ゲノム発見のための全ゲノムメディカルシーケンシング
遺伝子発見のための全ゲノムメディカルシーケンシング
バックグラウンド:
- 多くのまれな遺伝性疾患は少数の患者にしか影響を与えず、これらの状態の遺伝的原因は不明のままです. 研究者は、全ゲノムシーケンシングと呼ばれる新しい技術を使用して、どの遺伝子または複数の遺伝子がこれらの状態を引き起こすかを研究しています. これらの疾患を引き起こす遺伝子を理解することは、罹患した患者の診断と治療を改善するために重要です。
目的:
- 既存の技術では特定が困難な疾患の遺伝的原因を特定する。
- 全ゲノムシーケンシングの医療およびカウンセリングの課題に対するベストプラクティスを開発すること。
資格:
- この研究で考慮されているまれな疾患の 1 つを持っている個人。 これらの状態は、一般に、障害の遺伝的原因が不明な状態です。 ほとんどの個々の参加者の適格性は、研究者によってケースバイケースで決定されます。
- その家族(多くの場合、親)が遺伝情報を提供する可能性がある場合、罹患者の家族。
デザイン:
- この研究の参加者は、以下の手順のうち少なくとも 1 つ、場合によっては複数の手順を実行します。
- 医学的遺伝学評価。
- X線、磁気共鳴画像法(MRI)検査、および他の医師との相談を含むその他の検査。 一人一人にすべての研究が必要なわけではありませんが、遺伝子配列決定研究の一部を進めるために、検査からの情報が必要になる場合があります。
- 障害の特定の側面を記録するための臨床写真。
- 治験担当医師の要求に応じて、血液および皮膚生検サンプル、またはその他の組織サンプル。
- 研究者によって決定された遺伝子検査。 ただし、この研究のほとんどの参加者は、全ゲノム配列決定を受けることを期待できます。これは、人のすべての遺伝子を研究する技術です。
- 一部の参加者は、電話インタビューおよび/または Web ベースの調査への参加を求められる場合があります。
- 参加者は、全ゲノム配列決定からどのような結果を学びたいかを選択できます。
- テストが完了し、遺伝子研究の結果が判明した後、参加者はこれらの結果を学ぶために国立衛生研究所への再訪問が提供されます. この訪問中、参加者は調査に記入し、調査に参加するという決定に関連するインタビューに参加し、個々の遺伝子検査結果を知るよう求められます。
調査の概要
詳細な説明
私たちは、ゲノムスケールの医療シーケンシング (GSMS、エクソームと全体を含む) を使用することを目指しています。
必要に応じてゲノム配列決定を行う)、現在未知または特徴付けられていない遺伝子における体細胞変異、生殖細胞系 de novo ヘテロ接合性変異、生殖細胞系遺伝性劣性突然変異、または生殖細胞系遺伝性優性突然変異のいずれかによって引き起こされると仮定された一連のまれで重篤な表現型の原因となる分子病変を発見する。 この研究の目標は 3 つあります: 分子病因が以前は不明であった疾患の原因となる配列変異体を特定すること、この洞察を研究中のまれな疾患とより一般的な表現型の両方に適用すること、およびゲノム全体での突然変異の研究を強化することです。レベル。
調査中の表現型ごとに、両親と一緒に約3〜6人の罹患者を募集する予定です。 将来的に募集されたトリオは、簡単な臨床評価と分子評価のためにNIH臨床センターに運ばれます。 各トリオは、臨床的に関連する結果、つまり、問題の障害を説明する結果 (プライマリ バリアントと呼ばれるもの) や、GSMS の一部として偶然発見されたその他の臨床的に関連する結果を学習するオプションとともに、GSMS に同意します。プロセス (二次バリアントと呼ばれるもの)。 参加者は、これらの結果を学ぶために NIH への再訪問が提供されます。
NIH Intramural Sequencing Center (NISC) で生成された配列データは、仮定された遺伝パターンに一致する配列変異体について、ビーセッカー研究所のスタッフによってスクリーニングされます。 臨床的に関連があるとみなされるすべての配列バリアントは、CLIA 認定ラボで検証され、その結果がその参加者に返されます。 このプロトコルは、多くの異なる臨床プロジェクトを追求するための長期的な可能性を提供するように設計されています.
研究の種類
入学 (推定)
連絡先と場所
研究連絡先
- 名前:Leslie G Biesecker, M.D.
- 電話番号:(301) 402-2041
- メール:lesb@mail.nih.gov
研究連絡先のバックアップ
- 名前:Julie C Sapp
- 電話番号:(301) 435-2832
- メール:sappj@mail.nih.gov
研究場所
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Maryland
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Bethesda、Maryland、アメリカ、20892
- 募集
- National Institutes of Health Clinical Center
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参加基準
適格基準
就学可能な年齢
- 子
- 大人
- 高齢者
健康ボランティアの受け入れ
サンプリング方法
調査対象母集団
説明
- 包含基準:
研究中の障害に罹患しており、4週間以上経過している個人。 典型的な障害の最初のリストは廃止されました。これらの障害は、このプロトコルに含める一般的な属性を満たすものの例です。 上記のように、このプロトコルの下で調査することを選択した障害を持つ個人は、一般に、分子病因が不明なまれな表現型を持つ単純なケースを表します。
まれに、ポリシー 400 に従って、死亡した胎児/新生児からの DNA またはその他の保存された生物学的標本を含む、死亡した個人からの DNA を受け入れる場合があります。 これらのサンプルは、症状の重症度が原因で胎児/新生児が生存できない重度の遺伝的過成長障害のバリアントと症状を研究する絶好の機会を提供してくれる可能性があります。 生存不能な胎児/新生児からのサンプルを受け入れる予定のまれな状況では、妊娠中の母親と協力して同意の話し合いを開始し、標本収集を調整する場合があります。 侵襲的な出生前検査から自発的に胎児組織を提供し、トリオ分析が適切かつ必要な妊婦のみを登録します。 まれではあるが、科学的目的(発端者の遺伝的状態の分子的病因を解明すること)が、胎児/発端者および生物学的両親のDNAを分析しなければ不可能な状況があるかもしれない. 45CFR46.205で定められた条件 生存不能な新生児を含めるために満たされている:
- 新生児の重要な機能は人為的に維持されません。
- この研究は、新生児の心拍や呼吸を止めるものではありません。
- 研究の結果、新生児にリスクが追加されることはありません。
- 研究の目的は、他の方法では得られない重要な生物医学的知識の開発です。と
- 法的に有効なインフォームド コンセントは、適用される規制に従って取得されます。
その家族(多くの場合親)が遺伝的変異体の連鎖またはその他のバイオインフォマティクス分析に有益または有用である可能性がある、罹患した個人の家族が登録される場合があります。 未成年者または意思決定障害のある成人である発端者は、代わりに同意書に署名する権限を持つ親または法定後見人がいる場合に適格です。
除外内容:
成人で意思決定障害のある発端者は、代わりに同意書に署名する権限を持つ法定後見人がいない場合、資格がありません。
チームの判断で、複雑な医学的および遺伝的情報を理解して適切に使用する能力を損なう可能性がある、既知の重大な情動障害または精神障害を有する被験者は、意思決定障害と見なされ、指定されていない限り不適格となります (または、未成年の子供の場合は、適切な代理人の意思決定者の監護下にあります。
さらに、認知障害のある成人の発端者の後見人は法的に確立されなければならず、その家族が登録する前に後見人の証明を提出しなければなりません。
複数の遺伝性疾患に対してこのプロトコルを使用する機能を、アプリオリに具体的に説明することなく要求します。 ほとんどすべての遺伝性疾患では、GSMS のリスクと利点に実質的な違いはないため、このアプローチが適切であると考えています。 この概念は、遺伝性の先天性異常障害の広範なプロトコルであり、その多くは特定の診断分類に分類されない、現在終了したプロトコル 94-HG-0193 によって検証されました。
前述のように、問い合わせの時点では研究の対象ではないが、将来的には対象となる可能性のある参加予定者に関する情報を保持する許可を求める場合があります。 これらの参加者は同意書に署名しないため、これらの参加者を包含登録レポートに含めないことを提案しますが、各継続審査で保持された記録の集計を IRB に提供します。
このプロトコルの同意文書は、英語とスペイン語で入手できます。 まれに、NIH Short Written Consent Form Translation を使用して、他の言語を話す参加者を登録する場合があります。
上記のセクションで概説されている場合を除き、妊娠中の女性は登録しません。
研究計画
研究はどのように設計されていますか?
デザインの詳細
- 観測モデル:コホート
- 時間の展望:見込みのある
コホートと介入
グループ/コホート |
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遺伝性疾患
難治性または既存の技術では特定が困難な疾患の遺伝的原因を持つ患者または家族の発端者。
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この研究は何を測定していますか?
主要な結果の測定
結果測定 |
メジャーの説明 |
時間枠 |
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遺伝的原因が知られているが完全には説明されていないまれな疾患の GSMS 結果を分析する
時間枠:進行中
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私たちは、まれな遺伝性疾患の分子変異を研究し、病原性をより適切に予測し、新しい原因となる変異を特定するために、浸透性の症例を配列決定することを目指しています。
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進行中
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希少疾患の分子病因学
時間枠:進行中
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エクソームまたはゲノム配列決定を通じて、生殖適性が低い新たな変異による疾患など、難治性または既存の技術では特定が困難な疾患の遺伝的原因を特定します。
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進行中
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協力者と研究者
捜査官
- 主任研究者:Leslie G Biesecker, M.D.、National Human Genome Research Institute (NHGRI)
出版物と役立つリンク
一般刊行物
- Marteau TM, Dormandy E, Michie S. A measure of informed choice. Health Expect. 2001 Jun;4(2):99-108. doi: 10.1046/j.1369-6513.2001.00140.x.
- Evans JP, Green RC. Direct to consumer genetic testing: Avoiding a culture war. Genet Med. 2009 Aug;11(8):568-9. doi: 10.1097/GIM.0b013e3181afbaed. No abstract available.
- Mardis ER. Next-generation DNA sequencing methods. Annu Rev Genomics Hum Genet. 2008;9:387-402. doi: 10.1146/annurev.genom.9.081307.164359.
研究記録日
主要日程の研究
研究開始 (実際)
試験登録日
最初に提出
QC基準を満たした最初の提出物
最初の投稿 (推定)
学習記録の更新
投稿された最後の更新 (実際)
QC基準を満たした最後の更新が送信されました
最終確認日
詳しくは
本研究に関する用語
追加の関連 MeSH 用語
その他の研究ID番号
- 100065
- 10-HG-0065
個々の参加者データ (IPD) の計画
個々の参加者データ (IPD) を共有する予定はありますか?
医薬品およびデバイス情報、研究文書
米国FDA規制医薬品の研究
米国FDA規制機器製品の研究
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