Исследование биологических, генетических и конституциональных факторов, а также неинвазивного мониторинга для оценки индивидуальных рисков развития рака (PRO-ACTIVE)

Наблюдательное исследование состоит из ретроспективной и проспективной части.

Для ретроспективной части будет отобрано 400 пациентов с опухолями молочной железы, оперированных в период с 2000 по 2015 год, из которых 200 с наследственными опухолями молочной железы и 200 с ненаследственными опухолями молочной железы и со следующими клиническими, морфологическими и молекулярными характеристиками класса (люминальные А и В, тройные негативные) и сопоставимой стадией.

Ткань опухоли будет подвергнута иммуноцитохимическим исследованиям для изучения следующих параметров: ангиогенез (CD31), фибробласты (CD34 и виментин), макрофаги (CD68) и опухолеассоциированные макрофаги (M1: CD11c; M2: CD163); плазматические клетки (CD138), Т-лимфоциты (CD8); тучные клетки (CD117).

Данные будут коррелированы с прогнозом и с риском развития наследственного рака молочной железы.

Проспективная часть, напротив, предусматривает включение различных когорт пациентов, которые первоначально проходят скрининг в рамках WP1.

Будут оценены 600 пациентов, известных по раку молочной железы (N=200), раку яичников (N=200) и колоректальному раку (N=200), кандидатов на генетическое тестирование зародышевой линии в контексте онкогенной консультации. Пациенты будут отобраны до операции и, если они согласны участвовать в исследовании, подпишут информированное согласие в контексте онкогенетической консультации.

Отобранные пациенты пройдут забор крови (5 мл в пробирки с ЭДТА) для экстракции нуклеиновых кислот (ДНК и РНК).

На основании результата генетического тестирования зародышевой линии пациенты будут классифицированы на 3 когорты:

• КОГОРТА 2A, субъекты с наследственной передачей (пробанды): предполагается идентификация около 10% (N=60) пробандов из 600 обследованных субъектов (20 по патологии).
• КОГОРТА 2B, субъекты, идентифицированные генетическим консультированием как находящиеся в группе риска носительства наследственного неопластического синдрома, не подтвержденного генетическими тестами: популяция из 60 субъектов, 20 для каждого типа опухоли, со схожими клиническими характеристиками возраста и фенотипа по сравнению с когортой 2A.
• КОГОРТА 2C, дополнительная подгруппа пациентов (N=150), 50 для каждого типа опухоли, с отрицательными результатами в диагностическом генетическом анализе. У отобранных пациентов в когорте 2C ДНК/РНК будет проанализирована для идентификации причинных генетических вариантов в генах, ускользнувших от рутинного диагностического исследования.

Кроме того, будет отобрана дополнительная когорта пациентов, КОГОРТА 3, которая включает 250 пациентов, подвергающихся радикальному хирургическому лечению и имеющих следующие характеристики:

• местно-распространенный рак молочной железы с тройным негативным фенотипом или с лобулярной гистологией (N=50);
• серозная карцинома яичников высокой степени злокачественности (N=50);
• меланома III стадии (N=50);
• немелкоклеточный рак легкого стадии IIB и IIIA (N=50);
• рак толстой кишки с поражением лимфатических узлов и сосудистой инвазией (N=50).

Пациенты, включенные в КОГОРТЫ 2A, 2B и 3, пройдут следующие заборы крови для WP2:

• 20 мл в пробирки Cell-Free DNA BCT® CE (Streck) для анализа цтДНК. Образцы центрифугируют при 1600 (±150) g в течение 10 минут при комнатной температуре. После центрифугирования плазму подвергают дополнительному центрифугированию в течение 10 минут при 3000 (±150) g.
• 20 мл в пробирки Cell Save для выделения ЦТК.
• 30 мл для изучения циркулирующих иммунных популяций (WP3). Кроме того, опухолевая ткань, взятая во время хирургической фазы, будет собрана и проанализирована в WP4 и для изучения микроокружения с помощью методов "Секвенирования нового поколения", применяемых к опухоли в целом и на уровне единичной клетки, а также к иммунным популяциям (TIL).