En undersøgelse af biologiske, genetiske og konstitutionelle faktorer samt ikke-invasiv overvågning til vurdering af personlige kræftrisici (PRO-ACTIVE)

Observationsstudiet består af en retrospektiv og en prospektiv del.

Til den retrospektive del vil 400 patienter med brysttumorer opereret mellem 2000 og 2015 blive udvalgt, hvoraf 200 med arvelige brysttumorer og 200 med ikke-arvelige brysttumorer og med følgende kliniske, morfologiske og molekylære klassekarakteristika (luminal A og B, triple negative) og sammenlignelige stadier.

Tumorvævet vil blive undersøgt med immuncytokemiske undersøgelser for at studere følgende parametre: angiogenese (CD31), fibroblaster (CD34 og vimentin), makrofager (CD68) og tumorassocierede makrofager (M1: CD11c; M2: CD163); plasmaceller (CD138), T-lymfocytter (CD8); mastceller (CD117).

Dataene vil blive korreleret med prognosen og med risikoen for at udvikle arvelig brystkræft.

Den prospektive del forudsætter på den anden side inddragelelsen af forskellige kohorter af patienter, der først screenes i WP1.

600 patienter kendt for brystkræft (N=200), æggestokkræft (N=200) og tyktarmskræft (N=200) kandidater til germline genetisk testning i forbindelse med en onkogenetisk konsultation vil blive evalueret. Patienterne vil blive udvalgt før operation, og hvis de accepterer at deltage i studiet, vil de underskrive informeret samtykke i en onkogenetisk konsultationssammenhæng.

De udvalgte patienter vil gennemgå blodprøvetagning (5 ml i EDTA-rør) til udtrækning af nukleinsyrer (DNA og RNA).

Baseret på resultatet af germline genetisk testning vil patienterne blive klassificeret i 3 kohorter:

• KOHORTE 2A, personer med arvelig arv (probander): det forventes at identificere ca. 10% (N=60) probander ud af 600 undersøgte personer (20 pr. patologi).
• KOHORTE 2B, personer identificeret ved genetisk rådgivning som værende i risiko for at være bærere af et arveligt neoplastisk syndrom, ikke bevist af genetiske tests: en population på 60 personer, 20 for hver tumortype, med lignende kliniske karakteristika for alder og fænotype sammenlignet med kohorte 2A.
• KOHORTE 2C, en yderligere undergruppe af patienter (N=150), 50 for hver tumortype, negative resultater i diagnostisk genetisk analyse. Hos udvalgte patienter i kohorte 2C vil DNA/RNA blive analyseret for identifikation af årsagsskabende genetiske varianter i gener, der er undgået rutinemæssig diagnostisk undersøgelse.

Desuden vil en yderligere kohorte af patienter blive udvalgt, KOHORTE 3, som inkluderer 250 patienter, der gennemgår radikal kirurgisk behandling og med følgende karakteristika:

• lokalt fremskreden brystkræft med triple negativt fænotype eller med lobulær histologi (N=50);
• højgradig serøs æggestokkræft (N=50);
• stadie III melanoma (N=50);
• stadie IIB og IIIA ikke-småcellet lungekræft (N=50);
• tyktarmskræft med lymfeknudeinvolvering og vaskulær invasion (N=50).

Patienter inddraget i KOHORTE 2A, 2B og 3 vil gennemgå følgende blodprøvetagninger til WP2:

• 20 ml i Cell-Free DNA BCT® CE-rør (Streck) til ctDNA-analyse. Prøver centrifugeres ved 1600 (±150) g i 10 minutter ved stuetemperatur. Efter centrifugering undergår plasman yderligere centrifugering i 10 minutter ved 3000 (±150) g.
• 20 ml i Cell Save-rør til isolering af CTC'er.
• 30 ml til undersøgelse af cirkulerende immunpopulationer (WP3). Desuden vil tumorvævet taget under den kirurgiske fase blive indsamlet og analyseret i WP4 og til undersøgelse af mikromiljøet med "Next Generation Sequencing"-teknikker anvendt på tumoren som helhed og på enkeltcelle-niveau og til immunpopulationerne (TILs).