Retur av genomiske resultater og aggregert penetrans i populasjonsbaserte kohorter (PopSeq)

Målene med dette prosjektet er å: 1) Returnere klinisk handlingsdyktige genomiske resultater til deltakerne og spore resultater. Blant levende FHS/JHS-deltakere som har samtykket til gRoR, vil vi kontakte de som oppdager en skadelig handlingsbar variant i et av genene som er notert på ACMGs anbefalte sekundære funnliste (anslå 2 % av deltakerne). 2) Forbedre high-throughput metoder for å identifisere gyldig patogen variasjon. Avgrens og bruk metoder for høy gjennomstrømningsscreening av FHS/JHS-genomer på en måte som beholder høy sensitivitet for påvisning av skadelige varianter i ~3500 Mendelske sykdomsassosierte gener samtidig som den falske oppdagelsesraten for varianter som ikke er patogene/sannsynlig patogene reduseres. 3) Utforsk aggregert penetrans for Mendelske sykdommer. Gjennomgå fenotypedata fra en undergruppe av FHS- og JHS-deltakere og sammenlign dette med genotypiske data.

Data som skal samles inn inkluderer utfalls- og fenotypiske data om individene som godtar gRoR og som får vite at de har en skadelig variant i et av de ACMG-listede genene. Disse dataene vil bli selvrapportert gjennom undersøkelser og tilgjengelige journaler vil bli gjennomgått. Ytterligere fenotypiske data kan samles inn og gjennomgås for andre ikke-handlingsbare mendelske sykdomsgener for å utforske genomisk penetrans.

Forskningsdeltakere som er identifisert med en skadelig variant i et handlingsbart gen kan få direkte helsegevinster ved å lære denne informasjonen; imidlertid kan returnering av genomiske resultater til friske individer som ikke presenterer for en medisinsk indikasjon utgjøre uventede skader relatert til variantrettet økning i screening og behandling. Denne studien er fokusert på å utforske fordelene og eventuelle skader knyttet til returnering av genomisk informasjon i populasjonsbaserte kohorter. Det vil også tillate oss å bedre forstå penetreringen av disse variantene i to populasjoner som ikke er valgt for sykdomsstatus, og vil tillate oss å sammenligne resultater i en primært afroamerikansk populasjon vs en kaukasisk populasjon. Å utvikle metoder for å effektivisere variantanalyse vil bidra til å forbedre laboratorieeffektiviteten og vil utvikle feltet for variantkurering og analyse.