- ICH GCP
- Yhdysvaltain kliinisten tutkimusten rekisteri
- Kliininen tutkimus NCT01087320
Koko genomin lääketieteellinen sekvensointi genomin löytämiseksi
Koko genomin lääketieteellinen sekvensointi geenien löytämiseksi
Tausta:
– Monet harvinaiset perinnölliset sairaudet vaikuttavat vain harvoihin potilaisiin, ja näiden sairauksien geneettisiä syitä ei tunneta. Tutkijat tutkivat uuden teknologian, nimeltä koko genomin sekvensointi, käyttöä selvittääkseen, mikä geeni tai geenit aiheuttavat nämä tilat. Näitä sairauksia aiheuttavien geenien ymmärtäminen on tärkeää sairastuneiden potilaiden diagnoosin ja hoidon parantamiseksi.
Tavoitteet:
- Sellaisten häiriöiden geneettisen syyn tunnistaminen, joita on vaikea tunnistaa olemassa olevilla tekniikoilla.
- Kehittää parhaita käytäntöjä koko genomin sekvensoinnin lääketieteellisiin ja neuvontahaasteisiin.
Kelpoisuus:
- Henkilöt, joilla on jokin tässä tutkimuksessa tarkasteltavina olevista harvinaisista sairauksista. Nämä tilat ovat yleensä sellaisia, joissa häiriön geneettistä syytä ei tunneta. Useimpien yksittäisten osallistujien kelpoisuuden päättävät tutkijat tapauskohtaisesti.
- Sairastuneiden yksilöiden perheenjäsenet, jos tämä perheenjäsen (usein vanhempi) voi tarjota geneettistä tietoa.
Design:
- Tämän tutkimuksen osallistujilla on vähintään yksi ja joissakin tapauksissa useita seuraavista menettelyistä:
- Lääketieteellinen geneettinen arviointi.
- Muita testejä, jotka voivat sisältää röntgensäteet, magneettikuvaustutkimukset (MRI) ja neuvottelut muiden lääkäreiden kanssa. Kaikki tutkimukset eivät ole välttämättömiä jokaiselle henkilölle, mutta testeistä saatuja tietoja voidaan tarvita joidenkin geenisekvensointitutkimustemme jatkamiseksi.
- Kliiniset valokuvat häiriön tiettyjen näkökohtien dokumentoimiseksi.
- Veri- ja ihobiopsianäytteet tai muut kudosnäytteet tutkimuslääkäreiden vaatimalla tavalla.
- Geneettinen testaus tutkijoiden päättämänä. Useimmat tämän tutkimuksen osallistujat voivat kuitenkin odottaa käyvänsä läpi koko genomin sekvensoinnin, joka on tekniikka ihmisen kaikkien geenien tutkimiseksi.
- Joitakin osallistujia voidaan pyytää osallistumaan puhelinhaastatteluun ja/tai verkkopohjaiseen kyselyyn.
- Osallistujat voivat valita, millaisia tuloksia koko genomin sekvensoinnista he haluavat oppia.
- Kun testit on suoritettu ja geneettisten tutkimusten tulokset ovat tiedossa, osallistujille tarjotaan uusintakäynti National Institutes of Healthiin saadakseen nämä tulokset. Vierailun aikana osallistujia pyydetään suorittamaan kyselyitä ja osallistumaan haastatteluihin, jotka liittyvät heidän päätökseensä osallistua tutkimukseen sekä oppimaan yksilöllisiä geneettisten testien tuloksia.
Tutkimuksen yleiskatsaus
Tila
Yksityiskohtainen kuvaus
Pyrimme käyttämään genomimittakaavan lääketieteellistä sekvensointia (GSMS, sisältäen eksomin ja kokonaisuuden
genomin sekvensointi tarpeen mukaan), jotta löydettäisiin kausatiivisia molekyylivaurioita joukolle harvinaisia, vakavia fenotyyppejä, joiden oletetaan johtuvan joko somaattisista mutaatioista, ituradan de novo heterotsygoottisista mutaatioista, ituradan periytyvistä resessiivisistä tai ituradan periytyvistä hallitsevista mutaatioista tällä hetkellä tuntemattomissa tai karakterisoimattomissa geeneissä. Tämän tutkimuksen tavoitteena on kolmiosainen: tunnistaa kausatiivisia sekvenssivariantteja sairauksille, joiden molekyylinen etiologia oli aiemmin tuntematon, soveltaa tätä näkemystä sekä tutkittaviin harvinaisiin sairauksiin että yleisempiin fenotyyppeihin ja tehostaa mutaatioiden tutkimusta genominlaajuisella taso.
Aiomme rekrytoida noin kolmesta kuuteen sairastuvaa henkilöä molempien vanhempien kanssa jokaiseen tutkittavaan fenotyyppiin. Mahdollisesti rekrytoidut triot tuodaan NIH Clinical Centeriin lyhyitä kliinisiä arviointeja ja molekyyliarviointia varten. Jokaiselle kolmikolle annetaan suostumus GSMS:ään ja mahdollisuus oppia kliinisesti merkityksellisiä tuloksia, eli niitä, jotka selittävät kyseessä olevan häiriön (jota kutsumme ensisijaiseksi variantiksi) sekä muita kliinisesti merkityksellisiä löydöksiä, jotka on löydetty sattumalta osana GSMS:ää. prosessi (jota me kutsumme toissijaisiksi varianteiksi ). Osallistujille tarjotaan uusintavierailu NIH:lle näiden tulosten oppimiseksi.
Bieseckerin laboratorion henkilökunta seuloo NIH Intramural Sequencing Centerissä (NISC) tuotetut sekvenssitiedot sellaisten sekvenssivarianttien varalta, jotka vastaavat oletettua periytymismallia. Kaikki kliinisesti merkityksellisiksi katsotut sekvenssivariantit validoidaan CLIA-sertifioidussa laboratoriossa ja tulokset palautetaan kyseiselle osallistujalle. Tämä protokolla suunnitellaan tavalla, joka tarjoaa pitkän aikavälin mahdollisuudet monien erilaisten kliinisten projektien toteuttamiseen.
Opintotyyppi
Ilmoittautuminen (Arvioitu)
Yhteystiedot ja paikat
Opiskeluyhteys
- Nimi: Julie Sapp
- Puhelinnumero: (301) 435-2832
- Sähköposti: sappj@mail.nih.gov
Tutki yhteystietojen varmuuskopiointi
- Nimi: Leslie G Biesecker, M.D.
- Puhelinnumero: (301) 402-2041
- Sähköposti: lesb@mail.nih.gov
Opiskelupaikat
-
-
Maryland
-
Bethesda, Maryland, Yhdysvallat, 20892
- Rekrytointi
- National Institutes of Health Clinical Center
-
-
Osallistumiskriteerit
Kelpoisuusvaatimukset
Opintokelpoiset iät
- Lapsi
- Aikuinen
- Vanhempi Aikuinen
Hyväksyy terveitä vapaaehtoisia
Näytteenottomenetelmä
Tutkimusväestö
Kuvaus
- SISÄLLYTTÄMISKRITEERIT:
Henkilö, jolla on tutkittava sairaus ja joka on yli 4 viikkoa vanha. Alkuperäinen luettelomme esimerkkihäiriöistä on lopetettu; nämä häiriöt olivat esimerkkejä niistä, jotka täyttävät yleiset ominaisuudet sisällytettäväksi tähän protokollaan. Kuten edellä todettiin, yksilöt, joilla on sairauksia, joita päätämme tutkia tämän protokollan mukaisesti, edustavat yleensä simplex-tapauksia, joissa on harvinaisia fenotyyppejä, joiden molekyylinen etiologia on tuntematon.
Harvinaisissa tapauksissa saatamme hyväksyä DNA:ta kuolleilta henkilöiltä, mukaan lukien DNA:ta tai muita tallennettuja biologisia näytteitä kuolleista sikiöistä/vastasyntyneistä Policy 400:n mukaisesti. Nämä näytteet voivat tarjota meille poikkeuksellisia mahdollisuuksia tutkia vakavien geneettisten liikakasvuhäiriöiden variantteja ja ilmenemismuotoja, joissa sikiö/vastasyntynyt on elinkelvoton ilmentymien vakavuuden vuoksi. Siinä harvinaisessa tilanteessa, jossa aiomme ottaa näytteitä elottomista sikiöistä/vastasyntyneistä, voimme olla yhteydessä raskaana olevien äitien kanssa aloittaaksemme suostumuskeskustelut ja koordinoidaksemme näytteenottoa. Otamme mukaan vain raskaana olevat naiset, jotka vapaaehtoisesti luovuttavat sikiön kudosta invasiivisista prenataalisista testeistä ja joille trio-analyysi on tarkoituksenmukaista ja välttämätöntä. Vaikka se on harvinaista, saattaa olla olosuhteita, joissa tieteelliset tavoitteet (selvittää koehenkilön geneettisen tilan molekyyliset etiologiat) eivät olisi mahdollisia ilman sikiön/koekappaleen ja biologisten vanhempien DNA:n analysointia. 45CFR46.205:ssä asetetut ehdot täyttyvät elottomien vastasyntyneiden sisällyttämiseksi:
- Vastasyntyneen elintoimintoja ei ylläpidetä keinotekoisesti;
- Tutkimus ei katkaise vastasyntyneen sydämenlyöntiä tai hengitystä;
- Tutkimuksesta ei aiheudu lisäriskiä vastasyntyneelle;
- Tutkimuksen tavoitteena on sellaisen tärkeän biolääketieteellisen tiedon kehittäminen, jota ei voi saada millään muulla tavalla; ja
- Laillisesti tehokas tietoinen suostumus saadaan sovellettavien määräysten mukaisesti.
Sairastuneen yksilön perheenjäseniä voidaan ottaa mukaan, jos kyseinen perheenjäsen (usein vanhempi) on mahdollisesti informatiivinen tai hyödyllinen geneettisten muunnelmien yhdistämiselle tai muille bioinformaattisille analyyseille. Alaikäiset tai kehitysvammaiset aikuiset ovat kelpoisia, jos heillä on vanhempi tai laillinen huoltaja, jolla on valtuudet allekirjoittaa suostumuslomake heidän puolestaan.
POISSULKEMINEN SISÄLTÖ:
Täysi-ikäiset ja päätöksentekokyvyttömät probands eivät ole kelvollisia, jos heillä ei ole laillista huoltajaa, jolla on valtuudet allekirjoittaa suostumuslomake heidän puolestaan.
Koehenkilöt, joilla on tunnettuja merkittäviä mielialahäiriöitä tai psykiatrisia häiriöitä, jotka ryhmän arvion mukaan voivat heikentää heidän kykyään ymmärtää ja käyttää tarkoituksenmukaisesti monimutkaista lääketieteellistä ja geneettistä tietoa, katsotaan heikentyneeksi eivätkä kelpaa, elleivät he ole nimenneet (tai alaikäisten lasten huoltajina) sopiva korvaava päätöksentekijä.
Lisäksi kognitiivisesti vammaisten aikuisten edunvalvojan on oltava laillisesti vahvistettu ja todiste huoltajuudesta on toimitettava ennen perheen ilmoittautumista.
Pyydämme mahdollisuutta käyttää tätä protokollaa useisiin geneettisiin sairauksiin ilman, että niitä erikseen määritellään etukäteen. Uskomme, että tämä lähestymistapa on tarkoituksenmukainen, koska lähes kaikissa perinnöllisissä sairauksissa GSMS:n riskit ja hyödyt eivät olennaisesti eroa toisistaan. Tämän konseptin vahvisti nyt suljettu protokollamme 94-HG-0193, joka oli laaja-alainen protokolla perinnöllisille synnynnäisille epämuodostumille, joista monet eivät kuulu tarkasti tiettyyn diagnostiseen luokitukseen.
Kuten mainittiin, saatamme pyytää lupaa säilyttää joitakin tietoja mahdollisista osallistujista, jotka eivät tiedustelunsa aikana ehkä ole oikeutettuja tutkimukseen, mutta jotka voivat tulla kelpoisiksi tulevaisuudessa. Koska nämä osallistujat eivät allekirjoita suostumuslomaketta, ehdotamme, että näitä osallistujia EI oteta huomioon osallistumisraporteissamme, vaan toimitamme IRB:lle säilytetyt tietueet jokaisen jatkuvan tarkastelun yhteydessä.
Tämän protokollan suostumusasiakirjat ovat saatavilla englanniksi ja espanjaksi. Harvinaisissa tapauksissa saatamme rekisteröidä muita kieliä puhuvia osallistujia käyttämällä NIH:n lyhyttä kirjallista suostumuslomakekäännöstä.
Emme ota mukaan raskaana olevia naisia, paitsi yllä olevassa osiossa kuvatulla tavalla.
Opintosuunnitelma
Miten tutkimus on suunniteltu?
Suunnittelun yksityiskohdat
- Havaintomallit: Kohortti
- Aikanäkymät: Tulevaisuuden
Kohortit ja interventiot
Ryhmä/Kohortti |
---|
Geneettiset häiriöt
Potilaat tai perheenjäsenet, joilla on geneettinen syy häiriöihin, joita ei voida hoitaa tai joita on vaikea tunnistaa olemassa olevalla tekniikalla.
|
Mitä tutkimuksessa mitataan?
Ensisijaiset tulostoimenpiteet
Tulosmittaus |
Toimenpiteen kuvaus |
Aikaikkuna |
---|---|---|
Harvinaisten sairauksien molekulaarinen etiologia
Aikaikkuna: Meneillään oleva
|
Tunnista sellaisten häiriöiden geneettinen syy, joita ei voida hoitaa tai joita on vaikea tunnistaa olemassa olevilla tekniikoilla, esimerkiksi häiriöt, jotka johtuvat uusista mutaatioista, joilla on huono lisääntymiskyky eksomin tai genomin sekvensoinnin avulla
|
Meneillään oleva
|
Analysoi GSMS-tuloksia sellaisten harvinaisten sairauksien varalta, joiden geneettiset syyt tunnetaan, mutta joita ei ole täysin kuvattu
Aikaikkuna: Meneillään oleva
|
Pyrimme sekvensoimaan tunkeutuvia tapauksia tutkiaksemme harvinaisten geneettisten häiriöiden molekyylimuunnelmia, ennustaaksemme paremmin patogeenisyyttä ja tunnistaaksemme uusia kausatiivisia variantteja.
|
Meneillään oleva
|
Yhteistyökumppanit ja tutkijat
Tutkijat
- Päätutkija: Leslie G Biesecker, M.D., National Human Genome Research Institute (NHGRI)
Julkaisuja ja hyödyllisiä linkkejä
Yleiset julkaisut
- Marteau TM, Dormandy E, Michie S. A measure of informed choice. Health Expect. 2001 Jun;4(2):99-108. doi: 10.1046/j.1369-6513.2001.00140.x.
- Evans JP, Green RC. Direct to consumer genetic testing: Avoiding a culture war. Genet Med. 2009 Aug;11(8):568-9. doi: 10.1097/GIM.0b013e3181afbaed. No abstract available.
- Mardis ER. Next-generation DNA sequencing methods. Annu Rev Genomics Hum Genet. 2008;9:387-402. doi: 10.1146/annurev.genom.9.081307.164359.
Hyödyllisiä linkkejä
Opintojen ennätyspäivät
Opi tärkeimmät päivämäärät
Opiskelun aloitus (Todellinen)
Opintoihin ilmoittautumispäivät
Ensimmäinen lähetetty
Ensimmäinen toimitettu, joka täytti QC-kriteerit
Ensimmäinen Lähetetty (Arvioitu)
Tutkimustietojen päivitykset
Viimeisin päivitys julkaistu (Arvioitu)
Viimeisin lähetetty päivitys, joka täytti QC-kriteerit
Viimeksi vahvistettu
Lisää tietoa
Tähän tutkimukseen liittyvät termit
Avainsanat
Muita asiaankuuluvia MeSH-ehtoja
Muut tutkimustunnusnumerot
- 100065
- 10-HG-0065
Yksittäisten osallistujien tietojen suunnitelma (IPD)
Aiotko jakaa yksittäisten osallistujien tietoja (IPD)?
Lääke- ja laitetiedot, tutkimusasiakirjat
Tutkii yhdysvaltalaista FDA sääntelemää lääkevalmistetta
Tutkii yhdysvaltalaista FDA sääntelemää laitetuotetta
Nämä tiedot haettiin suoraan verkkosivustolta clinicaltrials.gov ilman muutoksia. Jos sinulla on pyyntöjä muuttaa, poistaa tai päivittää tutkimustietojasi, ota yhteyttä register@clinicaltrials.gov. Heti kun muutos on otettu käyttöön osoitteessa clinicaltrials.gov, se päivitetään automaattisesti myös verkkosivustollemme .
Kliiniset tutkimukset Synnynnäinen Anomalia
-
University Hospital, GhentRekrytointiMullerian Anomaly of Uterus, muualle | Mullerian emättimen anomalia | Mullerin kohdunkaulan anomaliaBelgia
-
University Hospital, GhentRekrytointiMullerian Anomaly of Uterus, muualle | Mullerian emättimen anomalia | Mullerin kohdunkaulan anomaliaBelgia
-
Uludag UniversityTuntematonMullerian Anomaly of Uterus, muualleTurkki
-
QLT Inc.ValmisLCA (Leber Congenital Amaurosis) | RP (Retinitis Pigmentosa)Yhdysvallat, Kanada, Saksa, Alankomaat, Yhdistynyt kuningaskunta
-
Editas Medicine, Inc.ValmisSilmäsairaudet | Verkkokalvon rappeuma | Silmäsairaudet, perinnölliset | Näköhäiriöt | Sokeus | Leber Congenital Amaurosis 10 | Verkkokalvon sairaus | Synnynnäiset silmäsairaudetYhdysvallat, Alankomaat, Ranska, Saksa
-
ProQR TherapeuticsRekrytointiSilmäsairaudet | Neurologiset ilmenemismuodot | Verkkokalvon rappeuma | Verkkokalvon dystrofiat | Sensaatiohäiriöt | Näköhäiriöt | Sokeus | Leberin synnynnäinen amauroosi | Leber Congenital Amaurosis 10 | Verkkokalvon sairaus | Synnynnäiset silmäsairaudetBelgia, Brasilia, Kanada, Saksa, Italia, Alankomaat, Yhdistynyt kuningaskunta
-
ProQR TherapeuticsAktiivinen, ei rekrytointiSilmäsairaudet | Neurologiset ilmenemismuodot | Silmäsairaudet, perinnölliset | Sensaatiohäiriöt | Näköhäiriöt | Sokeus | Leberin synnynnäinen amauroosi | Leber Congenital Amaurosis 10 | Verkkokalvon sairaus | Synnynnäiset silmäsairaudetYhdysvallat, Belgia, Brasilia, Kanada, Ranska, Saksa, Italia, Alankomaat, Yhdistynyt kuningaskunta
-
QLT Inc.ValmisLCA (Leber Congenital Amaurosis) | RP (Retinitis Pigmentosa)Kanada, Yhdysvallat, Saksa, Alankomaat, Yhdistynyt kuningaskunta
-
University of Campania "Luigi Vanvitelli"Retina Italia OnlusValmisLeber Congenital Amaurosis 2 | Pigmentosa retiniitti 20Italia
-
QLT Inc.ValmisLeber Congenital Amaurosis (LCA) | Retinitis Pigmentosa (RP)Yhdysvallat, Kanada, Tanska, Saksa, Alankomaat, Sveitsi, Yhdistynyt kuningaskunta