Étude de la réparation des tissus dans une maladie inflammatoire de l'intestin exploitant la technologie organoïde (ORGANOIDS)

Les maladies inflammatoires de l'intestin (MII) sont des inflammations chroniques du tractus gastro-intestinal. Quelle que soit l'étiologie, un trait commun de la pathogenèse des MICI est les dommages inflammatoires infligés à la muqueuse intestinale et la perte de l'intégrité de la barrière épithéliale intestinale. Par conséquent, la compréhension des mécanismes qui régissent la capacité de la CEI à maintenir la fonction des barrières et à orchestrer la guérison muqueuse est considérée comme un objectif majeur dans la recherche translationnelle. Nous souhaitons comprendre comment l'environnement inflammatoire présent dans la muqueuse intestinale, des patients atteints de MII, influence la capacité des cellules épithéliales à gouverner la réparation. Les complexités de la cytokine et du milieu métabolique présentes chez les patients atteints de MII rendent l'étude de la contribution de chaque voie de cytokines, métabolites et intracellulaires extrêmement compliqués. Par conséquent, la plupart des processus qui régissent la régénération tissulaire sont étudiés avec l'utilisation de modèles de souris qui récapitulent une ou plusieurs caractéristiques de la MII et permettent des modifications génétiques du gène et de la voie d'intérêt. Bien que les modèles de souris soient particulièrement adaptés pour étudier la diaphonie complexe entre le système immunitaire, le microbiote et l'épithélium intestinal, ils introduisent le problème important des différences spécifiques aux espèces, qui peuvent entraver la valeur translationnelle des études de souris.

Pour surmonter ces lacunes, nous proposons d'explorer l'influence des cytokines et des métabolites dans les organoïdes digestifs dérivés des patients et des témoins. Surtout, il a été démontré que l'expression des gènes et les réponses immunitaires innées sont modifiées dans les organoïdes primaires dérivés de patients atteints de MII, y compris la capacité altérée de proliférer, de répondre aux cytokines, de capacité métabolique et forment efficacement des organoïdes suggérant que les principales différences entre les cellules épithéliales du patient et du patient La biologie peut être fidèlement reproduite dans ce système.

Compte tenu de ces locaux, nous proposons les objectifs suivants:

Objectif principal:

L'objectif principal de cette étude est d'établir que les cellules épithéliales du patient des muqueuses enflammées ont diminué la capacité de réparer la muqueuse intestinale, par rapport aux cellules épithéliales des régions non inflammées du même patient, ou à contrôler le sujet sans maladies digestives inflammatoires.

Nous explorerons cette question dérivant les organoïdes des échantillons cliniques et les exposant à des cytokines et des métabolites inflammatoires in vitro, ainsi qu'en analysant les réponses de réparation des échantillons cliniques susmentionnés ex vivo.

Objectif secondaire

Les objectifs secondaires de cette étude sont:

- Pour comparer les organoïdes dérivés de: épithéliums dans la muqueuse enflammée des patients atteints de MII, épithélium dans la muqueuse non inflammatoire des patients atteints de MII et épithéliums de la muqueuse des témoins non IBD dans leur capacité à monter une réponse de réparation en réponse aux cytokines inflammatoires ou aux luminales ou luminale métabolites.

À savoir, nous évaluerons les paramètres suivants:

• Leur capacité à proliférer.
• Leur capacité à survivre au traitement avec des cytokines pro-inflammatoires
• L'activation des voies intracellulaires associées à la mort cellulaire.
• Leur activité métabolique globale.
• L'équilibre entre les types de cellules épithéliales différenciées et différenciés.
• L'activation transcriptionnelle des voies de protection telles que celles associées à la prolifération, à la migration, à la différenciation et à la survie cellulaire.
• Pour évaluer les caractéristiques de la réparation des tissus dans les biopsies dérivées d'épithéliums dans la muqueuse enflammée des patients atteints de MICI, les épithéliums dans la muqueuse non inflammée des patients atteints de MII et les épithéliums de la muqueuse des témoins non IBD et pour les corréler aux niveaux de cytokines inflammatoires, métabolites luminaux et gravité globale de la maladie. À savoir, nous évaluerons les paramètres suivants:
• L'abondance de cellules proliférantes.
• L'activation des voies intracellulaires associées à la mort cellulaire et à la survie.
• Leur activité métabolique globale.
• L'équilibre entre les types de cellules épithéliales différenciées et différenciés.
• L'activation transcriptionnelle des voies de protection telles que celles associées à la prolifération, à la migration, à la différenciation et à la survie cellulaire.