TNBC-darmmicrobiota tijdens neoadjuvante behandeling

Dit is een gerandomiseerde, prospectieve studie met een kleine groep van 30 patiënten (pilotstudie). Zodra de deelnemers zijn ingeschreven, worden ze gerandomiseerd in een verhouding van 2:1 van ofwel de voedingsinterventie (persoonlijk advies over het verhogen van de vezelinname en het handhaven van voldoende calorie-inname tijdens de behandeling van borstkanker) ofwel een educatieve hand-out over het verhogen van de vezelinname. Randomisatie wordt verborgen met behulp van een willekeurige nummergenerator. Onderzoekers en zorgverleners zullen niet verblind worden vanwege de aard van de interventie zelf, maar alle documentatie met betrekking tot de gepersonaliseerde voedingsinterventie zal geen deel uitmaken van het elektronische medische dossier van de deelnemer. Medeonderzoekers die de data-analyse voltooien, zullen blind zijn voor de groepsopdrachten van de deelnemers.

Toestemming wordt verkregen bij inschrijving. Variabelen die moeten worden verzameld als onderdeel van de demografische basisvragenlijst zijn onder meer: ​​leeftijd, geslacht, burgerlijke staat, opleidingsniveau, arbeidsstatus, jaarinkomen, woonplaats (postcode), BMI, medicijnen en dosis, TNBC-stadium bij diagnose en behandelingstype ( S).

Deelnemers voltooien: tussentijdse medicatie-updates inclusief antibioticagebruik (Interim Survey), gastro-intestinale symptomen met behulp van de PROMIS GI-symptoombeoordeling, voedingsinname (NCI-DSQ) met twee 24-uurs voedsellogboeken, prestatiestatus (FACT-G-schaal), angst ( GAD-7), en depressie (PHQ-9), en fysieke activiteit (RAPA). Als deelnemers via respectievelijk de GAD-7- en/of PHQ-9-enquêtes matige tot ernstige angst en/of depressie melden, worden zij telefonisch of per e-mail op de hoogte gebracht om contact op te nemen met hun huisarts of oncoloog voor een snelle evaluatie. Er zullen ontlastingsmonsters worden verzameld bij aanvang (vóór de behandeling), op de tijdstippen van 6 weken, 12 weken, 18 weken en 24 weken. De intervalperiode van 6 weken werd geselecteerd op basis van de verwachte behandelingscycli met dosisdichte doxorubicine/cyclofosfamide en Taxol +/- pembrolizumab. Dit interval werd ook geselecteerd op basis van de minimale hoeveelheid tijd die verwacht werd voor mogelijke veranderingen in de voedselinname en symptomen tijdens de behandeling. Elke 6 weken worden enquêteherinneringen via de app verzonden en worden de gegevens naar RedCap geëxporteerd.

De voedingsinterventie voor de behandelgroep – gepersonaliseerde begeleiding over het verhogen van de vezelinname en het handhaven van voldoende calorie-inname tijdens de behandeling – zal worden toegediend als (1) een eerste telezorgconsult van 60 minuten binnen de eerste week van inschrijving voor de studie, en (2) maximaal twee follow-ups van 30 minuten gedurende de hele studie, idealiter de eerste follow-up binnen 6 weken na inschrijving voor de studie. Deze sessies worden geleid door een geregistreerde diëtist, waarbij gebruik wordt gemaakt van cultureel bewustzijn en symptoombeoordeling. Aantekeningen van de sessie worden opgenomen in de medische dossiers van de deelnemers. De interventie van de controledeelnemers zal bestaan ​​uit een educatieve hand-out over het verhogen van de vezelinname. Masterstudenten bewegings- en voedingswetenschappen van de San Diego State University (SDSU) zullen alle deelnemers helpen met het invullen van twee 24-uurs ASA24-voedsellogboeken op elk tijdstip, samen met andere enquêtes. De voedingssamenstelling gerapporteerd in 24-uurslogboeken zal bij SDSU worden geanalyseerd met behulp van ASA24.

Deelnemers verzamelen ontlastingsmonsters met behulp van de Zymo Research-kit, waarvan eerder is aangetoond dat deze net zo effectief is als een groter ontlastingsmonster (schepje),10 dat naar hun huis wordt gestuurd. Deze kit bevat een ontlastingsopvangbuis, een ontlastingsvanger, een zak voor biologisch gevaarlijk materiaal, handschoenen en meertalige instructies. Om deelname en retentie aan te moedigen, krijgen de deelnemers een cadeaubon van $ 40 per ontlastingsmonster met een totale vergoeding van maximaal $ 200. Deelnemers sturen ontlastingsmonsters naar de Scripps Biorepository en worden verwerkt voor opslag bij -80 graden C. Zodra alle monsters zijn verzameld, worden ze naar de Scripps Genomics Core gestuurd voor DNA-extractie en 16S-sequencing. De analyse van sequentiegegevens door de CCBB omvat taxonomische classificatie, tabellen van overvloed, diversiteitsanalyse (alfa- en bèta-indices) en plots van hoofdcomponentenanalyse (PCA). Subsetanalyses zullen deelnemers vergelijken met een hoge/lage vezelconsumptie, hoge/lage calorie-inname, overgewicht/geen overgewicht op basis van BMI, en op kanker gerichte behandeling (alleen chemotherapie of met immunotherapie).

Enquêtegegevens worden geïmporteerd in GraphPad Prism voor visualisatie en analyses. Voor elk enquête-item dat op alle vijf de tijdstippen wordt verzameld, wordt een model met gemengde effecten gebruikt, waarbij het resultaat van het enquête-item de afhankelijke variabele is, de groep (controle- of voedingsinterventie) en het tijdstip vaste effecten zijn en de deelnemer wordt behandeld als een willekeurig effect. . Het mixed effects-model maakt gebruik van een beperkte schatting van de maximale waarschijnlijkheid om rekening te houden met ontbrekende waarden. Residuen zullen worden onderzocht om er zeker van te zijn dat aan de normaliteit wordt voldaan. P-waarden worden gerapporteerd voor elk vast effect (groep en tijd) en de interactie tussen deze effecten, gerapporteerd als tijd x groep.

Voor TME-analyse zullen maximaal 3 deelnemers met vezelrijke voedingsinname die pCR ervaren en 3 deelnemers met restziekte (d.w.z. maximaal 6 in totaal) worden geselecteerd op basis van retrospectief overzicht van de kaart, en biopsiemonsters voor en na de behandeling zullen worden geselecteerd. geïdentificeerd via de afdeling Pathologie. Monsters zullen verder worden verwerkt en op objectglaasjes worden gemonteerd, elk met 1 deelnemer met bijpassende pre- en post-neoadjuvante behandelingsmonsters per objectglaasje voor GeoMx ruimtelijke transcriptionele profilering van 96 interessegebieden (ROI's) via de Scripps Genomics Core. De CCBB zal statistische analyses uitvoeren om signaalroutes en immuuncelsamenstelling in TNBC te identificeren.

Aan het einde van het onderzoek krijgen de deelnemers deelname aangeboden aan een één-op-één sessie via een videoconferentieplatform (zoals Zoom) om deelnemers de mogelijkheid te bieden om in hun eigen woorden hun ervaringen in het onderzoek en het gebruik van de studie te delen. enquête-app. Concreet zal aan de deelnemers worden gevraagd om het nut van het verstrekte educatieve materiaal te bespreken, het gemak van het navigeren door de onderzoeksapp en het deelnemen aan het onderzoek, en andere feedback die medische oncologen en diëtisten zal helpen de ervaring van patiënten tijdens de neoadjuvante behandeling voortdurend te verbeteren. Deelnemers die de CareEvolution-app verwijderen of de app langer dan 60 dagen niet gebruiken, worden uitgeschreven voor het onderzoek.