- ICH GCP
- US Clinical Trials Registry
- Klinisk utprøving NCT01087320
Helgenom medisinsk sekvensering for genomoppdagelse
Helgenom medisinsk sekvensering for genoppdagelse
Bakgrunn:
– En rekke sjeldne arvelige sykdommer rammer kun noen få pasienter, og de genetiske årsakene til disse tilstandene er fortsatt ukjente. Forskere studerer bruken av en ny teknologi kalt helgenomsekvensering for å finne ut hvilket eller hvilke gener som forårsaker disse forholdene. Å forstå genene som forårsaker disse sykdommene er viktig for å forbedre diagnostisering og behandling av berørte pasienter.
Mål:
- Å identifisere den genetiske årsaken til lidelser som er vanskelige å identifisere med eksisterende teknikker.
- Å utvikle beste praksis for de medisinske og rådgivningsmessige utfordringene ved helgenomsekvensering.
Kvalifisering:
- Personer som har en av de sjeldne lidelsene som vurderes i denne studien. Disse tilstandene er vanligvis de der den genetiske årsaken til lidelsen er ukjent. Valgbarheten til de fleste individuelle deltakere vil avgjøres fra sak til sak av forskerne.
- Familiemedlemmer til berørte individer, hvis det familiemedlemmet (ofte en forelder) kan gi genetisk informasjon.
Design:
- Deltakere i denne studien vil ha minst én og i noen tilfeller flere av følgende prosedyrer:
- En medisinsk genetikkvurdering.
- Andre tester som kan inkludere røntgen, magnetisk resonans imaging (MRI) undersøkelser og konsultasjoner med andre leger. Ikke alle studier er nødvendige for hver person, men informasjonen fra testene kan være nødvendig for å fortsette med noen av våre gensekvenseringsstudier.
- Kliniske fotografier for å dokumentere visse aspekter av lidelsen.
- Blod- og hudbiopsiprøver, eller andre vevsprøver, som kreves av studielegene.
- Genetisk testing, som bestemt av forskerne. Imidlertid kan de fleste deltakere i denne studien forvente å gjennomgå helgenomsekvensering, som er en teknikk for å studere alle en persons gener.
- Noen deltakere kan bli bedt om å delta i et telefonintervju og/eller en nettbasert spørreundersøkelse.
- Deltakerne vil ha valg om hva slags resultater fra helgenomsekvensering de ønsker å lære.
- Etter at testene er fullført og resultatene av de genetiske studiene er kjent, vil deltakerne bli tilbudt et gjenbesøk til National Institutes of Health for å lære disse resultatene. Under dette besøket vil deltakerne bli bedt om å fullføre undersøkelser og delta i intervjuer relatert til deres beslutninger om å delta i studien og lære individuelle genetiske testresultater.
Studieoversikt
Status
Detaljert beskrivelse
Vi tar sikte på å bruke medisinsk sekvensering i genomskala (GSMS, for å inkludere eksom og helhet
genomsekvensering etter behov) for å oppdage kausative molekylære lesjoner for et sett av sjeldne, alvorlige fenotyper som antas å være forårsaket av enten somatiske mutasjoner, kimlinje de novo heterozygote mutasjoner, kimlinjearvede recessive eller kimlinjearvede dominante mutasjoner i for tiden ukjente eller ukarakteriserte gener. Målet med denne forskningen er tredelt: å identifisere kausative sekvensvarianter for lidelser hvis molekylære etiologi tidligere var ukjent, å anvende denne innsikten på både de sjeldne lidelsene som studeres og mer vanlige fenotyper, og å forbedre studiet av mutasjon på et genomomfattende nivå.
Vi planlegger å rekruttere omtrent tre til seks berørte individer sammen med begge foreldrene for hver fenotype som studeres. Prospektivt rekrutterte trioer vil bli brakt til NIH Clinical Center for korte kliniske evalueringer og molekylær evaluering. Hver trio vil bli samtykket til GSMS med muligheten til å lære klinisk relevante resultater, det vil si de som forklarer den aktuelle lidelsen (det vi refererer til som primærvarianten) samt andre klinisk relevante funn oppdaget tilfeldig som en del av GSMS. prosess (det vi omtaler som sekundære varianter ). Deltakerne vil bli tilbudt et gjenbesøk til NIH for å lære disse resultatene.
Sekvensdata generert ved NIH Intramural Sequencing Center (NISC) vil bli screenet av ansatte i Biesecker-laboratoriet for sekvensvarianter som samsvarer med det antatte arvemønsteret. Alle sekvensvarianter som anses klinisk relevante vil bli validert i et CLIA-sertifisert laboratorium og resultatene returneres til den deltakeren. Denne protokollen blir utformet på en måte som vil gi det langsiktige potensialet for å forfølge mange forskjellige kliniske prosjekter.
Studietype
Registrering (Antatt)
Kontakter og plasseringer
Studiekontakt
- Navn: Leslie G Biesecker, M.D.
- Telefonnummer: (301) 402-2041
- E-post: lesb@mail.nih.gov
Studer Kontakt Backup
- Navn: Julie C Sapp
- Telefonnummer: (301) 435-2832
- E-post: sappj@mail.nih.gov
Studiesteder
-
-
Maryland
-
Bethesda, Maryland, Forente stater, 20892
- Rekruttering
- National Institutes of Health Clinical Center
-
-
Deltakelseskriterier
Kvalifikasjonskriterier
Alder som er kvalifisert for studier
- Barn
- Voksen
- Eldre voksen
Tar imot friske frivillige
Prøvetakingsmetode
Studiepopulasjon
Beskrivelse
- INKLUSJONSKRITERIER:
En person som er rammet av en lidelse som studeres og er eldre enn 4 uker. Vår første liste over eksempler på lidelser har blitt avviklet; disse lidelsene var eksempler på de som oppfyller de generelle egenskapene for inkludering i denne protokollen. Som nevnt ovenfor, vil individer med lidelser vi velger å undersøke under denne protokollen generelt representere simpleks tilfeller med sjeldne fenotyper hvis molekylære etiologi er ukjent.
I sjeldne tilfeller kan vi godta DNA fra avdøde individer, inkludert DNA eller andre lagrede biologiske prøver fra avdøde fostre/nyfødte i samsvar med Policy 400. Disse prøvene kan gi oss eksepsjonelle muligheter til å studere varianter og manifestasjoner av alvorlige genetiske overvekstforstyrrelser der fosteret/nyfødt er ulevedyktig på grunn av alvorlighetsgraden av manifestasjonene. I de sjeldne tilfellene hvor vi planlegger å akseptere prøver fra ikke-levedyktige fostre/nyfødte, kan vi ta kontakt med gravide mødre for å starte samtykkediskusjoner og koordinere prøveinnsamling. Vi vil kun registrere gravide kvinner som frivillig donerer fostervev fra invasiv prenatal testing, og som trioanalyse er hensiktsmessig og nødvendig for. Selv om det er sjeldent, kan det være omstendigheter der de vitenskapelige målene (for å belyse den molekylære etiologien til probandets genetiske tilstand) ikke ville være mulig uten å analysere DNA til fosteret/proben og de biologiske foreldrene. Betingelsene satt under 45CFR46.205 oppfylles for inkludering av ikke-levedyktige nyfødte:
- Vitale funksjoner til den nyfødte vil ikke opprettholdes kunstig;
- Forskningen vil ikke avslutte hjerterytmen eller respirasjonen til den nyfødte;
- Det vil ikke være noen ekstra risiko for den nyfødte som følge av forskningen;
- Formålet med forskningen er utvikling av viktig biomedisinsk kunnskap som ikke kan oppnås på andre måter; og
- Det juridisk effektive informerte samtykket innhentes i samsvar med gjeldende forskrifter.
Familiemedlemmer til et berørt individ der det familiemedlemmet (ofte en forelder) er potensielt informativt eller nyttig for kobling eller andre bioinformatiske analyser av genetiske varianter kan bli registrert. Probands som er mindreårige eller beslutningshemmede voksne er kvalifisert hvis de har en forelder eller verge som har myndighet til å signere et samtykkeskjema på deres vegne.
UTSLUTTELSE INKLUSJON:
Probander som er voksne og beslutningshemmet er ikke kvalifisert hvis de ikke har en juridisk verge som har myndighet til å signere et samtykkeskjema på deres vegne.
Forsøkspersoner som har kjente, betydelige affektive eller psykiatriske lidelser som, etter teamets vurdering, kan svekke deres evne til å forstå og på riktig måte bruke kompleks medisinsk og genetisk informasjon, vil bli ansett som beslutningshemmet og vil ikke være kvalifisert med mindre de har utnevnt (eller, i tilfelle av mindreårige barn, er i varetekt av) en passende stedfortreder beslutningstaker.
I tillegg må vergemål for kognitivt svekkede voksne probands være lovlig etablert, og bevis på vergemål må fremlegges før familiens innmelding.
Vi ber om muligheten til å bruke denne protokollen for flere genetiske lidelser, uten å spesifikt avgrense dem på forhånd. Vi mener denne tilnærmingen er hensiktsmessig fordi risikoen og fordelene ved GSMS ikke er vesentlig forskjellig for nesten alle arvelige lidelser. Dette konseptet ble validert av vår nå lukkede protokoll 94-HG-0193, som var en bredt basert protokoll for arvelige medfødte anomaliforstyrrelser, hvorav mange ikke faller pent inn i en spesifikk diagnostisk klassifisering.
Som nevnt kan vi be om tillatelse til å beholde noe informasjon om potensielle deltakere som på tidspunktet for forespørselen deres kanskje ikke er kvalifisert for studien, men som kan bli kvalifisert i fremtiden. Siden disse deltakerne ikke vil signere et samtykkeskjema, foreslår vi å IKKE telle disse deltakerne i våre inkluderingsregistreringsrapporter, men vil gi IRB en oversikt over beholdte poster ved hver kontinuerlig gjennomgang.
Samtykkedokumenter for denne protokollen er tilgjengelige på engelsk og spansk. I sjeldne tilfeller kan vi registrere deltakere som snakker andre språk ved å bruke NIH Short Written Consent Form Translation.
Vi vil ikke registrere gravide kvinner, bortsett fra som beskrevet i avsnittet ovenfor.
Studieplan
Hvordan er studiet utformet?
Designdetaljer
- Observasjonsmodeller: Kohort
- Tidsperspektiver: Potensielle
Kohorter og intervensjoner
Gruppe / Kohort |
|---|
|
Genetiske lidelser
Pasienter eller familieprobander med genetisk årsak til lidelser som er vanskelige eller vanskelige å identifisere med eksisterende teknikk.
|
Hva måler studien?
Primære resultatmål
Resultatmål |
Tiltaksbeskrivelse |
Tidsramme |
|---|---|---|
|
Analyser GSMS-resultater for sjeldne lidelser der genetiske årsaker er kjent, men ikke fullstendig beskrevet
Tidsramme: Pågående
|
Vi tar sikte på å sekvensere penetrerende tilfeller for å studere de molekylære variasjonene av sjeldne genetiske lidelser, for bedre å forutsi patogenisitet og identifisere nye årsaksvarianter.
|
Pågående
|
|
Molekylær etiologi av sjeldne sykdommer
Tidsramme: Pågående
|
Identifiser den genetiske årsaken til lidelser som er vanskelige eller vanskelige å identifisere med eksisterende teknikker, for eksempel lidelser på grunn av nye mutasjoner med dårlig reproduktiv form, gjennom eksom- eller genomsekvensering.
|
Pågående
|
Samarbeidspartnere og etterforskere
Etterforskere
- Hovedetterforsker: Leslie G Biesecker, M.D., National Human Genome Research Institute (NHGRI)
Publikasjoner og nyttige lenker
Generelle publikasjoner
- Marteau TM, Dormandy E, Michie S. A measure of informed choice. Health Expect. 2001 Jun;4(2):99-108. doi: 10.1046/j.1369-6513.2001.00140.x.
- Evans JP, Green RC. Direct to consumer genetic testing: Avoiding a culture war. Genet Med. 2009 Aug;11(8):568-9. doi: 10.1097/GIM.0b013e3181afbaed. No abstract available.
- Mardis ER. Next-generation DNA sequencing methods. Annu Rev Genomics Hum Genet. 2008;9:387-402. doi: 10.1146/annurev.genom.9.081307.164359.
Hjelpsomme linker
Studierekorddatoer
Studer hoveddatoer
Studiestart (Faktiske)
Datoer for studieregistrering
Først innsendt
Først innsendt som oppfylte QC-kriteriene
Først lagt ut (Antatt)
Oppdateringer av studieposter
Sist oppdatering lagt ut (Faktiske)
Siste oppdatering sendt inn som oppfylte QC-kriteriene
Sist bekreftet
Mer informasjon
Begreper knyttet til denne studien
Nøkkelord
Ytterligere relevante MeSH-vilkår
- Nevrologiske manifestasjoner
- Sykdommer i nervesystemet
- Psykiske lidelser
- Nevroatferdsmanifestasjoner
- Nevroutviklingsforstyrrelser
- Patologiske tilstander, tegn og symptomer
- Tegn og symptomer
- Medfødte abnormiteter
- Genetiske sykdommer, medfødte
- Intellektuell funksjonshemming
- Medfødte, arvelige og neonatale sykdommer og abnormiteter
Andre studie-ID-numre
- 100065
- 10-HG-0065
Plan for individuelle deltakerdata (IPD)
Planlegger du å dele individuelle deltakerdata (IPD)?
Legemiddel- og utstyrsinformasjon, studiedokumenter
Studerer et amerikansk FDA-regulert medikamentprodukt
Studerer et amerikansk FDA-regulert enhetsprodukt
Denne informasjonen ble hentet direkte fra nettstedet clinicaltrials.gov uten noen endringer. Hvis du har noen forespørsler om å endre, fjerne eller oppdatere studiedetaljene dine, vennligst kontakt register@clinicaltrials.gov. Så snart en endring er implementert på clinicaltrials.gov, vil denne også bli oppdatert automatisk på nettstedet vårt. .