Étude des facteurs biologiques, génétiques et constitutionnels et de la surveillance non invasive pour évaluer les risques personnels de cancer (PRO-ACTIVE)

L'étude observationnelle se compose d'une partie rétrospective et d'une partie prospective.

Pour la partie rétrospective, 400 patientes atteintes de tumeurs mammaires opérées entre 2000 et 2015 seront sélectionnées, dont 200 avec des tumeurs mammaires héréditaires et 200 avec des tumeurs mammaires non héréditaires, présentant les caractéristiques cliniques, morphologiques et moléculaires suivantes (luminal A et B, triple négatif) et un stade comparable.

Le tissu tumoral sera soumis à des investigations immunocytochimiques pour étudier les paramètres suivants : angiogenèse (CD31), fibroblastes (CD34 et vimentine), macrophages (CD68) et macrophages associés aux tumeurs (M1 : CD11c ; M2 : CD163) ; plasmocytes (CD138), lymphocytes T (CD8) ; mastocytes (CD117).

Les données seront corrélées avec le pronostic et avec le risque de développer un cancer du sein héréditaire.

La partie prospective, quant à elle, prévoit l'inclusion de différentes cohortes de patientes initialement dépistées dans WP1.

600 patientes connues pour un cancer du sein (N=200), un cancer de l'ovaire (N=200) et un cancer colorectal (N=200), candidates à un test génétique germinal dans le cadre d'une consultation oncogénétique, seront évaluées. Les patientes seront sélectionnées avant la chirurgie et, si elles acceptent de participer à l'étude, elles signeront le consentement éclairé dans le cadre d'une consultation en oncogénétique.

Les patientes sélectionnées subiront un prélèvement sanguin (5 ml dans des tubes EDTA) pour l'extraction d'acides nucléiques (ADN et ARN).

Sur la base du résultat du test génétique germinal, les patientes seront classées en 3 cohortes :

• COHORTE 2A, sujets avec hérédité (probandes) : on suppose l'identification d'environ 10 % (N=60) de probandes sur 600 sujets examinés (20 par pathologie).
• COHORTE 2B, sujets identifiés par conseil génétique comme étant à risque d'être porteurs d'un syndrome néoplasique héréditaire, non prouvé par des tests génétiques : une population de 60 sujets, 20 pour chaque type de tumeur, avec des caractéristiques cliniques similaires d'âge et de phénotype par rapport à la cohorte 2A.
• COHORTE 2C, un autre sous-groupe de patientes (N=150), 50 pour chaque type de tumeur, avec des résultats négatifs à l'analyse génétique diagnostique. Chez les patientes sélectionnées dans la cohorte 2C, l'ADN/ARN sera analysé pour l'identification de variants génétiques causatifs dans des gènes échappant à l'investigation diagnostique de routine.

De plus, une autre cohorte de patientes sera sélectionnée, COHORTE 3, qui comprend 250 patientes subissant un traitement chirurgical radical et présentant les caractéristiques suivantes :

• cancer du sein localement avancé avec phénotype triple négatif ou avec histologie lobulaire (N=50) ;
• carcinome séreux de haut grade de l'ovaire (N=50) ;
• mélanome de stade III (N=50) ;
• cancer du poumon non à petites cellules de stade IIB et IIIA (N=50) ;
• cancer du colon avec atteinte ganglionnaire et invasion vasculaire (N=50).

Les patientes incluses dans les COHORTES 2A, 2B et 3 subiront les prélèvements sanguins suivants pour WP2 :

• 20 ml dans des tubes Cell-Free DNA BCT® CE (Streck) pour l'analyse de l'ADNtc. Les échantillons sont centrifugés à 1600 (±150) g pendant 10 minutes à température ambiante. Après centrifugation, le plasma est soumis à une centrifugation supplémentaire pendant 10 minutes à 3000 (±150) g.
• 20 ml dans des tubes Cell Save pour l'isolement des CTC.
• 30 ml pour l'étude des populations immunitaires circulantes (WP3). De plus, le tissu tumoral prélevé pendant la phase chirurgicale sera collecté et analysé dans WP4 et pour l'étude du microenvironnement avec des techniques de « Séquençage de Nouvelle Génération » appliquées à la tumeur dans son ensemble et au niveau cellulaire unique, ainsi qu'aux populations immunitaires (TILs).