Terugkeer van genomische resultaten en geaggregeerde penetratie in op populatie gebaseerde cohorten (PopSeq)

De doelstellingen van dit project zijn: 1) klinisch bruikbare genomische resultaten teruggeven aan deelnemers en resultaten volgen. Onder de levende FHS/JHS-deelnemers die hebben ingestemd met gRoR, zullen we contact opnemen met degenen bij wie een schadelijke bruikbare variant is ontdekt in een van de genen die zijn vermeld op de ACMG-lijst met aanbevolen secundaire bevindingen (schatting 2% van de deelnemers). 2) Verbeter high-throughput-methoden voor het identificeren van geldige pathogene variatie. Verfijn en pas methoden toe voor high-throughput screening van FHS/JHS-genomen op een manier die een hoge gevoeligheid behoudt voor de detectie van schadelijke varianten in ~3500 Mendeliaanse ziekte-geassocieerde genen, terwijl het valse ontdekkingspercentage van varianten die niet pathogeen/waarschijnlijk pathogeen zijn, wordt verminderd. 3) Onderzoek de totale penetrantie voor Mendeliaanse ziekten. Bekijk fenotypegegevens van een subset van FHS- en JHS-deelnemers en vergelijk deze met genotypische gegevens.

Gegevens die moeten worden verzameld, omvatten uitkomst- en fenotypische gegevens over de personen die akkoord gaan met gRoR en die vernemen dat ze een schadelijke variant hebben in een van de ACMG-geregistreerde genen. Deze gegevens zullen zelf worden gerapporteerd door middel van enquêtes en beschikbare medische dossiers zullen worden beoordeeld. Aanvullende fenotypische gegevens kunnen worden verzameld en beoordeeld voor andere niet-werkbare genen voor de ziekte van Mendel om genomische penetratie te onderzoeken.

Onderzoeksdeelnemers die zijn geïdentificeerd met een schadelijke variant in een bruikbaar gen, kunnen directe gezondheidsvoordelen behalen door deze informatie te leren; het retourneren van genomische resultaten aan gezonde individuen die zich niet presenteren voor een medische indicatie, kan echter onverwachte schade met zich meebrengen in verband met variantgerichte verhogingen van screening en management. Deze studie is gericht op het onderzoeken van de voordelen en mogelijke nadelen van het retourneren van genomische informatie in populatiegebaseerde cohorten. Het zal ons ook in staat stellen om de penetrantie van deze varianten beter te begrijpen in twee populaties die niet geselecteerd zijn op ziektestatus en zal ons in staat stellen om de resultaten in een voornamelijk Afro-Amerikaanse populatie te vergelijken met een blanke populatie. Het ontwikkelen van methoden om variantanalyse te stroomlijnen zal de laboratoriumefficiëntie helpen verbeteren en zal vooruitgang boeken op het gebied van curatie en analyse van varianten.