Studie opravy tkáně u zánětlivého onemocnění střev využívající organoidní technologii (ORGANOIDS)

Zánětlivá onemocnění střev (IBD) jsou chronické záněty gastrointestinálního traktu. Bez ohledu na etiologii je běžnou vlastností patogeneze IBD zánětlivé poškození způsobené střevní slizností a ztráta integrity střevní epitelové bariéry. Pochopení mechanismů, které řídí schopnost IEC udržovat funkci bariéry a orchestrovat hojení sliznice, je proto v translačním výzkumu považováno za hlavní cíl. Máme zájem porozumět tomu, jak zánětlivé prostředí přítomné ve střevní sliznici, u pacientů s IBD ovlivňuje kapacitu epiteliálních buněk řídit opravu. Složitost cytokinu a metabolického prostředí přítomného u pacientů s IBD poskytuje studium příspěvku každého cytokinu, metabolitu a intracelulární dráhy extrémně komplikované. Většina procesů, které řídí regeneraci tkáně, je proto studována pomocí myších modelů, které rekapitulují jeden nebo více rysů IBD a umožňují genetické modifikace genu a zájmu. Zatímco myší modely jsou jedinečně vhodné pro studium komplexního přeslechu mezi imunitním systémem, mikrobiotou a střevním epitelem, představují důležitý problém druhově specifických rozdílů, které mohou bránit translační hodnotě myších studií.

K překonání těchto nedostatků navrhujeme prozkoumat vliv cytokinů a metabolitů v trávicích organoidech odvozených od pacientů a kontrol. Důležité je, že bylo prokázáno, že genová exprese a vrozené imunitní odpovědi se mění u primárních organoidů odvozených od pacientů s IBD, včetně změněné schopnosti proliferovat, reagovat na cytokiny, metabolickou kapacitu a efektivně tvoří organoidy, což naznačuje, že hlavní rozdíly mezi epitelovou buňkou pacienta a kontroly pacienta a kontrolní buňkou pacienta a kontrolu vytvářejí, že hlavní rozdíly mezi epitelovou buňkou pacienta a kontroly pacienta a kontrolu pacienta a kontrolu vytvářejí, že hlavní rozdíly mezi epitelovou buňkou pacienta a kontroly jsou Biologii lze v tomto systému věrně replikovat.

Vzhledem k těmto prostorům navrhujeme následující cíle:

Primární cíl:

Hlavním cílem této studie je stanovit, že epiteliální buňky pacienta z zanícených sliznice mají sníženou schopnost opravit střevní sliznici ve srovnání s epiteliálními buňkami z nezatvořených oblastí u stejného pacienta nebo kontrolovat subjekt bez zánětlivých trávicích onemocnění.

Tuto otázku prozkoumáme jak odvozující organoidy z klinických vzorků, tak je vystavíme pro zánětlivé cytokiny a metabolity in vitro, tak analýzou opravárenských odpovědí z výše uvedených klinických vzorků ex vivo.

Sekundární cíl

Sekundární cíle této studie jsou:

-Pro porovnání organoidů odvozených od: epitelu v zanícené sliznici pacientů s IBD, epitelilií v nezazáření sliznice pacientů s IBD a epitel ze sliznice neibd kontrol v jejich schopnosti namontovat opravu reakce v reakci na zánětlivé cytokiny nebo luminal Metabolity.

Konkrétně vyhodnotíme následující parametry:

• Jejich schopnost proliferovat.
• Jejich schopnost přežít léčbu prozánětlivými cytokiny
• Aktivace intracelulárních drah spojených s buněčnou smrtí.
• Jejich celková metabolická aktivita.
• Rovnováha mezi typy kmene a diferencovaných epitelových buněk.
• Transkripční aktivace ochranných drah, jako jsou ty, které jsou spojeny s proliferací, migrací, diferenciací a přežitím buněk.
• Pro vyhodnocení charakteristik opravy tkáně v biopsiích odvozených z epitelu v zanícené sliznici pacientů s IBD, epitelilií v nezatáčené sliznici pacientů s IBD a epitelu ze sliznice kontrolních non-AIBD a korelaci je s hladinami zánětlivých cytokinů, Luminální metabolity a celková závažnost onemocnění. Konkrétně vyhodnotíme následující parametry:
• Hojnost proliferujících buněk.
• Aktivace intracelulárních drah spojených s buněčnou smrtí a přežitím.
• Jejich celková metabolická aktivita.
• Rovnováha mezi typy kmene a diferencovaných epitelových buněk.
• Transkripční aktivace ochranných drah, jako jsou ty, které jsou spojeny s proliferací, migrací, diferenciací a přežitím buněk.