- ICH GCP
- USA klinikai vizsgálatok nyilvántartása
- Klinikai vizsgálat NCT01087320
Teljes genom orvosi szekvenálása a genom felfedezéséhez
Teljes genom orvosi szekvenálás a génfelderítéshez
Háttér:
- Számos ritka örökletes betegség csak néhány beteget érint, és ezen állapotok genetikai okai ismeretlenek. A kutatók a teljes genom szekvenálásának nevezett új technológia használatát tanulmányozzák, hogy megtudják, melyik gén vagy gének okozzák ezeket a feltételeket. Az ezeket a betegségeket okozó gének megértése fontos az érintett betegek diagnózisának és kezelésének javítása érdekében.
Célok:
- A meglévő technikákkal nehezen azonosítható rendellenességek genetikai okának azonosítása.
- A legjobb gyakorlatok kidolgozása a teljes genom szekvenálásának orvosi és tanácsadói kihívásaihoz.
Jogosultság:
- Olyan személyek, akiknél a jelen tanulmányban vizsgált ritka rendellenességek egyike van. Ezek az állapotok általában olyanok, amelyekben a rendellenesség genetikai oka ismeretlen. A legtöbb egyéni résztvevő jogosultságáról eseti alapon a kutatók döntenek.
- Az érintett egyének családtagjai, ha az adott családtag (gyakran szülő) genetikai információt szolgáltathat.
Tervezés:
- A vizsgálatban részt vevőknek legalább egy, és néhány esetben több is eleget kell tenniük az alábbi eljárások közül:
- Orvosi genetikai értékelés.
- Egyéb vizsgálatok, amelyek magukban foglalhatják a röntgensugarakat, a mágneses rezonancia képalkotást (MRI) és a más orvosokkal folytatott konzultációkat. Nem minden vizsgálatra van szükség minden egyes személy esetében, de a tesztekből származó információkra szükség lehet egyes génszekvenálási vizsgálataink folytatásához.
- Klinikai fényképek a rendellenesség bizonyos aspektusainak dokumentálására.
- Vér- és bőrbiopsziás minták vagy egyéb szövetminták, a vizsgálatot végző orvosok által előírtak szerint.
- Genetikai tesztelés, a kutatók döntése szerint. A legtöbb résztvevő azonban arra számíthat, hogy teljes genom szekvenálásnak vetik alá magát, ami egy olyan technika, amellyel egy személy összes génjét tanulmányozzák.
- Egyes résztvevőket felkérhetik, hogy vegyenek részt egy telefonos interjúban és/vagy egy webalapú felmérésben.
- A résztvevők választhatnak arról, hogy a teljes genom szekvenálásából milyen eredményeket szeretnének megtanulni.
- A tesztek befejezése és a genetikai vizsgálatok eredményeinek megismerése után a résztvevőknek felajánlják, hogy visszatérjenek az Országos Egészségügyi Intézetbe, hogy megismerjék ezeket az eredményeket. A látogatás során a résztvevőket felkérik, hogy töltsenek ki felméréseket és vegyenek részt interjúkban a vizsgálatban való részvételre vonatkozó döntéseikhez kapcsolódóan, és megismerjék az egyéni genetikai tesztek eredményeit.
A tanulmány áttekintése
Állapot
Részletes leírás
Célunk a genom léptékű orvosi szekvenálás (GSMS, exome és egész) alkalmazása
genom szekvenálás, ha szükséges), hogy felfedezzék a kiváltó molekuláris elváltozásokat ritka, súlyos fenotípusok csoportjában, amelyekről feltételezhető, hogy szomatikus mutációk, csíravonal de novo heterozigóta mutációk, csíravonal által öröklött recesszív vagy csíravonal által öröklött domináns mutációk jelenleg ismeretlen vagy nem jellemzett génekben. Ennek a kutatásnak három célja van: azonosítani a korábban ismeretlen molekuláris etiológiájú rendellenességek okozó szekvencia-variánsait, alkalmazni ezt a betekintést mind a vizsgált ritka betegségekre, mind a gyakoribb fenotípusokra, valamint elősegíteni a mutációk vizsgálatát az egész genomra kiterjedően. szint.
Körülbelül három-hat érintett személyt, mindkét szülővel együtt tervezünk toborozni minden egyes vizsgált fenotípushoz. A leendő triókat az NIH Klinikai Központjába szállítják rövid klinikai és molekuláris értékelés céljából. Minden trió beleegyezik a GSMS-be, azzal a lehetőséggel, hogy megtanulja a klinikailag releváns eredményeket, vagyis azokat, amelyek magyarázatot adnak a szóban forgó rendellenességre (amit elsődleges variánsnak nevezünk), valamint más, a GSMS részeként véletlenül felfedezett klinikailag releváns eredményeket. folyamat (amit másodlagos változatoknak nevezünk). A résztvevőknek visszatérő látogatást ajánlanak az NIH-hoz, hogy megismerjék ezeket az eredményeket.
A NIH Intramural Sequencing Centerben (NISC) generált szekvenciaadatokat a Biesecker laboratórium munkatársai átvizsgálják a feltételezett öröklődési mintának megfelelő szekvenciaváltozatok után. Minden klinikailag relevánsnak ítélt szekvenciaváltozatot egy CLIA-tanúsítvánnyal rendelkező laboratóriumban validálnak, és az eredményeket visszaküldik az adott résztvevőnek. Ezt a protokollt úgy alakították ki, hogy hosszú távú lehetőséget biztosítson számos különböző klinikai projekt megvalósításához.
Tanulmány típusa
Beiratkozás (Becsült)
Kapcsolatok és helyek
Tanulmányi kapcsolat
- Név: Julie Sapp
- Telefonszám: (301) 435-2832
- E-mail: sappj@mail.nih.gov
Tanulmányozza a kapcsolattartók biztonsági mentését
- Név: Leslie G Biesecker, M.D.
- Telefonszám: (301) 402-2041
- E-mail: lesb@mail.nih.gov
Tanulmányi helyek
-
-
Maryland
-
Bethesda, Maryland, Egyesült Államok, 20892
- Toborzás
- National Institutes of Health Clinical Center
-
-
Részvételi kritériumok
Jogosultsági kritériumok
Tanulmányozható életkorok
- Gyermek
- Felnőtt
- Idősebb felnőtt
Egészséges önkénteseket fogad
Mintavételi módszer
Tanulmányi populáció
Leírás
- BEVÉTEL KRITÉRIUMAI:
Egy vizsgált betegségben szenvedő személy, aki 4 hetesnél idősebb. A példaértékű rendellenességek kezdeti listája megszűnt; ezek a rendellenességek példái voltak azoknak, amelyek megfelelnek az ebbe a protokollba való felvétel általános jellemzőinek. Amint fentebb említettük, az általunk e protokoll szerint vizsgálandó rendellenességekben szenvedő egyének általában olyan ritka fenotípusú szimplex eseteket képviselnek, amelyek molekuláris etiológiája ismeretlen.
Ritka esetekben elfogadhatunk DNS-t elhalálozott egyénektől, beleértve az elhalt magzatok/újszülöttek DNS-ét vagy más mentett biológiai mintáit a 400-as irányelvvel összhangban. Ezek a minták kivételes lehetőségeket biztosíthatnak számunkra a súlyos genetikai túlszaporodási rendellenességek olyan változatainak és megnyilvánulásainak tanulmányozására, ahol a magzat/újszülött a megnyilvánulások súlyossága miatt életképtelen. Abban a ritka esetben, amikor nem életképes magzatokból/újszülöttekből származó mintákat tervezünk fogadni, kapcsolatba léphetünk a várandós anyákkal, hogy megkezdjük a beleegyezési megbeszéléseket és összehangoljuk a mintavételt. Csak olyan terhes nőket veszünk fel, akik önkéntesen adományoznak magzati szövetet invazív prenatális vizsgálatból, és akiknél a trió elemzés megfelelő és szükséges. Bár ritka, előfordulhatnak olyan körülmények, amelyekben a tudományos célkitűzések (a proband genetikai állapotának molekuláris etiológiájának tisztázása) nem lennének lehetségesek a magzat/próbád és a biológiai szülők DNS-ének elemzése nélkül. A 45CFR46.205 által meghatározott feltételek teljesülnek az életképtelen újszülöttek felvételéhez:
- Az újszülött létfontosságú funkciói nem lesznek mesterségesen fenntartva;
- A kutatás nem szünteti meg az újszülött szívverését vagy légzését;
- A kutatás nem jelent további kockázatot az újszülöttre nézve;
- A kutatás célja olyan fontos, más úton nem megszerezhető orvosbiológiai ismeretek fejlesztése; és
- A jogilag hatályos tájékoztatáson alapuló beleegyezés a vonatkozó előírásoknak megfelelően történik.
Az érintett egyén családtagjai, ahol az adott családtag (gyakran egy szülő) potenciálisan informatív vagy hasznos lehet a genetikai variánsok összekapcsolásához vagy egyéb bioinformatikai elemzéséhez. A kiskorú vagy döntésképtelen felnőtt személyek jogosultak arra, hogy szülőjük vagy törvényes gyámjuk jogosult a hozzájárulási űrlap aláírására a nevükben.
KIZÁRÁSI TARTALOM:
A nagykorú és korlátozott döntéshozatali képességű gondviselők nem jogosultak a részvételre, ha nincs törvényes gyámjuk, aki felhatalmazással rendelkezik a hozzájárulási űrlap aláírására a nevükben.
Azokat az alanyokat, akiknek ismert, jelentős affektív vagy pszichiátriai rendellenességei vannak, amelyek a csoport megítélése szerint ronthatják az összetett orvosi és genetikai információk megértésének és megfelelő felhasználásának képességét, döntésképességében károsodottnak minősülnek, és nem jogosultak arra, hogy kijelöljék őket (vagy kiskorú gyermekek esetén megfelelő helyettes döntéshozó felügyelete alatt állnak.
Ezen túlmenően a kognitív fogyatékossággal élő felnőtt családtagok gondnokságát jogilag meg kell állapítani, és a család beiratkozása előtt be kell mutatni a gyámság igazolását.
Lehetőséget kérünk arra, hogy ezt a protokollt többféle genetikai rendellenesség esetén is használhassuk anélkül, hogy azokat előzetesen külön körülhatárolnánk. Úgy gondoljuk, hogy ez a megközelítés helyénvaló, mivel szinte minden öröklött rendellenesség esetén a GSMS kockázatai és előnyei nem térnek el lényegesen. Ezt a koncepciót a már lezárt 94-HG-0193 protokollunk igazolta, amely az örökletes veleszületett rendellenességek széles körű protokollja volt, amelyek közül sok nem tartozik pontosan egy specifikus diagnosztikai osztályozásba.
Amint már említettük, engedélyt kérhetünk bizonyos információk megőrzésére azokról a leendő résztvevőkről, akik megkeresésük időpontjában esetleg nem jogosultak a vizsgálatra, de a jövőben jogosulttá válhatnak. Mivel ezek a résztvevők nem írnak alá beleegyező nyilatkozatot, azt javasoljuk, hogy ezeket a résztvevőket NE vegyük figyelembe felvételi jelentkezési jelentéseinkben, hanem minden folyamatos felülvizsgálat alkalmával az IRB rendelkezésére bocsátjuk a megőrzött nyilvántartások összesítését.
A protokollhoz tartozó hozzájárulási dokumentumok angol és spanyol nyelven állnak rendelkezésre. Ritka esetekben az NIH rövid írásos hozzájárulási űrlapjának fordításával más nyelven beszélő résztvevőket is beírhatunk.
Terhes nőket nem veszünk fel, kivéve a fenti részben leírtakat.
Tanulási terv
Hogyan készül a tanulmány?
Tervezési részletek
- Megfigyelési modellek: Kohorsz
- Időperspektívák: Leendő
Kohorszok és beavatkozások
Csoport / Kohorsz |
---|
Genetikai rendellenességek
Betegek vagy családtagok, akiknek genetikai okai olyan rendellenességek, amelyek a meglévő technikával kezelhetetlenek vagy nehezen azonosíthatók.
|
Mit mér a tanulmány?
Elsődleges eredményintézkedések
Eredménymérő |
Intézkedés leírása |
Időkeret |
---|---|---|
Ritka betegségek molekuláris etiológiája
Időkeret: Folyamatban lévő
|
Azonosítsa azoknak a rendellenességeknek a genetikai okát, amelyek a meglévő technikákkal kezelhetetlenek vagy nehezen azonosíthatók, például olyan új mutációk miatti rendellenességek, amelyek rossz reproduktív alkalmassággal járnak exóm vagy genom szekvenálás révén
|
Folyamatban lévő
|
Elemezze a GSMS-eredményeket olyan ritka betegségekre, amelyek genetikai okai ismertek, de nem írták le teljesen
Időkeret: Folyamatban lévő
|
Célunk a penetráns esetek szekvenálása a ritka genetikai rendellenességek molekuláris variációinak tanulmányozására, a patogenitás jobb előrejelzésére és az új oki variánsok azonosítására.
|
Folyamatban lévő
|
Együttműködők és nyomozók
Nyomozók
- Kutatásvezető: Leslie G Biesecker, M.D., National Human Genome Research Institute (NHGRI)
Publikációk és hasznos linkek
Általános kiadványok
- Marteau TM, Dormandy E, Michie S. A measure of informed choice. Health Expect. 2001 Jun;4(2):99-108. doi: 10.1046/j.1369-6513.2001.00140.x.
- Evans JP, Green RC. Direct to consumer genetic testing: Avoiding a culture war. Genet Med. 2009 Aug;11(8):568-9. doi: 10.1097/GIM.0b013e3181afbaed. No abstract available.
- Mardis ER. Next-generation DNA sequencing methods. Annu Rev Genomics Hum Genet. 2008;9:387-402. doi: 10.1146/annurev.genom.9.081307.164359.
Hasznos linkek
Tanulmányi rekorddátumok
Tanulmány főbb dátumok
Tanulmány kezdete (Tényleges)
Tanulmányi regisztráció dátumai
Először benyújtva
Először nyújtották be, amely megfelel a minőségbiztosítási kritériumoknak
Első közzététel (Becsült)
Tanulmányi rekordok frissítései
Utolsó frissítés közzétéve (Tényleges)
Az utolsó frissítés elküldve, amely megfelel a minőségbiztosítási kritériumoknak
Utolsó ellenőrzés
Több információ
A tanulmányhoz kapcsolódó kifejezések
Kulcsszavak
További vonatkozó MeSH feltételek
Egyéb vizsgálati azonosító számok
- 100065
- 10-HG-0065
Terv az egyéni résztvevői adatokhoz (IPD)
Tervezi megosztani az egyéni résztvevői adatokat (IPD)?
Gyógyszer- és eszközinformációk, tanulmányi dokumentumok
Egy amerikai FDA által szabályozott gyógyszerkészítményt tanulmányoz
Egy amerikai FDA által szabályozott eszközterméket tanulmányoz
Ezt az információt közvetlenül a clinicaltrials.gov webhelyről szereztük be, változtatás nélkül. Ha bármilyen kérése van vizsgálati adatainak módosítására, eltávolítására vagy frissítésére, kérjük, írjon a következő címre: register@clinicaltrials.gov. Amint a változás bevezetésre kerül a clinicaltrials.gov oldalon, ez a webhelyünkön is automatikusan frissül. .
Klinikai vizsgálatok a Veleszületett anomália
-
Eyecure Therapeutics Inc.Beijing Tongren HospitalIsmeretlenLeber Congenital Amaurosis, Retinitis PigmentosaKína
-
QLT Inc.BefejezveLCA (Leber Congenital Amaurosis) | RP (Retinitis Pigmentosa)Egyesült Államok, Kanada, Németország, Hollandia, Egyesült Királyság
-
Assiut UniversityJelentkezés meghívóvalIsmétlődő Congenital Talipes EquinovarusEgyiptom
-
Editas Medicine, Inc.BefejezveSzembetegségek | Retina degeneráció | Szembetegségek, örökletes | Látászavarok | Vakság | Leber Congenital Amaurosis 10 | Retina betegség | Veleszületett szembetegségekEgyesült Államok, Hollandia, Franciaország, Németország
-
ProQR TherapeuticsAktív, nem toborzóSzembetegségek | Neurológiai megnyilvánulások | Szembetegségek, örökletes | Érzékelési zavarok | Látászavarok | Vakság | Leber veleszületett amaurosis | Leber Congenital Amaurosis 10 | Retina betegség | Veleszületett szembetegségekEgyesült Államok, Belgium, Brazília, Kanada, Franciaország, Németország, Olaszország, Hollandia, Egyesült Királyság
-
QLT Inc.BefejezveLCA (Leber Congenital Amaurosis) | RP (Retinitis Pigmentosa)Kanada, Egyesült Államok, Németország, Hollandia, Egyesült Királyság
-
ProQR TherapeuticsToborzásSzembetegségek | Neurológiai megnyilvánulások | Retina degeneráció | Retina disztrófiák | Érzékelési zavarok | Látászavarok | Vakság | Leber veleszületett amaurosis | Leber Congenital Amaurosis 10 | Retina betegség | Veleszületett szembetegségekBelgium, Brazília, Kanada, Németország, Olaszország, Hollandia, Egyesült Királyság
-
MeiraGTx UK II LtdSyne Qua Non LimitedBefejezveSzembetegségek | Retina betegségek | Szembetegségek, örökletes | Leber Congenital Amaurosis (LCA)Egyesült Államok, Egyesült Királyság
-
University of Campania "Luigi Vanvitelli"Retina Italia OnlusBefejezveLeber Congenital Amaurosis 2 | Pigmentosa retinitis 20Olaszország
-
QLT Inc.BefejezveLeber Congenital Amaurosis (LCA) | Retinitis Pigmentosa (RP)Egyesült Államok, Kanada, Dánia, Németország, Hollandia, Svájc, Egyesült Királyság