Микробиота кишечника TNBC во время неоадъювантного лечения

Это рандомизированное проспективное исследование с небольшой группой из 30 пациентов (пилотное исследование). После того, как участники будут зачислены, они будут рандомизированы в соотношении 2:1 либо по диетическому вмешательству (индивидуальные консультации по увеличению потребления клетчатки и поддержанию адекватного потребления калорий во время лечения рака молочной железы), либо по образовательным раздаточным материалам по увеличению потребления клетчатки. Рандомизация будет скрыта с помощью генератора случайных чисел. Исследователи и медицинские работники не будут ослеплены из-за характера самого вмешательства, но вся документация, связанная с персонализированным диетическим вмешательством, не будет частью электронной медицинской карты участника. Со-исследователи, завершающие анализ данных, не будут знать о групповых заданиях участников.

Согласие будет получено при регистрации. Переменные, которые должны быть собраны в рамках базового демографического опросника, включают: возраст, пол, семейное положение, уровень образования, статус занятости, годовой доход, место жительства (почтовый индекс), ИМТ, лекарства и дозы, стадию ТНРМЖ на момент постановки диагноза и тип лечения ( с).

Участники заполнят: промежуточные обновления лекарств, включая использование антибиотиков (промежуточный опрос), желудочно-кишечные симптомы с использованием оценки симптомов PROMIS GI, диетический прием (NCI-DSQ) с двумя 24-часовыми журналами питания, состояние работоспособности (шкала FACT-G), тревогу ( GAD-7), депрессия (PHQ-9) и физическая активность (RAPA). Если участники сообщают о тревоге и/или депрессии умеренной или тяжелой степени в ходе опросов GAD-7 и/или PHQ-9 соответственно, они будут уведомлены по телефону или электронной почте, чтобы они связались со своим лечащим врачом или онкологом для немедленного обследования. Образцы стула будут собираться исходно (до лечения), через 6, 12, 18 и 24 недели. 6-недельный период интервала был выбран на основе ожидаемых циклов лечения плотными дозами доксорубицина/циклофосфамида и таксола +/- пембролизумаба. Этот интервал также был выбран на основе минимального количества времени, ожидаемого для потенциальных изменений в рационе питания и симптомах во время лечения. Напоминания об опросах будут отправляться через приложение каждые 6 недель, а данные будут экспортироваться в RedCap.

Вмешательство по питанию для группы лечения — индивидуальное консультирование по увеличению потребления клетчатки и поддержанию адекватного потребления калорий во время лечения — будет проводиться в виде (1) 60-минутной первоначальной телемедицинской консультации в течение первой недели после включения в исследование и (2) до двух 30-минутных последующих посещений на протяжении всего исследования, в идеале первое наблюдение в течение 6 недель после включения в исследование. Эти занятия будет проводить дипломированный диетолог, используя культурную осведомленность и оценку симптомов. Заметки сеанса будут включены в медицинские записи участников. Вмешательство участников контрольной группы будет представлять собой образовательный материал по увеличению потребления клетчатки. Студенты магистратуры Университета штата Сан-Диего (SDSU) в области физических упражнений и диетологии помогут всем участникам заполнить два 24-часовых журнала питания ASA24 в каждый момент времени, а также другие опросы. Пищевой состав, указанный в 24-часовых журналах, будет проанализирован в SDSU с использованием ASA24.

Участники будут собирать образцы стула с помощью набора Zymo Research, который, как ранее было показано, столь же эффективен, как и более крупный образец стула (совок)10, отправленный им домой по почте. В этот комплект входят пробирка для сбора фекалий, улавливатель фекалий, мешок для биологически опасных отходов, перчатки и инструкции на нескольких языках. Чтобы стимулировать участие и удержание участников, участникам будет предоставлен подарочный сертификат на 40 долларов США за образец стула с общей компенсацией до 200 долларов США. Участники отправят образцы стула по почте в биорепозиторий Scripps и обработают для хранения при температуре -80 градусов C. Как только все образцы будут собраны, они будут отправлены в Scripps Genomics Core для выделения ДНК и секвенирования 16S. Анализ данных секвенирования CCBB будет включать таксономическую классификацию, таблицы численности, анализ разнообразия (альфа- и бета-индексы) и графики анализа главных компонентов (PCA). Анализ подмножества будет сравнивать участников с высоким/низким потреблением клетчатки, высоким/низким потреблением калорий, избыточным/не избыточным весом по ИМТ и лечением, направленным на рак (только химиотерапия или с иммунотерапией).

Данные опроса будут импортированы в GraphPad Prism для визуализации и анализа. Для каждого элемента опроса, собранного во всех 5 временных точках, будет использоваться модель смешанных эффектов, где результат элемента опроса является зависимой переменной, группа (контроль или диетическое вмешательство) и момент времени являются фиксированными эффектами, а участник рассматривается как случайный эффект. . Модель смешанных эффектов использует ограниченную оценку максимального правдоподобия для учета пропущенных значений. Остатки будут проверены, чтобы обеспечить приближение к нормальности. Значения P будут сообщаться для каждого фиксированного эффекта (группы и времени) и взаимодействия между этими эффектами, выраженного как время x группа.

Для анализа TME на основе ретроспективного обзора диаграмм будут выбраны до 3 участников с диетой с высоким содержанием клетчатки, у которых наблюдается pCR, и 3 участника с остаточным заболеванием (т.е. всего до 6), а образцы биопсии будут отобраны до и после лечения. выявлено через отделение патологии. Образцы будут дополнительно обработаны и помещены в слайды, каждый из которых будет состоять из одного участника с соответствующими образцами до и после неоадъювантного лечения на каждом слайде для пространственного транскрипционного профилирования GeoMx 96 областей интереса (ROI) через Scripps Genomics Core. CCBB проведет статистический анализ для определения сигнальных путей и состава иммунных клеток при ТНРМЖ.

В конце исследования участникам будет предложено участие в сеансе один на один через платформу видеоконференций (например, Zoom), чтобы предоставить участникам возможность поделиться своими словами своим опытом в исследовании и использовании приложение для опросов. В частности, участникам будет предложено обсудить полезность предоставленных образовательных материалов, простоту навигации по приложению исследования и участия в исследовании, а также другие отзывы, которые помогут медицинским онкологам и диетологам постоянно улучшать опыт пациентов во время неоадъювантного лечения. Участники, которые удалят приложение CareEvolution или не использовали его более 60 дней, будут исключены из исследования.