Deze pagina is automatisch vertaald en de nauwkeurigheid van de vertaling kan niet worden gegarandeerd. Raadpleeg de Engelse versie voor een brontekst.

Hele genoom medische sequencing voor genoomontdekking

Medische sequentiebepaling van het hele genoom voor het ontdekken van genen

Achtergrond:

- Een aantal zeldzame erfelijke ziekten treffen slechts enkele patiënten en de genetische oorzaken van deze aandoeningen blijven onbekend. Onderzoekers bestuderen het gebruik van een nieuwe technologie, sequentiebepaling van het hele genoom genaamd, om erachter te komen welk gen of welke genen deze aandoeningen veroorzaken. Het begrijpen van de genen die deze ziekten veroorzaken, is belangrijk om de diagnose en behandeling van getroffen patiënten te verbeteren.

Doelstellingen:

  • De genetische oorzaak identificeren van aandoeningen die met bestaande technieken moeilijk te identificeren zijn.
  • Best practices ontwikkelen voor de medische en counselinguitdagingen van sequentiebepaling van het hele genoom.

Geschiktheid:

  • Personen die een van de zeldzame aandoeningen hebben die in dit onderzoek worden overwogen. Deze aandoeningen zijn over het algemeen aandoeningen waarbij de genetische oorzaak van de aandoening onbekend is. Of de meeste individuele deelnemers in aanmerking komen, wordt per geval door de onderzoekers bepaald.
  • Familieleden van getroffen personen, als dat familielid (vaak een ouder) genetische informatie kan verstrekken.

Ontwerp:

  • Deelnemers aan dit onderzoek zullen ten minste één en in sommige gevallen meerdere van de volgende procedures ondergaan:
  • Een medische genetica-evaluatie.
  • Andere tests, waaronder röntgenfoto's, MRI-onderzoeken (magnetic resonance imaging) en overleg met andere artsen. Niet alle onderzoeken zijn nodig voor elke persoon, maar de informatie uit de tests kan nodig zijn om door te gaan met sommige van onze onderzoeken naar de sequentiebepaling van genen.
  • Klinische foto's om bepaalde aspecten van de aandoening te documenteren.
  • Bloed- en huidbiopsiemonsters of andere weefselmonsters, zoals vereist door de onderzoeksartsen.
  • Genetische tests, zoals besloten door de onderzoekers. De meeste deelnemers aan dit onderzoek kunnen echter verwachten dat ze volledige genoomsequencing ondergaan, wat een techniek is om alle genen van een persoon te bestuderen.
  • Sommige deelnemers kunnen worden gevraagd om deel te nemen aan een telefonisch interview en/of een webgebaseerde enquête.
  • Deelnemers hebben keuzes over wat voor soort resultaten van sequentiebepaling van het hele genoom ze willen leren.
  • Nadat de tests zijn voltooid en de resultaten van de genetische onderzoeken bekend zijn, wordt de deelnemers een tegenbezoek aangeboden aan de National Institutes of Health om deze resultaten te vernemen. Tijdens dit bezoek wordt deelnemers gevraagd enquêtes in te vullen en deel te nemen aan interviews met betrekking tot hun beslissing om deel te nemen aan het onderzoek en om individuele genetische testresultaten te leren.

Studie Overzicht

Gedetailleerde beschrijving

We streven ernaar om medische sequencing op genoomschaal (GSMS) te gebruiken, inclusief exome en geheel

genoomsequencing waar van toepassing) om oorzakelijke moleculaire laesies te ontdekken voor een reeks zeldzame, ernstige fenotypes waarvan wordt verondersteld dat ze worden veroorzaakt door ofwel somatische mutaties, kiemlijn de novo heterozygote mutaties, kiemlijn overgeërfde recessieve of kiemlijn overgeërfde dominante mutaties in momenteel onbekende of niet-gekarakteriseerde genen. Het doel van dit onderzoek is drieledig: oorzakelijke sequentievarianten identificeren voor aandoeningen waarvan de moleculaire etiologie voorheen onbekend was, dit inzicht toepassen op zowel de zeldzame aandoeningen die worden bestudeerd als meer algemene fenotypes, en de studie van mutatie op een genoombreed niveau verbeteren. niveau.

We zijn van plan om ongeveer drie tot zes getroffen individuen samen met beide ouders te rekruteren voor elk onderzocht fenotype. Toekomstig aangeworven trio's zullen naar het NIH Clinical Center worden gebracht voor korte klinische evaluaties en moleculaire evaluatie. Elk trio krijgt toestemming voor GSMS met de optie om klinisch relevante resultaten te leren, dat wil zeggen die die de betreffende stoornis verklaren (wat we de primaire variant noemen), evenals andere klinisch relevante bevindingen die incidenteel zijn ontdekt als onderdeel van de GSMS proces (wat we secundaire varianten noemen). Deelnemers zullen een tegenbezoek aan NIH worden aangeboden om deze resultaten te vernemen.

Sequentiegegevens die zijn gegenereerd in het NIH Intramural Sequencing Center (NISC) zullen door personeel in het Biesecker-laboratorium worden gescreend op sequentievarianten die voldoen aan het veronderstelde overervingspatroon. Alle sequentievarianten die klinisch relevant worden geacht, worden gevalideerd in een CLIA-gecertificeerd laboratorium en de resultaten worden teruggestuurd naar die deelnemer. Dit protocol is zo ontworpen dat het op de lange termijn mogelijkheden biedt voor het nastreven van veel verschillende klinische projecten.

Studietype

Observationeel

Inschrijving (Geschat)

2000

Contacten en locaties

In dit gedeelte vindt u de contactgegevens van degenen die het onderzoek uitvoeren en informatie over waar dit onderzoek wordt uitgevoerd.

Studiecontact

Studie Contact Back-up

  • Naam: Leslie G Biesecker, M.D.
  • Telefoonnummer: (301) 402-2041
  • E-mail: lesb@mail.nih.gov

Studie Locaties

    • Maryland
      • Bethesda, Maryland, Verenigde Staten, 20892
        • Werving
        • National Institutes of Health Clinical Center

Deelname Criteria

Onderzoekers zoeken naar mensen die aan een bepaalde beschrijving voldoen, de zogenaamde geschiktheidscriteria. Enkele voorbeelden van deze criteria zijn iemands algemene gezondheidstoestand of eerdere behandelingen.

Geschiktheidscriteria

Leeftijden die in aanmerking komen voor studie

  • Kind
  • Volwassen
  • Oudere volwassene

Accepteert gezonde vrijwilligers

Nee

Bemonsteringsmethode

Niet-waarschijnlijkheidssteekproef

Studie Bevolking

Patiënten of familieleden met een genetische oorzaak van aandoeningen die hardnekkig of moeilijk te identificeren zijn met de bestaande techniek.

Beschrijving

  • INSLUITINGSCRITERIA:

Een persoon die lijdt aan een stoornis die wordt bestudeerd en ouder is dan 4 weken. Onze aanvankelijke lijst met voorbeeldaandoeningen is stopgezet; deze aandoeningen waren voorbeelden van aandoeningen die voldoen aan de algemene kenmerken voor opname in dit protocol. Zoals hierboven vermeld, vertegenwoordigen personen met aandoeningen die we volgens dit protocol onderzoeken over het algemeen eenvoudige gevallen met zeldzame fenotypes waarvan de moleculaire etiologie onbekend is.

In zeldzame gevallen kunnen we DNA van overleden personen accepteren, inclusief DNA of andere bewaarde biologische monsters van overleden foetussen/pasgeborenen in overeenstemming met Beleid 400. Deze monsters kunnen ons uitzonderlijke mogelijkheden bieden om varianten en manifestaties van ernstige genetische overgroeistoornissen te bestuderen waarbij de foetus/pasgeborene niet levensvatbaar is vanwege de ernst van de manifestaties. In de zeldzame omstandigheid dat we van plan zijn om monsters van niet-levensvatbare foetussen/pasgeborenen te accepteren, kunnen we contact opnemen met zwangere moeders om toestemmingsgesprekken te beginnen en de afname van monsters te coördineren. We zullen alleen zwangere vrouwen inschrijven die vrijwillig foetaal weefsel doneren uit invasieve prenatale tests en voor wie trio-analyse geschikt en noodzakelijk is. Hoewel zeldzaam, kunnen er omstandigheden zijn waarin de wetenschappelijke doelstellingen (om de moleculaire etiologie van de genetische toestand van de proband op te helderen) niet mogelijk zouden zijn zonder analyse van het DNA van de foetus/proband en de biologische ouders. De voorwaarden gesteld onder 45CFR46.205 wordt voldaan voor opname van niet-levensvatbare pasgeborenen:

  • Vitale functies van de pasgeborene worden niet kunstmatig in stand gehouden;
  • Het onderzoek beëindigt de hartslag of ademhaling van de pasgeborene niet;
  • Er is geen extra risico voor de pasgeborene als gevolg van het onderzoek;
  • Het doel van het onderzoek is de ontwikkeling van belangrijke biomedische kennis die op geen enkele andere manier kan worden verkregen; en
  • De rechtsgeldige geïnformeerde toestemming wordt verkregen in overeenstemming met de toepasselijke regelgeving.

Familieleden van een getroffen persoon waarbij dat familielid (vaak een ouder) mogelijk informatief of nuttig is voor koppeling of andere bioinformatische analyses van genetische varianten, kunnen worden ingeschreven. Probands die minderjarig zijn of volwassenen met een wilsbeperking komen in aanmerking als ze een ouder of wettelijke voogd hebben die bevoegd is om namens hen een toestemmingsformulier te ondertekenen.

UITSLUITING INCLUSIEF:

Probands die volwassen zijn en wilsbekwaam zijn, komen niet in aanmerking als ze geen wettelijke voogd hebben die bevoegd is om namens hen een toestemmingsformulier te ondertekenen.

Proefpersonen die bekende, significante affectieve of psychiatrische stoornissen hebben die, naar het oordeel van het team, hun vermogen om complexe medische en genetische informatie te begrijpen en correct te gebruiken, kunnen aantasten, worden beschouwd als wilsbekwaam en komen niet in aanmerking, tenzij ze zijn aangesteld (of, in het geval van minderjarige kinderen, onder de voogdij staan ​​van) een geschikte plaatsvervangende beslisser.

Bovendien moet de voogdij over volwassen probands met een cognitieve beperking wettelijk zijn vastgelegd en moet een bewijs van voogdij worden geleverd voordat het gezin wordt ingeschreven.

We vragen de mogelijkheid om dit protocol te gebruiken voor meerdere genetische aandoeningen, zonder ze a priori specifiek af te bakenen. Wij zijn van mening dat deze benadering geschikt is omdat voor bijna alle erfelijke aandoeningen de risico's en voordelen van GSMS niet substantieel verschillen. Dit concept werd gevalideerd door ons nu gesloten protocol 94-HG-0193, een breed gebaseerd protocol voor erfelijke aangeboren afwijkingen, waarvan er vele niet netjes in een specifieke diagnostische classificatie vallen.

Zoals vermeld, kunnen we toestemming vragen om bepaalde informatie te bewaren over potentiële deelnemers die op het moment van hun onderzoek mogelijk niet in aanmerking komen voor het onderzoek, maar die in de toekomst wel in aanmerking zouden kunnen komen. Aangezien deze deelnemers geen toestemmingsformulier zullen ondertekenen, stellen we voor om deze deelnemers NIET mee te tellen in onze Inclusie-inschrijvingsrapporten, maar de IRB een overzicht te geven van de bewaarde gegevens bij elke doorlopende beoordeling.

Toestemmingsdocumenten voor dit protocol zijn beschikbaar in het Engels en Spaans. In zeldzame gevallen kunnen we deelnemers inschrijven die andere talen spreken met behulp van de NIH Short Written Consent Form Translation.

We zullen geen zwangere vrouwen inschrijven, behalve zoals beschreven in het bovenstaande gedeelte.

Studie plan

Dit gedeelte bevat details van het studieplan, inclusief hoe de studie is opgezet en wat de studie meet.

Hoe is de studie opgezet?

Ontwerpdetails

  • Observatiemodellen: Cohort
  • Tijdsperspectieven: Prospectief

Cohorten en interventies

Groep / Cohort
Genetische afwijkingen
Patiënten of familieleden met een genetische oorzaak van aandoeningen die hardnekkig of moeilijk te identificeren zijn met de bestaande techniek.

Wat meet het onderzoek?

Primaire uitkomstmaten

Uitkomstmaat
Maatregel Beschrijving
Tijdsspanne
Moleculaire etiologie van zeldzame ziekten
Tijdsspanne: Voortdurende
Identificeer de genetische oorzaak van aandoeningen die hardnekkig of moeilijk te identificeren zijn met bestaande technieken, bijvoorbeeld aandoeningen als gevolg van nieuwe mutaties met slechte reproductieve fitheid door middel van exoom- of genoomsequencing
Voortdurende
Analyseer GSMS-resultaten voor zeldzame aandoeningen waarvan de genetische oorzaken bekend zijn maar niet volledig beschreven
Tijdsspanne: Voortdurende
We streven ernaar om penetrante gevallen te sequensen om de moleculaire variaties van zeldzame genetische aandoeningen te bestuderen, om pathogeniteit beter te voorspellen en om nieuwe oorzakelijke varianten te identificeren.
Voortdurende

Medewerkers en onderzoekers

Hier vindt u mensen en organisaties die betrokken zijn bij dit onderzoek.

Onderzoekers

  • Hoofdonderzoeker: Leslie G Biesecker, M.D., National Human Genome Research Institute (NHGRI)

Publicaties en nuttige links

De persoon die verantwoordelijk is voor het invoeren van informatie over het onderzoek stelt deze publicaties vrijwillig ter beschikking. Dit kan gaan over alles wat met het onderzoek te maken heeft.

Studie record data

Deze datums volgen de voortgang van het onderzoeksdossier en de samenvatting van de ingediende resultaten bij ClinicalTrials.gov. Studieverslagen en gerapporteerde resultaten worden beoordeeld door de National Library of Medicine (NLM) om er zeker van te zijn dat ze voldoen aan specifieke kwaliteitscontrolenormen voordat ze op de openbare website worden geplaatst.

Bestudeer belangrijke data

Studie start (Werkelijk)

18 februari 2010

Studieregistratiedata

Eerst ingediend

13 maart 2010

Eerst ingediend dat voldeed aan de QC-criteria

13 maart 2010

Eerst geplaatst (Geschat)

16 maart 2010

Updates van studierecords

Laatste update geplaatst (Werkelijk)

9 mei 2024

Laatste update ingediend die voldeed aan QC-criteria

8 mei 2024

Laatst geverifieerd

3 mei 2024

Meer informatie

Termen gerelateerd aan deze studie

Plan Individuele Deelnemersgegevens (IPD)

Bent u van plan om gegevens van individuele deelnemers (IPD) te delen?

NEE

Informatie over medicijnen en apparaten, studiedocumenten

Bestudeert een door de Amerikaanse FDA gereguleerd geneesmiddel

Nee

Bestudeert een door de Amerikaanse FDA gereguleerd apparaatproduct

Nee

Deze informatie is zonder wijzigingen rechtstreeks van de website clinicaltrials.gov gehaald. Als u verzoeken heeft om uw onderzoeksgegevens te wijzigen, te verwijderen of bij te werken, neem dan contact op met register@clinicaltrials.gov. Zodra er een wijziging wordt doorgevoerd op clinicaltrials.gov, wordt deze ook automatisch bijgewerkt op onze website .

3
Abonneren