Návrat genomických výsledků a souhrnná penetrace v populačních kohortách (PopSeq)

Cíle tohoto projektu jsou: 1) Vrátit klinicky použitelné genomické výsledky účastníkům a sledovat výsledky. Mezi žijícími účastníky FHS/JHS, kteří souhlasili s gRoR, budeme kontaktovat ty, u kterých je objevena škodlivá akceschopná varianta v jednom z genů uvedených na seznamu sekundárních nálezů doporučených ACMG (odhad 2 % účastníků). 2) Zlepšit vysoce výkonné metody pro identifikaci platných patogenních variací. Zdokonalte a aplikujte metody pro vysoce výkonný screening genomů FHS/JHS způsobem, který si zachová vysokou citlivost pro detekci škodlivých variant v ~3500 genech spojených s Mendelovou chorobou a zároveň sníží míru falešných objevů variant, které nejsou patogenní/pravděpodobně patogenní. 3) Prozkoumejte penetraci agregátů pro mendelovské choroby. Zkontrolujte údaje o fenotypu od podskupiny účastníků FHS a JHS a porovnejte je s genotypovými údaji.

Údaje, které mají být shromážděny, zahrnují výsledky a fenotypové údaje o jednotlivcích, kteří souhlasí s gRoR a kteří se dozvěděli, že mají škodlivou variantu v jednom z genů uvedených v ACMG. Tyto údaje budou vykazovány prostřednictvím průzkumů a budou přezkoumány dostupné lékařské záznamy. Další fenotypová data mohou být shromážděna a přezkoumána pro jiné geny mendelovské choroby, které nelze ovlivnit, za účelem prozkoumání genomové penetrace.

Účastníci výzkumu, kteří jsou identifikováni se škodlivou variantou v použitelném genu, mohou získat přímé zdravotní přínosy z učení se této informace; nicméně vracení genomických výsledků zdravým jedincům, kteří nemají lékařskou indikaci, může představovat neočekávané škody související s variantně zaměřeným zvýšením screeningu a léčby. Tato studie je zaměřena na zkoumání přínosů a jakýchkoli potenciálních škod souvisejících s navracením genomických informací v populačních kohortách. Umožní nám to také lépe porozumět penetraci těchto variant ve dvou populacích, které nebyly vybrány pro stav onemocnění, a umožní nám to porovnat výsledky u primárně afroamerické populace vs. kavkazské populace. Vývoj metod pro zefektivnění analýzy variant pomůže zlepšit efektivitu laboratoře a pokročí v oblasti ošetřování a analýzy variant.