Powrót wyników genomowych i zagregowana penetracja w kohortach opartych na populacji (PopSeq)

Cele tego projektu to: 1) Zwrócenie uczestnikom wyników badań genomicznych dających się zastosować klinicznie i śledzenie wyników. Wśród żyjących uczestników FHS / JHS, którzy wyrazili zgodę na gRoR, skontaktujemy się z tymi, u których odkryto szkodliwy wariant nadający się do działania w jednym z genów odnotowanych na liście wyników wtórnych zalecanych przez ACMG (szacuje się, że 2% uczestników). 2) Poprawa wysokowydajnych metod identyfikacji ważnych zmienności patogennych. Udoskonalić i zastosować metody wysokowydajnych badań przesiewowych genomów FHS/JHS w sposób, który zachowuje wysoką czułość wykrywania szkodliwych wariantów w około 3500 genach związanych z chorobą Mendla, jednocześnie zmniejszając odsetek fałszywych odkryć wariantów, które nie są patogenne/prawdopodobnie patogenne. 3) Zbadaj zagregowaną penetrację dla chorób Mendla. Przejrzyj dane fenotypowe z podzbioru uczestników FHS i JHS i porównaj je z danymi genotypowymi.

Dane, które należy zebrać, obejmują wyniki i dane fenotypowe dotyczące osób, które zgadzają się na gRoR i które dowiadują się, że mają szkodliwy wariant jednego z genów wymienionych przez ACMG. Dane te będą zgłaszane samodzielnie za pomocą ankiet, a dostępna dokumentacja medyczna zostanie poddana przeglądowi. Dodatkowe dane fenotypowe mogą być gromadzone i przeglądane pod kątem innych niepodlegających działaniu genów choroby mendlowskiej w celu zbadania penetracji genomowej.

Uczestnicy badań, u których zidentyfikowano szkodliwy wariant genu umożliwiającego działanie, mogą odnieść bezpośrednie korzyści zdrowotne z poznania tych informacji; jednak zwracanie wyników genomicznych zdrowym osobom, które nie zgłaszają się z powodu wskazań medycznych, może spowodować nieoczekiwane szkody związane z ukierunkowanym na warianty wzrostem badań przesiewowych i zarządzania. Niniejsze badanie koncentruje się na zbadaniu korzyści i wszelkich potencjalnych szkód związanych ze zwracaniem informacji genomowych w kohortach populacyjnych. Pozwoli nam to również lepiej zrozumieć penetrację tych wariantów w dwóch populacjach niewybranych ze względu na stan chorobowy i pozwoli nam porównać wyniki w populacji głównie afroamerykańskiej z populacją kaukaską. Opracowanie metod usprawniających analizę wariantów pomoże poprawić wydajność laboratoriów i przyczyni się do postępu w dziedzinie kuracji i analizy wariantów.