- ICH GCP
- Amerikanska kliniska prövningsregistret
- Klinisk prövning NCT01087320
Helgenom medicinsk sekvensering för genomupptäckt
Helgenomets medicinska sekvensering för genupptäckt
Bakgrund:
– Ett antal sällsynta ärftliga sjukdomar drabbar endast ett fåtal patienter, och de genetiska orsakerna till dessa tillstånd är fortfarande okända. Forskare studerar användningen av en ny teknik som kallas helgenomsekvensering för att lära sig vilken eller vilka gener som orsakar dessa tillstånd. Att förstå generna som orsakar dessa sjukdomar är viktigt för att förbättra diagnostik och behandling av drabbade patienter.
Mål:
- Att identifiera den genetiska orsaken till störningar som är svåra att identifiera med befintliga tekniker.
- Att utveckla bästa praxis för de medicinska och rådgivningsmässiga utmaningarna med sekvensering av hela genomet.
Behörighet:
- Individer som har en av de sällsynta störningar som övervägs i denna studie. Dessa tillstånd är vanligtvis de där den genetiska orsaken till sjukdomen är okänd. De flesta enskilda deltagares valbarhet kommer att avgöras från fall till fall av forskarna.
- Familjemedlemmar till drabbade individer, om den familjemedlemmen (ofta en förälder) kan ge genetisk information.
Design:
- Deltagare i denna studie kommer att ha minst en och i vissa fall flera av följande procedurer:
- En medicinsk genetikutvärdering.
- Andra tester som kan inkludera röntgenstrålar, magnetisk resonanstomografi (MRI) undersökningar och konsultationer med andra läkare. Alla studier är inte nödvändiga för varje person, men informationen från testerna kan krävas för att gå vidare med några av våra gensekvenseringsstudier.
- Kliniska fotografier för att dokumentera vissa aspekter av sjukdomen.
- Blod- och hudbiopsiprover, eller andra vävnadsprover, som krävs av studieläkarna.
- Genetisk testning, enligt beslut av forskarna. De flesta deltagare i denna studie kan dock förvänta sig att genomgå sekvensering av hela genomet, vilket är en teknik för att studera alla en persons gener.
- Vissa deltagare kan bli ombedda att delta i en telefonintervju och/eller en webbaserad undersökning.
- Deltagarna kommer att ha val om vilka typer av resultat från helgenomsekvensering de vill lära sig.
- Efter att testerna har slutförts och resultaten av de genetiska studierna är kända, kommer deltagarna att erbjudas ett återbesök till National Institutes of Health för att lära sig dessa resultat. Under detta besök kommer deltagarna att uppmanas att fylla i undersökningar och delta i intervjuer relaterade till deras beslut att delta i studien och att lära sig individuella genetiska testresultat.
Studieöversikt
Status
Detaljerad beskrivning
Vi strävar efter att använda medicinsk sekvensering i genomskala (GSMS, för att inkludera exom och helhet
genomsekvensering vid behov) för att upptäcka orsakande molekylära lesioner för en uppsättning sällsynta, allvarliga fenotyper som antas vara orsakade av antingen somatiska mutationer, germline de novo heterozygota mutationer, könslinje ärvda recessiva eller könslinje ärvda dominanta mutationer i för närvarande okända eller okaraktäriserade gener. Målet med denna forskning är trefaldigt: att identifiera orsakssekvensvarianter för sjukdomar vars molekylära etiologi tidigare var okänd, att tillämpa denna insikt på både de sällsynta störningarna som studeras och vanligare fenotyper, och att förbättra studiet av mutation på ett genomomfattande nivå.
Vi planerar att rekrytera cirka tre till sex drabbade individer tillsammans med båda föräldrarna för varje fenotyp som studeras. Prospektivt rekryterade trior kommer att föras till NIH Clinical Center för korta kliniska utvärderingar och molekylär utvärdering. Varje trio kommer att godkännas för GSMS med möjlighet att lära sig kliniskt relevanta resultat, det vill säga de som förklarar störningen i fråga (det vi kallar den primära varianten) samt andra kliniskt relevanta fynd som upptäckts tillfälligt som en del av GSMS. process (det vi kallar sekundära varianter ). Deltagarna kommer att erbjudas ett återbesök till NIH för att lära sig dessa resultat.
Sekvensdata som genereras vid NIH Intramural Sequencing Center (NISC) kommer att screenas av personal i Biesecker-laboratoriet för sekvensvarianter som överensstämmer med det hypoteserade arvsmönstret. Alla sekvensvarianter som anses kliniskt relevanta kommer att valideras i ett CLIA-certifierat laboratorium och resultaten returneras till den deltagaren. Detta protokoll utformas på ett sätt som ger den långsiktiga potentialen för att driva många olika kliniska projekt.
Studietyp
Inskrivning (Beräknad)
Kontakter och platser
Studiekontakt
- Namn: Julie Sapp
- Telefonnummer: (301) 435-2832
- E-post: sappj@mail.nih.gov
Studera Kontakt Backup
- Namn: Leslie G Biesecker, M.D.
- Telefonnummer: (301) 402-2041
- E-post: lesb@mail.nih.gov
Studieorter
-
-
Maryland
-
Bethesda, Maryland, Förenta staterna, 20892
- Rekrytering
- National Institutes of Health Clinical Center
-
-
Deltagandekriterier
Urvalskriterier
Åldrar som är berättigade till studier
- Barn
- Vuxen
- Äldre vuxen
Tar emot friska volontärer
Testmetod
Studera befolkning
Beskrivning
- INKLUSIONSKRITERIER:
En individ som är drabbad av en störning som studeras och är äldre än 4 veckor. Vår första lista över exemplariska störningar har avbrutits; dessa störningar var exempel på sådana som uppfyller de allmänna attributen för inkludering i detta protokoll. Som nämnts ovan kommer individer med störningar som vi väljer att undersöka enligt detta protokoll i allmänhet representera simplexfall med sällsynta fenotyper vars molekylära etiologi är okänd.
I sällsynta fall kan vi acceptera DNA från avlidna individer, inklusive DNA eller andra sparade biologiska prover från avlidna foster/nyfödda i enlighet med Policy 400. Dessa prover kan ge oss exceptionella möjligheter att studera varianter och manifestationer av allvarliga genetiska överväxtsjukdomar där fostret/nyfödda är olämpligt på grund av manifestationernas svårighetsgrad. I de sällsynta fall då vi planerar att ta emot prover från icke-livsdugliga foster/nyfödda, kan vi komma i kontakt med gravida mödrar för att påbörja samtyckesdiskussioner och samordna provinsamling. Vi kommer endast att registrera gravida kvinnor som frivilligt donerar fostervävnad från invasiv prenatal testning och för vilka trioanalys är lämplig och nödvändig. Även om det är sällsynt, kan det finnas omständigheter där de vetenskapliga målen (att belysa den molekylära etiologin för probandens genetiska tillstånd) inte skulle vara möjliga utan att analysera fostrets/probens och de biologiska föräldrarnas DNA. Villkoren enligt 45CFR46.205 uppfylls för inkludering av icke-livsdugliga nyfödda:
- Den nyföddas vitala funktioner kommer inte att upprätthållas på konstgjord väg;
- Forskningen kommer inte att avbryta hjärtslag eller andning hos nyfödd;
- Det kommer inte att finnas någon extra risk för det nyfödda barnet till följd av forskningen;
- Syftet med forskningen är att utveckla viktig biomedicinsk kunskap som inte kan erhållas på annat sätt; och
- Det juridiskt effektiva informerade samtycket erhålls i enlighet med gällande bestämmelser.
Familjemedlemmar till en drabbad individ där den familjemedlemmen (ofta en förälder) är potentiellt informativ eller användbar för länkning eller andra bioinformatiska analyser av genetiska varianter kan registreras. Probands som är minderåriga eller beslutsstörda vuxna är berättigade om de har en förälder eller vårdnadshavare som har behörighet att underteckna ett samtyckesformulär för deras räkning.
EXKLUSION INKLUSION:
Probands som är vuxna och beslutsmässigt nedsatta är inte berättigade om de inte har en vårdnadshavare som har behörighet att underteckna ett samtyckesformulär för deras räkning.
Försökspersoner som har kända, betydande affektiva eller psykiatriska störningar som, enligt teamets bedömning, kan försämra deras förmåga att förstå och på lämpligt sätt använda komplex medicinsk och genetisk information kommer att betraktas som beslutsmässigt försvagade och kommer att vara olämpliga om de inte har utsett (eller, när det gäller minderåriga barn, är i vårdnad av) en lämplig surrogatbeslutsfattare.
Dessutom måste förmynderskap för kognitivt nedsatt vuxna probands vara lagligt etablerat och bevis på förmynderskap måste tillhandahållas innan den familjen registreras.
Vi begär möjligheten att använda detta protokoll för flera genetiska sjukdomar, utan att specifikt avgränsa dem a priori. Vi anser att detta tillvägagångssätt är lämpligt eftersom riskerna och fördelarna med GSMS inte skiljer sig väsentligt för nästan alla ärftliga sjukdomar. Detta koncept validerades av vårt nu stängda protokoll 94-HG-0193, som var ett brett baserat protokoll för ärftliga medfödda anomalistörningar, av vilka många inte faller in i en specifik diagnostisk klassificering.
Som nämnts kan vi begära tillstånd att behålla viss information om potentiella deltagare som vid tidpunkten för sin förfrågan kanske inte är behöriga för studien men som kan bli behöriga i framtiden. Eftersom dessa deltagare inte kommer att underteckna ett samtyckesformulär, föreslår vi att INTE räkna dessa deltagare i våra inkluderingsrapporter utan kommer att förse IRB med en sammanställning av bevarade uppgifter vid varje kontinuerlig granskning.
Samtyckesdokument för detta protokoll finns på engelska och spanska. I sällsynta fall kan vi registrera deltagare som talar andra språk med hjälp av NIH Short Written Consent Form Translation.
Vi kommer inte att registrera gravida kvinnor, förutom vad som beskrivs i avsnittet ovan.
Studieplan
Hur är studien utformad?
Designdetaljer
- Observationsmodeller: Kohort
- Tidsperspektiv: Blivande
Kohorter och interventioner
Grupp / Kohort |
---|
Genetiska störningar
Patienter eller familjemedlemmar med genetisk orsak till störningar som är svårlösta eller svåra att identifiera med befintlig teknik.
|
Vad mäter studien?
Primära resultatmått
Resultatmått |
Åtgärdsbeskrivning |
Tidsram |
---|---|---|
Molekylär etiologi för sällsynta sjukdomar
Tidsram: Pågående
|
Identifiera den genetiska orsaken till störningar som är svårlösta eller svåra att identifiera med befintliga tekniker, till exempel störningar på grund av nya mutationer med dålig reproduktionsförmåga genom exom- eller genomsekvensering
|
Pågående
|
Analysera GSMS-resultat för sällsynta sjukdomar för vilka genetiska orsaker är kända men inte fullständigt beskrivna
Tidsram: Pågående
|
Vi strävar efter att sekvensera penetrerande fall för att studera de molekylära variationerna av sällsynta genetiska störningar, för att bättre förutsäga patogenicitet och identifiera nya orsaksvarianter.
|
Pågående
|
Samarbetspartners och utredare
Utredare
- Huvudutredare: Leslie G Biesecker, M.D., National Human Genome Research Institute (NHGRI)
Publikationer och användbara länkar
Allmänna publikationer
- Marteau TM, Dormandy E, Michie S. A measure of informed choice. Health Expect. 2001 Jun;4(2):99-108. doi: 10.1046/j.1369-6513.2001.00140.x.
- Evans JP, Green RC. Direct to consumer genetic testing: Avoiding a culture war. Genet Med. 2009 Aug;11(8):568-9. doi: 10.1097/GIM.0b013e3181afbaed. No abstract available.
- Mardis ER. Next-generation DNA sequencing methods. Annu Rev Genomics Hum Genet. 2008;9:387-402. doi: 10.1146/annurev.genom.9.081307.164359.
Användbara länkar
Studieavstämningsdatum
Studera stora datum
Studiestart (Faktisk)
Studieregistreringsdatum
Först inskickad
Först inskickad som uppfyllde QC-kriterierna
Första postat (Beräknad)
Uppdateringar av studier
Senaste uppdatering publicerad (Beräknad)
Senaste inskickade uppdateringen som uppfyllde QC-kriterierna
Senast verifierad
Mer information
Termer relaterade till denna studie
Nyckelord
Ytterligare relevanta MeSH-villkor
Andra studie-ID-nummer
- 100065
- 10-HG-0065
Plan för individuella deltagardata (IPD)
Planerar du att dela individuella deltagardata (IPD)?
Läkemedels- och apparatinformation, studiedokument
Studerar en amerikansk FDA-reglerad läkemedelsprodukt
Studerar en amerikansk FDA-reglerad produktprodukt
Denna information hämtades direkt från webbplatsen clinicaltrials.gov utan några ändringar. Om du har några önskemål om att ändra, ta bort eller uppdatera dina studieuppgifter, vänligen kontakta register@clinicaltrials.gov. Så snart en ändring har implementerats på clinicaltrials.gov, kommer denna att uppdateras automatiskt även på vår webbplats .
Kliniska prövningar på Medfödd anomali
-
University Hospital, GhentRekryteringMullerian Anomaly of Uterus, Nec | Mullerian Anomaly of Vagina | Mullerian anomali av livmoderhalsenBelgien
-
University Hospital, GhentRekryteringMullerian Anomaly of Uterus, Nec | Mullerian Anomaly of Vagina | Mullerian anomali av livmoderhalsenBelgien
-
Sahlgrenska University Hospital, SwedenSaint Joseph University, at Bellevue Medical CentreAvslutadInfertilitet, Kvinna | Mrk AnomalySverige
-
Sahlgrenska University Hospital, SwedenAnmälan via inbjudanTransplantation | Absolut uterin faktor infertilitet | Mrk AnomalySverige
-
Enzyvant Therapeutics GmBHNational Institute of Allergy and Infectious Diseases (NIAID); Eunice Kennedy... och andra samarbetspartnersAvslutadDiGeorge Anomaly | Komplettera DiGeorge Anomaly | Komplett DiGeorges syndrom | Komplett Atypical DiGeorge Anomaly | Komplett atypiskt DiGeorges syndromFörenta staterna
-
Enzyvant Therapeutics GmBHNational Institute of Allergy and Infectious Diseases (NIAID); Eunice Kennedy... och andra samarbetspartnersGodkänd för marknadsföringDiGeorges syndrom | DiGeorge Anomaly | Komplettera DiGeorge Anomaly | Komplett DiGeorges syndromFörenta staterna
-
Lifetech Scientific (Shenzhen) Co., Ltd.OkändPatent Ductus Arteriosus | Kanalberoende Cyanotic Congenital Heart DiseaseMalaysia
-
Enzyvant Therapeutics GmBHNational Institute of Allergy and Infectious Diseases (NIAID); Eunice Kennedy... och andra samarbetspartnersAvslutadDiGeorges syndrom | DiGeorge Anomaly | Komplettera DiGeorge Anomaly | Komplett DiGeorges syndromFörenta staterna
-
Enzyvant Therapeutics GmBHNational Institute of Allergy and Infectious Diseases (NIAID); Eunice Kennedy... och andra samarbetspartnersAvslutadDiGeorges syndrom | DiGeorge Anomaly | Komplettera DiGeorge Anomaly | Komplett DiGeorges syndromFörenta staterna
-
Cure CMDCongenital Muscle Disease International RegistrIndragenLAMA2-MD (Merosin Deficient Congenital Muskeldystrophy, MDC1A)Förenta staterna