Изучение восстановления тканей при воспалительных заболеваниях кишечника, эксплуатируя органоидную технологию (ORGANOIDS)

Воспалительные заболевания кишечника (IBD) представляют собой хронические воспаления желудочно -кишечного тракта. Независимо от этиологии, общей чертой патогенеза IBD является воспалительное повреждение, нанесенное слизистой оболочкой кишечника и потерю целостности эпителиального барьера кишечника. Таким образом, понимание механизмов, которые регулируют способность МЭК поддерживать барьерную функцию и организовать заживление слизистой оболочки, считается основной целью в трансляционных исследованиях. Мы заинтересованы в понимании того, как воспалительная среда, присутствующая в слизистой оболочке кишечника, пациентов с ВЗК влияет на способность эпителиальных клеток для управления восстановлением. Сложности цитокинов и метаболической среды, присутствующей у пациентов с ВЗК, значительно сложны изучение вклада каждого цитокина, метаболита и внутриклеточного пути. Следовательно, большинство процессов, которые определяют регенерацию тканей, изучаются с использованием мышиных моделей, которые повторяют одну или множественные особенности ВЗК и позволяют генетические модификации гена и интереса. В то время как мышиные модели уникально подходят для изучения сложных перекрестных помех между иммунной системой, микробиотой и эпителией кишечника, они вводят важную проблему видоспецифических различий, которые могут препятствовать трансляционной ценности исследований мышей.

Чтобы преодолеть эти недостатки, мы предлагаем изучить влияние цитокинов и метаболитов на пищеварительные органоиды, полученные от пациентов и контролей. Важно отметить, что было продемонстрировано, что экспрессия генов и врожденные иммунные ответы изменяются у первичных органоидов, полученных от пациентов с ВЗК, включая измененную способность пролиферировать, реагировать на цитокины, метаболическую способность и эффективную формирование органоидов, что позволяет предположить, что основные различия между пациентом и контрольной клеткой. Биология может быть верно воспроизведена в этой системе.

Учитывая эти помещения, мы предлагаем следующие цели:

Основная цель:

Основная цель этого исследования состоит в том, чтобы установить, что эпителиальные клетки пациента из воспаленных слизистой оболочки обладают сниженной способностью восстанавливать слизистую оболочку кишечника по сравнению с эпителиальными клетками из невоспаленных областей у одного и того же пациента или для контроля субъекта без воспалительных пищеварительных заболеваний.

Мы рассмотрим этот вопрос как получение органоидов из клинических образцов, так и подвергнуто им, так и подвергают их воспалительным цитокинам и метаболитам in vitro, а также путем анализа ответов на восстановление из вышеупомянутых клинических образцов ex vivo.

Вторичная цель

Вторичные цели этого исследования:

-Сравнить органоиды, полученные из: эпителии в воспаленной слизистой оболочке пациентов с ВЗК, эпителии в невоспаленной слизистой оболочке пациентов с ВЗК и эпителия из слизистой оболочки, не имеющих контроля, в их способности устанавливать реакцию на восстановление в ответ на воспалительные цитокины или прочь. Метаболиты.

А именно мы оценим следующие параметры:

• Их способность размножаться.
• Их способность пережить лечение провоспалительными цитокинами
• Активация внутриклеточных путей, связанных с гибелью клеток.
• Их общая метаболическая активность.
• Баланс между STEM и дифференцированными типами эпителиальных клеток.
• Транскрипционная активация защитных путей, таких как те, которые связаны с пролиферацией, миграцией, дифференцировкой и выживанием клеток.
• Чтобы оценить отличительные признаки восстановления тканей в биопсии, полученной из эпителии в воспаленной слизистой оболочке пациентов с ВЗК, эпителии в невоспаленной слизистой оболочке пациентов с ВЗК и эпителии из слизистой оболочки невзвучащих контролей и коррелировать их до уровней воспалительных цитокинов,, непревзойденных контролей и для их корреляции до уровней воспалительных цитокинов,, не связанных с IBD, и для корреляции их уровней воспалительных цитокинов. Левельные метаболиты и общая тяжесть заболевания. А именно мы оценим следующие параметры:
• Обилие пролиферирующих клеток.
• Активация внутриклеточных путей, связанных с гибелью клеток и выживанием.
• Их общая метаболическая активность.
• Баланс между STEM и дифференцированными типами эпителиальных клеток.
• Транскрипционная активация защитных путей, таких как те, которые связаны с пролиферацией, миграцией, дифференцировкой и выживанием клеток.