En studie av biologiske, genetiske og konstitusjonelle faktorer samt ikke-invasiv overvåking for å vurdere personlige kreftrisikoer (PRO-ACTIVE)

Den observasjonelle studien består av en retrospektiv og en prospektiv del.

For den retrospektive delen vil 400 pasienter med brystsvulster operert mellom 2000 og 2015 bli utvalgt, hvorav 200 med arvelige brystsvulster og 200 med ikke-arvelige brystsvulster og med følgende kliniske, morfologiske og molekylære klassekarakteristikker (luminal A og B, triple negative) og sammenlignbar stadieinndeling.

Svulstvevet vil bli underlagt immunocytokjemiske undersøkelser for å studere følgende parametere: angiogenese (CD31), fibroblaster (CD34 og vimentin), makrofager (CD68) og svulstassosierte makrofager (M1: CD11c; M2: CD163); plasmaceller (CD138), T-lymfocytter (CD8); mastceller (CD117).

Dataene vil bli korrelert med prognosen og med risikoen for å utvikle arvelig brystkreft.

Den prospektive delen forutsetter på den annen side innrullering av forskjellige kohorter av pasienter som først screenes i WP1.

600 pasienter kjent for brystkreft (N=200), eggstokkkreft (N=200) og tykktarmskreft (N=200) som er kandidater for germline genetisk testing i sammenheng med en onkogenetisk konsultasjon vil bli evaluert. Pasientene vil bli utvalgt før operasjon og, hvis de samtykker til å delta i studien, vil de signere informert samtykke i en onkogenetisk rådgivningssammenheng.

De utvalgte pasientene vil gjennomgå blodprøvetaking (5 ml i EDTA-rør) for ekstraksjon av nukleinsyrer (DNA og RNA).

Basert på resultatet av germline genetisk testing, vil pasientene bli klassifisert i 3 kohorter:

• KOHORT 2A, individer med arvelig arv (probander): identifikasjon av omtrent 10 % (N=60) probander av 600 undersøkte individer (20 per patologi) forutsettes.
• KOHORT 2B, individer identifisert gjennom genetisk rådgivning som har risiko for å være bærere av et arvelig neoplastisk syndrom, ikke bevist gjennom genetiske tester: en populasjon på 60 individer, 20 for hver type svulst, med lignende kliniske karakteristikker for alder og fenotype sammenlignet med kohort 2A.
• KOHORT 2C, en ytterligere undergruppe av pasienter (N=150), 50 for hver type svulst, med negative resultater i diagnostisk genetisk analyse. I utvalgte pasienter i kohort 2C vil DNA/RNA bli analysert for identifikasjon av årsaksgivende genetiske varianter i gener som har unnsluppet rutinemessig diagnostisk undersøkelse.

Videre vil en ytterligere kohort av pasienter bli utvalgt, KOHORT 3 som inkluderer 250 pasienter som gjennomgår radikal kirurgisk behandling og med følgende karakteristikker:

• lokalt avansert brystkreft med triple negativt fenotype eller med lobulær histologi (N=50);
• høygradig serøst eggstokkkarsinom (N=50);
• stadie III melanom (N=50);
• stadie IIB og IIIA ikke-småcellet lungekreft (N=50);
• tykktarmskreft med lymfeknutebefolkning og vaskulær invasjon (N=50).

Pasienter innrullert i KOHORTENE 2A, 2B og 3 vil gjennomgå følgende blodprøvetaking for WP2:

• 20 ml i Cell-Free DNA BCT® CE-rør (Streck) for ctDNA-analyse. Prøver sentrifugeres ved 1600 (±150) g i 10 minutter ved romtemperatur. Etter sentrifugering undergår plasma ytterligere sentrifugering i 10 minutter ved 3000 (±150) g.
• 20 ml i Cell Save-rør for isolering av CTC-er.
• 30 ml for studiet av sirkulerende immunpopulasjoner (WP3). Videre vil svulstvevet tatt under den kirurgiske fasen bli samlet og analysert i WP4 og for studiet av mikromiljøet med "Next Generation Sequencing"-teknikker anvendt på svulsten som helhet og på enkeltcelle-nivå og på immunpopulasjonene (TILs).