Clostridioides Difficile : Comprendre les Réponses et les Effets du Traitement (CURE-CDI)

L'infection à Clostridioides difficile (ICD) est une cause fréquente de colite associée aux antibiotiques et se caractérise par des taux élevés de récidive et, chez certains patients, une maladie réfractaire. Bien que la transplantation de microbiote fécal (TMF) soit un traitement efficace pour l'ICD récurrente et réfractaire, les mécanismes biologiques sous-jacents à la réponse au traitement, l'amélioration clinique précoce, les effets à long terme et la vulnérabilité à une exposition ultérieure aux antibiotiques restent incomplètement compris.

Il s'agit d'une étude observationnelle conçue pour caractériser les changements biologiques et cliniques associés au traitement antibiotique standard et à la TMF chez les patients atteints d'ICD. L'étude examinera la composition du microbiote intestinal, les métabolites microbiens, les réponses immunitaires muqueuses et systémiques, la fonction de barrière intestinale et les résultats rapportés par les patients, et reliera ces résultats à l'évolution clinique de la maladie et au résultat du traitement.

Les patients adultes présentant une ICD symptomatique, vérifiée microbiologiquement, recevant des soins cliniques de routine seront inclus. Les décisions de traitement, y compris l'utilisation d'antibiotiques ou de TMF, sont prises par le médecin traitant conformément aux directives cliniques et ne sont pas influencées par la participation à l'étude. Les participants seront suivis longitudinalement pendant jusqu'à cinq ans.

Des échantillons biologiques seront collectés pendant l'épisode aigu d'ICD et à des moments prédéfinis de suivi. Des échantillons de selles seront obtenus pour caractériser la composition du microbiote intestinal et les profils métaboliques au fil du temps. Chez les participants traités par TMF, l'échantillonnage des selles sera plus fréquent au cours de la première semaine suivant le traitement pour saisir les changements précoces post-traitement. Des échantillons sanguins seront collectés pour évaluer les marqueurs immunitaires et inflammatoires systémiques. Des échantillons d'urine seront collectés pour analyser les métabolites liés à l'intégrité de la barrière intestinale. Des écouvillons nasopharyngés seront obtenus pour explorer si la modulation du microbiote intestinal est associée à des changements dans la composition du microbiote et les réponses immunitaires au niveau des sites muqueux distants.

Dans un sous-groupe de participants jugés appropriés par le clinicien responsable, des biopsies coliques basses répétées seront obtenues par sigmoïdoscopie. Ces échantillons seront utilisés pour évaluer la guérison de la muqueuse colique, la fonction de la barrière muqueuse, le microbiote associé à la muqueuse et les réponses immunitaires locales.

Les analyses du microbiote incluront des approches de séquençage métagénomique, et des analyses métabolomiques seront réalisées sur les échantillons de selles et d'autres échantillons biologiques. Les réponses immunitaires seront évaluées à l'aide de dosages biochimiques et cellulaires dans le sang, les tissus muqueux et les types d'échantillons pertinents. Le matériel fécal du donneur utilisé pour la TMF sera analysé et mis en relation avec les résultats des receveurs.

Les résultats cliniques seront évalués à 2 et 8 semaines après le début du traitement actuel de l'ICD et pendant le suivi à long terme. La gravité de la maladie et les résultats du traitement, y compris la réponse au traitement, la récidive, la maladie réfractaire et la guérison durable, seront classés selon les directives cliniques établies. Les participants présentant un échec thérapeutique peuvent réintégrer les calendriers d'échantillonnage correspondant aux traitements ultérieurs.

La qualité de vie liée à la santé rapportée par les patients sera évaluée pendant l'infection aiguë et le suivi à l'aide d'instruments génériques et spécifiques à la maladie validés.

Cette étude vise à fournir une caractérisation détaillée des processus biologiques et cliniques associés à la TMF et au traitement antibiotique dans l'ICD, y compris les effets précoces et à long terme, et à soutenir l'optimisation future des stratégies thérapeutiques basées sur le microbiote.