A genomikai eredmények megtérülése és az összesített behatolás a népesség alapú kohorszokban (PopSeq)
2026. július 8. frissítette: Robert C. Green, MD, MPH, Brigham and Women's Hospital
A PopSeq Project egy prospektív kohorsztanulmány, amely az eredmények genomiális visszatérési (gRoR) folyamatát fejleszti ki és hajtja végre a Framingham Heart Study (FHS) és a Jackson Heart Study (JHS) kohorszokban, és tárja fel a kapcsolódó orvosi, viselkedési és gazdasági eredményeket.
A tanulmány értelmezni fogja a TOPMed által korábban szekvenált JHS/FHS résztvevők genomiális szekvenciáit, akik hozzájárultak az eredmények genomiális visszaküldéséhez és/vagy a genetikai teszteléshez.
Új módszereket fejlesztünk és alkalmazunk a genomiális variánsok skálázható szűrésére/osztályozására, és feltárjuk a genomi penetranciát az FHS és a JHS résztvevőinek egy alcsoportjának fenotipizálásával.
A tanulmány áttekintése
Állapot
Befejezve
Körülmények
Beavatkozás / kezelés
Részletes leírás
A projekt céljai a következők: 1) Klinikailag hasznosítható genomikai eredmények visszaadása a résztvevőknek és az eredmények nyomon követése. Azon élő FHS/JHS résztvevők közül, akik beleegyeztek a gRoR-be, felvesszük a kapcsolatot azokkal, akiknél az ACMG által javasolt másodlagos leletek listáján szereplő gének valamelyikében káros hatásos variánst fedeznek fel (a résztvevők 2%-a). 2) Javítani kell a nagy áteresztőképességű módszereket az érvényes patogén variációk azonosítására. Finomítsa és alkalmazza az FHS/JHS genomok nagy áteresztőképességű szűrésére szolgáló módszereket oly módon, hogy megőrizze a nagy érzékenységet a káros változatok kimutatására ~3500 Mendel-betegséggel összefüggő génben, miközben csökkenti a nem patogének/valószínűleg patogének variánsok hamis felfedezési arányát. 3) Fedezze fel a mendeli betegségek összesített penetranciáját. Tekintse át az FHS- és JHS-résztvevők egy részhalmazának fenotípus-adatait, és hasonlítsa össze ezeket a genotípusos adatokkal.
Az összegyűjtendő adatok magukban foglalják az olyan egyének kimenetelét és fenotípusos adatait, akik beleegyeztek a gRoR-be, és akik tudomást szereztek arról, hogy az ACMG listán szereplő gének valamelyikében káros változatuk van. Ezeket az adatokat felmérések útján saját maguk jelentik be, és felülvizsgálják a rendelkezésre álló egészségügyi feljegyzéseket. További fenotípusos adatokat lehet gyűjteni és felülvizsgálni más nem hatásos mendeli betegség génekre vonatkozóan a genomi penetrancia feltárása érdekében.
Azok a kutatásban résztvevők, akiket egy működőképes gén káros változatával azonosítottak, közvetlen egészségügyi előnyökhöz juthatnak ezen információk megismerése révén; azonban a genomiális eredmények visszaküldése egészséges egyéneknek, akik nem jelentkeznek orvosi indikációra, váratlan károkat okozhatnak a szűrés és kezelés variánsok által irányított növekedésével kapcsolatban. Ez a tanulmány a genomikai információk populációalapú kohorszokban történő visszaküldésével kapcsolatos előnyök és esetleges károk feltárására összpontosít. Lehetővé teszi továbbá, hogy jobban megértsük ezeknek a változatoknak a penetrációját két olyan populációban, amelyeket nem választottak ki a betegség státusza alapján, és lehetővé teszi számunkra, hogy összehasonlítsuk az elsődlegesen afroamerikai és a kaukázusi populáció eredményeit. A variánsanalízis egyszerűsítésére szolgáló módszerek kidolgozása elősegíti a laboratóriumi hatékonyság javítását, és előrelépést tesz a variánsok kezelésének és elemzésének területén.
Tanulmány típusa
Beavatkozó
Beiratkozás (Tényleges)
7603
Fázis
- Nem alkalmazható
Kapcsolatok és helyek
Ez a rész a vizsgálatot végzők elérhetőségeit, valamint a vizsgálat lefolytatásának helyére vonatkozó információkat tartalmazza.
Tanulmányi helyek
-
-
Massachusetts
-
Framingham, Massachusetts, Egyesült Államok, 01702
- Framingham Heart Study
-
-
Mississippi
-
Jackson, Mississippi, Egyesült Államok, 39213
- Jackson Heart Study
-
-
Részvételi kritériumok
A kutatók olyan embereket keresnek, akik megfelelnek egy bizonyos leírásnak, az úgynevezett jogosultsági kritériumoknak. Néhány példa ezekre a kritériumokra a személy általános egészségi állapota vagy a korábbi kezelések.
Jogosultsági kritériumok
Tanulmányozható életkorok
18 év (Felnőtt, Idősebb felnőtt)
Egészséges önkénteseket fogad
Nem
Leírás
Bevételi kritériumok:
- A Framingham Heart Study-ba és a Jackson Heart Study-ba beiratkozott élő egyedek, akiknek genomjukat a TOPMed program részeként szekvenálták.
- 18 év feletti felnőttek
- Azok, akik hozzájárultak DNS-mintáik kutatási célú felhasználásához (és azok, akik részt vesznek a gRoR-ban, akik hozzájárultak a genomiális információk átvételéhez).
Kizárási kritériumok:
- A Framingham Heart Study vagy Jackson Heart Study résztvevői, akiknek nem szekvenálták a genomjukat a TOPMed részeként
- Azok a résztvevők, akik nem a genomikai/genetikai kutatást választották
- Résztvevők, akik hozzájárultak/nem járultak hozzá a genomikai eredmény megkapásához (csak a vizsgálat gRoR részére)
Tanulási terv
Ez a rész a vizsgálati terv részleteit tartalmazza, beleértve a vizsgálat megtervezését és a vizsgálat mérését.
Hogyan készül a tanulmány?
Tervezési részletek
- Elsődleges cél: Megelőzés
- Kiosztás: N/A
- Beavatkozó modell: Egyetlen csoportos hozzárendelés
- Maszkolás: Nincs (Open Label)
Fegyverek és beavatkozások
Résztvevő csoport / kar |
Beavatkozás / kezelés |
|---|---|
|
Kísérleti: FHS és JHS résztvevők egy működő genomikai lelettel
A Framingham és Jackson Heart Study azon résztvevői, akiknek genomjukat a TOPMed részeként szekvenálták, értesítést kapnak, ha egy ACMG v2.0 génben használható genetikai eredményt azonosítanak, és lehetőséget kapnak arra, hogy kutatási eredményüket a tanulmány klinikailag megerősítse.
|
Teljes genom szekvenálása és az ACMG másodlagos leletlistáján szereplő gének végrehajtható genomikai eredményeinek jelentése.
|
Mit mér a tanulmány?
Elsődleges eredményintézkedések
Eredménymérő |
Intézkedés leírása |
Időkeret |
|---|---|---|
|
Follow Through With Disclosure
Időkeret: From genetic result notification to 8 months post-disclosure
|
Living JHS/FHS participants sequenced as part of the TOPMed program who were notified about an actionable genetic result that warranted having the research result verified who followed through with having their result confirmed and disclosed to their health care provider.
|
From genetic result notification to 8 months post-disclosure
|
|
Total Costs of Program Implementation
Időkeret: From the initiation of bioinformatics analysis to disclosure of confirmed actionable genetic finding (approximately 6 months).
|
We will determine the costs and associated time demands of implementing gRoR using a microcosting approach in which study staff track the amount of time they spend and the resources they use for each step of the protocol.
Ranges are based on 50% to 200% of point estimates given variability in wages and prices of services.
|
From the initiation of bioinformatics analysis to disclosure of confirmed actionable genetic finding (approximately 6 months).
|
|
Costs of Follow-Up Care
Időkeret: 1 Year Post-Disclosure Survey (from 12 months to 15 months after disclosure of confirmed results)
|
For follow-up medical care, we use a gross costing approach where we apply Centers for Medicare and Medicaid fee schedules to participant-reported referrals and tests.
|
1 Year Post-Disclosure Survey (from 12 months to 15 months after disclosure of confirmed results)
|
Másodlagos eredményintézkedések
Eredménymérő |
Intézkedés leírása |
Időkeret |
|---|---|---|
|
Guideline Compliance
Időkeret: At the time of disclosure of confirmed findings (approximately 3 months after initial results notification)
|
Number of participants with actionable genetic results who, per the judgement of a genetic specialist, had already met clinical criteria for genetic testing based on their personal and family histories of disease.
|
At the time of disclosure of confirmed findings (approximately 3 months after initial results notification)
|
|
New and Modified Diagnoses
Időkeret: 6 months Post-Disclosure Survey (6-9 months after disclosure of confirmed results);1 Year Post-Disclosure Survey (from 1 year to 15 months after disclosure of confirmed results)
|
We will examine cases to determine the percentage of individuals who report a new or modified diagnosis attributed to results disclosure.
|
6 months Post-Disclosure Survey (6-9 months after disclosure of confirmed results);1 Year Post-Disclosure Survey (from 1 year to 15 months after disclosure of confirmed results)
|
|
Self-Rated Health
Időkeret: Post Disclosure Survey (up to 1 month from disclosure of confirmed results); 1 Year Post-Disclosure Survey (from 12 months to 15 months after disclosure of confirmed results)
|
A single item of self rated health derived from the SF-12v2.
|
Post Disclosure Survey (up to 1 month from disclosure of confirmed results); 1 Year Post-Disclosure Survey (from 12 months to 15 months after disclosure of confirmed results)
|
|
Number of Participants With Recommendations to Referrals or Services During Clinical Disclosure Sessions
Időkeret: From disclosure to 1 month post-disclosure
|
We reviewed chart notes from results disclosure sessions to determine whether referrals or services were recommended in response to genetic findings.
|
From disclosure to 1 month post-disclosure
|
|
Health Care Utilization
Időkeret: 1 year Post-Disclosure Survey (from 12 months to 15 months after disclosure of confirmed results)
|
Health care utilization in response to results disclosure reported by participants in the one year follow-up survey, including referrals, tests and/or procedures, and changes to medications.
|
1 year Post-Disclosure Survey (from 12 months to 15 months after disclosure of confirmed results)
|
Egyéb eredményintézkedések
Eredménymérő |
Intézkedés leírása |
Időkeret |
|---|---|---|
|
Self-Reported Changes to Health Behaviors
Időkeret: 1 Year Post-Disclosure Survey (from 12 months to 15 months after disclosure of confirmed results)
|
A series of standardized yes/no questions that assess whether disclosed genetic information motivated participants to make changes to health behaviors, including diet, exercise, dietary supplements use, alcohol use, stress management, and smoking.
|
1 Year Post-Disclosure Survey (from 12 months to 15 months after disclosure of confirmed results)
|
|
Disclosure-specific Impact
Időkeret: 6 months Post-Disclosure Survey (6-9 months after disclosure of confirmed results)
|
The survey assessed the disclosure-specific impact of information on distress and positive emotions using an adapted 12-item version of the FaCTOR, a validated instrument developed for genomic sequencing that is sensitive to responses to high- and low-risk genetic risk results.
Subscales assess negative emotions (range: 3 to 15), positive feelings (reverse-scored, range: 4 to 20), uncertainty (range: 3 to 15), and privacy concerns (range: 2 to 10), with higher scores on each subscale indicating more negative experiences.
|
6 months Post-Disclosure Survey (6-9 months after disclosure of confirmed results)
|
|
Satisfaction With Disclosure
Időkeret: 6 months Post-Disclosure Survey (6-9 months after disclosure of confirmed results); 1 Year Post-Disclosure Survey (from 12 months to 15 months after disclosure of confirmed results)
|
Surveys assessed how helpful participants felt the results disclosure session was using a novel single question.
|
6 months Post-Disclosure Survey (6-9 months after disclosure of confirmed results); 1 Year Post-Disclosure Survey (from 12 months to 15 months after disclosure of confirmed results)
|
|
Decisional Regret
Időkeret: 6 months Post-Disclosure Survey (6-9 months after disclosure of confirmed results); 1 Year Post-Disclosure Survey (from 12 months to 15 months after disclosure of confirmed results)
|
Surveys assessed if participants regretted their decisions to receive their genetic findings using a novel single question.
|
6 months Post-Disclosure Survey (6-9 months after disclosure of confirmed results); 1 Year Post-Disclosure Survey (from 12 months to 15 months after disclosure of confirmed results)
|
|
Sharing With Relatives
Időkeret: 1 Year Post-Disclosure Survey (from 12 months to 15 months after disclosure of confirmed results)
|
The survey assessed with whether participants shared their genetic information with relatives .
|
1 Year Post-Disclosure Survey (from 12 months to 15 months after disclosure of confirmed results)
|
|
Family Testing
Időkeret: 1 Year Post-Disclosure Survey (from 12 months to 15 months after disclosure of confirmed results)
|
The survey assessed whether participants had relatives that received genetic testing based on disclosure to the participant.
|
1 Year Post-Disclosure Survey (from 12 months to 15 months after disclosure of confirmed results)
|
|
General Anxiety
Időkeret: Post Disclosure Survey (up to 1 month from disclosure of confirmed results); 6 months Post-Disclosure Survey (6-9 months after disclosure of confirmed results)
|
We measure general anxiety using a 4-item version of the General Anxiety Disorder Scale, a validated scale that allows investigators to identify individuals with a potential mood disorder.
Scores range from 4 to 16, with higher scores indicating greater anxiety.
|
Post Disclosure Survey (up to 1 month from disclosure of confirmed results); 6 months Post-Disclosure Survey (6-9 months after disclosure of confirmed results)
|
Együttműködők és nyomozók
Itt találhatja meg a tanulmányban érintett személyeket és szervezeteket.
Publikációk és hasznos linkek
A vizsgálattal kapcsolatos információk beviteléért felelős személy önkéntesen bocsátja rendelkezésre ezeket a kiadványokat. Ezek bármiről szólhatnak, ami a tanulmányhoz kapcsolódik.
Általános kiadványok
- Wolf SM, Branum R, Koenig BA, Petersen GM, Berry SA, Beskow LM, Daly MB, Fernandez CV, Green RC, LeRoy BS, Lindor NM, O'Rourke PP, Breitkopf CR, Rothstein MA, Van Ness B, Wilfond BS. Returning a Research Participant's Genomic Results to Relatives: Analysis and Recommendations. J Law Med Ethics. 2015 Fall;43(3):440-63. doi: 10.1111/jlme.12288.
- Wolf SM, Lawrenz FP, Nelson CA, Kahn JP, Cho MK, Clayton EW, Fletcher JG, Georgieff MK, Hammerschmidt D, Hudson K, Illes J, Kapur V, Keane MA, Koenig BA, Leroy BS, McFarland EG, Paradise J, Parker LS, Terry SF, Van Ness B, Wilfond BS. Managing incidental findings in human subjects research: analysis and recommendations. J Law Med Ethics. 2008 Summer;36(2):219-48, 211. doi: 10.1111/j.1748-720X.2008.00266.x.
- Vassy JL, Lautenbach DM, McLaughlin HM, Kong SW, Christensen KD, Krier J, Kohane IS, Feuerman LZ, Blumenthal-Barby J, Roberts JS, Lehmann LS, Ho CY, Ubel PA, MacRae CA, Seidman CE, Murray MF, McGuire AL, Rehm HL, Green RC; MedSeq Project. The MedSeq Project: a randomized trial of integrating whole genome sequencing into clinical medicine. Trials. 2014 Mar 20;15:85. doi: 10.1186/1745-6215-15-85.
- McLaughlin HM, Ceyhan-Birsoy O, Christensen KD, Kohane IS, Krier J, Lane WJ, Lautenbach D, Lebo MS, Machini K, MacRae CA, Azzariti DR, Murray MF, Seidman CE, Vassy JL, Green RC, Rehm HL; MedSeq Project. A systematic approach to the reporting of medically relevant findings from whole genome sequencing. BMC Med Genet. 2014 Dec 14;15:134. doi: 10.1186/s12881-014-0134-1.
- Vassy JL, Christensen KD, Schonman EF, Blout CL, Robinson JO, Krier JB, Diamond PM, Lebo M, Machini K, Azzariti DR, Dukhovny D, Bates DW, MacRae CA, Murray MF, Rehm HL, McGuire AL, Green RC; MedSeq Project. The Impact of Whole-Genome Sequencing on the Primary Care and Outcomes of Healthy Adult Patients: A Pilot Randomized Trial. Ann Intern Med. 2017 Jun 27;167(3):159-169. doi: 10.7326/M17-0188. Print 2017 Aug 1.
- Christensen KD, Vassy JL, Phillips KA, Blout CL, Azzariti DR, Lu CY, Robinson JO, Lee K, Douglas MP, Yeh JM, Machini K, Stout NK, Rehm HL, McGuire AL, Green RC, Dukhovny D; MedSeq Project. Short-term costs of integrating whole-genome sequencing into primary care and cardiology settings: a pilot randomized trial. Genet Med. 2018 Dec;20(12):1544-1553. doi: 10.1038/gim.2018.35. Epub 2018 Mar 22.
- Lupo PJ, Robinson JO, Diamond PM, Jamal L, Danysh HE, Blumenthal-Barby J, Lehmann LS, Vassy JL, Christensen KD, Green RC, McGuire AL; MedSeq Project team. Patients' perceived utility of whole-genome sequencing for their healthcare: findings from the MedSeq project. Per Med. 2016 Jan 1;13(1):13-20. doi: 10.2217/pme.15.45. Epub 2016 Jan 8.
- Biesecker LG, Green RC. Diagnostic clinical genome and exome sequencing. N Engl J Med. 2014 Sep 18;371(12):1170. doi: 10.1056/NEJMc1408914. No abstract available.
- Wolf SM, Crock BN, Van Ness B, Lawrenz F, Kahn JP, Beskow LM, Cho MK, Christman MF, Green RC, Hall R, Illes J, Keane M, Knoppers BM, Koenig BA, Kohane IS, Leroy B, Maschke KJ, McGeveran W, Ossorio P, Parker LS, Petersen GM, Richardson HS, Scott JA, Terry SF, Wilfond BS, Wolf WA. Managing incidental findings and research results in genomic research involving biobanks and archived data sets. Genet Med. 2012 Apr;14(4):361-84. doi: 10.1038/gim.2012.23.
- Burke W, Evans BJ, Jarvik GP. Return of results: ethical and legal distinctions between research and clinical care. Am J Med Genet C Semin Med Genet. 2014 Mar;166C(1):105-11. doi: 10.1002/ajmg.c.31393. Epub 2014 Mar 10.
- National Heart, Lung, and Blood Institute working group; Fabsitz RR, McGuire A, Sharp RR, Puggal M, Beskow LM, Biesecker LG, Bookman E, Burke W, Burchard EG, Church G, Clayton EW, Eckfeldt JH, Fernandez CV, Fisher R, Fullerton SM, Gabriel S, Gachupin F, James C, Jarvik GP, Kittles R, Leib JR, O'Donnell C, O'Rourke PP, Rodriguez LL, Schully SD, Shuldiner AR, Sze RK, Thakuria JV, Wolf SM, Burke GL. Ethical and practical guidelines for reporting genetic research results to study participants: updated guidelines from a National Heart, Lung, and Blood Institute working group. Circ Cardiovasc Genet. 2010 Dec;3(6):574-80. doi: 10.1161/CIRCGENETICS.110.958827.
- Natarajan P, Gold NB, Bick AG, McLaughlin H, Kraft P, Rehm HL, Peloso GM, Wilson JG, Correa A, Seidman JG, Seidman CE, Kathiresan S, Green RC. Aggregate penetrance of genomic variants for actionable disorders in European and African Americans. Sci Transl Med. 2016 Nov 9;8(364):364ra151. doi: 10.1126/scitranslmed.aag2367.
- Christensen KD, Phillips KA, Green RC, Dukhovny D. Cost Analyses of Genomic Sequencing: Lessons Learned from the MedSeq Project. Value Health. 2018 Sep;21(9):1054-1061. doi: 10.1016/j.jval.2018.06.013. Epub 2018 Aug 14.
- Roberts JS, Robinson JO, Diamond PM, Bharadwaj A, Christensen KD, Lee KB, Green RC, McGuire AL; MedSeq Project team. Patient understanding of, satisfaction with, and perceived utility of whole-genome sequencing: findings from the MedSeq Project. Genet Med. 2018 Sep;20(9):1069-1076. doi: 10.1038/gim.2017.223. Epub 2018 Jan 4.
- Christensen KD, Dukhovny D, Siebert U, Green RC. Assessing the Costs and Cost-Effectiveness of Genomic Sequencing. J Pers Med. 2015 Dec 10;5(4):470-86. doi: 10.3390/jpm5040470.
- Machini K, Ceyhan-Birsoy O, Azzariti DR, Sharma H, Rossetti P, Mahanta L, Hutchinson L, McLaughlin H; MedSeq Project; Green RC, Lebo M, Rehm HL. Analyzing and Reanalyzing the Genome: Findings from the MedSeq Project. Am J Hum Genet. 2019 Jul 3;105(1):177-188. doi: 10.1016/j.ajhg.2019.05.017. Epub 2019 Jun 27.
- Green RC, Berg JS, Grody WW, Kalia SS, Korf BR, Martin CL, McGuire AL, Nussbaum RL, O'Daniel JM, Ormond KE, Rehm HL, Watson MS, Williams MS, Biesecker LG; American College of Medical Genetics and Genomics. ACMG recommendations for reporting of incidental findings in clinical exome and genome sequencing. Genet Med. 2013 Jul;15(7):565-74. doi: 10.1038/gim.2013.73. Epub 2013 Jun 20.
- Kalia SS, Adelman K, Bale SJ, Chung WK, Eng C, Evans JP, Herman GE, Hufnagel SB, Klein TE, Korf BR, McKelvey KD, Ormond KE, Richards CS, Vlangos CN, Watson M, Martin CL, Miller DT. Recommendations for reporting of secondary findings in clinical exome and genome sequencing, 2016 update (ACMG SF v2.0): a policy statement of the American College of Medical Genetics and Genomics. Genet Med. 2017 Feb;19(2):249-255. doi: 10.1038/gim.2016.190. Epub 2016 Nov 17.
Tanulmányi rekorddátumok
Ezek a dátumok nyomon követik a ClinicalTrials.gov webhelyre benyújtott vizsgálati rekordok és összefoglaló eredmények benyújtásának folyamatát. A vizsgálati feljegyzéseket és a jelentett eredményeket a Nemzeti Orvostudományi Könyvtár (NLM) felülvizsgálja, hogy megbizonyosodjon arról, hogy megfelelnek-e az adott minőség-ellenőrzési szabványoknak, mielőtt közzéteszik őket a nyilvános weboldalon.
Tanulmány főbb dátumok
Tanulmány kezdete (Tényleges)
2021. június 9.
Elsődleges befejezés (Tényleges)
2025. május 30.
A tanulmány befejezése (Tényleges)
2025. május 30.
Tanulmányi regisztráció dátumai
Először benyújtva
2019. december 10.
Először nyújtották be, amely megfelel a minőségbiztosítási kritériumoknak
2019. december 10.
Első közzététel (Tényleges)
2019. december 12.
Tanulmányi rekordok frissítései
Utolsó frissítés közzétéve (Tényleges)
2026. augusztus 3.
Az utolsó frissítés elküldve, amely megfelel a minőségbiztosítási kritériumoknak
2026. július 8.
Utolsó ellenőrzés
2026. július 1.
Több információ
A tanulmányhoz kapcsolódó kifejezések
További vonatkozó MeSH feltételek
Egyéb vizsgálati azonosító számok
- R01HL143295 (Az Egyesült Államok NIH támogatása/szerződése)
Terv az egyéni résztvevői adatokhoz (IPD)
Tervezi megosztani az egyéni résztvevői adatokat (IPD)?
NEM
IPD terv leírása
Az egyes résztvevők adatait nem osztjuk meg.
Az összesített adatokat közzététel útján osztjuk meg, és kérésre figyelembe vesszük.
Gyógyszer- és eszközinformációk, tanulmányi dokumentumok
Egy amerikai FDA által szabályozott gyógyszerkészítményt tanulmányoz
Nem
Egy amerikai FDA által szabályozott eszközterméket tanulmányoz
Nem
Ezt az információt közvetlenül a clinicaltrials.gov webhelyről szereztük be, változtatás nélkül. Ha bármilyen kérése van vizsgálati adatainak módosítására, eltávolítására vagy frissítésére, kérjük, írjon a következő címre: register@clinicaltrials.gov. Amint a változás bevezetésre kerül a clinicaltrials.gov oldalon, ez a webhelyünkön is automatikusan frissül. .