Étude de collaboration longitudinale Aimmune (FIBER-IMPACT)

Les participants seront soit sélectionnés parmi un groupe de candidats préalablement sélectionnés et identifiés, soit ayant manifesté leur intérêt à participer à la recherche par le biais du programme GoodNature, géré par Aimmune. Aucun participant ayant fabriqué ou ayant le potentiel de fabriquer une grande partie d'un produit fini ne sera autorisé à participer. Ceux qui acceptent de participer rempliront une enquête de présélection sur la santé par formulaire électronique ou par appel téléphonique et rempliront le formulaire de consentement éclairé (ICF). Une fois l'ICF terminé, les participants se verront attribuer un identifiant de participant unique et anonyme. Seuls quelques membres sélectionnés du sponsor de l'étude auront accès aux codes d'identification ; les codes de désidentification ne seront pas partagés avec les collaborateurs. Suite à cela, les participants recevront des informations générales sur les pratiques alimentaires, les avantages des fibres et des détails concernant l'étude, y compris le prélèvement et l'étiquetage des échantillons, le suivi du régime via des enquêtes, des photos des repas soumis, etc.

Les participants se rencontreront sur un site d'étude et recevront des graines de chia, l'outil manuel d'échantillonnage des selles et des contenants d'échantillons pré-étiquetés s'ils collectent leurs échantillons à la maison. À ce moment-là, les participants peuvent également fournir des échantillons de sang.

Une fois le matériel de pré-intervention terminé, les participants (60) commenceront une période d'intervention de 16 semaines ; la moitié des participants ajouteront quotidiennement 2,5 cuillères à soupe de graines de chia pendant les 8 premières semaines de l'étude et reprendront leur alimentation normale pendant les 8 secondes semaines, la moitié des participants maintiendront leur alimentation normale pendant les 8 premières semaines et ajouteront quotidiennement 2,5 cuillères à soupe de graines de chia pendant les 8 secondes semaines en tant que conception croisée. Plusieurs personnes du foyer peuvent participer, mais parce que nous voulons comprendre la transmissibilité des niveaux de SCFU et/ou d'IgA.

Les participants seront randomisés en deux groupes, mais les membres du même ménage seront répartis en groupes opposés.

Tous les participants seront invités à répondre à une courte enquête électronique sur le stress quotidien, notamment en fournissant des photos quotidiennes des repas. L'enquête quotidienne comprendra le questionnaire sur la santé du patient (PHQ-4), un bref questionnaire de dépistage validé composé d'une échelle de dépression à 2 éléments (PHQ-2) et d'une échelle d'anxiété à 2 éléments (GAD-2)2. Les données PHQ-4 seront utilisées pour suivre le stress. Des photos quotidiennes des repas seront utilisées pour suivre les données diététiques tout au long de l'étude.

Le score total du PHQ-4 varie de 0 à 12, les catégories de détresse psychologique étant2 :

• Aucun 0-2
• Doux 3-5
• Modéré 6-8
• Grave 9-12

Sous-échelle d'anxiété = somme des éléments 2 et 3 du formulaire d'enquête quotidienne (plage de scores de 0 à 6) Sous-échelle de dépression = somme des éléments 4 et 5 du formulaire d'enquête quotidienne (plage de scores de 0 à 6) Sur chaque sous-échelle, un score de 3 ou plus est considéré comme positif à des fins de dépistage.

Il sera également demandé aux participants de prélever un minimum de 3 échantillons de selles par semaine pendant l'étude. Les participants qui collectent des échantillons de selles à la maison stockeront les échantillons dans leurs congélateurs dans un conteneur de stockage pour risques biologiques fourni et les échantillons seront récupérés chaque semaine par le personnel de l'étude ou un coursier. Tous les participants scanneront le code QR sur le conteneur pour enregistrer la date et l'heure de prélèvement de l'échantillon et écriront la date de prélèvement sur le conteneur.

Au cours des semaines 1, 8 et 16, les participants seront invités à collecter des données détaillées sur leur alimentation via une enquête électronique, à l'aide de l'outil d'évaluation diététique auto-administré automatisé sur 24 heures du NIH. Des échantillons de selles seront préparés et aliquotés par le promoteur de l'étude et envoyés à l'UCI et à la Cleveland Clinic pour la PCR bactérienne, l'analyse métabolomique, le séquençage métagénomique Shotgun, l'évaluation du titre des spores bactériennes et les tests IgA. Tous les échantillons, y compris les échantillons de sang, seront conservés indéfiniment dans un congélateur à -80 °C chez Aimmune Therapeutics pour la recherche conformément au protocole de biobanque existant n° 20234092. Des enquêtes à mi-intervention et post-intervention seront envoyées aux participants pour évaluer les expériences avec l'étude et les graines de chia, ainsi que pour identifier tout effet secondaire ou plainte.

Des enquêtes anonymisées seront fournies et analysées par le promoteur de l'étude.

Sujets à faible taux d'IgA tout au long de l'étude. Pour découvrir les bactéries inconnues dégradant les IgA, les chercheurs répandront des échantillons fécaux de sujets IgA-Low sur des plaques de gélose au sang anaérobie CDC pour former des colonies uniques. Ensuite, les chercheurs repiqueront toutes les colonies sur une nouvelle gélose au sang CDC par stries. Les chercheurs gratteront chaque colonie de sous-culture dans un tampon PBS stérile et regrouperont environ 15 colonies individuelles pour l'incubation in vitro avec IgA et Pigr. Après une nuit d'incubation à 37 °C, l'analyse WB sera utilisée pour évaluer la dégradation des IgA et Pigr. Les colonies du pool bactérien présentant une activité de clivage IgA/Pigr seront à nouveau incubées individuellement avec les substrats et analysées par immunoblot.

Évaluer la complexité des bactéries dégradant les IgA. Les chercheurs détermineront la sensibilité aux antibiotiques des bactéries candidates in vitro. En raison des défis liés à l'immunophilie de T. (dégradeur d'IgA chez la souris), les chercheurs évalueront la complexité des colonies (sont-elles facilement cultivées en culture pure par rapport à la présence de bactéries compagnes au sein de la colonie isolée). Si le dégradeur d'IgA candidat se développe lentement en culture, les chercheurs évalueront l'auxotrophie de la bactérie comme pour T. immunophila. Les chercheurs utiliseront en combinaison des outils génomiques et métaboliques pour tester l’auxotrophie.

Sujets riches en IgA à la fin de l'étude. Les chercheurs inoculeront des souris sans germes avec des échantillons de selles provenant de ces donneurs et évalueront les niveaux d'IgA après deux semaines chez ces souris (nous utiliserons des échantillons faibles en IgA comme contrôle). Pour les souris qui ont des niveaux élevés d’IgA, les chercheurs isoleront les spores à l’aide de diverses méthodes et les testeront sur des souris sans germes. Les chercheurs affineront autant que possible la communauté stimulant les IgA et testeront si elle est cultivable. L’objectif est d’identifier les microbes intestinaux humains qui répondent aux fibres présentes dans l’alimentation et modifient les niveaux d’IgA de tous les microbes intestinaux.