- ICH GCP
- Registr klinických studií v USA
- Klinická studie NCT01087320
Lékařské sekvenování celého genomu pro objev genomu
Lékařské sekvenování celého genomu pro objev genu
Pozadí:
- Řada vzácných dědičných onemocnění postihuje pouze několik pacientů a genetické příčiny těchto stavů zůstávají neznámé. Vědci studují použití nové technologie zvané sekvenování celého genomu, aby zjistili, který gen nebo geny tyto stavy způsobují. Pochopení genů, které způsobují tato onemocnění, je důležité pro zlepšení diagnostiky a léčby postižených pacientů.
Cíle:
- Identifikovat genetickou příčinu poruch, které je obtížné identifikovat stávajícími technikami.
- Vyvinout osvědčené postupy pro lékařské a poradenské problémy sekvenování celého genomu.
Způsobilost:
- Jedinci, kteří mají jednu ze vzácných poruch, o kterých se v této studii uvažuje. Tyto stavy jsou obecně ty, u kterých není známa genetická příčina poruchy. O způsobilosti většiny jednotlivých účastníků rozhodnou výzkumníci případ od případu.
- Rodinní příslušníci postižených jedinců, pokud tento rodinný příslušník (často rodič) může poskytnout genetickou informaci.
Design:
- Účastníci této studie budou mít alespoň jeden a v některých případech několik z následujících postupů:
- Hodnocení lékařské genetiky.
- Další testy, které mohou zahrnovat rentgenové záření, vyšetření magnetickou rezonancí (MRI) a konzultace s jinými lékaři. Ne všechny studie jsou nutné pro každou osobu, ale informace z testů mohou být vyžadovány pro pokračování některých našich studií sekvenování genů.
- Klinické fotografie dokumentující určité aspekty poruchy.
- Vzorky krve a biopsie kůže nebo jiné vzorky tkáně, jak to vyžadují lékaři studie.
- Genetické testování, jak rozhodli vědci. Většina účastníků této studie však může očekávat, že podstoupí sekvenování celého genomu, což je technika pro studium všech genů člověka.
- Někteří účastníci mohou být požádáni, aby se zúčastnili telefonického rozhovoru a/nebo webového průzkumu.
- Účastníci budou mít na výběr, jaké druhy výsledků sekvenování celého genomu se chtějí naučit.
- Poté, co budou testy dokončeny a budou známy výsledky genetických studií, bude účastníkům nabídnuta zpětná návštěva Národního institutu zdraví, kde se tyto výsledky dozví. Během této návštěvy budou účastníci požádáni, aby dokončili průzkumy a zúčastnili se rozhovorů souvisejících s jejich rozhodnutím zúčastnit se studie a dozvědět se výsledky jednotlivých genetických testů.
Přehled studie
Postavení
Detailní popis
Naším cílem je používat lékařské sekvenování v měřítku genomu (GSMS, včetně exomu a celého
sekvenování genomu podle potřeby) k odhalení kauzativních molekulárních lézí pro soubor vzácných, závažných fenotypů, o nichž se předpokládá, že jsou způsobeny buď somatickými mutacemi, zárodečnými de novo heterozygotními mutacemi, zárodečnými dědičnými recesivními nebo zárodečnými dědičnými dominantními mutacemi v aktuálně neznámých nebo necharakterizovaných genech. Cíl tohoto výzkumu je trojí: identifikovat kauzativní sekvenční varianty pro poruchy, jejichž molekulární etiologie byla dříve neznámá, aplikovat tento pohled na vzácné studované poruchy i na běžnější fenotypy a posílit studium mutací na celém genomu. úroveň.
Plánujeme získat přibližně tři až šest postižených jedinců spolu s oběma rodiči pro každý studovaný fenotyp. Potenciálně přijatá tria budou přivezena do NIH Clinical Center pro krátká klinická hodnocení a molekulární hodnocení. Každé trio bude schváleno GSMS s možností naučit se klinicky relevantní výsledky, tedy ty, které vysvětlují danou poruchu (což označujeme jako primární variantu), stejně jako další klinicky relevantní nálezy objevené náhodně v rámci GSMS proces (což označujeme jako sekundární varianty). Účastníkům bude nabídnuta zpětná návštěva NIH, aby se dozvěděli tyto výsledky.
Sekvenční data generovaná v NIH Intramural Sequencing Center (NISC) budou zaměstnanci v laboratoři Biesecker prověřována na sekvenční varianty, které odpovídají předpokládanému vzoru dědičnosti. Všechny sekvenční varianty považované za klinicky relevantní budou validovány v laboratoři certifikované CLIA a výsledky vráceny danému účastníkovi. Tento protokol je navržen tak, aby poskytoval dlouhodobý potenciál pro provádění mnoha různých klinických projektů.
Typ studie
Zápis (Odhadovaný)
Kontakty a umístění
Studijní kontakt
- Jméno: Leslie G Biesecker, M.D.
- Telefonní číslo: (301) 402-2041
- E-mail: lesb@mail.nih.gov
Studijní záloha kontaktů
- Jméno: Julie C Sapp
- Telefonní číslo: (301) 435-2832
- E-mail: sappj@mail.nih.gov
Studijní místa
-
-
Maryland
-
Bethesda, Maryland, Spojené státy, 20892
- Nábor
- National Institutes of Health Clinical Center
-
-
Kritéria účasti
Kritéria způsobilosti
Věk způsobilý ke studiu
- Dítě
- Dospělý
- Starší dospělý
Přijímá zdravé dobrovolníky
Metoda odběru vzorků
Studijní populace
Popis
- KRITÉRIA PRO ZAŘAZENÍ:
Jedinec, který je postižen studovanou poruchou a je starší 4 týdnů. Náš původní seznam příkladných poruch byl zrušen; tyto poruchy byly příklady těch, které splňují obecné atributy pro zahrnutí do tohoto protokolu. Jak bylo uvedeno výše, jedinci s poruchami, které se rozhodneme vyšetřovat podle tohoto protokolu, budou obecně představovat simplexní případy se vzácnými fenotypy, jejichž molekulární etiologie není známa.
Ve vzácných případech můžeme přijmout DNA od zemřelých jedinců, včetně DNA nebo jiných uložených biologických vzorků od zemřelých plodů/novorozenců v souladu se zásadou 400. Tyto vzorky nám mohou poskytnout výjimečné příležitosti ke studiu variant a projevů závažných poruch genetického přerůstání, kdy je plod/novorozenec neživotaschopný vzhledem k závažnosti projevů. Ve vzácných případech, kdy plánujeme přijímat vzorky od neživotaschopných plodů/novorozenců, můžeme jednat s těhotnými matkami, abychom zahájili diskuse o souhlasu a koordinovali odběr vzorků. Zařadíme pouze těhotné ženy, které dobrovolně darují fetální tkáň z invazivního prenatálního testování a pro které je vhodná a nezbytná trojanalýza. I když je to vzácné, mohou nastat okolnosti, za kterých by vědecké cíle (objasnění molekulární etiologie genetického stavu probanda) nebyly možné bez analýzy DNA plodu/probanda a biologických rodičů. Podmínky stanovené v 45CFR46.205 jsou splněny pro zahrnutí neživotaschopných novorozenců:
- Životní funkce novorozence nebudou uměle udržovány;
- Výzkum neukončí srdeční tep ani dýchání novorozence;
- Z výzkumu nevznikne žádné další riziko pro novorozence;
- Účelem výzkumu je rozvoj důležitých biomedicínských poznatků, které nelze získat jinými prostředky; a
- Právně účinný informovaný souhlas se získává v souladu s platnými předpisy.
Mohou být zařazeni rodinní příslušníci postiženého jedince, kde je tento rodinný příslušník (často rodič) potenciálně informativní nebo užitečný pro propojení nebo jiné bioinformatické analýzy genetických variant. Probandi, kteří jsou nezletilí nebo dospělí s poruchou rozhodování, jsou způsobilí, pokud mají rodiče nebo zákonného zástupce, kteří mají oprávnění podepsat jejich jménem souhlas.
VYLOUČENÍ VČETNĚ:
Probandi, kteří jsou dospělí a s poruchou rozhodování, jsou nezpůsobilí, pokud nemají zákonného zástupce, který je oprávněn podepsat za ně formulář souhlasu.
Subjekty se známými významnými afektivními nebo psychiatrickými poruchami, které podle úsudku týmu mohou narušit jejich schopnost porozumět a vhodně používat složité lékařské a genetické informace, budou považovány za osoby s narušeným rozhodováním a nebudou způsobilé, pokud nebudou jmenovány (nebo, v případě nezletilých dětí jsou v péči) příslušného náhradního rozhodovatele.
Kromě toho musí být zákonně ustanoveno opatrovnictví pro kognitivně postižené dospělé probandy a před zápisem do rodiny musí být předložen důkaz o opatrovnictví.
Požadujeme možnost používat tento protokol pro více genetických poruch, aniž bychom je a priori konkrétně vymezovali. Domníváme se, že tento přístup je vhodný, protože u téměř všech dědičných poruch se rizika a přínosy GSMS podstatně neliší. Tento koncept byl ověřen naším nyní uzavřeným protokolem 94-HG-0193, což byl široce založený protokol pro dědičné vrozené anomálie, z nichž mnohé nespadají přesně do specifické diagnostické klasifikace.
Jak již bylo zmíněno, můžeme požádat o povolení k uchování některých informací o potenciálních účastnících, kteří v době jejich dotazu nemusí být způsobilí pro studii, ale kteří by se mohli stát způsobilými v budoucnu. Vzhledem k tomu, že tito účastníci nebudou podepisovat formulář souhlasu, navrhujeme NEPOČÍTAT tyto účastníky v našich zprávách o registraci, ale poskytneme IRB součet uchovávaných záznamů při každé průběžné kontrole.
Dokumenty o souhlasu pro tento protokol jsou k dispozici v angličtině a španělštině. Ve vzácných případech můžeme zapsat účastníky, kteří mluví jinými jazyky, pomocí překladu krátkého písemného souhlasu NIH.
Nebudeme registrovat těhotné ženy, kromě případů uvedených v části výše.
Studijní plán
Jak je studie koncipována?
Detaily designu
- Observační modely: Kohorta
- Časové perspektivy: Budoucí
Kohorty a intervence
Skupina / kohorta |
|---|
|
Genetické poruchy
Pacienti nebo rodinní probandi s genetickou příčinou poruch, které jsou neřešitelné nebo obtížně identifikovatelné se stávající technikou.
|
Co je měření studie?
Primární výstupní opatření
Měření výsledku |
Popis opatření |
Časové okno |
|---|---|---|
|
Analyzujte výsledky GSMS pro vzácné poruchy, u kterých jsou známy genetické příčiny, ale nejsou plně popsány
Časové okno: Pokračující
|
Naším cílem je sekvenovat penetrující případy, abychom mohli studovat molekulární variace vzácných genetických poruch, lépe předpovídat patogenitu a identifikovat nové kauzativní varianty.
|
Pokračující
|
|
Molekulární etiologie vzácných onemocnění
Časové okno: Pokračující
|
Identifikujte genetickou příčinu poruch, které jsou neřešitelné nebo obtížně identifikovatelné pomocí stávajících technik, například poruchy způsobené novými mutacemi se špatnou reprodukční zdatností, pomocí exomu nebo sekvenování genomu.
|
Pokračující
|
Spolupracovníci a vyšetřovatelé
Vyšetřovatelé
- Vrchní vyšetřovatel: Leslie G Biesecker, M.D., National Human Genome Research Institute (NHGRI)
Publikace a užitečné odkazy
Obecné publikace
- Marteau TM, Dormandy E, Michie S. A measure of informed choice. Health Expect. 2001 Jun;4(2):99-108. doi: 10.1046/j.1369-6513.2001.00140.x.
- Evans JP, Green RC. Direct to consumer genetic testing: Avoiding a culture war. Genet Med. 2009 Aug;11(8):568-9. doi: 10.1097/GIM.0b013e3181afbaed. No abstract available.
- Mardis ER. Next-generation DNA sequencing methods. Annu Rev Genomics Hum Genet. 2008;9:387-402. doi: 10.1146/annurev.genom.9.081307.164359.
Užitečné odkazy
Termíny studijních záznamů
Hlavní termíny studia
Začátek studia (Aktuální)
Termíny zápisu do studia
První předloženo
První předloženo, které splnilo kritéria kontroly kvality
První zveřejněno (Odhadovaný)
Aktualizace studijních záznamů
Poslední zveřejněná aktualizace (Aktuální)
Odeslaná poslední aktualizace, která splnila kritéria kontroly kvality
Naposledy ověřeno
Více informací
Termíny související s touto studií
Klíčová slova
Další relevantní podmínky MeSH
Další identifikační čísla studie
- 100065
- 10-HG-0065
Plán pro data jednotlivých účastníků (IPD)
Plánujete sdílet data jednotlivých účastníků (IPD)?
Informace o lécích a zařízeních, studijní dokumenty
Studuje lékový produkt regulovaný americkým FDA
Studuje produkt zařízení regulovaný americkým úřadem FDA
Tyto informace byly beze změn načteny přímo z webu clinicaltrials.gov. Máte-li jakékoli požadavky na změnu, odstranění nebo aktualizaci podrobností studie, kontaktujte prosím register@clinicaltrials.gov. Jakmile bude změna implementována na clinicaltrials.gov, bude automaticky aktualizována i na našem webu .
Klinické studie na Vrozená anomálie
-
QLT Inc.DokončenoLCA (Leber Congenital Amaurosis) | RP (Retinitis Pigmentosa)Spojené státy, Kanada, Německo, Holandsko, Spojené království
-
QLT Inc.DokončenoLCA (Leber Congenital Amaurosis) | RP (Retinitis Pigmentosa)Kanada, Spojené státy, Německo, Holandsko, Spojené království