- ICH GCP
- Registro de ensayos clínicos de EE. UU.
- Ensayo clínico NCT01087320
Secuenciación médica del genoma completo para el descubrimiento del genoma
Secuenciación médica del genoma completo para el descubrimiento de genes
Fondo:
- Varias enfermedades hereditarias raras afectan solo a unos pocos pacientes, y las causas genéticas de estas condiciones siguen siendo desconocidas. Los investigadores están estudiando el uso de una nueva tecnología llamada secuenciación del genoma completo para saber qué gen o genes causan estas afecciones. Comprender los genes que causan estas enfermedades es importante para mejorar el diagnóstico y el tratamiento de los pacientes afectados.
Objetivos:
- Identificar la causa genética de trastornos que son difíciles de identificar con las técnicas existentes.
- Desarrollar las mejores prácticas para los desafíos médicos y de asesoramiento de la secuenciación del genoma completo.
Elegibilidad:
- Individuos que tienen uno de los trastornos raros bajo consideración en este estudio. Estas condiciones son generalmente aquellas en las que se desconoce la causa genética del trastorno. Los investigadores decidirán caso por caso la elegibilidad de la mayoría de los participantes individuales.
- Miembros de la familia de las personas afectadas, si ese miembro de la familia (a menudo uno de los padres) puede proporcionar información genética.
Diseño:
- Los participantes en este estudio tendrán al menos uno y en algunos casos varios de los siguientes procedimientos:
- Una evaluación de genética médica.
- Otras pruebas que pueden incluir radiografías, exámenes de imágenes por resonancia magnética (IRM) y consultas con otros médicos. No todos los estudios son necesarios para cada persona, pero la información de las pruebas puede ser necesaria para continuar con algunos de nuestros estudios de secuenciación de genes.
- Fotografías clínicas para documentar ciertos aspectos del trastorno.
- Muestras de biopsia de sangre y piel, u otras muestras de tejido, según lo requieran los médicos del estudio.
- Pruebas genéticas, según lo decidido por los investigadores. Sin embargo, la mayoría de los participantes en este estudio pueden esperar someterse a la secuenciación del genoma completo, que es una técnica para estudiar todos los genes de una persona.
- A algunos participantes se les puede pedir que participen en una entrevista telefónica y/o una encuesta basada en la web.
- Los participantes tendrán opciones sobre qué tipo de resultados de la secuenciación del genoma completo desean aprender.
- Una vez que se hayan completado las pruebas y se conozcan los resultados de los estudios genéticos, se ofrecerá a los participantes una visita de regreso a los Institutos Nacionales de Salud para conocer estos resultados. Durante esta visita, se les pedirá a los participantes que completen encuestas y participen en entrevistas relacionadas con sus decisiones de participar en el estudio y conocer los resultados de las pruebas genéticas individuales.
Descripción general del estudio
Estado
Descripción detallada
Nuestro objetivo es utilizar la secuenciación médica a escala del genoma (GSMS, para incluir el exoma y el
secuenciación del genoma, según corresponda) para descubrir las lesiones moleculares causantes de un conjunto de fenotipos raros y graves que se supone que son causados por mutaciones somáticas, mutaciones heterocigotas de novo de la línea germinal, mutaciones recesivas heredadas de la línea germinal o mutaciones dominantes heredadas de la línea germinal en genes actualmente desconocidos o no caracterizados. El objetivo de esta investigación es triple: identificar las variantes de la secuencia causante de los trastornos cuya etiología molecular se desconocía anteriormente, aplicar este conocimiento tanto a los trastornos raros en estudio como a los fenotipos más comunes, y mejorar el estudio de la mutación en un genoma completo. nivel.
Planeamos reclutar aproximadamente de tres a seis individuos afectados junto con ambos padres para cada fenotipo en estudio. Los tríos prospectivamente reclutados serán llevados al Centro Clínico NIH para evaluaciones clínicas breves y evaluación molecular. Cada trío accederá al GSMS con la opción de conocer resultados clínicamente relevantes, es decir, aquellos que expliquen el trastorno en cuestión (lo que llamamos variante primaria), así como otros hallazgos clínicamente relevantes descubiertos incidentalmente como parte del GSMS. proceso (lo que llamamos variantes secundarias). A los participantes se les ofrecerá una visita de regreso a los NIH para conocer estos resultados.
Los datos de secuencia generados en el Centro de Secuenciación Intramural de los NIH (NISC, por sus siglas en inglés) serán evaluados por el personal del laboratorio de Biesecker en busca de variantes de secuencia que se ajusten al patrón de herencia hipotético. Todas las variantes de secuencia que se consideren clínicamente relevantes se validarán en un laboratorio certificado por CLIA y los resultados se devolverán a ese participante. Este protocolo se está diseñando de manera que proporcione el potencial a largo plazo para llevar a cabo muchos proyectos clínicos diferentes.
Tipo de estudio
Inscripción (Estimado)
Contactos y Ubicaciones
Estudio Contacto
- Nombre: Julie Sapp
- Número de teléfono: (301) 435-2832
- Correo electrónico: sappj@mail.nih.gov
Copia de seguridad de contactos de estudio
- Nombre: Leslie G Biesecker, M.D.
- Número de teléfono: (301) 402-2041
- Correo electrónico: lesb@mail.nih.gov
Ubicaciones de estudio
-
-
Maryland
-
Bethesda, Maryland, Estados Unidos, 20892
- Reclutamiento
- National Institutes of Health Clinical Center
-
-
Criterios de participación
Criterio de elegibilidad
Edades elegibles para estudiar
- Niño
- Adulto
- Adulto Mayor
Acepta Voluntarios Saludables
Método de muestreo
Población de estudio
Descripción
- CRITERIOS DE INCLUSIÓN:
Individuo afectado por un trastorno en estudio y mayor de 4 semanas. Nuestra lista inicial de trastornos ejemplares ha sido descontinuada; estos trastornos fueron ejemplos de aquellos que cumplen con los atributos generales para su inclusión en este protocolo. Como se indicó anteriormente, las personas con trastornos que elegimos para investigar bajo este protocolo generalmente representarán casos simples con fenotipos raros cuya etiología molecular se desconoce.
En raras ocasiones, podemos aceptar ADN de personas fallecidas, incluido el ADN u otras muestras biológicas guardadas de fetos/recién nacidos fallecidos de acuerdo con la Política 400. Estas muestras pueden brindarnos oportunidades excepcionales para estudiar variantes y manifestaciones de trastornos genéticos de sobrecrecimiento graves en los que el feto/recién nacido es inviable debido a la gravedad de las manifestaciones. En las raras circunstancias en las que planeemos aceptar muestras de fetos/recién nacidos no viables, es posible que nos comuniquemos con las madres embarazadas para iniciar discusiones sobre el consentimiento y coordinar la recolección de muestras. Solo inscribiremos a mujeres embarazadas que voluntariamente donen tejido fetal de pruebas prenatales invasivas, y para las cuales el análisis de trío sea apropiado y necesario. Si bien es raro, puede haber circunstancias en las que los objetivos científicos (aclarar la etiología molecular de la condición genética del probando) no serían posibles sin analizar el ADN del feto/probando y los padres biológicos. Las condiciones establecidas en 45CFR46.205 se cumplen para la inclusión de neonatos no viables:
- Las funciones vitales del recién nacido no se mantendrán artificialmente;
- La investigación no interrumpirá los latidos del corazón ni la respiración del recién nacido;
- No habrá riesgo adicional para el neonato derivado de la investigación;
- El propósito de la investigación es el desarrollo de importantes conocimientos biomédicos que no pueden obtenerse por ningún otro medio; y
- El consentimiento informado legalmente efectivo se obtiene de acuerdo con la normativa aplicable.
Los miembros de la familia de un individuo afectado donde ese miembro de la familia (a menudo un padre) es potencialmente informativo o útil para la vinculación u otros análisis bioinformáticos de variantes genéticas pueden inscribirse. Los probandos que son menores de edad o adultos con problemas de decisión son elegibles si tienen un padre o tutor legal que tenga autoridad para firmar un formulario de consentimiento en su nombre.
EXCLUSIÓN INCLUSIÓN:
Los probandos que son adultos y tienen problemas de decisión no son elegibles si no tienen un tutor legal que tenga autoridad para firmar un formulario de consentimiento en su nombre.
Los sujetos que tengan trastornos afectivos o psiquiátricos significativos conocidos que, a juicio del equipo, puedan afectar su capacidad para comprender y utilizar adecuadamente información médica y genética compleja se considerarán afectados por la decisión y no serán elegibles a menos que hayan designado (o, en el caso de hijos menores, están bajo la custodia de) un sustituto apropiado para tomar decisiones.
Además, la tutela para los probandos adultos con deterioro cognitivo debe establecerse legalmente y se debe proporcionar prueba de la tutela antes de la inscripción de esa familia.
Solicitamos la posibilidad de utilizar este protocolo para múltiples trastornos genéticos, sin delimitarlos específicamente a priori. Creemos que este enfoque es apropiado porque para casi todos los trastornos hereditarios, los riesgos y beneficios de GSMS no difieren sustancialmente. Este concepto fue validado por nuestro protocolo ahora cerrado 94-HG-0193, que era un protocolo de base amplia para trastornos de anomalías congénitas hereditarias, muchos de los cuales no encajan claramente en una clasificación diagnóstica específica.
Como se mencionó, podemos solicitar permiso para conservar cierta información sobre posibles participantes que, en el momento de su consulta, pueden no ser elegibles para el estudio pero que podrían volverse elegibles en el futuro. Como estos participantes no firmarán un formulario de consentimiento, proponemos NO contar a estos participantes en nuestros Informes de inscripción de inclusión, pero proporcionaremos al IRB un recuento de los registros retenidos en cada Revisión continua.
Los documentos de consentimiento para este protocolo están disponibles en inglés y español. En raras ocasiones, podemos inscribir a participantes que hablen otros idiomas mediante la traducción breve del formulario de consentimiento por escrito de los NIH.
No inscribiremos a mujeres embarazadas, excepto como se describe en la sección anterior.
Plan de estudios
¿Cómo está diseñado el estudio?
Detalles de diseño
- Modelos observacionales: Grupo
- Perspectivas temporales: Futuro
Cohortes e Intervenciones
Grupo / Cohorte |
---|
Desordenes genéticos
Pacientes o probandos familiares con causa genética de trastornos que son intratables o difíciles de identificar con la técnica existente.
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¿Qué mide el estudio?
Medidas de resultado primarias
Medida de resultado |
Medida Descripción |
Periodo de tiempo |
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Etiología molecular de las enfermedades raras
Periodo de tiempo: En curso
|
Identificar la causa genética de los trastornos que son intratables o difíciles de identificar con las técnicas existentes, por ejemplo, trastornos debidos a nuevas mutaciones con mala aptitud reproductiva a través de la secuenciación del exoma o del genoma.
|
En curso
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Analice los resultados de GSMS para trastornos raros para los cuales se conocen las causas genéticas pero no se describen completamente
Periodo de tiempo: En curso
|
Nuestro objetivo es secuenciar casos penetrantes para estudiar las variaciones moleculares de trastornos genéticos raros, para predecir mejor la patogenicidad e identificar nuevas variantes causales.
|
En curso
|
Colaboradores e Investigadores
Patrocinador
Investigadores
- Investigador principal: Leslie G Biesecker, M.D., National Human Genome Research Institute (NHGRI)
Publicaciones y enlaces útiles
Publicaciones Generales
- Marteau TM, Dormandy E, Michie S. A measure of informed choice. Health Expect. 2001 Jun;4(2):99-108. doi: 10.1046/j.1369-6513.2001.00140.x.
- Evans JP, Green RC. Direct to consumer genetic testing: Avoiding a culture war. Genet Med. 2009 Aug;11(8):568-9. doi: 10.1097/GIM.0b013e3181afbaed. No abstract available.
- Mardis ER. Next-generation DNA sequencing methods. Annu Rev Genomics Hum Genet. 2008;9:387-402. doi: 10.1146/annurev.genom.9.081307.164359.
Enlaces Útiles
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Fechas importantes del estudio
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Más información
Términos relacionados con este estudio
Palabras clave
Términos MeSH relevantes adicionales
Otros números de identificación del estudio
- 100065
- 10-HG-0065
Plan de datos de participantes individuales (IPD)
¿Planea compartir datos de participantes individuales (IPD)?
Información sobre medicamentos y dispositivos, documentos del estudio
Estudia un producto farmacéutico regulado por la FDA de EE. UU.
Estudia un producto de dispositivo regulado por la FDA de EE. UU.
Esta información se obtuvo directamente del sitio web clinicaltrials.gov sin cambios. Si tiene alguna solicitud para cambiar, eliminar o actualizar los detalles de su estudio, comuníquese con register@clinicaltrials.gov. Tan pronto como se implemente un cambio en clinicaltrials.gov, también se actualizará automáticamente en nuestro sitio web. .
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