuti durante lo studio, idealmente il primo follow-up entro 6 settimane dall'iscrizione allo studio. Queste sessioni saranno condotte da un dietista registrato utilizzando la consapevolezza culturale e la valutazione dei sintomi. Gli appunti della sessione saranno inclusi nella cartella clinica dei partecipanti. L'intervento dei partecipanti al controllo consisterà in un volantino educativo sull'aumento dell'assunzione di fibre. Gli studenti del master in Scienze motorie e nutrizionali della San Diego State University (SDSU) aiuteranno tutti i partecipanti a completare due registri alimentari ASA24 24 ore su 24 in ciascun punto temporale insieme ad altri sondaggi. La composizione nutrizionale riportata nei registri delle 24 ore sarà analizzata presso SDSU utilizzando ASA24.

I partecipanti raccoglieranno campioni di feci utilizzando il kit Zymo Research, che in precedenza ha dimostrato di essere altrettanto efficace di un campione di feci più grande (paletta),10 spedito a casa. Questo kit include un tubo per la raccolta delle feci, un raccoglitore di feci, una borsa per materiali a rischio biologico, guanti e istruzioni multilingue. Per incoraggiare la partecipazione e la fidelizzazione, ai partecipanti verrà dato un buono regalo di $ 40 per campione di feci con un compenso totale fino a $ 200. I partecipanti invieranno i campioni di feci allo Scripps Biorepository e li processeranno per la conservazione a -80 gradi C. Una volta raccolti tutti i campioni, verranno inviati allo Scripps Genomics Core per l'estrazione del DNA e il sequenziamento 16S. L'analisi dei dati di sequenziamento da parte del CCBB includerà la classificazione tassonomica, le tabelle di abbondanza, l'analisi della diversità (indici alfa e beta) e i grafici dell'analisi delle componenti principali (PCA). Le analisi dei sottoinsiemi confronteranno i partecipanti con consumo elevato/basso di fibre, apporto calorico elevato/basso, sovrappeso/non sovrappeso in base al BMI e trattamento antitumorale (sola chemioterapia o con immunoterapia).

I dati del sondaggio verranno importati in GraphPad Prism per la visualizzazione e l'analisi. Per ogni elemento dell'indagine raccolto in tutti e 5 i punti temporali, verrà utilizzato un modello a effetti misti in cui il risultato dell'elemento dell'indagine è la variabile dipendente, il gruppo (controllo o intervento nutrizionale) e il punto temporale sono effetti fissi e il partecipante viene trattato come un effetto casuale . Il modello a effetti misti utilizza una stima di massima verosimiglianza ristretta per tenere conto dei valori mancanti. I residui saranno esaminati per garantire che venga rispettata un'approssimazione della normalità. Verranno riportati i valori P per ciascun effetto fisso (gruppo e tempo) e l'interazione tra questi effetti, riportata come tempo x gruppo.

Per l'analisi TME, saranno selezionati fino a 3 partecipanti con assunzione dietetica ricca di fibre che presentano pCR e 3 partecipanti con malattia residua (ovvero fino a 6 in totale) sulla base di una revisione retrospettiva della cartella e verranno analizzati campioni bioptici prima e dopo il trattamento identificati attraverso il Dipartimento di Patologia. I campioni verranno ulteriormente elaborati e montati su vetrini, ciascuno con 1 partecipante con campioni di trattamento pre e post-neoadiuvante abbinati per vetrino per la profilazione trascrizionale spaziale GeoMx di 96 regioni di interesse (ROI) attraverso Scripps Genomics Core. Il CCBB eseguirà analisi statistiche per identificare le vie di segnalazione e la composizione delle cellule immunitarie nel TNBC.

Alla fine dello studio, ai partecipanti verrà offerta la partecipazione a una sessione individuale tramite piattaforma di videoconferenza (come Zoom) per offrire ai partecipanti l'opportunità di condividere con parole proprie le loro esperienze nello studio e nell'utilizzo del app per sondaggi. Nello specifico, ai partecipanti verrà chiesto di discutere l'utilità dei materiali didattici forniti, la facilità di navigazione nell'app dello studio e di partecipazione allo studio e altri feedback che aiuteranno gli oncologi medici e i dietisti a migliorare continuamente l'esperienza dei pazienti durante il trattamento neoadiuvante. I partecipanti che disinstallano l'app CareEvolution o non interagiscono con l'app per oltre 60 giorni verranno cancellati dallo studio.