TNBC tarmmikrobiota under neoadjuverende behandling

Dette er et randomiseret, prospektivt studie med en lille gruppe på 30 patienter (pilotstudie). Når deltagerne er tilmeldt, vil de blive randomiseret i et 2:1-forhold af enten ernæringsinterventionen (personlig rådgivning om at øge fiberindtaget og opretholde tilstrækkeligt kalorieindtag under brystkræftbehandling) eller en pædagogisk uddeling om at øge fiberindtaget. Randomisering vil blive skjult ved hjælp af en tilfældig talgenerator. Efterforskere og sundhedspersonale vil ikke blive blindet på grund af selve interventionens karakter, men al dokumentation relateret til den personlige ernæringsintervention vil ikke være en del af deltagerens elektroniske journal. Medundersøgere, der gennemfører dataanalysen, vil blive blindet over for deltagernes gruppeopgaver.

Samtykke indhentes ved tilmelding. Variabler, der skal indsamles som en del af det grundlæggende demografiske spørgeskema, omfatter: alder, køn, civilstand, uddannelsesniveau, beskæftigelsesstatus, årlig indkomst, bopæl (postnummer), BMI, medicin og dosis, TNBC-stadium ved diagnose og behandlingstype( s).

Deltagerne vil gennemføre: midlertidige medicinopdateringer, herunder antibiotikabrug (interimsundersøgelse), gastrointestinale symptomer ved hjælp af PROMIS GI-symptomvurderingen, diætindtag (NCI-DSQ) med to 24-timers fødevarelogfiler, præstationsstatus (FACT-G Scale), angst ( GAD-7) og depression (PHQ-9) og fysisk aktivitet (RAPA). Hvis deltagerne rapporterer moderat-alvorlig angst og/eller depression gennem henholdsvis GAD-7 og/eller PHQ-9 undersøgelserne, vil de blive underrettet via telefon eller e-mail for at kontakte deres primære plejer eller onkolog for at søge hurtig evaluering. Afføringsprøver vil blive indsamlet ved baseline (forbehandling), 6-ugers, 12-ugers, 18-ugers og 24-ugers tidspunkter. Intervalperioden på 6 uger blev udvalgt baseret på forventede behandlingscyklusser med dosistæt doxorubicin/cyclophosphamid og Taxol +/- pembrolizumab. Dette interval blev også valgt ud fra den forventede minimumsperiode for potentielle ændringer i diætindtagelse og symptomer under behandlingen. Påmindelser om undersøgelser vil blive sendt via appen hver 6. uge, og data vil blive eksporteret til RedCap.

Ernæringsinterventionen for behandlingsgruppen -- personlig rådgivning om at øge fiberindtaget og opretholde et tilstrækkeligt kalorieindtag under behandlingen -- vil blive administreret som (1) en 60-minutters indledende telesundhedskonsultation inden for den første uge efter tilmelding til studiet, og (2) op til to 30-minutters opfølgninger gennem hele studiet, ideelt set den første opfølgning inden for 6 uger efter studietilmelding. Disse sessioner vil blive ledet af en registreret diætist ved hjælp af kulturel bevidsthed og symptomvurdering. Sessionsnotater vil indgå i deltagernes journaler. Kontroldeltagernes intervention vil være en pædagogisk håndbog om at øge fiberindtaget. San Diego State University (SDSU) masterstuderende i trænings- og ernæringsvidenskab vil hjælpe alle deltagere med at udfylde to 24-timers ASA24-madlogfiler på hvert tidspunkt sammen med andre undersøgelser. Ernæringssammensætning rapporteret i 24-timers logfiler vil blive analyseret på SDSU ved hjælp af ASA24.

Deltagerne vil indsamle afføringsprøver ved hjælp af Zymo Research-sættet, som tidligere har vist sig at være lige så effektivt som en større afføringsprøve (scoop),10 sendt til deres hjem. Dette sæt inkluderer et fækalopsamlingsrør, en fæcesfanger, en biohazard-pose, handsker og flersprogede instruktioner. For at opmuntre til deltagelse og fastholdelse vil deltagerne få et gavekort på $40 pr. skammelprøve med op til $200 samlet kompensation. Deltagerne sender afføringsprøver til Scripps Biorepository og behandles til opbevaring ved -80 grader C. Når alle prøver er indsamlet, vil de blive sendt til Scripps Genomics Core til DNA-ekstraktion og 16S-sekventering. CCBB's sekventeringsdataanalyse vil omfatte taksonomisk klassificering, overflodstabeller, diversitetsanalyse (alfa- og beta-indeks) og plot af principal komponentanalyse (PCA). Undergruppeanalyser vil sammenligne deltagere med højt/lavt fiberforbrug, højt/lavt kalorieindtag, overvægt/ikke overvægtig af BMI og cancer-rettet behandling (kemoterapi alene eller med immunterapi).

Undersøgelsesdata vil blive importeret til GraphPad Prism til visualisering og analyser. For hvert undersøgelseselement indsamlet på alle 5 tidspunkter, vil der blive brugt en blandet effektmodel, hvor undersøgelseselementets resultat er den afhængige variabel, gruppe (kontrol eller ernæringsintervention) og tidspunkt er faste effekter, og deltageren behandles som en tilfældig effekt . Blandede effekter-modellen bruger begrænset maksimal sandsynligheds-estimering til at tage højde for manglende værdier. Rester vil blive undersøgt for at sikre, at tilnærmelse af normaliteten er opfyldt. P-værdier vil blive rapporteret for hver fast effekt (gruppe og tid) og interaktionen mellem disse effekter, rapporteret som tid x gruppe.

Til TME-analyse vil op til 3 deltagere med højt fiberindhold i kosten, som oplever pCR, og 3 deltagere med resterende sygdom (dvs. op til 6 i alt) blive udvalgt baseret på retrospektiv diagramgennemgang, og biopsiprøver før og efter behandling vil blive udvalgt. identificeret gennem patologisk afdeling. Prøver vil blive yderligere behandlet og monteret på objektglas, hver med 1 deltager med matchede præ- og post-neoadjuverende behandlingsprøver pr. objektglas til GeoMx rumlig transkriptionel profilering af 96 regioner af interesse (ROI'er) gennem Scripps Genomics Core. CCBB vil udføre statistisk analyse for at identificere signalveje og immuncellesammensætning i TNBC.

Ved afslutningen af ​​undersøgelsen vil deltagerne blive tilbudt deltagelse i en en-til-en session via videokonferenceplatform (såsom Zoom) for at give deltagerne mulighed for med egne ord at dele deres erfaringer med undersøgelsen og i at bruge undersøgelse app. Specifikt vil deltagerne blive bedt om at diskutere anvendeligheden af ​​det tilvejebragte undervisningsmateriale, nem at navigere i undersøgelsesappen og deltage i undersøgelsen og anden feedback, der vil hjælpe medicinske onkologer og diætister til løbende at forbedre patienternes oplevelse under neoadjuverende behandling. Deltagere, der afinstallerer CareEvolution-appen eller ikke har brugt appen i over 60 dage, vil blive udmeldt fra undersøgelsen.